Protein
View in Explore- Genbank accession
- YP_012475971.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TF
- Protein sequence
-
MAGGRRFQAGLGSEHKRLYKEGQQINTLLLAQVIQVNYKYNTVDLLALQHKEVFQNSYANEGRFSARLPMEFGGRNLAGQPYGQVNPIAVGTVVLVGFINSDKDMPIVISVYNNNDVNKQLSRTRFANADPTDMALAGQMYQKFSLYPSLTYDSIDGDGNRVVTFSGKSFIAFDTKDMQNSPMTDASYGSRYEDLGTSYYNDGELIEPMKGRAPNVLFKHQGILDDDNKPDTHNFMIHINPDGTYRTSMMDTEQDWRTMFEMTPEGKIRLRRQGDTVRLNDGFEIGELGINEEGIVYLRNGDMDLEVREDGIYSQGKLITEGINLDDIYDKISNITFEINKTNESLQILTEKSELQDGKIVNLETEITIVAGKVESKVSATEVQDMIDSSIVDMTEAIRQAQEDADRANQVISDMASDNRLAPSEKLDLLKEWDIIKNEYPTYLAQAELYEVDSTTYTAKYKALETFVTPLLADMEATSVVDGSIMRKTFSAYYTERINLLNAITKGLKDGLEEAMKKASQASVDATQALADSAQAQIDANNAQQLIADIASDGKLTASEKYQLKKEWDVIAKEYPTTIAQATKYKVNTDNYTAKYKALETFVTPLFANMDETSVVNGEQLRVVFSDYYAVKITLLKEITDIARDELTDYGNRITVAETKITQTSEAITLMATRVETVENNVKTNTAQLKVQADLISQKVTASEVKDAIDNAIDNMSIGGSNLFVIKTQTAGLLNENDGTVGTAVDKSVVSNYIKVTAKTPYVASLYGNTGTNTIIIAWYDTSKTFISGQAVADSSDFHKTYVAPENAVYARLSYKKADTVKMKFEVGTKPTDYSPSWDDIKGDQTALEEYIKQVEEQAKQAQQEAENAKNEAENANSAIADMSNDNMLTANEKQQILLQWEEIKTEYPINLDQATKFGVSATQYTTSYNSLKTYLEPLLADMTTTSVIIGSTMRSTFTTYYDRRTTLLNRVAELAKQVADQAKDTADKVDDDLNNIGGYNYIGFSSGDHMYPRLMIKNVGYYYVPSTTSAEFVDDMVCLKPKTATATSVQYDIGNSSASVANVGLANYRMKEVKTGQWLTASANLKVVGTGTAYLTIFTLENGSWKASYSDRISANQGVTRVVAQRQVTDATTGILVRVDGSNITEVHFGNTQLEVGIRPTPWKKSDIDIQEDINNVADDIKDYIGARSDNLITNGFGELGNNTNIGGIFDGADRIVGKGSFRQEEGNKSLLFSEHIVIDNKKVYNFDYYMHTLKGVGRSYAMICPYDVDGIRITYPSLGGRNYNSTTPVKFTKLVKPLKVGDTEVYVEDVSLWNGQAPQDYQRSIIMWGYKNSFGYTYPDGTYSQLMQMKTYDIGAVDITANKITLNKPWAVTNPNSSDGVFPVGHTLSPTSDGSTYLYLTGHVNLQVPTTYTKYSHLISGSTEFANTTFIPVETGSIQLGFLLNRDTTGEKSWLNGLRLRDYTDTYKLNDDVRETQENVDKAQADANKANQSIADLSNDNLVTPNEKLDLKKEWEIIVAEKPKNDAQADKFGVSKVAYGTAYTALDTYLKPILASTTTNSAIVGQTMRDTFKAYYTARTDLLNAIASKAKELADNAQDTADNITVGTRNLLVGTKDFSKGIPSGNTSVTIDTDKLFGNAVLKNNLVGTTGQSDMYKLATSITPTATQYTLSFYAKADTANAKMYCYFYEPNTTTKVETSQGVKESTLSGNGAVQITLSTEWVKYWVTWTQTATTTVKSVIIGRVKAEDTPKSAVYMSSPMMVEGNKAQTWVQAPEDVQEQLNGKEGAWVYSPTEPTNPAIGLVWVDSSKTPNQPKRWVGGETGWVALTPEEVKDLPWGEDGSSLADWVAQAEQKISSDAIISTVLGSEDFTGIFDSKANTEDLNNLASYDDLDAMQAEYERLLQEGIAGIDFSPYVTNTELEQLKDSFTFSVQQAGGVNMLKNSLGFSGTDFWQASSGIDTTQNEQLSKLGFGSGFMINRVQNATLSQKIELPEAKQGLQYALSFYMNVATFGDVTDFQCGAHIYEEGVLKYTVGVTDATQDIPSDYHLYKLVFEPESPNTVIELFVTNGAGATVIISGVMYNIGNIALKWQPYPSEIYNTNVKIDINGITVKNNQTDGYTMITPQEFSGYARVNGEMERIFTLNGQVTEVKMLQAEKRITMEPISVFAMNSKETNTIGWAFVASGEVAHSAIASRTQ
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 2201 AA molecular weight: 243262,96820 Da isoelectric point: 4,76728 aromaticity: 0,08996 hydropathy: -0,40127
Domains
Domains [InterPro]
DC_1874
ATT
75–510
ATT
75–510
Coil
Unmapped
391–418
Unmapped
391–418
1
2201
Architecture
ATT 75-510 | STR 555-2201
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Enterococcus phage TJE1 [NCBI] |
2951262 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host |
Enterococcus faecium [NCBI] |
1352 | cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Bacillota > Bacilli > Lactobacillales |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_012475971.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_109279.1
[NCBI]
CDS location
range 50933 -> 57538
strand -
strand -
CDS
TTGGCAGGAGGACGTAGATTTCAGGCAGGGTTAGGTTCCGAACATAAAAGATTATACAAAGAAGGACAACAAATTAATACTTTGTTGCTAGCCCAAGTTATCCAAGTTAATTATAAATACAATACAGTTGATTTACTAGCATTACAGCATAAAGAAGTTTTTCAAAACTCCTATGCCAATGAAGGTAGATTTTCTGCTCGTTTACCAATGGAATTTGGTGGACGAAATCTTGCAGGACAACCATATGGTCAAGTAAACCCTATTGCCGTTGGTACTGTTGTCCTAGTAGGTTTTATTAACTCTGATAAAGACATGCCGATTGTTATTAGTGTATACAATAACAACGATGTAAATAAACAATTATCCCGTACACGTTTTGCTAACGCAGACCCTACAGATATGGCTTTAGCAGGACAAATGTACCAAAAATTTAGTTTGTACCCATCTTTAACTTACGATAGTATTGATGGTGATGGTAACCGAGTAGTTACATTCTCTGGTAAATCATTTATTGCATTCGATACAAAAGATATGCAAAACTCCCCAATGACAGATGCTAGTTATGGTTCTCGTTATGAAGACCTAGGAACATCTTACTACAATGATGGGGAACTAATTGAACCGATGAAAGGTCGAGCACCAAACGTGTTATTCAAACACCAAGGGATTCTTGACGATGATAATAAACCTGACACACATAATTTCATGATTCATATTAACCCAGATGGAACATATCGTACATCTATGATGGATACGGAACAAGACTGGCGGACAATGTTCGAAATGACACCGGAAGGTAAAATTCGTTTACGTAGACAAGGGGATACTGTACGTTTAAATGACGGGTTTGAAATTGGTGAACTAGGTATTAACGAAGAGGGTATCGTTTACTTACGTAACGGAGACATGGACTTAGAAGTTCGTGAAGATGGTATCTATTCACAAGGTAAGTTAATTACAGAAGGTATCAATTTAGATGATATTTATGATAAAATCTCTAACATTACCTTTGAAATTAATAAGACTAACGAATCATTGCAGATTTTAACTGAGAAATCAGAACTACAAGACGGTAAAATTGTAAATCTTGAAACAGAGATTACAATTGTAGCCGGAAAAGTAGAGTCTAAGGTAAGTGCAACAGAAGTACAAGATATGATTGATAGCTCTATCGTAGACATGACAGAGGCTATTAGACAAGCCCAAGAAGATGCTGATAGAGCAAACCAAGTTATTTCTGACATGGCTAGTGATAATCGTTTAGCTCCTAGTGAGAAGCTAGACTTATTAAAAGAATGGGACATTATTAAGAATGAGTACCCAACTTATTTAGCACAAGCTGAACTATATGAAGTAGATAGTACAACCTATACTGCTAAGTATAAAGCGTTGGAAACATTTGTTACTCCTTTATTAGCAGACATGGAAGCTACTAGTGTAGTAGACGGTTCTATTATGCGCAAAACATTTAGTGCATACTACACTGAACGAATTAATCTGTTAAATGCAATCACTAAAGGTTTAAAAGATGGTTTAGAAGAAGCAATGAAGAAAGCTTCTCAGGCTTCTGTTGATGCGACACAAGCATTAGCCGATTCTGCACAAGCTCAAATTGATGCAAATAATGCACAACAGTTGATTGCAGATATTGCTAGTGATGGTAAACTAACTGCTTCTGAAAAGTATCAGTTGAAAAAAGAATGGGATGTTATTGCTAAAGAATATCCTACTACAATTGCCCAAGCAACAAAGTATAAAGTCAATACAGATAATTACACTGCTAAGTATAAAGCGTTGGAAACATTTGTTACTCCTTTGTTTGCTAACATGGATGAAACAAGTGTAGTTAACGGGGAACAATTACGTGTTGTATTTTCTGATTACTATGCTGTAAAGATTACTTTACTAAAAGAAATTACGGATATTGCTCGTGATGAATTAACTGATTACGGTAATCGTATTACTGTAGCAGAAACAAAAATCACACAGACATCCGAAGCTATTACTTTGATGGCTACTCGTGTAGAAACCGTTGAGAATAACGTTAAAACGAATACTGCACAGTTGAAGGTACAAGCAGACCTAATCAGTCAGAAGGTAACAGCTAGTGAAGTAAAAGATGCAATTGATAATGCGATTGACAACATGTCTATTGGTGGCTCAAACTTGTTTGTAATCAAAACACAAACAGCAGGACTATTGAATGAAAACGATGGTACTGTAGGAACAGCGGTTGATAAATCTGTAGTATCTAATTATATTAAAGTAACAGCTAAGACTCCTTATGTAGCTTCTTTATATGGAAATACAGGTACAAACACAATTATCATTGCATGGTACGATACAAGTAAAACATTTATTTCAGGTCAAGCTGTAGCTGATTCCAGTGATTTCCATAAAACGTATGTTGCACCAGAAAATGCTGTGTATGCACGTTTAAGCTATAAAAAAGCTGATACTGTTAAAATGAAATTCGAAGTAGGTACAAAGCCAACTGATTACAGCCCATCATGGGATGATATTAAAGGTGACCAAACTGCTTTAGAGGAATACATTAAACAGGTAGAAGAACAAGCTAAACAGGCACAACAAGAAGCTGAAAATGCGAAGAATGAAGCTGAAAATGCAAATAGTGCTATTGCTGACATGTCTAACGATAACATGTTAACAGCGAATGAGAAACAACAAATCTTATTGCAATGGGAAGAAATTAAAACGGAATATCCAATTAATTTAGACCAAGCAACTAAGTTTGGGGTTTCTGCCACTCAGTATACAACATCATATAATTCTTTGAAGACATATTTAGAACCATTATTAGCAGATATGACAACAACTTCTGTGATTATTGGGTCTACTATGCGCAGTACATTTACAACGTATTATGACCGTAGAACGACCTTGCTTAATCGTGTAGCTGAATTAGCTAAACAAGTAGCTGACCAAGCTAAAGATACCGCAGATAAGGTAGACGATGACTTAAACAACATCGGTGGATACAACTACATCGGATTCTCTTCCGGAGACCATATGTACCCTCGTTTAATGATTAAGAACGTTGGTTATTACTACGTTCCTTCTACAACAAGTGCAGAATTTGTAGATGATATGGTTTGTTTAAAACCTAAAACAGCTACAGCTACAAGTGTTCAATATGACATCGGTAACTCTAGTGCTAGTGTGGCTAACGTTGGACTTGCTAACTATCGAATGAAAGAAGTTAAAACAGGTCAATGGCTGACTGCTTCTGCAAATTTAAAAGTTGTGGGAACAGGTACTGCTTATCTAACTATTTTTACACTGGAAAATGGTTCATGGAAAGCTTCATACAGTGATAGAATTAGTGCAAATCAAGGTGTAACCCGTGTAGTTGCTCAAAGACAAGTTACAGATGCGACTACAGGTATTTTAGTTCGAGTTGATGGAAGTAACATAACCGAAGTTCATTTCGGAAATACGCAGTTAGAAGTTGGTATCCGACCTACTCCTTGGAAGAAATCAGATATTGACATTCAAGAAGACATCAACAATGTTGCAGATGACATTAAAGACTATATCGGTGCTCGTTCAGATAACCTAATTACAAACGGTTTTGGTGAGTTAGGGAACAATACGAACATTGGTGGTATCTTTGATGGTGCTGATAGGATTGTAGGTAAAGGTTCCTTCCGTCAAGAAGAAGGAAACAAATCACTATTATTCAGTGAACACATTGTTATTGACAATAAAAAAGTTTATAATTTTGATTACTATATGCACACATTAAAAGGTGTAGGTAGAAGTTATGCCATGATTTGTCCTTATGACGTAGACGGTATTCGTATTACTTACCCTTCTCTTGGAGGACGTAACTACAATTCTACTACTCCTGTTAAATTTACTAAACTAGTAAAACCACTTAAAGTTGGAGATACCGAAGTTTATGTAGAAGATGTGAGTCTATGGAATGGTCAAGCACCACAAGACTACCAACGTAGTATTATCATGTGGGGTTATAAAAACTCATTTGGCTATACTTATCCTGATGGAACATACAGTCAGCTAATGCAAATGAAAACCTATGATATTGGTGCAGTTGATATTACAGCTAATAAGATTACATTAAACAAACCGTGGGCGGTAACTAACCCTAATAGTTCAGACGGAGTTTTCCCAGTAGGTCATACGCTTAGTCCAACTTCTGATGGTTCTACTTACTTGTACCTAACTGGACATGTAAACCTTCAAGTACCAACTACGTATACAAAATATAGCCATTTGATTAGTGGTTCTACTGAGTTTGCTAATACCACATTTATTCCAGTAGAAACAGGTTCTATCCAACTTGGATTCTTGTTGAACCGTGATACAACAGGTGAAAAATCTTGGCTAAATGGTTTACGTTTACGTGATTATACAGACACGTACAAGCTAAACGATGATGTAAGAGAAACGCAGGAAAACGTAGATAAAGCCCAAGCAGATGCTAATAAAGCTAACCAATCAATTGCTGACCTATCTAATGACAACCTAGTTACTCCTAATGAGAAACTAGATTTGAAAAAAGAGTGGGAAATTATTGTTGCTGAAAAACCTAAGAATGATGCTCAGGCAGATAAATTCGGTGTAAGTAAGGTAGCTTACGGTACTGCGTACACAGCTTTAGATACGTATTTGAAGCCCATATTAGCAAGCACAACAACGAACTCTGCAATTGTTGGACAAACTATGCGGGATACGTTTAAAGCTTACTACACAGCTCGTACAGACCTTTTAAATGCTATTGCATCTAAAGCTAAAGAATTGGCTGATAATGCACAAGATACCGCAGATAACATAACTGTAGGTACTCGTAACCTTTTAGTTGGAACGAAGGACTTCTCTAAAGGGATTCCATCTGGAAACACATCGGTAACGATTGATACTGATAAACTATTTGGAAATGCTGTTTTAAAAAACAACCTAGTAGGTACAACAGGACAGTCTGATATGTACAAACTGGCTACGTCAATAACACCAAC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Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
7fb73d0e04658ce2bc2ea7a1d039bfba1dab413b24fa7db561f6cab05870c2fe
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50