Protein

View in Explore
Genbank accession
CAO2433534.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,90
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MADYKLSELNSIDTIRSDDLLHVRVKKRPEMLGDEDRRMTYQDFLASFKLERFVQIAGSTMTGDLGIVKLLYGGKAIFDPTGSSEITIGDVLKTFKINANGLKLTIADASRSATVYHTLNKPSPNELGMRTNEENDARYSRLAANNTFRGTQAILSDNEALIVKNITQGMPLYIRGQDADGTNRWYLGNDNKGTDNLVLKNVKYGAYVAILANLISVNKSIQINGQVQPSDFSNLDARYFTQTAANQRFAQLVGNNTFSGLNTFNQLSVFKKDGEAIRLQNANAAQPLYIKAIDSTGVNRWYIGNSNEGDNVALENYKTSGKITVGTSVNINKTLTVTGQVQPSDWTNIDSRYVLIGSYANLAKKNEANTFTLQQNIQSDGEALRIYSKAQNNSSYIVGKNTDNTNKWFIGCGTNGSGTASFHNYLTGARIDLADEILLSKSLQITGQVKPSDWGNLDARYFTQTAANSRFMLASNTGQYTATDWNAVPWDAKTGLYNIMNGGGSQMIFHMYQAVGSCRSAQLRFNYKNGGMFYRSSRDGFGFEADWSKIYTEAQKPTPSELGAYTKAETDQKIAQAVSDSTDLNKIYPVGIVTWFNSNVNPNTALPGLTWTYLNNGVGRTIRIAAANGSDVATTGGSDSVTLAVGNLPSHTHSFSATTSSFDYGTKKH
Physico‐chemical
properties
protein length:669 AA
molecular weight: 73311,80960 Da
isoelectric point:8,83199
aromaticity:0,09567
hydropathy:-0,43288

Domains

Domains [InterPro]
DC_0032
ATT
1–272
DC_0032 G3DSA:6.20.80.10 G3DSA:6.20.80.10 IPR022246
G3DSA:6.20.80.10
STR
158–219
G3DSA:6.20.80.10 IPR048388 IPR048388
IPR048388
ATT
159–248
IPR048388 DC_0026
CAO2433534.1
1 669
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT 1-363 | STR 364-380 | ATT 381-473 | STR 474-669
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage KCP_040
[NCBI] 		3465633 Viruses >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CAO2433534.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OZ346214.1 [NCBI]
CDS location
range 20474 -> 22483
strand +
CDS
ATGGCAGATTACAAGTTGAGTGAATTAAACTCAATTGATACAATTCGTTCAGACGACCTTCTTCATGTCAGGGTTAAAAAGAGACCTGAAATGCTGGGTGATGAAGACCGTCGAATGACCTATCAAGATTTCTTAGCATCTTTTAAACTAGAAAGGTTTGTTCAGATTGCTGGTAGCACTATGACTGGTGACTTAGGGATTGTTAAGTTACTTTATGGTGGTAAGGCAATCTTTGACCCAACAGGCTCTTCTGAGATTACTATTGGGGATGTTTTAAAGACTTTTAAAATCAACGCAAATGGCCTTAAACTAACTATTGCAGATGCTTCAAGGTCGGCAACTGTTTATCATACTCTGAATAAGCCAAGTCCTAATGAACTTGGGATGAGAACTAATGAAGAGAATGATGCAAGATACTCAAGATTAGCTGCAAATAACACCTTTAGAGGTACTCAAGCTATTCTCTCTGATAATGAAGCCCTCATTGTTAAGAATATTACACAAGGGATGCCACTCTATATTCGTGGTCAAGATGCAGATGGCACTAACAGATGGTATCTAGGCAATGATAATAAAGGCACAGACAACCTTGTTTTAAAAAACGTTAAATATGGTGCATACGTAGCGATTTTAGCTAACCTAATCTCTGTGAATAAATCAATTCAAATCAATGGTCAAGTTCAACCTTCTGACTTCTCTAACTTAGATGCTAGATACTTTACTCAGACAGCAGCTAATCAGAGATTTGCGCAGCTAGTTGGTAATAACACATTCAGTGGTTTAAACACATTCAACCAACTAAGTGTTTTCAAAAAAGATGGTGAAGCAATTAGGCTACAGAATGCCAATGCTGCACAACCATTGTACATTAAGGCGATTGATAGCACAGGTGTCAACAGATGGTACATTGGTAATAGTAACGAAGGTGATAACGTAGCTCTAGAAAACTACAAAACTAGTGGCAAGATTACTGTAGGGACAAGTGTTAATATCAATAAAACACTAACTGTAACTGGTCAAGTTCAACCTTCTGACTGGACTAACATTGACTCTCGTTATGTTCTTATCGGTTCATACGCAAATCTTGCTAAGAAGAATGAAGCTAACACATTCACTTTACAGCAGAATATTCAATCTGATGGTGAAGCATTAAGAATCTACAGCAAGGCTCAGAATAATTCTTCTTACATTGTTGGTAAGAATACTGATAACACAAATAAGTGGTTTATCGGTTGTGGTACTAATGGTTCTGGTACGGCATCATTCCATAACTACTTGACTGGTGCAAGAATTGATTTAGCTGACGAAATTCTTCTGTCTAAATCTCTACAGATTACTGGACAGGTAAAACCTTCTGATTGGGGTAACTTGGATGCAAGGTACTTCACGCAGACAGCAGCTAACTCAAGATTCATGTTGGCATCAAATACTGGTCAGTACACTGCTACAGACTGGAATGCTGTCCCTTGGGATGCTAAAACAGGGCTGTACAACATCATGAATGGTGGTGGTTCGCAGATGATTTTCCACATGTATCAAGCAGTTGGTTCATGTCGTTCTGCACAACTACGTTTTAACTACAAAAATGGTGGAATGTTTTACAGGTCGTCAAGGGATGGTTTTGGTTTTGAAGCAGATTGGTCTAAGATTTATACAGAAGCACAGAAACCAACCCCTTCAGAGCTTGGTGCATACACTAAAGCTGAAACTGACCAGAAGATTGCACAGGCAGTAAGTGACTCTACAGACCTTAACAAAATCTATCCAGTGGGTATTGTGACGTGGTTTAACAGTAATGTTAACCCTAATACAGCACTGCCTGGTCTAACTTGGACGTATCTGAACAATGGTGTTGGTAGAACTATCAGAATTGCAGCAGCAAACGGTTCAGATGTTGCTACAACTGGTGGTTCAGACTCTGTGACGTTAGCTGTTGGGAACTTGCCTTCACACACTCACAGTTTTTCTGCGACTACCTCATCGTTTGACTACGGAACAAAAAAACACTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
7b2f2941367b295f1739ccbdb18c3dd2079d18d659504cfbf9375bd7c8b0a146
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7817
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50