Protein

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Genbank accession
XMN00704.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,76
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MADQNLKQIQFKRTSTENKAPGADIVARGEIALNTHGRTLAIYTKDEADNVVQLAGKGVPFLDTSGTLSVDGTTTLKDNVTISPNKAISFETTDLSGEITRHIVGKCATNDGWYIGAGGTSNNGILEIGTIDDGTETIQFVQRGAGNVEARKLVLLDGSGNTTLPGDLRLSTNKTVKISNGSTLTLEMGVGANDAYIKNLRGSGVLQLTNDSNLTFRNSQVYYAMNGRGPGKSGTLLTNVENNRQAWQYTISAATASTPRWVKVATIKHPGMGSSQLDLMISGGIDSGHGRHYVDFITLSGRNLTSWSTNSLDNWVEWRRVGSPSKTNVPEYYVVKNDSATDADASFDFYAKIPRYGNDLYVTVLNTSGYNGQDSGTVIIYETNQDTGATTPSGSILVSMKQIFDSLAKPDFGDTTGTLPVNRGGTGATNVGDARNNLGLGTAAVRDVGESAGNVLENGAYGLGGNGGKSINDIISNADMLTRLKAHGGTFWRGVTKSGVSVQNGLYSHGSGIFMNAGDTMSAINIDYASAKVRVYAANNSDLAAGNVNYNELYGTANKPTKADVGLGNLTNDTQVKKAGDTMTGDLTVPNLHASGPGTASVYVNAGSGNAHVWFRTDGNERGVIWATPNTADLGQINIRAKTTGDVSAGDFSFRSDGRLDVPVAVKIGGAAMLTKDGNITSGSMFGGNLNNYLTSIKNDITTGDSKQVSKTGDTMTGNLTINANLKVENPNGSMVDLGSENSDKYSRLTLARKVGSGASVAMLKITPEGYVQFGYQDAVATPSPSKYIRVKPDGLDVEGDLVFNQTYRGTEEAVDISDKTNDLNNMVIKGSDLGTRLLYKCTSTGGASNISNKPTSDGNFVLEVLSLRKISDNDWTCKQTFTTKNGNVEGTYVRYCQNGTWSAWKEVVAGVQPINLGGTGATSVAAARNNLGVGEGQTVSFGNLVTNDLTANGNVRLVGRLNLGSTSATGVLRANETGAVVLGSASGQNIHIRAGSPDTSSGETRFEPNGNVLVGGVLTTSGSLQVNGEATMGRSLIVSQNIKNTNDNSFILMGKDSDLGFVKKSNSGAKLVFASGKSFIVAKSSATTIANPATETYTDVFKVDADGNQTVYGNSTVSRALTVSSSATVNGVINANGGIIVPTTKYVQIADAPTQNNQATNKKYVDDKVASAISNAGDTYLPLAGGTVTGRLIITGDQLKTTSLWTTGDAAVNGALTVDGNVVSNYGIGSFVGAVDVKAPAVDNGTTHLWFRHSNGGERGVIYMPGNNNTMMGLRAASSEWQFHGATGQITGPGARWTLHSDGNLQSSLFTSYGVGGEGYINNWVPGVANKVSNDNIWAWRISRGAFDVGMYIMAATRNEWTGGQEFTPGQTIAGSNLFWTTADGGDWNYGDKRLSGTWMACGFSAVTNNIHRTTIWKRIA
Physico‐chemical
properties
protein length:1422 AA
molecular weight: 149537,01110 Da
isoelectric point:6,47836
aromaticity:0,07032
hydropathy:-0,30288

Domains

Domains [InterPro]
DC_1942
ATT
4–617
DC_1942 cd19958 DC_0238
DC_0468
STR
484–1012
DC_0468 DC_1233
XMN00704.1
1 1422
Architecture
ATT
STR
RBD
ATT 4-617 | STR 618-1012 | RBD 1013-1422
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
XMN00704.1
1 1422
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 1057 1057 0,1063
Central domain 1058 1256 200 0,3198
C-terminal 1257 1422 165 0,9499
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-1057
Central
1058-1256
C-terminal
1257-1422

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Klebsiella phage Mexia
[NCBI] 		3374133 Viruses >
Host Klebsiella pneumoniae
[NCBI] 		573 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XMN00704.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ368522.1 [NCBI]
CDS location
range 153577 -> 157845
strand +
CDS
ATGGCCGATCAAAACTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAACTAGCACAGAGAATAAAGCACCAGGTGCAGATATCGTAGCCCGTGGCGAAATCGCGTTGAATACACATGGGCGTACTCTCGCTATCTATACCAAAGATGAAGCTGATAATGTTGTTCAGCTTGCTGGTAAAGGTGTTCCTTTCTTAGATACATCTGGAACTCTTAGCGTTGATGGAACTACTACATTAAAAGACAACGTTACTATTTCTCCGAATAAAGCGATCAGTTTTGAAACTACTGATTTAAGCGGTGAAATAACTCGTCATATCGTTGGCAAATGTGCTACTAATGATGGCTGGTACATTGGTGCCGGTGGTACAAGCAATAACGGCATTCTTGAAATCGGTACTATTGACGATGGTACTGAAACCATCCAATTTGTGCAACGTGGCGCAGGTAATGTTGAAGCCCGAAAATTAGTCTTGCTTGATGGTTCAGGTAATACTACTCTTCCTGGGGATTTAAGATTATCCACTAATAAAACCGTTAAAATTAGTAATGGAAGCACTCTTACTTTAGAAATGGGTGTAGGTGCTAATGATGCCTATATTAAAAACTTGAGAGGCTCGGGTGTTCTTCAATTAACCAATGATAGTAACCTGACGTTCAGAAATTCCCAGGTTTATTATGCCATGAACGGAAGAGGTCCTGGTAAATCCGGTACTCTTCTGACGAATGTAGAAAACAATCGTCAAGCCTGGCAATATACCATTTCTGCTGCAACTGCGTCAACTCCACGCTGGGTAAAAGTAGCTACAATAAAGCATCCAGGAATGGGTTCTTCGCAACTGGATTTAATGATTAGCGGTGGTATTGATTCTGGGCACGGTAGACATTACGTTGATTTTATCACGTTATCAGGACGAAATTTAACATCATGGAGCACCAACAGTTTAGATAACTGGGTTGAATGGCGCCGGGTTGGGTCTCCTTCTAAAACGAACGTTCCAGAGTATTACGTTGTTAAAAACGATTCTGCTACTGATGCGGATGCGTCATTTGATTTTTATGCTAAGATTCCTCGTTATGGCAATGACCTTTATGTTACAGTGCTAAACACATCTGGATACAACGGCCAAGATTCAGGTACAGTAATTATCTATGAAACCAATCAAGATACTGGTGCTACTACACCGTCTGGAAGTATTCTTGTTTCAATGAAACAGATTTTTGATAGTTTAGCAAAACCAGATTTCGGTGATACCACAGGTACTCTTCCGGTTAACCGTGGTGGTACAGGTGCTACTAACGTAGGAGACGCTCGAAATAACTTAGGTTTAGGTACTGCGGCTGTTCGTGATGTTGGTGAATCTGCTGGTAACGTTTTAGAAAATGGTGCTTACGGCTTAGGTGGCAACGGTGGTAAATCCATCAATGACATTATCTCTAACGCTGATATGTTGACTCGTTTAAAAGCACACGGCGGTACTTTCTGGCGTGGTGTTACTAAATCTGGTGTTAGCGTTCAAAATGGCCTTTATAGCCATGGCTCTGGTATTTTTATGAATGCTGGCGACACCATGTCAGCCATTAATATCGACTACGCTAGTGCTAAAGTTCGTGTATATGCAGCTAACAACAGTGATCTTGCCGCAGGAAATGTTAACTACAATGAACTTTACGGCACAGCAAACAAACCAACAAAGGCTGACGTTGGACTTGGTAATCTGACAAACGATACTCAAGTTAAGAAAGCTGGTGACACCATGACTGGTGATTTAACTGTTCCTAATTTACATGCTTCCGGCCCGGGTACTGCATCAGTATATGTTAACGCAGGAAGCGGAAACGCTCATGTATGGTTTAGAACAGACGGTAACGAACGTGGTGTAATTTGGGCAACTCCGAATACAGCGGACTTGGGTCAGATTAATATTCGTGCAAAAACTACTGGTGATGTTTCTGCCGGTGATTTTAGCTTCCGTTCTGATGGCCGCCTGGATGTTCCTGTAGCAGTTAAAATTGGTGGAGCAGCAATGCTAACCAAAGACGGGAATATTACCTCTGGTTCGATGTTTGGTGGTAACCTTAACAACTATTTGACTTCTATTAAAAATGATATCACCACTGGTGATAGTAAGCAAGTAAGCAAGACCGGTGACACCATGACCGGTAACTTGACTATTAACGCTAACTTAAAAGTCGAAAACCCTAATGGATCAATGGTTGATTTAGGTTCAGAGAACTCAGATAAGTATAGCAGATTGACCCTTGCACGTAAAGTTGGCTCTGGCGCTTCCGTAGCAATGCTTAAAATTACTCCTGAAGGATACGTGCAATTTGGTTATCAAGATGCAGTTGCTACTCCGTCTCCTAGCAAGTACATCCGAGTTAAACCTGACGGTCTTGATGTAGAAGGGGATTTGGTTTTTAATCAGACCTATCGCGGCACTGAAGAGGCAGTTGATATTTCTGATAAGACTAATGACCTTAACAACATGGTTATTAAAGGCAGTGATTTAGGTACTCGTCTATTATACAAGTGTACTTCTACCGGCGGTGCTTCTAATATATCTAATAAACCTACATCTGACGGCAACTTTGTTCTTGAAGTTCTGTCTTTGCGTAAAATTTCTGACAATGATTGGACGTGTAAGCAGACCTTTACTACAAAGAATGGTAATGTTGAAGGTACATATGTTCGATACTGCCAAAACGGTACATGGTCTGCATGGAAAGAGGTTGTTGCTGGTGTTCAGCCAATTAATTTAGGTGGTACTGGAGCAACATCTGTAGCTGCTGCTCGTAATAATCTTGGTGTTGGTGAAGGACAAACAGTATCATTCGGTAATTTAGTTACCAACGATTTAACTGCAAACGGAAACGTTAGATTAGTTGGAAGACTGAACCTTGGTTCTACTTCTGCGACTGGCGTATTACGAGCTAATGAAACTGGTGCGGTTGTCTTAGGTTCTGCTAGCGGTCAAAACATCCACATCAGAGCAGGAAGCCCAGATACTTCTTCTGGTGAAACCCGCTTTGAGCCAAATGGAAACGTTTTAGTTGGCGGAGTTCTGACGACTTCAGGAAGCTTGCAAGTAAATGGCGAAGCCACGATGGGCAGAAGCTTGATCGTTTCTCAAAACATAAAGAATACTAACGATAACAGTTTTATTCTGATGGGAAAAGATTCGGATTTAGGTTTCGTTAAAAAATCTAACTCAGGCGCTAAACTGGTATTTGCTTCAGGAAAATCGTTTATTGTCGCTAAATCGTCAGCAACTACCATAGCTAACCCAGCGACGGAAACTTACACTGATGTATTTAAAGTTGATGCTGATGGAAACCAAACTGTTTATGGAAATTCAACAGTTTCTAGAGCTCTGACTGTATCAAGCTCAGCGACCGTTAATGGCGTTATTAATGCCAACGGCGGTATTATTGTTCCTACTACCAAGTATGTGCAAATTGCCGATGCTCCTACGCAGAATAACCAAGCCACCAACAAGAAATATGTTGATGACAAGGTTGCTTCTGCTATTAGTAATGCTGGCGATACTTATCTTCCGTTAGCTGGTGGTACTGTAACCGGAAGATTAATAATTACAGGTGATCAGTTAAAAACTACATCGCTCTGGACTACCGGAGACGCTGCTGTTAATGGTGCTTTAACTGTTGACGGTAATGTTGTTAGTAATTACGGTATTGGTAGCTTTGTTGGTGCTGTAGATGTTAAGGCCCCTGCCGTAGATAATGGTACAACGCACCTTTGGTTCCGACATTCTAATGGTGGCGAGCGTGGTGTGATTTACATGCCAGGTAACAATAATACCATGATGGGATTAAGAGCCGCTTCTAGTGAATGGCAGTTCCACGGTGCTACAGGACAAATTACTGGCCCTGGAGCGCGTTGGACGTTGCATTCTGACGGTAACTTACAATCTAGCCTATTCACTTCATATGGTGTAGGTGGCGAAGGTTATATTAATAACTGGGTTCCTGGCGTAGCTAATAAGGTATCTAATGATAATATTTGGGCCTGGCGTATTAGTCGAGGCGCATTTGATGTCGGTATGTATATCATGGCAGCTACCCGCAACGAGTGGACTGGTGGACAGGAATTTACACCAGGACAAACTATCGCGGGAAGTAATCTTTTTTGGACAACAGCTGATGGTGGGGATTGGAATTATGGCGATAAACGCCTTTCTGGCACCTGGATGGCCTGCGGATTCTCTGCTGTCACTAATAATATTCACCGCACAACTATTTGGAAAAGAATTGCATGA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
6b8628b3ce62d3902a557dc7b1ea9d9e60c115ed07ebc159506433ddc51de7bf
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,4971
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete genome of Klebsiella phage Mexia Mora,D.A., Lessor,L. and Gill,J.J. 2021-01-28 — GenBank