Protein

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Genbank accession
XPN41237.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,83
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKTAGARPAASVLAEGELAINLKDRTIFTKDDSGNIIDLSISAGGNINGNITQTGDYTQTGKFNLIGPQIIASGGYIEFNYRTTGSGAWSGQHTAKAPIFVDLSSATSTSEYNPIIKQRFKDGTFSLGTLVSEGSLKIHYIDETGQSKYWTFARSGNFQVDSGNLLVSGGYLVAQSNIETRTGSLIGPSVVTKNISFDTKAFGQYDSQSLVQYVYPGTGETNGINYLRKFRAKSGGTIYHELASAQTGKSDELSWWTGNTAVNKQMGLRNDGSLVLRRSLAIGTITTDENINNYGSTGAMGECYIVIGDAATGISYKRSGVYDLVANGLSIASITPDSFRSTRKALFGRSEDQGATWIMPGTNAAFLSVQTQADENSAGDGQTHIGYNSGGKMNHYFRGKGKTNINTQEGMEVNPGILKLVTGANNVMFYADGGITSVKQLSIYNGIYLAANNSTAGLTFAPTTTIDGTKQIMWEGGKRAGQNKSYVTVKAWGNSFNASGDRNRETVFEVADGQGYYFYSQRVAPSGSETTGPVVTQFAGAVNARGSIITDGSFKVNGLSTLVGNVTMSNGLFVQGGSSITGQVKIGGTADALRIWNAEYGAIFRRSESNLYIIPTLKDAGESGGISNLRPLIIELNTGTVKMSHDVHLGDSGSGTGLLQVSNSLKTIKMICPVTINERNAALTLDSPSSSSANYLQGSKAGTRSWYVGLGGAGNDLSLYSQSYGHGLVISDNFVSITKPFKVGNAQLGTDGNITSGSGNFANLNTTLNRKVNSGFITYGATAGWYKFATVTMPQSTSTVFFKIAGGSGFNSGLFTQCNIAEIVLRTSNERPADLNAVLYTRTIAAAFKNIAVNNVSGDTYDIYVYAGTYCNQLTCEWSCTENATVSVIGINSSTQSPVDALPDTAVDGQVANVLNNLVDRGKVKRYEADSEIAINNQTGIRIRSNSDKTGSVATMLRNDGSSFYILFTDKNATDGEATVNGDWNSKRPFAINLTTGEVLMNNGIAVRSAALFYNSINVKDNGSINFDKSGANPRNMRIFHAGDASRGNRIEIADETNYIAYFEKAPGGANRFVVNNATVAGVNQMNSFGININNALGGNSIAFGDSDTGIKQNGDGLLDIYANSVQVFRFQNGDLYSYKNINAPNVYIRSDIRLKSNFKPIENALDKVEKLNGVIYDKAEYIGGEAIETEAGIVAQTLQDVLPEAVRETEDSKGNKILTVSSQAQIALLVEAVKTLSSRVKELESKLM
Physico‐chemical
properties
protein length:1260 AA
molecular weight: 134554,32690 Da
isoelectric point:7,88005
aromaticity:0,08651
hydropathy:-0,25103

Domains

Domains [InterPro]
DC_1954
STR
1–1259
DC_1954
IPR048390
ATT
509–645
IPR048390 G3DSA:6.20.80.10 IPR030392
IPR048388
ATT
694–766
IPR048388 IPR030392 Coil
XPN41237.1
1 1260
Architecture
STR
ATT
STR
ATT
STR
STR 1-508 | ATT 509-645 | STR 646-693 | ATT 694-766 | STR 767-1259 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
XPN41237.1
1 1260
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 302 302 0,1123
Central domain 303 508 207 0,6487
C-terminal 509 1260 751 0,5676
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-302
Central
303-508
C-terminal
509-1260

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Shigella phage SP21535
[NCBI] 		3384871 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Shigella sonnei
[NCBI] 		624 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XPN41237.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ615101 [NCBI]
CDS location
range 151485 -> 155267
strand -
CDS
ATGGCTACTTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAAGCAAAACCGCAGGTGCACGTCCTGCTGCTTCAGTATTAGCCGAAGGTGAATTGGCTATAAACTTAAAAGATAGAACAATTTTTACTAAAGATGATTCAGGAAATATCATTGACTTAAGCATTTCCGCTGGCGGTAATATCAATGGAAATATCACTCAAACTGGTGATTATACACAGACTGGAAAATTTAATTTAATTGGCCCGCAGATTATAGCAAGTGGTGGATATATTGAGTTTAATTATCGTACTACTGGAAGTGGGGCTTGGTCCGGTCAACACACTGCAAAAGCTCCAATTTTTGTAGATTTAAGCTCAGCTACTTCCACATCTGAATATAATCCTATAATTAAACAGCGCTTTAAAGATGGAACTTTTTCATTAGGTACTTTAGTTTCTGAAGGTTCGTTAAAGATTCATTATATTGATGAAACTGGTCAATCTAAATATTGGACATTTGCGCGCTCAGGTAATTTTCAAGTTGATTCTGGTAATTTATTAGTATCTGGTGGATATTTAGTCGCTCAGAGTAATATTGAAACAAGAACAGGTTCTTTGATTGGTCCATCTGTTGTAACTAAAAATATTTCATTTGATACGAAAGCGTTTGGACAATACGATTCGCAGTCATTAGTTCAATATGTTTATCCTGGAACTGGTGAAACAAACGGAATTAATTACCTTCGTAAATTCCGTGCAAAATCTGGTGGTACGATTTATCATGAATTAGCTTCTGCACAAACCGGAAAAAGTGATGAACTGTCTTGGTGGACCGGTAATACAGCCGTTAATAAACAAATGGGCCTTCGCAATGATGGGTCTTTAGTATTGCGACGCTCACTCGCAATTGGTACAATTACAACAGATGAAAACATTAATAATTACGGCTCCACTGGAGCAATGGGTGAATGCTATATAGTCATTGGAGATGCCGCAACTGGTATATCATATAAAAGATCTGGTGTATATGATTTAGTTGCTAATGGTCTTTCTATCGCGTCTATTACTCCTGACAGTTTCCGTAGTACTCGTAAAGCATTATTTGGACGTTCAGAAGACCAAGGTGCAACTTGGATTATGCCAGGTACGAATGCTGCATTTTTATCAGTTCAAACACAGGCTGATGAAAACTCTGCTGGAGATGGTCAAACCCACATTGGATATAACTCTGGCGGTAAAATGAACCACTATTTCCGTGGTAAAGGAAAAACTAATATTAATACTCAAGAAGGCATGGAAGTTAACCCGGGTATTCTTAAACTAGTAACCGGTGCAAATAATGTAATGTTTTATGCTGATGGCGGTATTACATCTGTTAAGCAGCTTTCAATATATAACGGCATATATTTAGCAGCTAATAATTCTACTGCTGGGCTGACATTCGCTCCAACTACTACAATTGATGGTACTAAGCAAATCATGTGGGAAGGCGGTAAGCGTGCTGGTCAAAATAAAAGCTATGTAACCGTTAAAGCGTGGGGTAATTCATTTAACGCATCTGGCGATCGTAATCGTGAAACAGTTTTTGAAGTAGCTGACGGACAAGGTTATTATTTTTATTCCCAGCGTGTAGCCCCAAGCGGCTCAGAAACTACTGGTCCTGTTGTAACCCAGTTTGCTGGAGCTGTTAATGCTAGAGGAAGTATTATTACTGACGGAAGTTTTAAAGTTAATGGATTAAGCACTTTAGTCGGTAATGTTACCATGTCTAATGGTTTGTTTGTCCAAGGTGGTTCTTCTATTACTGGACAAGTTAAAATCGGCGGAACTGCTGATGCATTAAGAATTTGGAATGCCGAATATGGTGCTATTTTCCGTCGCTCAGAAAGTAATCTTTATATTATCCCGACTCTTAAAGATGCTGGAGAATCTGGCGGTATAAGTAATCTTAGACCATTGATAATAGAACTGAACACCGGCACAGTTAAAATGTCGCATGATGTTCATTTAGGAGATTCTGGATCTGGTACAGGATTATTACAAGTAAGTAATAGTCTTAAAACTATTAAAATGATATGTCCAGTAACTATTAATGAACGTAATGCAGCGCTTACTCTAGATTCTCCTTCATCTTCTTCTGCTAATTATTTGCAGGGTTCTAAAGCTGGAACTAGATCGTGGTATGTTGGTCTTGGTGGTGCTGGAAATGATTTATCACTTTATAGCCAATCTTATGGACATGGTCTTGTTATAAGTGATAATTTCGTGTCAATCACTAAACCCTTTAAAGTCGGAAATGCCCAACTAGGAACTGACGGTAATATTACTAGCGGTTCAGGAAACTTTGCTAACTTAAACACCACGCTAAATCGTAAAGTTAATTCTGGATTTATTACTTATGGAGCAACTGCTGGATGGTATAAGTTTGCAACAGTAACAATGCCACAATCCACTTCTACGGTCTTCTTTAAAATAGCCGGTGGTTCTGGATTTAATAGTGGATTATTCACACAATGCAATATTGCTGAAATTGTTTTACGTACTAGTAATGAAAGACCTGCTGACTTAAATGCTGTATTATACACAAGAACAATTGCAGCTGCATTTAAAAATATTGCAGTTAATAACGTCTCTGGAGATACATATGACATTTATGTTTATGCCGGAACATATTGCAATCAATTAACTTGTGAATGGTCATGTACCGAAAATGCTACTGTTAGCGTTATTGGTATTAACTCATCTACCCAATCACCTGTGGATGCTCTTCCAGATACAGCAGTTGATGGGCAAGTTGCTAATGTTCTTAATAACTTGGTTGATCGCGGCAAAGTTAAGCGTTATGAAGCCGATTCTGAAATAGCTATTAATAACCAAACTGGTATTCGTATTAGAAGCAACAGCGATAAAACTGGTTCTGTTGCTACAATGCTACGAAATGATGGCAGTAGTTTTTATATTCTGTTTACAGATAAAAATGCCACCGATGGCGAAGCAACTGTTAACGGTGATTGGAATAGTAAGCGTCCTTTCGCAATTAACTTAACAACAGGCGAAGTATTAATGAATAACGGCATAGCTGTTCGCAGTGCTGCTTTATTCTATAATAGCATAAATGTCAAAGATAATGGTTCTATTAACTTTGATAAGTCTGGTGCTAACCCAAGAAATATGAGAATATTTCATGCTGGCGATGCTTCTCGTGGTAACCGTATTGAAATTGCCGATGAAACTAACTATATTGCTTACTTTGAAAAAGCTCCAGGTGGAGCTAACCGTTTTGTAGTAAATAATGCTACTGTAGCTGGTGTTAACCAAATGAATTCATTTGGTATTAATATCAATAACGCACTTGGTGGAAATAGTATAGCATTTGGCGATAGCGATACTGGTATTAAGCAAAATGGCGATGGATTATTAGACATATATGCGAACAGTGTACAAGTATTCCGTTTCCAAAACGGTGATTTGTACTCATATAAAAATATAAATGCTCCAAACGTTTATATTCGTTCTGATATTCGTTTAAAATCCAACTTTAAACCTATCGAAAATGCACTTGATAAAGTTGAAAAACTTAACGGTGTCATTTACGATAAAGCTGAATACATCGGTGGAGAGGCAATTGAAACTGAAGCAGGTATTGTGGCTCAAACGTTGCAAGACGTTTTACCAGAAGCCGTCCGTGAAACAGAAGATAGCAAGGGTAATAAAATACTCACTGTTTCTTCTCAAGCCCAGATTGCTCTTCTGGTTGAAGCTGTGAAAACACTTTCTTCTCGTGTAAAAGAACTTGAATCTAAACTTATGTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
b27656cbead27be394df9b1f6413033938f1d4fd8dbbfb289551ddd1bf46e848
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2730
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50