Protein

View in Explore
Genbank accession
QOI71706.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MYSIKTDLDVSGNQTISKDLLVKGSAVITNNLTVGGTINFANATFTQITVTGTANLADVNSTGTAALNNVQVSGNTTLGDSDADSVTVNGTSTFNAPITAKSNVSIEGNTVVGNASTDTLTVNATSTFAAPATFNNNVTVGDAAADALTVNSTSTFKNNVTVGEDATDTLTINSTTNLKNNVTVGEDATDNLVVNSTSDFKNNVTLGDASTDVLTVNATSNFNNNVVIGSDSADNLTIKSTTQITGDVQITGETELEGLTVNGASNFLSNLSMPTGTTATFQDVVINGTLSGDYTIANGNFTTLTVTGQSNLNSVILSGNVTGTTRSATFQTYNVAGASGVVQFTYNDPARPSDIKSSIEPYKVSSNEFQGQKATVGHVIFGDVTYADYGLTALGKASIDYLDIKGNSTTGTTRAQLTVAGKSVLNDVEFTGSVTGLTVDVTGQDITPNSVVATAGLSSDTLDVAGAATIGNGLTVTGGATFNSPAVVDNTLQVKDLVVTGTTTGVTAEANVDGLDIAPKSVNATTSIKGATVESTGSLTVNGSITSTNTNVAIGKNTVISGTLNSGSISSTGDVSATGNFLGAGASLTGPNTALAVTNNAVIGGRLTVDGNTSFGGSTGTTTIHDLVVTGTTTGVAVVADVDGLDIAPNKVTVSTTLGVTGQSTLGSVSASTLSTSGLATLASATVTGVATAGSLVTSSIGNSTNAVNFTSPVTTSGNLTVGGTLILAGGLDLSDVDIEAKSIHTTEQATFDGDVIVGGQISLSSASVAALTFTATDNVNTNTLPILQSVTATINTADITTLNATGTSTLATASIGTLTGTGTATFAAATVTGAATFNGNITSTNATVAIAKNTAITGNLSVSGTLTPGAVDLSTADVTVKSLTSSGNAHVVGDLTVDGAFDLSATNLVAATLESTGKTTVGADLILTTGVITGAPKISGNTTIAGTLGVTGNTSVSTLSTSGVATLNSAAVTTTLGVSGATTLSTLTTNGLATLNSATVSGALIANGNITLGNASSDTLTVNATSTFAGDVTVNGSFTPAGGLNLGSAALNVASVTTTGAISVGTTLGVTGITTLAAVNSGNHAITGTLSTSGLATLNSASITTTLGVTGNSTMTGTLTVNGSGTSKIQALQVGTGTADTDKVLNVFGDTIITGDLDVTGIINAQIDLTSRDISPRNVTASGNISSAGSLTAATSLTAATAIIGAPSSTNNNLQVNGNVVTNGDFTVTGVINGTLNQTNSDVTFKSVTTSAGVTVGTTLGVTGLSTLAGLNAGNTAITGTLSTSGLATLNSASITTTLGVTGATTLAATSATTLSTSGLATLNSATITGALTANGNTVIGDAAADTLTVNATSNFIGDTTVKNITITGTLTADLSNLTTTSFKTGTYFVAQHAAETVSTATWTPDGTSNVYNVNVTANTSIQPITGVNGAGSWFIYVTQDATGGHTVTWDTAYAIIGGEVNTDPNAVSICQVVYCGIGSKYDVFIAQRP
Physico‐chemical
properties
protein length:1491 AA
molecular weight: 146770,37670 Da
isoelectric point:4,08084
aromaticity:0,03488
hydropathy:0,22602

Domains

Domains [InterPro]
DC_0092
STR
179–484
DC_0092 DC_0092 DC_0931
IPR058970
RBD
1404–1480
IPR058970
QOI71706.1
1 1491
Architecture
STR
STR
RBD
STR 179-484 | STR 780-984 | RBD 1131-1491
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Erwinia phage pEa_SNUABM_47
[NCBI] 		2768774 Uroviricota > Caudoviricetes > Eneladusvirus >
Host Erwinia amylovora
[NCBI] 		552 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QOI71706.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MT939487.1 [NCBI]
CDS location
range 133620 -> 138095
strand -
CDS
ATGTATTCTATAAAAACGGATCTTGACGTATCTGGTAATCAAACGATTTCTAAAGATCTTTTGGTTAAAGGTAGTGCAGTCATTACAAATAATCTTACTGTAGGTGGTACGATTAATTTTGCTAATGCTACATTTACACAGATTACAGTCACAGGTACTGCTAATCTAGCTGATGTTAACTCTACTGGTACTGCTGCATTGAACAATGTTCAAGTTTCTGGTAACACAACTCTTGGTGATTCCGACGCCGATTCTGTTACTGTAAATGGAACATCAACATTTAATGCTCCAATTACTGCAAAAAGTAATGTATCAATTGAAGGAAACACAGTAGTAGGTAATGCTAGTACTGACACATTAACTGTCAATGCAACTTCAACATTTGCTGCACCAGCTACATTCAATAATAATGTAACTGTGGGTGACGCTGCTGCTGACGCATTAACCGTTAACTCTACTTCTACATTTAAAAATAATGTAACAGTTGGTGAAGATGCTACTGATACACTAACAATTAATTCAACAACTAACTTAAAAAATAACGTTACCGTTGGTGAAGATGCTACTGATAATCTAGTTGTTAATTCAACTTCAGATTTCAAAAATAACGTTACTTTAGGTGACGCTAGTACTGATGTTCTAACTGTAAATGCTACATCCAATTTTAATAACAATGTAGTAATTGGGTCAGACAGTGCTGATAATTTAACAATAAAGTCAACGACTCAAATTACTGGAGATGTTCAAATAACGGGCGAAACTGAACTTGAAGGTTTAACTGTTAATGGAGCTTCTAATTTCCTTAGTAATCTTTCAATGCCTACTGGTACAACTGCAACTTTCCAAGATGTAGTTATTAATGGTACTTTAAGTGGTGATTATACTATCGCAAATGGCAATTTTACAACCTTAACAGTAACTGGTCAAAGTAATCTAAACAGTGTTATTCTCAGTGGTAACGTAACTGGTACAACTCGTTCTGCTACTTTCCAAACTTATAATGTTGCAGGTGCTTCTGGTGTTGTTCAATTTACATACAATGACCCAGCACGTCCATCAGATATTAAATCAAGTATTGAACCTTATAAAGTAAGTTCTAACGAATTCCAAGGTCAAAAAGCTACTGTAGGTCACGTAATTTTTGGTGATGTTACATATGCTGACTATGGTCTAACTGCACTTGGTAAAGCAAGTATTGATTATCTTGATATTAAAGGTAACAGCACTACTGGTACAACTCGTGCACAACTTACTGTAGCAGGAAAATCAGTACTTAATGATGTTGAGTTTACTGGTTCAGTGACTGGTTTAACAGTTGATGTAACTGGTCAAGATATTACACCAAACTCTGTAGTTGCTACTGCTGGTCTTTCATCAGATACTTTAGATGTTGCTGGTGCTGCAACTATTGGTAATGGTCTAACCGTAACTGGTGGAGCTACATTCAATAGCCCTGCTGTTGTTGATAATACACTACAAGTAAAAGATTTAGTAGTAACTGGTACAACAACTGGTGTAACGGCTGAAGCAAATGTTGATGGTTTAGATATTGCTCCAAAATCTGTAAATGCAACAACATCAATTAAGGGTGCTACCGTAGAAAGTACTGGTTCTCTAACTGTAAACGGATCTATCACTTCTACTAACACAAATGTTGCAATTGGTAAAAATACCGTAATTAGTGGAACACTAAACTCTGGTTCTATATCTTCTACTGGTGATGTTAGTGCGACAGGTAATTTCTTAGGTGCTGGAGCATCATTAACTGGTCCAAATACTGCATTAGCAGTAACAAATAACGCAGTTATTGGTGGACGATTAACAGTTGATGGTAATACTTCATTCGGTGGAAGCACAGGAACAACAACTATTCACGATCTTGTAGTAACTGGTACAACAACTGGCGTTGCTGTAGTTGCTGATGTGGATGGTTTAGATATTGCTCCTAATAAAGTTACAGTTTCAACCACTTTAGGCGTAACTGGTCAAAGTACATTAGGTTCTGTTTCAGCTTCTACATTAAGTACTTCTGGATTAGCAACATTAGCATCTGCAACCGTAACTGGTGTAGCTACTGCGGGTTCTTTAGTAACTTCAAGTATCGGAAATAGTACTAATGCAGTAAACTTTACTTCTCCAGTGACTACTTCTGGTAATTTAACAGTTGGTGGAACATTAATTCTTGCTGGTGGTTTAGATCTATCAGATGTAGATATTGAAGCTAAATCTATTCATACTACAGAACAAGCAACTTTTGATGGTGACGTAATTGTTGGTGGACAAATTAGTTTAAGTTCAGCCAGTGTTGCGGCTCTTACATTCACAGCTACTGATAATGTTAATACAAACACATTACCAATATTGCAAAGTGTTACTGCAACAATCAATACTGCTGATATAACTACATTAAATGCTACTGGTACAAGTACTCTTGCAACTGCTAGTATCGGTACACTAACTGGAACCGGTACAGCGACTTTCGCTGCTGCAACAGTAACTGGTGCTGCAACATTTAACGGAAATATTACTTCAACGAATGCAACTGTAGCAATCGCTAAGAATACTGCAATTACTGGTAACTTATCAGTATCTGGTACTCTAACCCCTGGTGCGGTAGATTTAAGTACTGCTGATGTAACTGTTAAATCATTAACATCTTCTGGTAATGCTCATGTTGTTGGTGACCTAACTGTTGATGGTGCATTTGATTTAAGTGCAACAAATCTAGTAGCTGCAACATTAGAAAGTACTGGTAAAACTACCGTTGGTGCAGATTTAATTCTAACTACTGGTGTTATCACAGGTGCTCCAAAAATCTCTGGAAATACAACAATTGCCGGAACATTAGGTGTAACTGGAAATACTTCTGTAAGTACTCTAAGTACTTCTGGTGTAGCTACTTTAAATAGTGCTGCGGTAACTACAACTTTAGGTGTATCTGGAGCAACAACTCTAAGTACTTTAACTACTAATGGGTTAGCTACTTTAAATAGTGCTACTGTATCTGGTGCATTAATTGCAAATGGTAATATTACTCTAGGTAATGCAAGCTCTGATACTTTAACTGTTAATGCTACAAGTACTTTTGCTGGAGATGTAACTGTTAATGGTTCATTCACCCCTGCTGGTGGATTAAACTTAGGTTCTGCTGCGTTGAATGTTGCTTCAGTAACCACAACTGGTGCAATTTCTGTAGGAACTACTTTAGGTGTAACTGGTATTACAACACTTGCTGCTGTAAATTCTGGTAACCATGCAATCACTGGTACTCTAAGTACTTCTGGTCTAGCTACATTGAATAGTGCCTCTATTACAACTACTTTAGGTGTAACTGGTAATAGTACAATGACTGGTACTCTAACTGTTAATGGATCTGGTACTTCTAAGATTCAAGCATTACAAGTTGGTACTGGTACTGCTGATACTGATAAAGTTCTAAATGTATTTGGTGATACAATCATCACTGGTGATTTAGATGTAACTGGTATTATAAACGCACAGATTGACTTAACATCACGTGATATTTCACCACGTAACGTAACTGCTTCAGGAAATATTAGTTCTGCTGGTTCATTGACCGCTGCAACTTCTCTAACTGCTGCAACAGCAATCATTGGTGCACCATCAAGTACAAATAACAACCTACAAGTTAACGGTAACGTAGTAACTAATGGTGACTTTACAGTAACTGGTGTAATTAATGGTACATTGAATCAAACCAATTCTGATGTAACTTTTAAATCAGTAACTACATCTGCTGGTGTAACAGTAGGAACTACATTAGGTGTAACTGGTTTAAGTACATTAGCTGGATTGAATGCTGGAAATACTGCAATTACTGGTACTCTAAGTACTTCAGGATTAGCAACACTAAACAGTGCTTCAATCACCACTACATTAGGTGTAACTGGTGCAACTACATTAGCTGCAACATCTGCAACCACTTTGAGTACTTCTGGTCTAGCTACATTGAATAGTGCTACAATTACTGGTGCATTAACCGCTAATGGTAACACTGTTATTGGTGATGCGGCGGCAGATACATTAACTGTTAATGCTACAAGTAACTTTATTGGTGATACTACTGTTAAGAATATTACAATCACTGGTACTTTAACTGCTGATTTATCTAACTTAACAACAACATCATTCAAAACTGGAACATACTTTGTTGCTCAACATGCTGCTGAAACAGTAAGTACTGCAACTTGGACTCCAGATGGTACTTCAAACGTTTATAACGTAAACGTTACTGCAAATACCTCAATTCAACCAATTACTGGTGTGAATGGTGCAGGTTCATGGTTCATCTATGTAACACAAGATGCTACTGGTGGACATACTGTAACATGGGATACTGCTTATGCAATCATTGGTGGTGAAGTTAATACTGATCCAAACGCTGTAAGCATCTGTCAAGTAGTGTACTGTGGTATTGGTTCTAAATATGATGTGTTCATTGCACAACGTCCATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
5bab3b8956cb3f736edd06bbaa1b5b21e047b439efbb84257e53ef3c351d268e
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,6133
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete genome sequence of Erwinia phage pEa_SNUABM_47 Kim,S.G., Lee,S.B. and Park,S.C. 2021-01-07 — GenBank