Phage RBP Database

UniProt accession

A0A1D8KKW9 [UniProt]

Protein name

Structural protein

RBP type

TF

Evidence RBPdetect2

Probability 0,59

Protein sequence

MPSVKTNRISTLIESQLPEFISSEYELFGKFVEKYYEAQEVQGGPLDVLSNIQKYANIDYYEKNLLNQKDSIVANVSISDTTILLVDAQSFPEKNGYVRIDDEIIFYESRVGDQLQNCSRGVSGNTKLGDLYNSSNFSSTTAAEHLAGAEVYNISNLFLYAFVRNFENQYLGSFPEKYLRGEVDKRTLIKNIQKFYKAKGTDDSIKFIFNTIISDDVENKPEVYHPREFTYKSSESDWINVYALKVKVVSGNPKDLIGKKIVQTATDEYGYASATVDNVIAQGTIDGEVIWNIVVAPETVNGEFQISTKTKLESSIASSLGVGDRVNVFSTIGWSSIGEILIGNEIIKFSDKTVTQFIIKERSSSVVHPRGEFVYKPVTIEGSDVTLLTLGVVYDALPNVSEPYSFTGDAVQVSQPGFKTADPRIVLTGTNQLRWIKDTGTSVTSNTNTPVEQSLAGVSNNVSAIFADDQYYYITSSSYPSYNIFDGPIITQPVQDQKILRILRKTPVATTEIYKTQKRDVGILLNGVPIYGYKDSESLRFGKLEEIRVDNRGRGYANPPFVVVDGLAGRARAQMVGRVVDSIIVDTDITFPVTPTVEITSGRDGVARAVVTGGEVTSIIVENPGKFYSTPPIVRITDRVGKGRFAEYNTVIDRDGSIVEFIKIAGGSLYTQQNIQVEIISIGSGAEVTPLLKEWNKNRYVNLESNLDKQYGYVFENIDNVLEYGYGQVANPKALRIQLNDNLNSADTEPTNKTHSPILGFAYDGNPIYGPFGHENPLDQSSSIVRMTSSYSLSGSRQDGPSPVEYPLGSFINDYVYSHKSGSLDENNGRFCITPDFPDGTYAYFITINSSQVPQFPYILGDKFYSLPVDSNYTTKINQNDIPKDSKRFFTPGMLGNGDGLVATISEVRSGTVDNIAVDSSSSNFSVNSQLYFNNLGTEGKDASALVSSVKGKGVNYLQSKEDKVVKLTTIQNAFLFVDDTLRQPASGASGSIVGTVSNDNLIVLKNVIGTFNNTGTFSADIKTFILTIDQDSNYTKGAILSLTDGVNPPIATAEILEGTSRQNTVTIKVLSGVWIVDDNYYLQSDNLFNTSGSKIVTLVSLSDNLEPFEVNQSVVLIETTEDHGLAIGDSVDVNIFPDDATKTKTYYIRKRLYQQVTLTPPSNTTTINFNGIGRFSNLNGGADYTAGTYTDIPITGGSGSGAIADITVSAAGVVNSIVITNGGTDYKRGDYLGVDDDQLQRSGASLSSSRLALYVDHAGVSFNSNTIEVKTSKGFAVGDLISIGSEIVEISAINSNTLTVIRSREGTTAADHYNGASLSLYKPRYNFSNNFKITSANGSGYIQSYDLNTQNATIVFDYSIDKRAAEAITLSTSFFDESSQQRLVSIVSAGDIDFKFEFSEDNTTFTPNPNINLQEFYNYVFDTSHSSLIGTYFDMSPSKSYNLLTTEKLATTILPGNSGSSTTVKFGFGPALAQNNYDTKVGTDFLNFYYFDKNNIVNSEGAYLQVINDPLQGTKTLNYVTRNRFVYDVLSTPLWDGSGSISYTTSGQFAIGEIDDIRITNLGQNYKKVPLVVGCDPSEPYRGSATVLFDTAANIITSVNIDNVGSNYVNPKVVITNSDGTGAEFNVIQRNGRLFSITVKSPGIGYTYAPEIIIIESAVNLYAESESIGIPQSVRIINNGAGYHLDKTVASAVTSKYTLALKNFNGVYQKGEILTQTINGVEVSRAVVSEYRQGSNLIKIEKVVGIIRENVSIVGFISGASGVVKKAFITTFNTTTKATYDNLGYYTSDKGRLGAANQKLTDSFFYQDYSYVVKSKTSIEQWRDLIKSTTHPAGFKLFGQVDIETTARSEMPDAGEKKAGTFSIIQLWDPNKNKITVESTKQVTTQTIQTVKNTRIRNGQGSAATSEFNFNETRAFSFTLSAPFDGYFDTDGRLQGTTSFQVLDDTGLPFTPVNAESLIVTLNGVLQEPGVAYTVSGDNIIFSAPPLGPGNKLTGNNISETSPYKGTKFVGRNFYFKDSQYNTRYLRKLRNIFQRNGTWIDAANQIDRNKQFIIEESIGYGKQYYSSLDWSTKLDDYTIDIGYILDAYQHDIRFGGNSKLVDYANIFATSSDYIKNNSAESLSIFKYATNLANLAIRNWDYVEESVVFIQGSKEVTVTNTDNIAIGMTISAGRAYSSDTIVVSIDSRTQVTLSKPALANSGGGGGASSSTTTLSGSSSGSEILGTSVGVVQPGDQYSVNPNDVLQVPISFASTDSATFFFSGINNGTYYDASTLIANNKEYLQEEVSEFVYANYALPVSDKVKCARDLGFLIDDIVYHLRFGGNAKIVEFAQLYYTNRGYPYGEELTYLTGLEVTAAVAAWERLRDLMILAMRNTLTSGTYTSIVPYVDNTVFVDSEFPVCADVESTITTMIDIVKDIIAKGTGVVEIVNINPNKPGYWSATLTYSNYNILPDPLLPSQECNDVISSINSLYNNLDDVLNKLEVAKTLPDYIDGETKEFELYWEDGSSVVTEQDENLLISINAVLQETKYNADYPGDDSYYIDRTVIPNILKFDVAPIWDQYAGARILGEPTAVEKVVGIGVGNYKRMTLDKNLVNNVRTGPFLILDLEDLTVVNVEEPDYLLVFIDGVLQKNIDSYTVSGPNIFFNFPITEQMKVDMRYLYGRDVGQVLNLYDFNTDVYYANGIVTLETVSGLDTFLANNWMGIKRGEPIHAYQINDDGTYNVIGQISNPKTSGSTLSLEVFGFKCDLIQGRDVYFSVARRYEINTIVGLDSSGSSIVYETDNDGRSTLRGTDQNWRGTYWRRTYRNPFINLSINSLIKVEGEDKFRKIKELPAKLTSKEQRNQQQVSNSYFGQVEVQAYNGVTRGEGLSIVAKIENGVVIDLDWNQRSYDPITQPTAYQYYTPPVINFIPENGEGGGARAQVLVSKGQVISVELIEGGSGYTKAPKVVVARRYDVLEETDIGVSLINVAMNLEQSLGLNVISTIDVISNQAASVETITSTLVDSPLIIDTKLVDIITPTPLIPSEFLSANLDEVLTTFHTQQQAAPIDTFYNGTEVYIRINTPYIVDIESSSTLTVSATREITSSVNNVINNTALTNINYFEVGAFLDTTLGINDTVIYVGNTDKFKNNGYLIVGSEIVRYFRKINDRFLNVERGQQNTTAQEWIAGTFLRQIPDPVSVAFSGVTLVESESTVVSVKGGANVGRTERETELQIETPVVNTTISNVIEAQLQPQINVESISSVNTVIVYKLEPALNSVQSFTLSHNETNVGVEIQVVLSDISVTKKQTQVLIFTPPGGVIDGYEESVFITDPINTRLNGFVDLLDDYGVIKRNGVEIFVNNSIFGQTTAYVGNYTTTNAGYVISHYDGIFDDGSAQVSGLTLEELNLYFPALSLKDFSERRDSSYTLAGDKFNLLPPSIQNPVAISSSTGIIGGSIVVQDTTYFPNTGYLFTSGGTVIQYTGKTPTEFTGCTLYSGPNSINATEELVPFTIS

Physico‐chemical properties

protein length:	3494 AA
molecular weight:	383477,19900 Da
isoelectric point:	4,70709
aromaticity:	0,10160
hydropathy:	-0,19347

Domains [InterPro]

Domain ID	Category	Cluster	Start	End	Layer	Name	Pref Zone	Confidence	Evidence	Support
DC_1555	ATT	DC_1555	4	255	Novel HMM	DC_1555	N-terminal	Low	Positional only	41 proteins / 41 hits
DC_0146	STR	DC_0146	501	1060	Novel HMM	DC_0146	Central	Low	Positional only	81 proteins / 81 hits
IPR025924	STR	DC_0819	751	852	InterPro cluster	YHYH domain	Central	Low	Positional only	112 proteins / 112 hits
DC_0891	STR	DC_0891	1232	1757	Novel HMM	DC_0891	Central	Low	Positional only	66 proteins / 66 hits
DC_0085	STR	DC_0085	2037	2494	Novel HMM	DC_0085	Central	Low	Positional only	39 proteins / 39 hits
DC_1338	ATT	DC_1338	2401	3014	Novel HMM	DC_1338	N-terminal	Low	Positional only	78 proteins / 78 hits
DC_2171	RBD	DC_2171	3022	3380	Novel HMM	DC_2171	C-terminal	Low	Positional only	10 proteins / 10 hits

	Name	Taxonomy ID	Lineage
Phage	Synechococcus phage S-CAM4 [NCBI]	1883367	Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Potamoivirus > Potamoivirus cam4
Host	Synechococcus sp. [NCBI]	1131	cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Cyanobacteriota/Melainabacteria group > Cyanobacteriota > Cyanophyceae

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession

AOV59312.1 [NCBI]

Genbank nucleotide accession

KU686200 [NCBI]

CDS location

range 60609 -> 71093
strand +

CDS

ATGCCTTCTGTAAAGACTAATAGAATTTCTACTCTAATTGAATCTCAACTTCCAGAATTCATTTCTTCTGAATATGAACTGTTTGGTAAGTTTGTAGAGAAGTATTACGAAGCACAGGAAGTACAGGGTGGTCCTCTGGATGTTTTAAGTAACATCCAAAAATATGCTAACATTGATTATTACGAGAAAAATCTACTCAACCAGAAAGATTCTATCGTTGCTAATGTTAGCATTAGTGATACAACCATTCTTCTTGTAGATGCTCAGTCTTTTCCAGAAAAAAATGGATATGTAAGAATTGATGACGAAATTATTTTCTATGAAAGTCGCGTTGGTGACCAATTACAGAATTGCTCCAGAGGAGTAAGCGGTAATACTAAGTTAGGAGATTTATACAATTCTTCTAATTTTTCTAGCACAACAGCAGCAGAGCATTTAGCAGGTGCTGAAGTTTATAACATCAGTAATCTATTCTTATATGCTTTTGTAAGAAATTTTGAAAATCAATACCTTGGTTCATTCCCGGAAAAGTATCTTAGAGGAGAAGTAGATAAGAGAACTCTGATTAAAAACATTCAGAAGTTCTACAAAGCAAAAGGAACTGATGATTCTATTAAATTTATTTTTAATACTATTATATCAGATGATGTAGAAAACAAACCAGAAGTATATCACCCAAGAGAATTTACATACAAATCCTCGGAATCTGATTGGATTAATGTATATGCTCTTAAGGTAAAAGTAGTATCAGGAAACCCAAAAGATTTAATTGGTAAGAAAATAGTACAGACTGCAACAGACGAGTATGGATATGCATCTGCTACTGTAGATAATGTTATTGCTCAAGGCACGATTGATGGTGAAGTAATCTGGAATATTGTTGTTGCCCCAGAAACTGTCAATGGCGAATTTCAAATTTCAACAAAAACTAAGTTGGAAAGTAGCATAGCATCATCTCTTGGAGTTGGTGATAGAGTTAATGTATTTTCTACGATTGGATGGAGTTCTATTGGAGAAATTTTAATTGGTAATGAAATTATCAAGTTTTCTGATAAAACAGTAACTCAGTTTATTATTAAAGAAAGAAGTTCATCTGTAGTGCATCCTCGGGGTGAGTTTGTTTACAAACCAGTCACAATTGAAGGTTCAGATGTTACATTACTAACGTTAGGTGTTGTTTATGATGCGTTACCCAATGTTTCAGAACCATATTCATTCACAGGTGATGCTGTACAAGTATCCCAACCTGGTTTTAAAACAGCAGATCCTAGAATTGTTTTAACCGGAACCAATCAACTTAGATGGATTAAGGATACAGGAACATCAGTAACATCAAATACTAATACACCAGTAGAACAATCACTCGCTGGTGTTTCTAATAATGTATCTGCTATTTTTGCAGATGATCAGTATTACTATATCACATCTTCTAGTTATCCATCATATAATATTTTTGATGGTCCTATTATCACACAACCTGTCCAAGATCAAAAAATACTTAGAATCCTTAGAAAAACTCCTGTAGCAACAACAGAGATTTATAAGACGCAAAAAAGAGATGTTGGTATCTTGTTAAATGGTGTTCCCATTTATGGATATAAAGATTCGGAAAGTTTACGTTTTGGAAAACTAGAAGAAATTCGTGTAGATAATAGAGGACGTGGGTATGCCAATCCTCCATTTGTTGTAGTTGATGGTCTTGCTGGGAGAGCAAGGGCACAGATGGTTGGTAGAGTTGTTGACAGTATTATTGTTGATACTGATATCACATTCCCAGTTACTCCCACAGTAGAGATTACTTCTGGAAGAGACGGTGTTGCTAGAGCAGTTGTGACTGGTGGAGAAGTAACTAGTATAATCGTTGAAAATCCTGGTAAATTTTATTCTACACCACCTATTGTAAGAATTACTGATCGTGTTGGTAAAGGAAGATTTGCCGAATATAACACAGTAATTGATAGAGATGGATCTATTGTAGAATTTATTAAAATTGCTGGTGGTTCATTATACACTCAACAAAATATTCAAGTAGAAATTATTTCTATTGGATCTGGTGCTGAAGTAACACCATTGTTAAAAGAATGGAACAAGAATCGTTATGTCAATTTAGAATCAAATTTAGACAAACAGTATGGTTATGTATTTGAAAACATAGACAATGTTCTGGAATATGGATATGGTCAAGTTGCTAATCCAAAAGCACTTAGAATTCAATTAAACGATAATTTAAATTCTGCTGATACAGAACCAACAAATAAAACACATTCTCCCATTTTAGGATTTGCTTATGATGGCAACCCAATCTATGGTCCATTTGGACACGAGAATCCACTAGATCAATCTTCTTCAATTGTAAGGATGACTTCTAGTTATTCTTTGTCTGGAAGTAGGCAGGATGGTCCTTCACCAGTAGAGTATCCATTAGGATCCTTTATCAATGACTATGTTTATTCCCATAAAAGTGGATCTTTGGACGAGAACAATGGTCGTTTTTGTATCACTCCAGATTTTCCTGACGGAACATATGCTTATTTCATTACTATCAACAGTAGTCAAGTACCACAGTTTCCATATATTTTGGGAGACAAATTCTATTCTCTACCAGTAGATAGTAATTATACTACTAAAATTAATCAAAACGATATTCCTAAAGATTCTAAAAGATTTTTTACTCCTGGAATGTTAGGAAATGGTGATGGATTAGTAGCTACTATTTCAGAAGTACGATCGGGAACTGTAGATAATATTGCTGTTGATAGTTCGTCCAGCAATTTTTCTGTCAATTCACAACTATACTTTAATAATCTTGGAACTGAAGGAAAAGATGCTAGTGCATTAGTATCATCAGTTAAAGGAAAAGGTGTTAACTACTTACAGAGTAAAGAAGATAAAGTTGTAAAATTAACAACTATTCAAAATGCTTTCTTGTTTGTAGATGACACATTAAGACAACCAGCAAGTGGAGCATCCGGATCAATCGTAGGAACTGTTTCCAACGATAACTTGATTGTACTTAAAAATGTTATAGGAACGTTTAATAACACCGGAACTTTTTCTGCTGATATCAAAACTTTTATTCTTACTATAGACCAAGATAGCAATTACACCAAAGGCGCTATATTAAGTTTAACTGATGGTGTCAACCCACCTATTGCTACTGCCGAAATTTTAGAAGGAACTAGTAGGCAGAATACAGTTACCATCAAAGTATTGTCTGGTGTGTGGATTGTTGATGACAATTACTACCTTCAGTCAGATAATCTTTTCAACACATCTGGATCTAAAATTGTCACATTAGTTTCTTTGAGTGATAACTTAGAACCATTTGAAGTAAATCAAAGTGTTGTCTTAATAGAAACTACAGAAGATCATGGATTAGCAATTGGAGACTCTGTTGATGTTAACATATTTCCAGATGATGCTACCAAAACTAAAACATATTATATCAGAAAAAGATTATATCAGCAAGTAACACTTACACCACCGTCTAATACAACAACAATTAATTTTAATGGTATTGGAAGATTTTCTAATTTAAATGGTGGAGCAGACTATACAGCAGGAACATATACAGATATTCCAATTACAGGAGGTTCTGGTTCTGGTGCTATTGCGGACATTACAGTATCTGCTGCCGGAGTCGTTAATAGTATCGTTATTACAAATGGTGGTACTGATTATAAAAGAGGAGATTATCTTGGTGTAGATGATGACCAACTACAAAGATCAGGAGCATCTTTAAGTTCTTCTAGATTAGCATTATATGTTGATCATGCAGGTGTTTCATTTAACTCTAATACTATTGAAGTTAAAACTTCAAAAGGATTTGCTGTAGGAGATTTGATAAGCATCGGATCCGAGATTGTAGAAATTTCTGCTATCAACAGCAATACACTAACAGTAATTCGATCCAGAGAAGGAACTACTGCGGCAGATCATTATAATGGAGCATCTCTCTCGTTATACAAACCAAGATATAATTTTTCAAATAATTTTAAAATTACTTCTGCTAACGGTAGTGGGTATATTCAATCATATGATTTGAATACTCAAAATGCTACTATTGTATTTGATTATAGTATTGACAAAAGAGCAGCAGAAGCAATAACATTGAGCACGTCATTCTTTGATGAAAGTAGTCAACAAAGATTAGTATCTATTGTTTCTGCTGGAGACATTGATTTCAAGTTTGAATTCTCCGAAGATAATACTACATTCACACCAAATCCAAATATCAATTTACAAGAGTTTTATAATTACGTATTTGATACTTCACATTCTTCTCTGATTGGAACATATTTTGATATGAGTCCAAGTAAGAGTTATAATTTATTAACTACAGAAAAACTCGCTACTACAATTTTACCTGGTAATTCTGGATCATCAACAACAGTTAAATTTGGATTTGGTCCTGCTTTAGCACAAAATAATTATGATACTAAAGTAGGAACAGATTTCCTCAATTTCTATTATTTTGACAAAAATAATATTGTAAATTCCGAGGGAGCATATTTACAAGTTATCAATGATCCGTTACAAGGAACAAAAACACTTAACTATGTTACAAGAAATCGTTTTGTATACGATGTTTTAAGTACTCCTCTATGGGATGGTTCTGGATCTATTTCATATACCACTAGTGGTCAATTTGCTATTGGTGAAATTGACGATATTAGAATAACAAATTTAGGACAAAACTACAAAAAAGTTCCATTAGTTGTGGGTTGTGATCCTTCAGAACCATATAGAGGTTCAGCAACAGTTTTGTTTGACACAGCTGCTAATATTATTACTAGTGTTAATATAGACAATGTTGGATCCAATTATGTTAATCCTAAAGTTGTAATTACTAATTCTGATGGAACGGGTGCAGAATTTAATGTAATCCAACGTAATGGTAGATTGTTTTCAATTACTGTTAAAAGTCCTGGTATTGGTTACACATATGCTCCAGAGATTATAATAATTGAATCCGCAGTAAATTTATATGCTGAAAGTGA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GAAACGGAGTGGAAATCTTTGTTAACAACTCTATCTTTGGTCAAACTACCGCATACGTAGGAAATTATACAACAACTAATGCCGGTTATGTAATTAGTCATTATGACGGTATTTTTGATGACGGCAGTGCTCAAGTTTCTGGATTGACTCTTGAAGAACTTAATCTTTACTTCCCAGCATTATCATTAAAAGATTTCAGTGAGCGTAGAGATTCCAGTTATACTCTAGCGGGGGATAAATTCAATTTATTACCACCATCTATCCAAAATCCAGTTGCTATCAGTTCTTCTACTGGAATTATTGGTGGTTCGATTGTTGTACAAGATACAACATACTTCCCAAATACTGGATATTTGTTTACCAGTGGCGGAACTGTAATTCAATATACTGGCAAGACACCAACCGAATTTACTGGTTGCACTCTCTATAGTGGACCAAATTCTATCAATGCCACTGAAGAATTGGTTCCGTTTACAATTTCATAA

Protein

Domains

Domains [InterPro]

Domains [InterPro]

Taxonomy

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

Predicted Aligned Error (PAE)

Model Confidence