Protein

View in Explore
Genbank accession
QGT54648.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,72
Protein sequence
MALNRLENFLKSSRGKVLHVNPENLDSTDAISNDGSSPFTPFKTINRALMEASRYSYQIGLGNDRFNFCTILLYSGEHLVDNRPGAVISDNGIVRVRSGSTTIINQFDINTILDITNSNNKLYLLNSVHGGVIVPRGTSIIAQDLRKTVVRPLYVPDPISSDAVDENIERSAIFRITGASFFFGFSILDASPNGFCYKNYNTSKFTPNYSHHKLTAFEYADGVNPVKIRDAFINLDTTRTDLDQYYEKISLVYGVSSGRTITDVNYVGGVSVDIQPIIDEYRIVGPRGEVVGISSIISGDGVTPSKVITVTLDGPATGISVDTSIQVSDVNEIGYDGQYVVAAIPTTNQVQYITPNIPTDPNPPLFGATLNIISDTISSASPYVFNVSLRSVYGMCGLHADGSKVTGFKSVVVAQFTAVCLQKDDNAFVIYDEDSGNYVDSSVIPDLYKNTRSRYKPEFENYHIKVSNDSFAQLVSVFSIGYATQIVAESGGDYSITNSNSNFGAKTFISSGYKKDSFDQDDHGYIIGVIPPEEVNVDPVTVEFAQIDIGLTKSVSVGIGTTNRLYLYNKTDINSPPNVIMDGFTVGAKINDTINIELPTRASSKIVIPNTESSYAKSFNVQRQNNDFENAITGGVLTLTQSHTFEAGEKVRVLSENGHLPDGLDDRVYYIIESSIDNTLLNTQVKLATTFNNSINNISILPNRKGGVLSIVSRVHDKIANDPGHPIQWDSVNNNWYITVSETDNGIYSVIIPLSIDSTGRTFVIRTPDRRTEQNKLYKLIYSIPKNTATAARPPINGYIIQESNNSSLTNEELSRYFGSSSLTVDNEIRNPRFISDIRWVSGEIIVTTELPHKLNVGDFTEIVNVLPVGYNGTYQVLRTPSSRSFVYTSTNNPGIFSNDTRNRNIDLPYIKRKEIRDVFQIYKSEEVQKFIRDKQDGIYELTVIHNSVAPTVAPFTEFKFSQPLTNLYPRLDRDNLNIDPDPTVCFADSNLIGSVLVNNPENSVTKESFNKFNSDLVVGFGVTGIVSNQTGTSHTIYTSVDHGLAGITSVSVVSTGASYISGTYYGVGVGTTSGGISASFKVVVDGTQRVSSVSLMNGGSNYSVGNRISIISGIGTTTGFIPAVLNVTAIADSIDNSVSVSGFCEKYSNYNDAYRITEIKNSNQVIVSSASTIIGFSTSIVPIIGAGIINGKIIPIVSLTYNNVTGISTVTLGRSSGIKLNSKIRITGFNSDLYNQDVVVTKVNSLTQVEVKTGISTTTPLTSGSGIVIPLGISPIIGKNRNSYYYSGISTTTGSALNSNASDSTPLNIRNATVTGLNQGDFIEVNGEIMRIKSPITSNLVPVYRGVFGTERTTHPTNSLVKKVQIIPVELRRNSIIRASGHTFEYVGYGPGNYSTALPENQDREISTKERLLSQATKIGGGTIYYSGMDENGDFYSGNRKLSSSTGQEEVYDLPIPTVVGEYSTPNIAESDKLIVSSSITVNGGENNNAVSEFNGPIILNKKLTSYSPDGIETTSLFLQGDQESSRRHSISEDTPIIVGNYGDILYRATPNEGENIGWVYTTNNRWKTWGYVGDLGTLVYLYSGTESTSTLEGIVDSLKIVGDPNGFGIDVDIQIDPVVGFGTIVLRNPISIINFGTELSRNNPTFTNRSGGSRLVYYNNLNTTNVDYATGVSANSLWNSIPINDSSVNFKWFAGETEIASLNGVGNLTIAGTLNVSGGITGTITGNVTGNLTGTATSSITSANLTRSVVAGDGLAGGGSLNGQDVTLNIGTVVNGGIQVDGDSIQVDSTVVRTSGTQSISGAKTFNDGVSVTGNTSSTTFTGNGIAPIGGIIMWNGTFAEAATLQPGWAICDGRTVSGRTTPDLRNRFIIGSAGDSGGISVATITGGVTKTGGNKDSIVVSHSHTGSTTGAGGHIHDVSDPGHSHNATAAVTGAAFPSLASSGRLGLVVANTTISTTGSGTGISISAVGNHTHGLSIDATGGSGTDANLPPYYALAFIMRTA
Physico‐chemical
properties
protein length:2005 AA
molecular weight: 214551,20190 Da
isoelectric point:5,27246
aromaticity:0,07980
hydropathy:-0,13496

Domains

Domains [InterPro]
DC_0066
STR
1–2005
DC_0066
G3DSA:6.10.140.2190
STR
1776–1817
G3DSA:6.10.140.2190 IPR037053
IPR040956
Unmapped
1789–1808
IPR040956 SSF88874
QGT54648.1
1 2005
Architecture
STR
ATT
STR
STR 1-1820 | ATT 1821-1880 | STR 1881-2005
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage B23
[NCBI] 		2674977 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QGT54648.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MN695335.1 [NCBI]
CDS location
range 18012 -> 24029
strand +
CDS
ATGGCGTTAAACCGTTTAGAGAATTTTCTGAAGTCTTCTAGAGGAAAAGTTCTTCATGTAAATCCAGAAAATCTGGATTCAACTGATGCAATTTCAAATGATGGTTCCTCACCATTTACTCCGTTTAAGACCATCAACAGAGCCCTCATGGAGGCTTCAAGATATTCTTATCAAATTGGTTTAGGTAATGATAGATTTAATTTCTGCACCATTCTATTATACTCAGGTGAACATCTTGTAGATAATAGACCAGGTGCAGTAATAAGTGATAATGGAATAGTAAGAGTAAGAAGCGGTTCTACTACAATAATCAACCAGTTTGATATAAACACTATTCTTGATATCACAAATTCCAATAATAAATTATACCTCTTAAATTCTGTTCATGGTGGAGTGATAGTTCCAAGAGGAACATCTATTATTGCACAAGATTTAAGGAAAACAGTAGTTAGACCATTATATGTTCCAGATCCTATAAGTAGCGATGCTGTCGATGAAAACATAGAAAGATCCGCTATTTTTAGAATTACTGGGGCTTCTTTTTTCTTTGGTTTTAGTATTTTAGATGCAAGTCCAAATGGATTCTGTTATAAAAATTATAATACTTCTAAATTTACTCCAAATTATTCACACCACAAATTAACCGCATTTGAATATGCTGATGGGGTGAATCCAGTAAAAATAAGAGATGCTTTTATTAATCTAGATACTACTAGAACTGACCTAGATCAATATTACGAAAAGATTTCTCTGGTTTATGGTGTTAGTTCTGGTAGAACTATAACTGATGTAAATTATGTTGGTGGAGTATCTGTCGATATTCAACCAATTATTGATGAATATCGAATTGTTGGACCTAGAGGAGAAGTTGTAGGTATTTCAAGTATTATTTCTGGTGATGGTGTAACGCCATCAAAAGTAATCACCGTAACTCTAGATGGACCAGCAACTGGTATTTCAGTAGACACTTCTATTCAAGTTTCTGACGTTAATGAAATAGGATATGATGGACAATATGTTGTTGCCGCTATTCCAACAACTAATCAGGTTCAGTACATAACACCGAATATTCCAACTGATCCAAATCCACCATTATTTGGTGCTACGTTAAACATCATATCTGATACTATATCATCAGCGTCACCATATGTTTTTAACGTATCATTAAGATCCGTTTATGGCATGTGTGGCCTACATGCAGACGGTAGTAAAGTTACTGGATTTAAGAGTGTAGTTGTTGCACAATTTACTGCTGTTTGTTTACAGAAAGACGATAATGCATTTGTAATTTATGATGAAGATAGCGGTAATTATGTTGATTCATCAGTAATACCAGATCTCTATAAAAATACCAGATCAAGATATAAGCCAGAGTTCGAAAACTACCACATTAAGGTATCTAATGACTCTTTTGCACAGCTAGTTTCTGTTTTCTCTATTGGATATGCTACTCAAATTGTTGCGGAAAGCGGTGGTGATTATTCAATCACTAACTCAAACTCCAACTTTGGGGCAAAGACCTTCATTTCTTCTGGTTATAAAAAGGACTCATTTGATCAAGATGACCACGGATACATTATAGGTGTAATTCCACCCGAAGAAGTAAATGTAGATCCAGTTACAGTTGAATTCGCTCAGATTGATATTGGTCTGACTAAATCTGTTTCTGTGGGAATCGGCACCACAAATAGATTGTATTTGTATAATAAAACTGATATAAATTCTCCACCTAATGTAATTATGGATGGATTTACTGTTGGTGCTAAAATAAATGATACAATAAACATTGAACTACCAACAAGAGCATCATCTAAAATTGTTATACCGAATACTGAAAGTTCATATGCAAAATCTTTTAATGTTCAAAGACAAAATAACGATTTTGAAAATGCGATTACCGGTGGAGTTTTAACTCTAACACAATCACACACATTTGAGGCCGGTGAAAAAGTAAGGGTATTGTCTGAAAATGGACATCTACCAGACGGTCTTGATGATAGAGTTTATTATATTATAGAATCGAGTATCGATAATACTCTTTTAAATACTCAAGTAAAACTAGCCACCACATTTAATAACTCTATCAACAATATATCCATACTACCAAATAGGAAGGGTGGAGTTCTTTCAATTGTAAGTAGAGTACACGACAAGATAGCGAATGATCCAGGACACCCTATTCAGTGGGATTCGGTTAATAATAATTGGTATATTACTGTAAGTGAAACAGACAATGGAATATATTCTGTTATTATTCCCCTTAGTATTGATAGCACTGGAAGAACTTTCGTCATCAGGACCCCCGATAGAAGAACAGAGCAGAATAAATTATATAAATTAATTTATAGTATTCCAAAGAATACAGCAACCGCTGCAAGGCCGCCAATTAACGGATATATCATACAGGAAAGTAATAATAGTTCTCTTACTAATGAAGAACTTTCAAGATATTTTGGAAGCAGTAGCTTAACTGTAGACAATGAAATTAGAAATCCTAGATTTATTTCTGATATACGGTGGGTCAGTGGTGAGATTATAGTAACTACAGAATTGCCTCATAAGTTAAACGTAGGGGACTTTACCGAAATTGTAAATGTTCTCCCTGTTGGATATAATGGAACATATCAAGTATTAAGAACACCTAGTTCTAGAAGTTTCGTTTATACTTCAACAAATAATCCTGGTATCTTCTCAAACGATACCAGAAATAGAAATATTGATCTTCCATATATTAAAAGAAAAGAAATCCGGGATGTTTTTCAAATCTATAAATCTGAAGAAGTTCAGAAATTTATTAGAGATAAACAAGATGGTATATATGAATTAACAGTTATTCATAATTCTGTAGCACCGACAGTAGCGCCGTTTACTGAATTTAAGTTCTCACAACCATTAACAAATCTCTATCCAAGATTGGATAGAGATAATTTGAATATAGATCCAGATCCAACAGTTTGTTTTGCTGATTCTAATCTAATTGGTAGTGTATTAGTAAATAATCCAGAAAACTCAGTTACAAAAGAATCTTTTAATAAATTTAATTCTGATTTAGTGGTTGGTTTTGGTGTCACAGGTATAGTGTCCAATCAAACTGGTACTTCACATACGATTTATACTAGTGTTGATCATGGATTGGCTGGTATTACTAGTGTTTCTGTCGTTAGTACTGGAGCATCTTATATAAGTGGAACTTACTATGGGGTGGGTGTTGGTACTACTTCTGGTGGAATATCAGCGTCCTTTAAAGTTGTTGTTGACGGTACTCAAAGAGTTTCATCTGTCAGCCTCATGAATGGGGGCAGCAATTATTCAGTTGGAAACCGAATTTCTATTATATCAGGAATCGGAACTACTACTGGATTTATTCCTGCCGTTTTAAATGTAACTGCAATTGCCGATAGTATTGATAACTCAGTTTCCGTTTCTGGTTTCTGTGAAAAATATTCGAATTATAATGACGCATATAGAATAACCGAGATTAAAAATTCAAATCAAGTAATAGTTTCTTCAGCATCTACAATAATTGGGTTTTCGACTTCAATAGTTCCGATTATCGGTGCAGGCATAATTAATGGTAAAATTATACCAATAGTATCATTAACATATAACAATGTCACTGGTATTTCAACTGTTACTTTAGGTCGATCATCTGGTATAAAATTAAATTCTAAAATTAGAATTACTGGATTTAATTCCGACTTATATAATCAAGACGTTGTAGTAACTAAAGTAAACTCTCTGACACAAGTTGAAGTCAAAACTGGTATTTCTACTACAACACCACTAACTAGTGGTTCTGGTATTGTAATTCCATTGGGTATTTCACCTATTATTGGAAAAAATAGAAATAGTTATTACTACTCTGGAATTTCAACAACCACTGGATCCGCACTTAACTCTAATGCTTCTGATAGCACACCACTTAACATAAGAAATGCCACTGTAACTGGTTTAAATCAGGGTGATTTTATTGAAGTGAATGGTGAAATCATGAGAATTAAATCACCTATAACTTCAAATTTAGTTCCAGTTTATCGTGGAGTTTTTGGTACTGAAAGAACAACACACCCAACCAATTCTTTAGTTAAAAAAGTACAGATCATTCCAGTTGAATTAAGAAGAAATTCCATCATTAGGGCGTCTGGTCATACATTTGAATATGTTGGTTATGGTCCAGGTAATTATTCAACTGCGTTACCGGAAAATCAAGACCGAGAGATTTCAACCAAGGAAAGATTACTATCACAGGCTACTAAGATAGGTGGTGGAACAATCTATTATAGTGGAATGGATGAAAATGGTGACTTCTATTCTGGAAATAGGAAGTTGTCATCTTCCACTGGACAAGAGGAAGTTTATGATCTTCCAATTCCAACAGTTGTAGGCGAATATTCTACCCCGAATATTGCGGAATCTGATAAATTAATTGTTTCCAGTTCCATTACGGTTAATGGTGGTGAGAATAATAATGCGGTATCTGAATTCAATGGACCCATTATTTTAAATAAAAAATTAACATCATATTCACCGGACGGAATAGAAACCACCTCGTTGTTTTTACAAGGTGATCAAGAAAGTTCAAGAAGACATTCTATTTCTGAAGATACTCCAATTATTGTAGGTAATTATGGTGATATTCTTTACCGTGCCACTCCAAATGAGGGTGAAAATATTGGATGGGTTTATACCACAAACAATAGATGGAAAACCTGGGGATACGTTGGCGATCTAGGAACATTAGTTTACTTATATTCTGGAACAGAATCGACATCCACTTTAGAAGGTATCGTTGATTCACTTAAAATTGTTGGTGATCCTAATGGATTCGGTATAGATGTTGATATTCAAATAGATCCAGTAGTTGGATTTGGTACAATTGTATTACGAAATCCAATTAGTATTATAAATTTTGGAACGGAGTTAAGTAGAAATAATCCGACTTTTACAAATAGAAGTGGCGGATCTCGATTAGTTTATTATAATAATTTAAATACAACTAATGTAGATTATGCCACTGGTGTAAGCGCCAACTCTCTATGGAATTCAATTCCAATTAATGATTCCTCAGTTAACTTTAAATGGTTTGCTGGTGAAACTGAAATTGCATCTTTAAATGGTGTTGGTAATCTTACCATAGCTGGAACACTTAACGTAAGTGGTGGAATTACTGGTACCATAACCGGTAATGTGACTGGTAATTTGACTGGCACTGCGACAAGTTCAATAACATCTGCAAACTTAACTCGATCAGTCGTTGCTGGTGATGGATTAGCTGGTGGCGGATCTTTAAATGGCCAGGATGTAACTTTAAATATAGGTACTGTGGTAAATGGTGGTATTCAAGTTGATGGTGATAGCATTCAAGTCGATTCCACTGTAGTAAGAACTTCTGGAACTCAGAGTATTTCTGGTGCCAAGACTTTTAATGATGGTGTTTCTGTTACTGGAAATACTAGTTCAACTACATTTACTGGTAATGGTATTGCCCCAATTGGTGGTATTATTATGTGGAATGGTACTTTTGCTGAAGCTGCCACATTACAGCCAGGTTGGGCAATATGTGATGGTAGGACAGTAAGTGGGAGAACTACTCCAGACTTAAGAAATAGATTCATTATTGGATCTGCCGGTGATTCCGGTGGAATATCTGTTGCCACAATAACCGGTGGAGTTACTAAAACTGGTGGTAATAAAGACTCAATTGTTGTTTCACACTCACATACAGGGTCTACTACTGGTGCTGGTGGTCACATTCACGATGTTTCAGATCCTGGTCACTCTCATAATGCGACTGCCGCAGTAACTGGTGCTGCGTTCCCATCACTTGCTTCTTCTGGTAGGTTGGGTCTTGTCGTGGCCAATACAACAATTAGTACCACTGGTTCTGGAACTGGAATTAGTATCTCTGCTGTTGGTAATCACACTCATGGATTATCGATTGATGCTACGGGCGGTTCAGGAACAGATGCTAATCTCCCACCATATTATGCACTTGCATTCATTATGAGAACTGCTTGA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
bf03626bd332923d6585dccbae12634ecfac559f0770b65e0cbac2edcae3a021
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,8015
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete genome sequences for two Myoviridae strains infecting cyanobacteria in a subarctic lake Levesque,A.V., Thaler,M., Labrie,S.J., Marois,C., Vincent,A.T., Lapointe,A.-M. and Culley,A. — — GenBank