Protein
View in Explore- Genbank accession
- AAK83249.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein and host specificity
- RBP type
-
TF
- Protein sequence
-
MQIWIHDKSMRKVCALNNEIPGMLPYTNSQWHQYLEYSTSTLDFTIPKFVNGKLHDDIKYINDQMYVSFYYDNSYHVFYVSQLVENDFSFQVTCNNTNLELAAEIERPLASVDGAKTLEWYLQTLDLLGFAGLEVGFNEIPDRTRTITFESQNGTKLEQLHSLMNQFDAEFVFRTDLNRDGTLKKFVIDIYQRPDENHHGIGKVRGDVTLYYQTGLKGVQVTSDKTQLFNAGYFVGKDGLTLGSVVFEEKNELGQVEFYSFKDSPMVYAPLSADKYPSHMNTTNEDRWTRRDFQTEYSDVDSLKAYALRTIKQYAYPLMTYTVSVQSSFIENYKDINLGDTVKIIDNNFRGGLALEARVSEMIISFDNPTNNSVVFTNFRKLDNKPSSELQQRIDEIVSKSLPYHVEIRTTNGTVFKNGIGRSTVKPVLKQGDKIVDATYRFVIDGTIKYSGMTYDMVASEINQPTTLTISAWVDNKEVASEEVTFVNVSDGKQGPKGDQGIPGPKGADGKTPYVHFAYADSADGQKGFSLTQTGSKRYLGVYTDFNQAGSTNPADYTWSDTAGSVSVGGDNLITNSSFPKNLDGWGYYEEGEPNSNLHISTHEFYYNGARKLFRLNNNGKEEVPAASRRFKVKRNTDYSFNILIFATWNIHSVDIYFLGRKANETKTFTKVVNLKTHTGSPSVTQAVKWHLTFNSGECDEGFIRIDNNGTTDGKTSMLFFAELDCYEGTTDRSWQASPEDLKDEIDTKADNALTQAQLNKLSEINSVMKAELEAKASLATINQWIKAYQDFVNANSADRAQAQKALADASARVVKLENNLNDMSERWNFIDNYMAASNDGLVIGKKDNSSSIVFNPNGRISMFSAGNEVMYISKGVIHIENGIFSKTIQIGRFREEQDFINPDRNVIRYAGGI
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 914 AA molecular weight: 103079,69680 Da isoelectric point: 5,34005 aromaticity: 0,11379 hydropathy: -0,50011
Domains
Domains [InterPro]
DC_0002
STR
1–914
STR
1–914
IPR010572
ENZ
141–381
ENZ
141–381
1
914
Architecture
STR 1-914
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Streptococcus phage DT1.2 [NCBI] |
152557 | No lineage information |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AAK83249.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
AF348743.1
[NCBI]
CDS location
range 163 -> 2907
strand +
strand +
CDS
ATGCAAATCTGGATTCATGATAAAAGTATGCGTAAAGTGTGTGCTTTGAATAATGAAATTCCCGGAATGTTGCCATATACGAACAGTCAATGGCATCAATATCTTGAATACTCAACAAGCACGCTTGACTTCACAATTCCTAAGTTTGTAAATGGAAAACTTCACGATGATATTAAATACATCAATGATCAAATGTATGTGTCGTTTTATTATGATAATTCCTACCACGTTTTCTATGTATCGCAACTCGTTGAAAATGATTTTAGTTTTCAAGTGACTTGTAACAATACCAACTTGGAACTAGCAGCAGAAATAGAGCGGCCGTTAGCTAGTGTTGACGGTGCTAAAACACTTGAGTGGTATCTTCAAACCCTTGATTTACTTGGTTTTGCTGGCCTTGAAGTTGGTTTCAATGAGATTCCTGATAGGACAAGAACTATCACGTTTGAATCACAAAATGGTACAAAACTAGAACAGCTTCATAGCTTGATGAATCAATTCGATGCAGAGTTTGTTTTTCGTACAGATTTAAACCGAGATGGTACTTTAAAAAAATTTGTCATTGACATTTACCAACGACCAGATGAAAACCATCACGGCATTGGAAAGGTTCGAGGGGATGTAACTCTTTACTATCAAACAGGTTTGAAAGGCGTTCAAGTTACTAGTGATAAAACGCAACTATTTAACGCTGGATATTTTGTTGGAAAAGACGGACTAACGCTAGGAAGCGTTGTGTTTGAGGAAAAGAATGAGCTAGGACAAGTAGAGTTCTACTCATTTAAAGACAGTCCGATGGTTTACGCACCTTTATCAGCAGATAAATATCCATCACACATGAATACTACCAATGAAGATAGATGGACACGTAGGGACTTTCAAACAGAATACAGTGATGTTGATTCCCTCAAAGCTTATGCCTTACGTACTATCAAGCAGTATGCTTATCCACTAATGACTTATACTGTCAGCGTTCAATCTAGTTTCATTGAAAACTACAAGGATATTAATCTAGGTGACACTGTTAAAATCATCGATAATAATTTTAGAGGTGGTTTAGCCCTCGAAGCGCGTGTATCTGAAATGATTATCAGCTTTGACAATCCCACAAACAACTCGGTTGTTTTTACTAATTTCAGAAAATTGGATAATAAACCGTCTAGCGAATTACAACAACGTATCGATGAGATTGTTTCTAAGTCATTGCCATATCATGTTGAGATAAGGACCACGAATGGTACAGTATTTAAGAATGGTATTGGTCGTTCTACTGTTAAACCAGTTTTGAAACAAGGCGATAAAATTGTTGATGCAACTTATCGATTTGTGATTGACGGTACTATTAAATATTCAGGTATGACCTATGATATGGTAGCATCAGAGATTAACCAACCAACCACGCTTACTATCTCAGCTTGGGTAGATAATAAAGAAGTAGCTTCAGAAGAAGTTACTTTTGTAAATGTATCAGATGGTAAACAAGGACCTAAAGGTGACCAAGGAATACCAGGTCCAAAGGGTGCTGACGGGAAAACACCTTATGTTCACTTTGCTTATGCCGATAGTGCCGATGGTCAAAAGGGTTTCAGTTTGACACAGACTGGAAGTAAACGCTATTTAGGTGTGTACACCGATTTCAATCAGGCGGGCAGCACTAACCCAGCTGATTATACTTGGAGTGACACGGCTGGCAGTGTTTCGGTTGGTGGTGATAATTTAATCACTAACTCATCTTTCCCAAAAAATCTTGACGGATGGGGTTATTATGAAGAAGGAGAGCCTAATAGCAATCTTCATATAAGTACACATGAATTTTATTACAACGGTGCAAGAAAACTATTTAGACTAAATAATAACGGCAAGGAGGAAGTTCCTGCTGCATCAAGACGTTTTAAAGTTAAACGCAATACAGATTATTCGTTTAATATTCTGATATTTGCAACCTGGAACATCCATAGTGTTGATATCTATTTTTTGGGTCGGAAGGCGAATGAAACTAAGACATTTACTAAAGTGGTCAACTTAAAGACACATACAGGTTCACCATCGGTTACACAAGCTGTTAAATGGCATCTAACATTTAACTCTGGAGAGTGTGATGAAGGGTTCATTCGTATTGATAACAATGGCACTACTGACGGTAAAACTTCTATGCTATTTTTCGCAGAACTAGACTGCTATGAGGGTACTACTGATAGATCGTGGCAAGCGTCACCGGAAGACTTAAAGGACGAGATAGACACTAAAGCTGACAATGCATTAACGCAGGCTCAGCTTAATAAATTAAGTGAAATTAATTCGGTGATGAAAGCAGAGCTCGAAGCAAAAGCATCCCTTGCCACTATTAATCAATGGATTAAGGCTTATCAAGATTTTGTTAATGCAAACAGCGCAGATCGCGCACAAGCTCAAAAGGCTTTGGCAGATGCCAGTGCACGAGTAGTGAAACTAGAAAATAACTTAAACGATATGTCAGAGCGTTGGAATTTTATCGATAACTACATGGCAGCATCAAATGATGGTTTGGTTATCGGGAAGAAAGATAACTCTAGCTCTATCGTGTTCAACCCAAACGGTCGTATATCAATGTTTTCAGCTGGTAATGAGGTAATGTATATCTCTAAGGGTGTGATTCACATTGAAAACGGTATTTTTTCTAAGACTATTCAAATTGGACGATTCCGAGAAGAACAAGATTTTATTAATCCGGATCGCAACGTCATCCGCTATGCAGGAGGTATTTAA
Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
d23af689effc8d1841545d5be1e788cf6837fdeaf4eac4a7dbe07cbefff5a510
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50