Protein

View in Explore
Genbank accession
AXF41244.1 [GenBank]
Protein name
YadA domain-containing structural protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
Protein sequence
MANRIQLRRGGAQEWANSNPTLAQGELGIELDTGRFKIGDGVSAWNTLRYERPVESTSNTANTLVQRDADGNFSAGTITSTVIGNSSTASRLASSRQIQLSNEVTASGVFDGSQNLNLSAELALVSTLPHYDGTSSPSATYNKVTVDAKGRVTNAQDFTASNNGTLADYGLDGTNEGTSAQPYDLDLVALAGLTTTGMISRTASNTVATRAITGTATRISVSEGAGISGNPTIDMITTAVTAGNYNTESLTSVSGAGGNGEPFGTATVNATKFTVDAYGRLTSATNVPIATAAEGSKYASYNAGTTYVRYDIIANASKVYQAITGIAAGAGAPTHSSGDSGGWRYLAAEATEQKGLASFAQEDFDVDANGHVTIATAGVDNTQLQNNKLIFTDGNAVENFELDNELTTSTANTGFNKLNFIKINNTSGGLLFGANNTGDSGAGEIDVNVRSYFSDPDITLDGSVAQTLNKTGDGNLTFTTTQNSSSARSLTVSASNSGSGTSTVTITAEDVVDIDASDSNGKVHVEDSRFQDNYIATSNATMHLDPGDDRATSGLVRVHGDLQVDGTTTTINSTVTTIDDPIITLGGDTAPGSDDNKDRGVEFRYYDNQARIGFFGYDDSYTDLGGHVGGFTFLHNATNTSEVFSGTASGITAGNLKLTTNTNSTSNTTGDLVVAGGVGIGDDVNIGGLLDVDGTFRANSTSRFDDNIVFQGASKTLSLNNGSGTTKIQLHTTTGNVEIGGILTNTGAIDANSTLNVAGIVRFEDTDEPTVAQNGGTGLYEIQSNDYGAFRFDGGGYVEGDTVFNSDVFINGVLNQRDSATESFGNRNYLNIRYKLRSGSSAAYTPSYASDNTSNLRIFGGAGIQTDLHIGDDLYIGKLNSGDSVSFQVLGESGNTTTQGTLTVEGQATINDSLIVNASNENFKIQNGSAADKFTVDTDNGNTVIQGSLNVNGVTDIDADFAVRNGTTDKFFVDNVTGNTNIEGTLTADGHTELNSTLNVDNNTTLGSQLTVTGNSEFNGTVDVDANFAVRSGTTDKMTVASSTGNIATDGTLTVQGETQIIDSLIINASNEEFAVQNGSGVDKFTVDTDNGNTNIIGTLTVADATQINNTLGVSNVVTLTRNTQQTLTGSYSADGAFKLTGGAGIGKNLAVGEGLRVYGGTELTGALDLNNSADISGALVTHDDVTITADNKMFKVQNASAANKFTVDTDNGNTDIQGTLDVAGDVTASSDLTVTGNLTVNGTTTTVNSTVTTIDDPVITVGGDTAPASNDGKDRGIEFRYYDGSAKIGFFGFDRSSSQFQFLTSATNTSEVLSGTDGALRAGSLNLTGAGTSLDVDANANIDGTLTVDGQIISQVSSGPALVIPTTDKINNLNADLLDGATTATAATASTVVLRDSSGDFAANQITAASAAGSGAGFLGNASTADAWKTARTLTISGVVSGSVVIDGSENETLTTTYVDADITALAAMSGTGYVVRTAANTYAQRTLQVTASSGITLTNADGVSGNTTINVASASSNSANNLVLRDGSGNFAAGTITAALTGNVTGNVTGNVTGQVSDISNHDTGDLTEGSNLYYTNERVDDRVNALITAGTGITKVYDDAANTYTLTVTQSDINTDNVTEGSTNLFTTAARTRTHFTYGTGITHSSGTLSVTQSDINTDNVTEGSTNLFTTAARTRTHFTYGTGITHSSGTLSVTQSDINTDNITEGSTNLFITNERVDDRVNALTVAGTGVSKTYDDAAGTLTLAVDFSEFNTGNITEGSNLYFTNTRADARADLKVAAATGSNLDLSSKSTSDLSEGTNQYYTETRVQAKLDNAYEQLRAMLTNLATSTTLNLNLSGDPTPGAVVTTGVSVGGGGGFTAGTAVATSGSATGSGLTVDTTVDSDGNITAAAVNAGGSGYLITDTVTVTNPNAGKILTLNLATLSGGTGYSSATGVAVTGGDGSSATVDITASAGAITNVTVNNGGTGFAAGNTITIANANATGVKTLGSISAAGSGYSTGTAIATSASASGSGATLNITSVNASGGITGVAINDDGSGYAASEVLTITNANASGIATVGNIGAADASRTAGTYNLGTSDYGTEASGANATFTVVVDSNGAASITVTDDGSGFIANETITVADAQLGGGGGAALTFDVTAIHGSTATVPVSAIHGNGATVNVATVATNATLTLTDITTMEVGATVTGATSGTTGVITALGTNQITVNTVDGFFKKGEVVSANDVTTLTISSFS
Physico‐chemical
properties
protein length:2236 AA
molecular weight: 227007,39000 Da
isoelectric point:4,20065
aromaticity:0,05590
hydropathy:-0,15523

Domains

Domains [InterPro]
SSF69349
STR
4–247
SSF69349 DC_1607 DC_1607 DC_0029 DC_0029
IPR041352
ATT
5–43
IPR041352 DC_1617 DC_0029
AXF41244.1
1 2236
Architecture
ATT
STR
STR
STR
RBD
RBD
ATT 4-43 | STR 44-247 | STR 343-1067 | STR 1118-1538 | RBD 1727-1997 | RBD 2090-2236
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Cyanophage S-TIM4
[NCBI] 		1048189 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Thaumasvirus > Thaumasvirus stim4
Host Synechococcus sp.
[NCBI] 		1131 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Cyanobacteriota/Melainabacteria group > Cyanobacteriota > Cyanophyceae

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AXF41244.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MH512890 [NCBI]
CDS location
range 95209 -> 101919
strand +
CDS
ATGGCAAATAGAATTCAATTAAGAAGAGGTGGCGCACAGGAATGGGCGAACTCTAACCCGACTCTTGCACAAGGTGAATTGGGTATCGAACTTGACACGGGTCGTTTTAAGATCGGTGATGGTGTATCTGCATGGAACACCTTAAGGTACGAACGTCCTGTAGAGTCTACATCTAATACTGCAAATACTTTAGTCCAAAGGGATGCTGATGGTAACTTCTCTGCAGGTACCATTACTTCTACTGTTATTGGTAACTCGTCTACTGCGTCTAGACTTGCTTCATCTAGACAAATCCAACTCTCTAATGAGGTTACTGCTTCTGGTGTATTTGATGGTTCTCAAAACTTAAATCTATCTGCTGAATTAGCACTTGTTTCTACTTTACCACATTACGATGGTACATCATCTCCCTCAGCAACTTACAATAAGGTAACTGTTGATGCTAAAGGTAGAGTAACAAACGCACAAGATTTTACTGCTTCTAACAATGGTACTCTTGCTGATTATGGTCTTGATGGAACCAATGAAGGAACATCTGCACAACCATATGATTTAGACTTAGTTGCTTTAGCAGGTTTGACCACTACTGGTATGATCTCTAGAACTGCTTCTAATACTGTAGCAACTAGAGCAATTACTGGAACTGCCACAAGAATCTCTGTAAGTGAGGGTGCAGGTATTTCTGGTAACCCAACTATTGATATGATTACCACTGCTGTTACAGCAGGTAACTATAATACGGAATCCCTGACATCTGTATCTGGTGCAGGTGGAAATGGCGAACCCTTTGGTACCGCTACAGTTAACGCTACTAAGTTTACTGTTGATGCCTATGGTAGATTGACAAGTGCAACAAATGTGCCTATCGCTACTGCTGCAGAAGGTAGTAAGTATGCTAGCTATAATGCAGGTACTACTTACGTTAGATATGACATCATTGCTAACGCATCAAAAGTTTACCAAGCCATCACTGGCATTGCTGCAGGTGCAGGTGCACCTACTCATAGTAGCGGTGACTCTGGCGGGTGGAGATATCTCGCTGCCGAAGCAACAGAGCAGAAGGGATTGGCTAGTTTTGCACAAGAAGATTTCGACGTTGACGCGAACGGGCACGTCACGATCGCCACCGCAGGAGTAGATAATACACAACTACAAAATAATAAACTTATTTTCACAGATGGAAATGCTGTTGAAAATTTTGAATTAGATAACGAACTTACAACTTCTACCGCCAACACTGGTTTTAATAAATTAAACTTTATTAAAATCAATAATACTTCTGGCGGTTTATTATTTGGTGCTAATAATACTGGTGATAGTGGTGCAGGTGAGATCGATGTAAACGTACGTTCTTACTTTAGCGATCCTGATATCACTTTAGATGGTTCAGTTGCACAAACTCTAAACAAAACTGGTGATGGTAATCTTACTTTCACAACTACTCAAAACTCATCATCTGCAAGATCTTTAACAGTTTCAGCATCAAACTCTGGTTCTGGAACTAGCACAGTTACAATTACTGCAGAAGATGTTGTTGATATTGATGCCTCAGATTCAAACGGAAAAGTTCATGTCGAAGATTCTAGATTCCAAGATAACTACATTGCTACGTCTAATGCCACTATGCACCTTGATCCTGGTGATGATCGTGCTACTAGTGGGTTAGTTCGTGTTCATGGAGATTTACAGGTAGATGGTACGACTACGACAATTAATTCAACAGTTACAACAATTGATGATCCCATTATTACTCTTGGTGGCGATACTGCTCCAGGTAGTGATGACAATAAAGATCGTGGAGTTGAATTCAGATACTACGACAATCAAGCAAGAATTGGATTCTTTGGTTACGATGATTCTTACACCGACCTCGGAGGACACGTCGGAGGATTTACATTTTTACACAACGCCACAAATACTTCAGAGGTCTTTAGTGGAACTGCGTCAGGTATAACTGCAGGTAATTTAAAACTTACAACAAATACTAACTCAACATCTAATACTACAGGAGACTTAGTAGTTGCAGGTGGTGTTGGTATTGGAGATGATGTTAATATTGGTGGATTACTAGATGTAGATGGCACATTCCGTGCTAATAGCACATCTAGATTTGATGATAATATTGTATTCCAAGGTGCTTCTAAGACATTATCATTGAATAATGGTAGTGGAACGACTAAAATACAACTCCACACTACTACAGGTAATGTAGAAATTGGTGGTATTTTAACAAATACTGGTGCTATTGATGCAAACAGCACTTTGAATGTCGCAGGTATTGTTCGTTTTGAAGATACAGATGAACCAACTGTTGCACAGAATGGTGGAACTGGTCTTTATGAAATTCAATCAAATGATTATGGTGCATTTAGATTTGATGGTGGTGGATATGTTGAAGGTGATACAGTATTCAACAGCGATGTTTTTATTAACGGTGTTCTAAACCAAAGAGATAGTGCTACAGAATCATTCGGTAATAGAAACTATCTAAACATCAGATATAAATTACGTTCTGGTTCAAGTGCAGCGTATACTCCTTCATATGCATCTGATAATACCTCTAACTTGAGAATCTTTGGTGGTGCAGGTATTCAAACTGATCTCCATATTGGTGATGATCTTTATATTGGTAAACTAAACTCTGGTGACAGTGTTTCATTCCAAGTATTAGGAGAGTCAGGTAATACAACTACTCAAGGAACATTAACTGTTGAAGGTCAAGCAACTATTAATGACTCTCTAATTGTTAATGCTTCTAACGAAAACTTTAAGATTCAAAATGGATCTGCTGCAGATAAATTTACAGTTGATACTGATAATGGTAATACTGTAATTCAAGGATCATTGAATGTTAACGGTGTTACTGATATTGATGCTGATTTTGCAGTTAGAAACGGAACGACTGATAAATTCTTTGTCGATAACGTAACTGGTAATACTAATATTGAAGGTACGTTGACTGCTGATGGTCATACTGAATTAAATTCAACACTTAATGTTGATAATAATACAACACTTGGTTCACAACTTACAGTAACTGGTAACTCAGAGTTCAACGGAACTGTAGATGTTGATGCAAACTTTGCAGTCAGATCAGGAACTACTGATAAGATGACTGTTGCATCTTCTACAGGTAACATAGCAACTGATGGAACACTAACAGTTCAAGGTGAAACACAGATCATTGACTCTCTTATTATCAATGCATCTAACGAAGAGTTTGCAGTTCAGAATGGTTCTGGAGTTGATAAATTTACTGTAGATACTGATAACGGTAATACAAATATTATCGGAACATTAACAGTTGCTGATGCTACTCAAATTAATAATACTCTTGGTGTTTCTAACGTTGTAACCTTAACAAGAAACACTCAGCAAACTCTGACTGGATCTTATTCTGCTGATGGTGCATTCAAACTAACTGGTGGTGCAGGTATCGGTAAAAACCTTGCTGTTGGTGAAGGTCTAAGAGTATATGGAGGCACTGAACTTACTGGTGCTCTTGATCTTAATAATAGTGCTGATATATCTGGTGCTTTAGTAACTCATGATGATGTTACTATCACTGCAGATAATAAGATGTTCAAGGTGCAGAATGCTTCTGCAGCGAACAAGTTTACAGTCGATACCGATAATGGTAACACTGATATTCAAGGAACATTGGATGTTGCAGGTGATGTAACTGCATCATCTGACCTTACAGTCACAGGAAATCTTACAGTCAATGGAACAACAACTACTGTCAATTCTACGGTCACAACAATCGATGACCCTGTTATTACTGTTGGTGGTGATACAGCACCCGCGTCTAATGATGGAAAGGATCGTGGTATTGAATTTCGTTATTATGATGGTTCTGCTAAAATCGGTTTCTTCGGTTTTGATAGATCATCCTCCCAATTCCAATTCTTAACAAGTGCAACAAATACTTCTGAAGTTCTCTCAGGAACAGATGGTGCTCTAAGAGCAGGTAGTTTAAATCTTACTGGTGCGGGCACATCTCTTGATGTTGATGCTAATGCAAACATTGATGGCACACTGACTGTAGATGGTCAGATTATTTCACAAGTATCTTCAGGTCCTGCTCTTGTTATCCCAACAACAGATAAGATTAATAATCTTAACGCAGACTTACTAGATGGTGCTACAACCGCAACTGCTGCAACTGCATCCACAGTTGTTCTTCGTGATTCATCTGGTGATTTTGCTGCCAATCAAATCACTGCTGCTAGTGCTGCAGGATCTGGTGCAGGTTTCTTAGGAAACGCATCCACTGCTGACGCATGGAAGACTGCTAGAACACTCACCATTAGCGGTGTTGTATCTGGTTCTGTAGTCATCGATGGAAGTGAAAATGAAACACTTACAACAACTTATGTTGATGCAGACATCACTGCTCTAGCAGCGATGAGTGGAACTGGTTATGTCGTACGAACTGCTGCTAACACTTATGCCCAAAGAACTCTCCAAGTCACCGCATCGTCTGGAATCACTCTTACTAACGCTGATGGCGTTTCTGGTAATACTACAATTAACGTTGCTAGTGCATCTTCTAATTCTGCAAACAACCTCGTCCTAAGAGACGGATCTGGTAACTTTGCTGCAGGAACTATCACTGCTGCCTTAACTGGTAATGTCACAGGTAATGTAACTGGTAACGTTACTGGTCAGGTATCTGATATCTCAAACCATGATACTGGTGATCTTACTGAGGGATCTAACCTCTACTACACTAATGAAAGAGTTGACGATAGAGTCAATGCTCTTATTACTGCAGGAACTGGTATTACTAAGGTTTACGATGACGCTGCAAATACATATACACTGACTGTAACTCAGTCAGATATCAATACTGATAATGTAACTGAAGGATCAACAAATCTATTCACAACTGCTGCTAGAACTAGAACTCATTTCACATATGGAACTGGTATCACACATAGTTCTGGAACTTTATCAGTTACTCAGTCTGATATTAATACTGACAACGTAACTGAAGGATCAACTAACCTCTTTACTACTGCTGCTAGAACAAGAACACACTTTACATACGGAACTGGTATTACACACAGTTCTGGAACTTTATCAGTTACACAATCAGATATCAACACTGATAATATTACTGAAGGTTCTACAAACCTATTCATTACTAATGAACGTGTTGATGATAGAGTCAACGCCTTAACTGTTGCAGGAACTGGTGTAAGTAAGACATATGATGACGCTGCAGGAACTCTAACTTTAGCAGTTGACTTTAGTGAGTTTAATACTGGCAATATTACAGAGGGTTCTAACCTTTACTTTACAAACACTCGTGCTGATGCAAGGGCAGACTTGAAAGTTGCTGCTGCAACTGGTTCAAACCTTGATCTTTCTTCTAAGTCTACTTCCGATCTTTCTGAAGGAACTAATCAATACTATACAGAAACAAGAGTTCAAGCAAAACTTGACAATGCTTATGAGCAACTAAGAGCAATGTTAACTAACCTTGCAACTAGCACCACTCTAAATCTTAACTTGTCTGGTGATCCTACACCTGGCGCAGTCGTTACCACTGGTGTTAGTGTTGGTGGTGGCGGTGGATTTACTGCAGGAACTGCGGTTGCTACATCTGGTTCAGCAACTGGATCTGGATTGACTGTTGATACTACGGTTGATAGTGATGGAAACATCACTGCTGCTGCGGTAAATGCAGGTGGTTCTGGATATCTAATTACTGATACTGTCACAGTCACTAACCCCAACGCAGGTAAGATTCTTACATTGAACTTGGCAACATTATCAGGTGGAACAGGTTATTCATCTGCTACTGGAGTTGCAGTCACTGGGGGTGACGGTTCTTCTGCGACTGTTGACATTACTGCATCTGCAGGTGCTATCACTAACGTAACAGTTAATAACGGTGGAACAGGATTCGCTGCGGGTAATACTATAACTATTGCTAATGCTAATGCTACTGGAGTTAAGACTCTTGGATCTATTAGTGCTGCAGGATCTGGATATTCAACAGGAACTGCCATTGCAACATCAGCGTCCGCATCTGGATCTGGAGCAACATTAAATATCACTTCTGTCAATGCTAGTGGTGGTATCACTGGTGTTGCAATCAACGATGATGGATCTGGTTACGCTGCATCTGAAGTCTTGACAATTACTAATGCTAACGCATCTGGTATCGCAACAGTAGGAAACATTGGTGCTGCTGATGCATCAAGAACTGCAGGAACCTATAACTTAGGCACATCTGATTATGGAACTGAAGCATCTGGTGCCAACGCAACATTCACTGTTGTTGTTGATTCAAATGGTGCTGCTTCTATCACCGTAACAGATGATGGTAGCGGATTTATCGCCAATGAAACTATCACAGTTGCTGATGCTCAACTTGGTGGTGGCGGTGGTGCTGCTCTTACATTCGATGTAACAGCAATCCATGGTAGCACTGCTACAGTTCCAGTATCTGCGATTCATGGAAACGGTGCAACAGTTAATGTCGCTACCGTTGCAACAAATGCAACTCTAACTCTAACTGACATCACAACGATGGAAGTTGGAGCAACAGTTACAGGTGCTACTTCTGGCACCACAGGTGTTATCACTGCTCTGGGAACTAACCAGATCACTGTCAATACCGTTGACGGATTCTTCAAGAAAGGAGAAGTCGTCAGTGCTAATGATGTTACTACACTTACTATCTCCTCATTCAGTTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
5597ecf4cbaa960e930bb4048c4fb20b322f02a8db86d6b6d37f5471e79c1da2
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5022
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50