Protein

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Genbank accession
APC43904.1 [GenBank]
Protein name
central tail fiber J
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MGGVVSAITSVFSAFNPVSFAIQMIASAVISKIFAPSPPSQSAQAPEPNPGSRAQTPPGGDNKLPIVYGHAWTGGIVTDLSITTDNQTLYYVFALSEVTNTETGGTPDVITFGDVYWGGKKCVFDATDQTKVLTLLDPSTGESQDVSGYINVYLYSNGSFSPANSTTDAITIMSASNLTYKWNNAKTMTNCAFAIIKLKYSQSRNIVGLSSTNFELTNARKAPGDCFLDYLTSTRYGAAIPVENIDTTSLTALNTYSNQTITYTLYSGGTSTMKRFEFNGTLDTAQKIMKNIQSMADCCDCLVKYNEITGLWGVIVQKPTYTVAMNINDTNMIGAISVSPIDISNSFNIIETKFPDGSQQDSFNAATFDLSEINPSLMFPNEPVNKQSVSLYLTNNSVTAQYIANRMLEAAREDLQIQCEINYIGLELEAGDIVTITNVNYGWSAKLFRIMKVVEKFGDDGTVTATLSLSEYNPAIYDDYNVTEFTPAPNSGLSSPVTFGTVYPPVVIAQYPNTTNPTFTVRIQTSSAGISDYAEIYYSAYQYPSEDQLIFVGTTAIQPVGVPYVNNTYMPDVTLSNIPAGDWYLFTRMVNSLASSNYSLASAKFVWRPTTFQYVEKYLSVAYADNITGTSNFNLNPENRLYYGLCNQSTNSPSITPSQYTWYLANPTFGTDKYLAYSNRTGRKFSFATDNAAYAAGTASFVPLNTNLYDPSTWSSLPFNKNIIDLDQRTGQLIGTGTTTTATGEIAIVNTQNGQVVASLQKFLDFGGPTTFTGDATTLTIDIYGRVVGFSAADSFYMTIDQFTATSGQTVFSVSRSANYILGQCLVYENGILLQESEYTDASGSVTLDTGATLGDDITIISMRAISTNVYYSKMSMSVASVSSNVVTWNSANMPWDIINIGDKITFANTGSPTQYTVTNVNLSTFQITFSATVTGVSAGDSIYFYRAAASSYPVFSRYTDNLTNVGSYIPTEWSFDSGFEIPYINGTALTAYDYNLTSNTFASIPNIFTGDLDIIQFTGNNLTTPTGSIVNMLAYTVIGQTGYSFTSIVNALNIYMNGALLVNGTDYTSTTTDYTLSVTPANNTSIMSQQTFARYGAA
Physico‐chemical
properties
protein length:1099 AA
molecular weight: 119259,48250 Da
isoelectric point:4,34934
aromaticity:0,11920
hydropathy:-0,06142

Domains

Domains [InterPro]
DC_0187
STR
1–892
DC_0187
APC43904.1
1 1099
Architecture
STR
STR 1-892 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Methylophilaceae phage P19250A
[NCBI] 		1913040 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Methylophilaceae bacterium
[NCBI] 		2030816 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Betaproteobacteria > Nitrosomonadales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
APC43904.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KX815270.1 [NCBI]
CDS location
range 14243 -> 17542
strand +
CDS
ATGGGCGGTGTAGTTTCAGCTATAACTTCGGTATTTTCAGCATTTAATCCTGTATCTTTTGCTATTCAAATGATAGCAAGTGCGGTTATATCTAAAATATTTGCGCCTAGCCCTCCTAGTCAATCTGCTCAAGCTCCAGAGCCTAATCCTGGATCTCGCGCGCAAACTCCTCCAGGTGGCGACAATAAACTTCCTATAGTTTATGGACATGCTTGGACAGGCGGCATTGTTACAGATCTTTCTATTACAACAGACAATCAAACTCTTTATTATGTATTTGCTTTATCTGAAGTTACTAATACAGAAACAGGTGGAACTCCTGATGTCATAACTTTTGGCGATGTATATTGGGGTGGTAAAAAATGTGTATTTGATGCAACCGATCAAACTAAAGTATTAACATTGCTTGATCCAAGCACTGGCGAAAGTCAAGATGTGTCAGGATATATTAATGTATATCTTTATAGCAATGGATCATTTAGTCCTGCCAATTCAACTACAGACGCAATAACAATTATGAGCGCATCCAATTTGACTTATAAATGGAATAACGCTAAAACAATGACTAATTGCGCTTTTGCAATTATTAAACTTAAATACTCTCAATCAAGAAATATTGTAGGTCTTTCATCTACTAATTTTGAATTAACTAACGCAAGAAAAGCGCCTGGCGATTGCTTTTTAGATTATTTAACTTCAACTCGATATGGCGCTGCAATTCCTGTTGAAAATATTGATACTACAAGTCTTACTGCTCTTAATACTTATTCAAATCAAACTATAACTTACACTTTATATAGTGGTGGAACATCCACTATGAAAAGATTTGAATTTAATGGAACGCTAGATACAGCTCAAAAGATAATGAAAAATATTCAATCAATGGCTGATTGCTGTGATTGTTTGGTTAAATACAATGAAATTACTGGTCTTTGGGGTGTTATTGTTCAAAAGCCAACATACACAGTGGCTATGAATATTAACGATACTAATATGATTGGAGCTATTTCTGTTAGTCCAATTGATATTTCAAATTCATTTAATATTATTGAAACAAAATTTCCTGATGGTTCTCAACAAGATTCTTTTAATGCAGCTACTTTTGATTTATCAGAAATTAATCCATCTTTAATGTTTCCTAATGAGCCAGTTAATAAACAATCTGTAAGTCTTTATTTAACTAATAATTCCGTAACTGCTCAATATATTGCAAATAGAATGCTTGAGGCTGCAAGAGAAGATTTGCAAATTCAATGCGAAATTAATTATATTGGTCTTGAATTAGAAGCTGGTGATATTGTTACAATTACTAATGTTAATTATGGTTGGTCAGCTAAACTATTTAGAATAATGAAAGTTGTTGAAAAGTTTGGTGATGATGGAACTGTCACTGCAACATTAAGTTTGTCTGAATATAATCCAGCCATTTATGATGATTATAATGTAACTGAATTTACGCCAGCACCAAATTCAGGACTTTCAAGCCCTGTAACATTCGGAACTGTTTATCCGCCTGTTGTTATTGCTCAATACCCAAACACTACTAATCCAACATTTACAGTAAGAATTCAAACATCAAGTGCCGGTATTTCTGATTATGCTGAGATTTATTATTCAGCTTATCAATACCCTTCTGAAGACCAACTAATATTTGTTGGAACTACCGCAATTCAACCTGTTGGCGTTCCTTATGTAAATAATACTTATATGCCAGATGTTACATTAAGCAATATTCCTGCAGGCGATTGGTATTTATTTACTCGTATGGTTAATAGCCTTGCTTCAAGCAATTACTCATTAGCTTCAGCTAAATTTGTATGGCGACCAACTACATTTCAATATGTTGAAAAATACTTATCTGTGGCTTATGCAGACAATATTACTGGCACATCTAATTTTAATTTAAACCCAGAAAATAGACTTTATTATGGATTATGCAATCAAAGTACAAATTCACCAAGCATTACACCATCTCAATATACATGGTATTTAGCTAACCCTACTTTTGGAACAGATAAATATTTAGCTTATTCAAATAGAACTGGTCGTAAATTTAGTTTTGCTACTGATAATGCTGCTTATGCGGCAGGCACAGCTTCTTTTGTTCCTCTTAATACTAATTTATATGATCCTAGCACTTGGTCTTCATTGCCTTTTAATAAAAATATTATTGATTTAGATCAGAGAACAGGTCAGCTAATTGGAACAGGAACAACAACTACTGCAACTGGTGAAATAGCTATTGTAAATACACAAAATGGTCAAGTTGTTGCTTCGCTTCAAAAATTCCTAGACTTTGGTGGACCTACTACATTTACTGGTGATGCTACAACATTGACTATTGATATTTATGGTCGAGTGGTAGGATTTAGCGCGGCTGATTCATTTTATATGACTATAGATCAATTTACAGCGACTTCAGGGCAAACTGTATTTAGTGTATCAAGAAGCGCAAATTATATTTTAGGTCAATGCTTGGTATATGAAAATGGTATTTTATTGCAAGAATCAGAATATACAGACGCTTCAGGAAGTGTAACTTTAGATACTGGAGCTACTTTAGGCGACGATATTACTATTATTTCTATGAGAGCTATTTCTACAAATGTTTATTATTCAAAAATGAGCATGTCTGTAGCAAGTGTATCTTCTAATGTAGTTACTTGGAATAGTGCTAATATGCCATGGGACATTATTAATATTGGCGATAAAATAACTTTTGCAAACACTGGAAGCCCTACTCAATATACAGTAACCAATGTTAATTTATCCACTTTCCAAATAACATTTAGTGCCACTGTTACAGGTGTTTCAGCAGGCGATTCAATTTATTTTTATAGAGCAGCAGCTTCAAGTTATCCTGTATTTAGCAGATATACTGATAATTTAACTAATGTTGGTTCTTATATCCCAACTGAATGGTCTTTTGATAGTGGTTTTGAAATTCCATATATTAATGGAACTGCTTTAACTGCTTATGATTACAATCTTACATCCAATACATTTGCTTCAATTCCTAACATTTTTACTGGTGATTTAGACATTATTCAATTTACAGGAAATAACTTAACCACACCTACCGGAAGCATAGTAAATATGTTAGCATATACAGTAATTGGACAAACTGGATATTCATTTACATCGATTGTAAATGCTTTAAATATATATATGAATGGTGCATTATTAGTAAATGGCACTGATTATACTTCAACAACCACAGATTATACTTTATCTGTAACTCCGGCTAATAATACATCAATTATGAGCCAACAAACATTCGCTCGCTATGGGGCGGCATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
60e03fa3e3db8ea54f508d716c1eb6ed9864e99f04fd2e612e42cf05ecc3a96c
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6187
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Genome characteristics and environmental distribution of the first phage that infects the LD28 clade, a freshwater methylotrophic bacterial group Moon,K., Kang,I., Kim,S., Kim,S.J. and Cho,J.C. 2017 28925542 GenBank