Protein

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Genbank accession
UVD42008.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MAKDDFDDWGDDPFAGDIDFDFDFDNAPKKGFFASMGSGFLSELHSGTIGSSEGRLRTAKMLLPKSFGTVFDLKREFDWKKQEILSEVKAGSKDMVEDLQAIAQMTLDRHGDKVPNKIAQGLETFSNKDFSHWDQGGYTPSDPSMGEVDEDGLAGFISGVTAQQTGTMVGIGRAINNMTAVVGGRQLAQQQATNSLLGGISTTLQGILRYQNKIQAKNDAVKINLLARMHLTNAKYYKFMEASMHRQIDELKKITLNSGKSDYEKTSLAMAAKGRLRDSIFSTIGRRSGGVMGYLSETFGKEAREGMLSSLSGMVGAGRMGMEMSEGMGLNMGTIIGQMLANEVIERGPAFFKSGQGAKLINKLATLYPKEAKNIRRQYRKLEQLGSVLSYAGTNAAGLAGTILRNNANYEEDFSTYDDYLDSLAPGEKRLSERAWRLKQTGKNFLGNRLNDLSFNINDSRGKQYELKKRNLMDLTQPSYWSSQSDRTLNEIIPGWFAKLHLSLEKIRTGNDNLKEERFDYRSGKFLSHKQTQNAVKRNLLNGREFSGLASGTADMVSAIDKNGTLSPEAKRFLSYRLARDVDQDKGFNPFNYFGMEDEDGLTPSIRKEIEQVMRGSFRLTDQHIEAAKKSGLAGIKAQLNMPTAKSKRLAADLSLRAKNLKGYLPNISQQIDLLRNAGYDPLLREMNLINSENGSDFFNTDAIWDRLKSELNGNEGLIEEDDVGPLPTSGGMGGGNSKTIINNRRGLSGKDSGKLVTALSELTEQLKLGIPGRQDGNALSPEQVKSLTDSVMGIRDINQEQLEVLKQILSRQPAEVNKPKTDAEDAADTAQKKTILDRIKSLGGIKDIFSAGMDKLLAHEPLMLGGMLGGLAGLAIHDPKTAALIGGGAAAWALYTKVRSMADARDVSDDEDIYDGESEDPILEARKLRARQYYDKVLKKIITSWKEIKGSIVDLGTKVVISAKRLSGKLFSAEGKAVVLRGLNAVKSAGLKLFNWLDPLNRLKGIGQGITNRITQMDVYRVGEDSPVLTRKGFENGKYFKRLNGSVVPVKGWRDIDGPVYDENGDVIITQAEYEDGLITSGGMKIESLKRMTGVMGGKLLDLGRKLGDRAKGYGKRAGDKINDLVTADYTPITNSVDRIYALLCRKFGYDINDMPDIKADIVNETSRMGNTDDVRLNSLEDKERKAKAERESRYQDAIIDLAGHGEGERGSGSRDGEKKEGGFLNGLLGLVKNPMGTILGGVVGLGAKLSKFLTLGITTLPAIVGGLTSLAKILTVGLLGRRASDGVDDIVDAAGGASGRRRGRRTRGGRVGRGRAFKFGLAGLATAGLGMYLDATNEEHEGTNWKDVASNTLTAASAVSLGSSAMSAMGINLGIGSAIASGASAAGSAIVSGTGALATAVAPLLFNPVTLGIGAVAGAGYLIYKYYAKGKGSQFKLRMAQYGIKDVESDLAAKIRSAEEALREYVVVTAGVASIAKSAPLEQIFQSFIPQANDKGQQQAYFTWFNLRFKPIFLTYASAIDTAGYRDFETFDKSTDAKLYSTVSTINDRIGTINPYPYQIATQFDEATPIMGKDQTINQVRLYLDELKSFNERHGRTAEGIEKEGVVTMKTSAEQVEKSEKAGWWSSLKMRVGGTYEDRSDIEEINKRYPVTKSVMEINITDLLPGGDKPLAGITALRLAAYGDTEHIPWRVEAVLKLERYCEDYISVIGNDARFTSTTGAVYNLFKNSFRITDDQANQWCTWFRDRFLPVCMAWVKYVRIMRGVKPSAGWKSMTATNAFDFAKELLGLKVNIGKTPTSVWEVKWSPFPNTTSGSITPQVKAIVNNLDTAAKNAKLNFGDKEVKASGPKEVVPYTSAHSMGEGGLNQAVATAAMDDNVIAGGQPVINYKPITGNTDTSTVDLSGVTPVGGSGGGDKGVSVPQKAAEQLIMKEMIKAGFTDPRLIAEMLALANFESGGFKNTAEGMNYKPGRLLEIFPGRVKSMAQAQQIVAGGPQAIANAVYGGRMGNSGPNDGWLYRGRGFIQLTGKDNFRAASQYVGKDLVKNPELVSTDPEVMAKTLIWYLSNGSNGKRLQSIVKNNSFEYAAQGLNPNGLPDMPARTRLYQQYMKRLTSNELTVDPNAGATPSSSGETPPSSVSSVSPDAKPPTMKSENVGTANSVAAVSAITTPSVNQGPKPIGAVPSTPVSEGSVAYKSDPANPLNRVKVPTEQSTSAPPTPLAKPVQQPDPVATAQVQAQGRTNDLLAQLLKEIQNQKAPDPRMGYTSK
Physico‐chemical
properties
protein length:2268 AA
molecular weight: 245788,91400 Da
isoelectric point:9,03952
aromaticity:0,07055
hydropathy:-0,39594

Domains

Domains [InterPro]
DC_0124
STR
1–2063
DC_0124 DC_1350
Coil
Unmapped
1446–1466
Coil G3DSA:1.10.530.10
IPR023346
STR
1933–2114
IPR023346
IPR052354
Unmapped
1942–2072
IPR052354
IPR000726
ENZ
2015–2069
IPR000726
UVD42008.1
1 2268
Architecture
STR
RBD
STR 1-2114 | RBD 2115-2268
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Klebsiella phage KPN8
[NCBI] 		2972463 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Klebsiella pneumoniae
[NCBI] 		573 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
UVD42008.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OP079919.1 [NCBI]
CDS location
range 169954 -> 176760
strand -
CDS
ATGGCTAAAGATGATTTCGACGATTGGGGAGACGACCCGTTCGCCGGCGATATAGATTTCGACTTCGACTTCGATAACGCACCTAAAAAAGGTTTCTTTGCGAGCATGGGGAGTGGTTTTCTCAGTGAGCTCCACAGCGGTACGATAGGAAGTTCAGAAGGTAGGTTGAGAACGGCTAAAATGCTCCTCCCAAAATCATTTGGGACCGTCTTTGATTTAAAAAGAGAGTTTGATTGGAAGAAGCAGGAGATCCTAAGCGAGGTCAAAGCCGGATCAAAAGATATGGTGGAAGATCTCCAGGCAATTGCTCAGATGACCTTAGACCGCCACGGCGACAAGGTTCCTAATAAAATTGCCCAGGGGTTGGAGACCTTCAGTAATAAGGACTTTAGCCATTGGGATCAAGGAGGATACACACCTTCTGATCCAAGTATGGGAGAAGTCGATGAAGATGGCTTAGCCGGTTTTATAAGCGGAGTTACGGCCCAGCAGACAGGAACGATGGTGGGTATTGGGCGGGCTATCAACAACATGACCGCGGTAGTTGGCGGTCGTCAATTAGCTCAGCAACAAGCAACCAATTCGTTGTTAGGTGGAATCTCAACCACCCTTCAAGGCATTTTGCGTTACCAGAATAAAATCCAGGCTAAGAACGATGCAGTTAAGATCAACTTATTGGCCAGGATGCATTTAACCAACGCTAAATACTACAAGTTCATGGAAGCCTCGATGCATCGTCAGATTGACGAGCTTAAAAAGATTACTCTTAATTCAGGTAAGAGTGATTACGAGAAAACTTCCCTGGCCATGGCGGCTAAAGGCAGATTACGCGATTCTATCTTCTCCACAATTGGACGTAGGTCCGGTGGGGTGATGGGTTATCTGTCCGAGACGTTCGGTAAAGAAGCCAGAGAGGGGATGCTTTCTAGTTTAAGCGGAATGGTTGGCGCGGGTAGAATGGGGATGGAGATGTCCGAAGGAATGGGTCTCAATATGGGAACCATTATCGGGCAGATGCTAGCTAACGAGGTCATTGAGAGAGGACCGGCTTTCTTTAAATCCGGGCAGGGCGCTAAGCTTATTAATAAACTTGCGACCCTCTATCCAAAAGAAGCCAAAAACATCCGCCGGCAATACCGCAAGTTGGAACAGTTGGGTAGCGTTCTGTCATACGCCGGAACTAACGCGGCTGGTTTAGCAGGAACGATTCTCCGCAATAACGCTAACTACGAAGAAGACTTTTCCACCTACGACGATTACCTTGACTCACTTGCTCCCGGTGAAAAACGGTTAAGTGAAAGAGCGTGGCGTTTAAAACAAACGGGTAAAAACTTCCTGGGAAATAGATTAAACGATCTTTCTTTTAATATCAACGATTCCCGTGGTAAACAGTACGAACTCAAGAAACGTAACTTGATGGATTTGACTCAGCCCAGCTACTGGAGCAGTCAATCCGATCGTACGTTAAATGAAATCATTCCTGGGTGGTTCGCTAAGCTTCATCTGAGCTTGGAAAAGATACGCACGGGTAATGATAACCTGAAAGAAGAGCGCTTCGATTATCGCAGTGGGAAGTTCTTAAGCCATAAACAAACCCAAAATGCGGTTAAACGTAATTTGTTGAATGGGAGAGAATTTAGTGGGTTGGCCTCAGGTACAGCCGACATGGTTTCCGCCATTGACAAAAATGGAACGTTGTCACCAGAGGCTAAACGCTTCTTATCTTATCGTTTGGCGAGAGACGTCGACCAAGATAAAGGGTTTAACCCGTTCAACTATTTCGGGATGGAAGACGAAGACGGTCTAACCCCATCGATTCGTAAAGAAATTGAACAAGTGATGCGGGGGTCGTTCAGACTAACCGACCAGCATATTGAAGCGGCTAAAAAATCCGGCCTGGCTGGTATTAAAGCTCAGTTGAACATGCCGACCGCTAAAAGTAAACGTTTGGCGGCCGATCTTAGTCTGCGAGCCAAGAACCTCAAAGGTTATCTCCCTAATATTTCTCAGCAAATCGATTTGTTACGAAACGCTGGTTACGATCCACTATTAAGAGAAATGAATTTGATTAATAGTGAAAACGGGTCAGATTTCTTTAACACCGATGCGATATGGGACCGGTTAAAATCAGAGCTTAATGGTAACGAAGGCCTTATCGAAGAGGATGACGTAGGTCCTCTCCCTACTAGTGGTGGAATGGGTGGGGGTAATTCGAAAACCATTATCAATAACCGTCGCGGGTTGTCCGGGAAGGATTCCGGCAAACTGGTTACCGCCCTATCGGAACTCACCGAGCAGCTTAAACTCGGGATTCCCGGCAGACAAGATGGAAATGCATTAAGCCCAGAGCAAGTTAAATCTTTAACGGATTCTGTAATGGGAATAAGGGATATTAATCAGGAACAATTGGAAGTCCTGAAACAAATCCTTTCTCGTCAGCCAGCCGAGGTGAATAAGCCCAAAACTGATGCTGAAGATGCCGCTGATACCGCACAGAAGAAAACCATCCTCGACCGCATTAAAAGTCTTGGTGGGATTAAGGATATTTTCAGTGCAGGCATGGATAAACTGCTGGCTCACGAACCACTGATGCTGGGTGGGATGTTAGGTGGGTTAGCGGGATTGGCGATTCACGATCCTAAAACAGCGGCGTTGATCGGTGGTGGTGCTGCAGCCTGGGCGTTATATACCAAAGTTCGTAGCATGGCAGACGCCAGAGACGTCAGTGACGATGAAGACATTTACGATGGGGAGAGTGAAGATCCAATACTCGAAGCGCGTAAACTCAGAGCTCGTCAGTATTACGACAAAGTGTTAAAGAAAATTATTACCAGTTGGAAAGAGATCAAGGGGTCGATCGTTGATCTCGGAACCAAGGTCGTGATCTCCGCTAAACGTCTTTCGGGTAAACTGTTCAGTGCCGAAGGCAAGGCCGTTGTGCTTCGTGGCTTAAACGCGGTGAAATCAGCCGGGTTAAAACTCTTTAACTGGCTGGATCCTCTTAACCGATTGAAAGGCATAGGTCAGGGTATTACCAATCGAATAACCCAAATGGATGTTTATCGAGTCGGAGAGGATTCCCCTGTTCTGACAAGGAAGGGTTTTGAGAACGGCAAATACTTCAAACGTTTGAACGGTAGCGTTGTTCCTGTAAAGGGCTGGAGAGATATCGACGGACCGGTGTATGACGAGAACGGCGACGTTATTATTACGCAAGCCGAATACGAGGATGGGCTCATTACATCTGGGGGGATGAAAATAGAATCCCTCAAACGTATGACGGGAGTAATGGGTGGTAAACTTCTTGACCTGGGTAGGAAACTGGGTGATCGAGCTAAAGGCTATGGTAAGCGAGCTGGGGATAAGATCAATGATCTTGTAACCGCGGACTATACGCCTATTACCAATTCGGTCGATCGTATTTACGCTCTGCTTTGCCGTAAGTTTGGTTATGACATTAACGACATGCCGGATATCAAGGCTGATATTGTTAATGAAACAAGCCGAATGGGAAACACGGATGATGTACGCTTAAACTCCTTAGAAGATAAGGAACGTAAAGCGAAAGCTGAACGTGAATCACGGTATCAGGACGCCATCATCGATCTTGCTGGTCATGGAGAGGGAGAGAGAGGTTCTGGTTCTCGAGATGGGGAGAAGAAAGAAGGCGGATTCCTTAATGGACTTCTGGGTCTTGTTAAGAACCCCATGGGAACAATTTTGGGCGGAGTCGTCGGACTTGGCGCTAAACTCTCCAAATTCTTAACTCTCGGTATTACTACTCTGCCCGCTATTGTAGGTGGGTTAACGTCGTTAGCTAAGATCCTTACTGTTGGTCTGCTGGGTCGTAGGGCATCCGATGGTGTTGACGATATCGTTGATGCCGCAGGAGGGGCTTCAGGGAGACGTAGAGGAAGAAGAACCAGAGGTGGTAGGGTAGGTAGAGGAAGAGCATTTAAATTCGGCTTAGCGGGTTTGGCTACCGCTGGATTAGGAATGTACCTCGACGCCACCAATGAAGAACACGAAGGCACTAACTGGAAGGATGTAGCGAGCAACACGCTTACTGCAGCCTCAGCAGTATCTTTAGGTTCTAGCGCCATGTCGGCTATGGGGATTAACCTCGGGATCGGATCAGCTATTGCTTCTGGTGCGAGTGCTGCCGGGTCGGCTATTGTGTCGGGTACAGGTGCTTTGGCTACTGCCGTCGCCCCTCTGTTATTTAATCCAGTAACGTTGGGGATTGGGGCGGTCGCAGGCGCCGGGTATTTGATCTATAAGTATTACGCCAAAGGCAAAGGGTCGCAGTTTAAACTTCGTATGGCTCAATATGGTATCAAGGACGTCGAGTCAGATTTAGCCGCTAAGATCAGATCTGCCGAAGAAGCATTACGTGAATATGTCGTCGTAACCGCTGGGGTGGCTTCAATAGCTAAATCAGCTCCTCTCGAACAGATATTCCAAAGCTTCATACCTCAAGCCAATGACAAGGGCCAGCAGCAGGCTTACTTCACTTGGTTTAATCTTCGTTTCAAACCTATTTTCCTGACTTATGCTTCTGCGATCGATACCGCGGGGTACAGGGATTTTGAGACGTTCGATAAATCGACCGACGCTAAATTGTACTCTACTGTCTCCACCATCAATGACAGAATAGGGACAATCAATCCTTATCCTTATCAGATAGCCACGCAGTTCGATGAAGCCACGCCTATAATGGGTAAAGACCAAACCATTAATCAGGTTAGGCTGTATTTGGACGAACTGAAAAGCTTTAACGAAAGACACGGAAGAACAGCTGAGGGGATAGAGAAAGAAGGCGTCGTGACCATGAAGACCTCCGCCGAACAGGTTGAAAAATCTGAGAAGGCAGGTTGGTGGTCTAGTCTTAAAATGAGAGTGGGTGGGACGTACGAGGATCGTTCTGATATTGAAGAGATCAATAAACGTTATCCGGTAACAAAATCGGTTATGGAAATTAACATCACCGATCTTTTACC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Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
393af9333a40c882a2d03e70d7052d1fc37d94a8b716f07aaadec3f9d95902f8
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5143
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Isolation and characterisation of Klebsiella pneumoniae phages Kabwe,M., Ku,H. and Tucci,J. 2022-11-21 — GenBank