Protein

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Genbank accession
UKH49278.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,90
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MADYKLSELNSIDTIRSDDLLHVRVKKRPEMLGDEDRRMTYQDFLASFKLERFVQIAGSNMTGDLGIVKLLYGGKAVFDPTDSSEISIGDVLKTFKINANGLKLTIADASRSATVYHTLNKPSPNELGMRTNEQNDARYARLSVGNTFKAKQIITVDGEALALKNTSDMPSLYIRGKDSGDRLKWYVGFNTENKLGLSNSVTGTTLLLDDTGINSNKNLNITGQVKPSDWSNLDARYFTQTVANQRFAQLAGNNTFSGTNTFKKDVIFNSDVPVVLKNLTANKPLYIQGKDYQNTSLWFVGKGGTGTEIKFYNYATDTVLELSETARFNKTLKVTGQVQPSDWANIDSRYIPAATLSTLAKINAKNTFSQGQIIKVDGEGIRLQGVNDTGGLFLRGYTSDGTKKWFMGTNASGNFTIREMVLGTELSLRENYIQFNKNVTINGQVQPSDWANLDARYYTGSAANARYMYAERTGEGADEGAIAWNAKTGVYNVKTGAASSNLVLQFYQGSGSIPSTPSAQLRFKWANGGMWYRTSRDGNGFEKGWSMVYTTAQKPTPSDIGAYTKAETDQKIATAISDSTDLNKIYPVGIVTWFNSNVNPNTALPGLTWTYLNNGVGRTIRIAAANGSDVATTGGSDSVTLSVGNLPSHTHSFSATTSSFDYGTKGTNSTGGHTHSVSGTTSAAGNHAHHLGLLLVNGGDAQYGYTTIGNSKTRTLDWLDRRDNKFPNTNTTGNHTHTWSGTTSGAGNHSHSVGIGAHSHTVSGNTGSTGSGSAFSVTNQFYKLMAWVRTA
Physico‐chemical
properties
protein length:791 AA
molecular weight: 85741,13620 Da
isoelectric point:9,18547
aromaticity:0,09355
hydropathy:-0,46094

Domains

Domains [InterPro]
DC_1566
STR
60–791
DC_1566
G3DSA:6.20.80.10
STR
157–217
G3DSA:6.20.80.10 IPR048388 IPR048388 IPR022246 IPR005003 IPR005003 IPR005003 IPR005003
IPR048388
ATT
158–246
IPR048388 G3DSA:6.20.80.10 IPR051934
UKH49278.1
1 791
Architecture
STR
ATT
STR
ATT
STR
ATT
STR
STR 60-157 | ATT 158-246 | STR 247-272 | ATT 273-353 | STR 354-378 | ATT 379-470 | STR 471-791
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage vB_EcoM_DE7
[NCBI] 		2911670 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Escherichia coli
[NCBI] 		562 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
UKH49278.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OL825705.1 [NCBI]
CDS location
range 37380 -> 39755
strand +
CDS
ATGGCAGATTACAAGTTGAGTGAATTAAACTCAATCGACACAATCCGTTCAGACGACCTTCTTCATGTCAGAGTTAAAAAGAGACCTGAAATGCTGGGTGATGAAGACCGTCGAATGACCTATCAAGACTTCTTAGCGTCTTTTAAACTTGAAAGATTTGTTCAGATTGCTGGTAGTAATATGACAGGTGACTTAGGGATTGTTAAGCTACTTTATGGCGGTAAGGCAGTATTTGACCCAACAGACTCTTCTGAGATTAGTATTGGGGATGTTTTAAAGACTTTTAAAATTAACGCAAATGGTCTTAAACTAACTATTGCAGATGCTTCAAGGTCGGCAACTGTTTACCATACTCTGAATAAACCAAGTCCTAATGAGCTTGGGATGAGAACTAATGAACAGAATGATGCAAGGTATGCAAGGCTAAGCGTTGGTAATACATTTAAAGCTAAACAGATTATCACAGTAGATGGTGAAGCATTAGCACTTAAAAATACTTCTGATATGCCATCTTTATATATTAGAGGTAAAGATTCAGGAGATAGATTAAAGTGGTACGTTGGATTTAACACAGAAAATAAACTTGGTTTATCTAATAGTGTTACTGGTACAACACTACTATTAGATGATACCGGTATTAACTCAAATAAAAATCTAAATATCACTGGTCAGGTTAAACCCTCTGATTGGTCTAACTTAGATGCTAGATATTTTACTCAGACAGTAGCTAATCAGAGATTTGCACAGTTAGCTGGGAATAACACTTTTAGTGGCACTAATACGTTTAAAAAAGATGTTATCTTTAACTCAGATGTTCCGGTTGTTCTTAAGAACTTAACAGCTAATAAACCATTGTATATTCAGGGTAAGGATTACCAGAATACTAGTTTGTGGTTTGTTGGTAAGGGTGGAACTGGTACTGAGATTAAATTTTATAACTATGCGACTGATACAGTTTTAGAGTTGTCTGAGACGGCTAGATTTAATAAAACTTTGAAGGTTACTGGACAGGTTCAACCGTCTGATTGGGCTAACATTGACTCTAGATACATTCCAGCAGCAACTTTAAGTACTCTTGCAAAAATTAATGCTAAGAATACTTTTTCTCAAGGTCAGATTATTAAGGTTGACGGAGAGGGTATTAGACTTCAGGGGGTAAATGATACTGGTGGTTTGTTCTTGCGAGGTTATACTTCTGATGGTACTAAGAAGTGGTTTATGGGTACTAATGCTTCAGGTAACTTCACTATCAGGGAGATGGTGCTAGGCACTGAACTGTCTCTTAGGGAGAACTATATCCAGTTTAATAAGAATGTAACAATTAATGGGCAGGTTCAACCATCCGACTGGGCTAACCTAGATGCTAGATACTATACAGGTTCAGCAGCAAATGCCAGATATATGTATGCGGAAAGAACTGGTGAAGGTGCTGATGAGGGTGCTATTGCTTGGAATGCTAAGACAGGAGTATATAATGTCAAGACGGGAGCCGCATCATCAAATCTTGTACTTCAGTTCTATCAGGGGTCGGGGTCTATCCCATCTACGCCATCTGCGCAGCTAAGATTTAAATGGGCGAATGGTGGTATGTGGTATAGGACATCAAGAGATGGTAATGGCTTTGAGAAAGGTTGGTCTATGGTGTACACAACTGCACAGAAGCCAACCCCTTCAGATATTGGTGCATATACTAAAGCAGAAACTGACCAGAAAATTGCAACAGCAATTAGTGACTCTACAGACCTGAATAAAATCTATCCAGTAGGTATTGTAACGTGGTTTAACAGTAATGTTAACCCTAATACAGCACTCCCTGGTCTAACTTGGACGTACCTGAATAATGGTGTTGGCAGAACTATTAGAATTGCAGCAGCAAATGGTTCAGATGTTGCTACAACTGGTGGTTCAGATTCTGTAACGTTATCTGTTGGTAACTTACCTTCACACACACACAGTTTCTCTGCTACCACTTCATCATTTGATTATGGTACGAAGGGCACTAATAGTACTGGTGGACATACTCACTCTGTAAGTGGTACAACAAGTGCTGCTGGTAACCATGCTCACCACTTAGGTCTACTATTGGTTAATGGCGGTGATGCTCAGTACGGATATACCACTATTGGTAACAGCAAGACAAGAACTCTTGACTGGCTTGATAGAAGAGATAACAAGTTCCCTAACACTAACACAACTGGTAACCATACACACACATGGTCTGGTACTACAAGCGGTGCTGGTAACCATTCCCACTCTGTAGGCATTGGTGCTCACAGCCACACAGTTAGTGGTAACACTGGTAGTACAGGTTCTGGTTCAGCATTTAGTGTTACTAACCAGTTCTATAAGTTAATGGCTTGGGTAAGAACTGCTTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
76f68f7e47ae6ef8ba1e40ae30e556d973850845363e6b628696bddc54c8e94e
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6951
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete genome sequence analysis of a novel E. coli phage DE7 Cui,J. 2012-12-15 — GenBank