Protein

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Genbank accession
XOD41096.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber proximal subunit
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,71
Protein sequence
MAQAPKLAFRATEGLDAANEKIINVQKTTHPTATDKSTMNDGVSVDFFVEYNGIQQFDATRTYPKNMSVIYERRPYYAKNDITTAGPFKASDWQALRVDPTWISQVSQGAQEIFLEAGQYVITVSSYAEYTFKLPTDPVVGDTIVVKDGTGSVGQFSTKFNSSKPIRPNGQPSTSEPEITTYYLTHPLATAVFIYTSTNGWDLQILDAGKNAKGAQSNAPTSLYAMQAGQTWYRRTATGPIFMKLPKYANNGDTVHVYDIDKANVTNPTTFSTEGGATIDGKPSPFKPTTISDGMFVYDAVANNWVVYDSDIRGRMNIIGSNTNLLANNSYMLNAQAATNVDMILPTNAGIGDIITVSLKTLRRGQTARIKTEKTGTNIIVNGFEIITKYSSQGTNLNTAFKRVTELTYAGTTSYLPVVQFAHLGNGEWFLFESTNNIERVDPDNRGRIGVAPLATVAEAQAMTGHNREAIITPETLAQRTATDDRTGIAALANLGDAQKDGTTGLDHTKIVTVQRMDNRFATEARRGVAEIATQAEANGATDDERIITAKKLDTRKATPTQSGIAFTVNPGGTPATTRPGNGTGVFDMNDVAKIVTPKVLADYKATENQLGTVFLASESEVKGGNTAPSQGPIVVTPEMLGKRIALETNHGLIAIANQAETDAGVDDTKAVTPKKLNERRGSETLSGVSRFATKAEFEAGTKEIPLNAAVAANVKGQLAVSPEKVKDFFTATRSSVDTASGLTQGGNIWSRLDLGIVVPTESQRGTPRIATQLEVNAGTVNDVFVSPVKFINTRATYDQVGTTKFAADTVMRAKISDNDAVSVAKLVNAFEDYSEYTANDVKRGTIRNVKDIEAFTGDNISGSSKPFTDYLHNGTAISPRSMIYALRNYLPLNATAQNSLQLGGVNASSWMRRDIAQTVTGSMTFVPSQTFNDTVSVAGRFTNTGTSYFNSVTTDGSDTPQVSLGDGARLTSAVIRFNAGRVGIRNNWQLIAGGNSDWIGSDEFSISTVDTKRKVLTMKLDGSVSTLNTLSVGTNLTVAGTIAVNGVQLASRQDTNTLRIGTTDVNTKFYTKDASYNGLVMAKQGGGPDAIILNTQNFTQHADGTYVKRTGGVDSHMTGPLVYSQGGATSTDINGSAGVYTWLTEIADTKKPSDYPNGNWSMSITTKAIYDTYPNGSTVSEPAPRPGVGTLVQFGLSNTRIVQHWYLKDTSIWYTRSGSGTGSEFTPWARVYTTANPPVAEEIAGVMQEGKETDFLRVKQYIDIGNVRIRANDATRTVEFEWIGQ
Physico‐chemical
properties
protein length:1286 AA
molecular weight: 138519,90060 Da
isoelectric point:6,24254
aromaticity:0,07932
hydropathy:-0,34184

Domains

Domains [InterPro]
DC_1946
ATT
1–218
DC_1946 DC_1209
XOD41096.1
1 1286
Architecture
ATT
STR
ATT 1-218 | STR 353-1270 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Serratia phage WSPA
[NCBI] 		3384840 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Serratia marcescens
[NCBI] 		615 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XOD41096.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ600363 [NCBI]
CDS location
range 130097 -> 133957
strand -
CDS
ATGGCCCAGGCACCAAAATTAGCATTCAGAGCTACAGAAGGGCTCGATGCTGCAAATGAAAAAATTATAAATGTACAGAAAACCACGCACCCGACGGCGACAGACAAGTCAACCATGAATGATGGGGTCTCTGTAGATTTCTTCGTAGAGTATAACGGCATTCAGCAGTTCGACGCAACTCGTACATATCCAAAAAATATGTCAGTGATTTATGAACGTCGTCCTTATTATGCCAAAAACGATATTACGACTGCAGGCCCGTTCAAGGCATCTGACTGGCAGGCATTACGTGTTGACCCAACTTGGATCTCTCAAGTTTCTCAGGGTGCACAAGAAATTTTCTTAGAAGCAGGCCAATATGTAATCACTGTTTCTTCGTATGCTGAATACACCTTTAAATTGCCTACTGATCCGGTTGTCGGCGATACCATCGTAGTTAAAGATGGTACTGGTTCTGTTGGACAGTTTAGCACTAAATTTAACTCGAGCAAACCGATTCGTCCTAATGGCCAGCCAAGCACAAGTGAACCAGAAATCACTACATATTATCTGACTCACCCATTAGCAACAGCTGTGTTTATCTACACTAGCACGAATGGTTGGGATCTCCAGATTTTAGATGCTGGTAAAAATGCTAAAGGTGCTCAGTCTAACGCACCAACTAGCTTATATGCTATGCAGGCAGGCCAGACTTGGTATCGTAGAACTGCAACTGGACCTATTTTCATGAAACTGCCTAAGTACGCTAATAACGGCGACACGGTTCATGTTTATGATATCGATAAGGCTAACGTTACAAACCCTACTACTTTCAGTACTGAAGGTGGCGCGACAATTGATGGTAAACCAAGTCCGTTTAAACCGACTACAATCAGTGACGGCATGTTTGTGTATGATGCTGTAGCGAATAACTGGGTCGTTTATGATTCTGATATTCGTGGTCGTATGAACATCATTGGATCTAATACTAATCTGTTGGCTAACAACTCATATATGTTGAATGCTCAAGCAGCAACCAACGTAGATATGATTTTGCCTACTAACGCAGGTATTGGTGACATCATCACTGTTTCTCTGAAGACTTTACGTCGCGGTCAAACCGCTCGTATCAAAACAGAGAAAACAGGTACAAATATTATTGTAAACGGTTTTGAGATCATCACTAAGTATAGCTCTCAAGGCACAAATCTTAACACGGCATTCAAACGTGTTACTGAATTAACTTATGCCGGTACTACTTCGTATTTGCCTGTTGTTCAGTTTGCTCACTTAGGTAATGGCGAATGGTTCTTGTTCGAAAGTACTAATAACATCGAACGTGTTGATCCAGATAACCGTGGTCGTATTGGTGTTGCTCCTCTGGCTACTGTCGCAGAAGCTCAGGCGATGACAGGCCATAACAGGGAAGCTATCATTACCCCTGAGACTTTAGCTCAACGTACTGCTACAGATGATCGTACTGGTATCGCAGCTTTGGCCAATTTAGGTGATGCTCAGAAAGACGGCACTACTGGATTAGATCATACTAAGATCGTAACTGTTCAACGTATGGATAACCGTTTTGCTACTGAGGCTCGTCGTGGTGTTGCCGAAATTGCAACTCAGGCGGAAGCTAATGGCGCAACTGATGATGAACGTATTATCACAGCCAAAAAATTAGACACTCGTAAGGCGACTCCTACGCAATCAGGCATTGCATTCACTGTTAACCCAGGTGGCACTCCAGCGACAACTCGCCCTGGCAATGGTACTGGTGTGTTCGACATGAATGATGTTGCTAAAATCGTAACACCAAAAGTGTTAGCCGATTATAAAGCAACAGAGAACCAATTGGGTACTGTTTTCCTGGCGTCCGAATCTGAAGTTAAAGGTGGTAACACGGCTCCTTCTCAAGGCCCAATTGTTGTTACTCCTGAAATGCTTGGTAAACGTATTGCATTAGAAACTAACCATGGTTTAATTGCGATCGCTAACCAGGCCGAAACTGATGCTGGTGTGGATGATACTAAAGCTGTAACGCCTAAAAAACTTAATGAGCGTCGTGGTTCTGAAACTTTGAGTGGCGTTTCAAGATTTGCTACTAAAGCTGAATTCGAAGCTGGTACTAAAGAAATTCCTCTGAATGCTGCTGTAGCTGCTAACGTTAAAGGTCAATTGGCTGTATCGCCTGAAAAAGTTAAAGACTTCTTTACGGCAACTCGTAGCTCTGTTGATACTGCTTCAGGTTTAACTCAAGGTGGAAATATCTGGTCTAGACTAGATTTAGGTATTGTTGTTCCTACTGAATCTCAGCGTGGTACTCCAAGAATTGCTACCCAGCTTGAAGTTAATGCAGGTACAGTTAACGATGTATTTGTGAGTCCAGTTAAGTTCATTAATACTCGAGCTACTTATGATCAAGTAGGTACTACTAAGTTTGCAGCCGACACTGTAATGAGAGCTAAAATCTCAGATAACGATGCCGTTTCTGTTGCTAAATTAGTCAATGCCTTCGAGGATTATAGCGAATACACAGCTAATGATGTTAAACGAGGAACAATTCGTAACGTCAAAGATATTGAAGCATTTACTGGTGATAACATTTCTGGCTCTTCTAAGCCATTTACTGATTATCTTCACAACGGTACTGCAATTAGTCCACGTAGCATGATTTATGCATTACGTAACTATTTGCCACTGAATGCTACGGCTCAGAACTCATTACAGTTAGGTGGTGTCAATGCTTCTAGTTGGATGCGTCGTGATATTGCTCAGACTGTAACAGGTTCAATGACCTTTGTTCCGTCCCAAACATTCAATGATACCGTTTCTGTTGCTGGCAGATTCACTAATACCGGAACTAGTTATTTCAACTCAGTAACAACTGATGGTTCTGATACTCCACAAGTATCTTTAGGTGATGGCGCTAGATTAACTTCTGCTGTTATTCGTTTTAATGCTGGTAGGGTAGGTATTCGTAACAACTGGCAGCTTATTGCCGGTGGGAATAGTGATTGGATTGGTTCAGACGAATTCTCAATATCTACTGTTGATACTAAACGTAAAGTATTGACTATGAAGTTGGATGGATCTGTTAGTACTTTAAACACATTAAGTGTTGGCACTAATTTAACTGTTGCTGGAACTATTGCAGTTAATGGTGTTCAATTAGCATCTAGACAAGATACTAACACACTTCGTATTGGTACTACTGATGTTAATACTAAGTTCTATACCAAAGACGCTAGCTATAATGGTTTAGTAATGGCTAAACAAGGTGGTGGTCCAGATGCTATTATTCTGAACACCCAAAACTTCACTCAGCATGCTGACGGTACTTATGTCAAACGCACTGGTGGTGTTGATAGCCATATGACAGGACCATTGGTTTATTCTCAAGGCGGAGCTACTAGTACTGATATCAATGGTTCAGCTGGTGTTTATACTTGGTTGACTGAAATTGCAGATACTAAGAAACCTTCTGATTATCCAAATGGCAACTGGTCTATGAGTATTACGACTAAAGCCATTTATGACACTTATCCTAATGGATCTACAGTGAGTGAACCGGCGCCTCGTCCTGGTGTTGGTACTTTAGTTCAATTTGGGTTATCAAATACTCGTATTGTTCAACACTGGTATTTGAAAGATACTTCAATTTGGTATACTCGTTCTGGTTCAGGTACTGGATCAGAGTTTACGCCTTGGGCTCGTGTTTATACTACTGCAAACCCACCTGTTGCAGAGGAAATTGCTGGTGTTATGCAAGAAGGTAAGGAAACCGATTTCTTGCGTGTTAAACAGTATATAGATATTGGTAACGTGCGTATCCGTGCAAATGATGCAACTCGTACCGTAGAGTTTGAATGGATCGGTCAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
b1d3c804209c84b1991e8bcda6334e2f8d7b1d766f958e6e4bf6478194010204
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2687
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50