Protein

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Genbank accession
QQG30947.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber protein proximal subunit
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,60
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,71
Protein sequence
MADILKPAFRATSGLDAAGEKVINVAKADYSVLSDGVNVDFFIEENTVQQYDATRGYKKNFAVINDNRIWVAQRDIDAPAGAFTPQYWLATRTDPKWETVASPTRQLSSGEFIAVDSAASFTTFTLPTNPVDGDTIVIKDIGGNVGYNEIKVQSSNVPGGGNQKIVRFGNQYSEVLITKPFSYNMLIFSNRLWQFWEAGNEERGIRVEPSTGRFHAQAGDFIMRRYTTGAPITFILPKYANQGDIVKSVDIDGLGPTFHLMVETFDSSSSLGKAGQHQMEFRTTGDGFFVYNAAEKLWYVWDGDFKTRLRVIRDNVKLLPNESVIVFGEDNSTPATINIDLPTDVLQGDIVKIALNYLRKSQTVNIRAAAGDKIASDIKLLQFPKRSEYPPDTTWVFVDSLTFNGDISYTPVIELSYAEDKVSGTSYWVVAQNVPTVERVDSLNDSTRARLGVIALANQTQANVDHENNPEKELAITPQTLANRVAKENQRGIARIATTAQVNQNSDFAFVDDVIISPKKLNERTATETRRGLAELATQQETDAGVDDTTIITPKKLQARQGSESLSGIVTYVPTTGATPAASRELNGTNVYNKNTTNLVISPKALDQYKATYTQQGAVILAVESEVIAGTSQAGWSNAVVTPEMLHRKTALDSRIGLIEIATQTETNAGTDYTRAVTPKTLNDRKASETLTGIAEIATQSEFDTGTDDTRISTPLKIKTRFNNTARTSVNALSGLVETGTLWDHYSLNILEANETQRGTARLATQGEVNTGTDDKTIVTPLKLMSKKATENAEGIVRIATNAEATAGTSKVLAISPSALKYIAQTETTWEASETLRGFVRLSSGTATSAATTTTGAGFTYEGGVYTPDPSKLVSYAKSGYAVSPYELNRVLQNFLPINAMAVNAEKLDNLDSTQFIRRDIAQTVEGVLTLTKQTNISAPVVSTSTAVFTDVTAGTSTFGTVNVVNGTNKWKITAPSTGTTMTIGDTTNVLTLNTASGNVAVLNNLSAGNDVQAKNNYVLNGRTIATTTGEASGATLALGDNSQNLVLKTLDAGNIIANGGGAFKVLTEKNAVEIVDRNFVNQAGDTMSGVLRVNAPVRVFGTKPSLIAQAPTADTVGFWSVDINDEPTYSQFPGYWTMKLKRQVNIDTVQTKPAGVTDEVWNASGWLTENGTFASPAIRYRLDDGSFGDEVLGSSGQKLRGTWFDYSVRDKQIKYPGTLTQFGNTLDSCYQDWVCYPTGLNGGTIRYTRTWQKNKSAWTTFAMVYTADNPPSAEDVGALPADNTTMGNLTILDWLRIGNVRIIPDPTTKSVKFEWIE
Physico‐chemical
properties
protein length:1318 AA
molecular weight: 143087,17080 Da
isoelectric point:5,20125
aromaticity:0,08118
hydropathy:-0,29090

Domains

Domains [InterPro]
DC_1946
ATT
1–208
DC_1946 DC_1209
IPR048391
ATT
1112–1145
IPR048391 IPR048391
QQG30947.1
1 1318
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT
STR
ATT 1-208 | STR 349-1111 | ATT 1112-1145 | STR 1146-1204 | ATT 1205-1266 | STR 1267-1300 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage UPEC01
[NCBI] 		2796516 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QQG30947.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MW233709 [NCBI]
CDS location
range 78341 -> 82297
strand -
CDS
ATGGCCGATATTTTAAAACCAGCATTCAGAGCAACATCCGGTCTCGATGCTGCTGGTGAGAAAGTCATTAATGTCGCGAAAGCTGATTACTCAGTTTTGTCAGACGGCGTTAACGTAGATTTCTTTATAGAAGAAAACACAGTTCAACAATATGATGCAACGCGTGGATACAAAAAGAACTTCGCAGTTATTAATGATAACCGTATTTGGGTTGCTCAACGTGATATTGATGCTCCAGCAGGAGCATTTACCCCTCAGTATTGGTTGGCAACTCGTACTGACCCTAAATGGGAAACTGTTGCATCTCCAACTCGTCAGCTTAGCTCCGGTGAATTTATCGCAGTCGACTCAGCTGCAAGCTTTACCACATTTACATTACCTACAAACCCGGTCGATGGCGATACCATCGTTATTAAAGATATCGGCGGCAATGTTGGTTACAACGAAATTAAAGTGCAGTCAAGCAACGTACCAGGCGGCGGTAACCAAAAGATTGTTCGTTTTGGTAATCAGTATTCAGAAGTTTTAATTACCAAACCATTCTCTTATAACATGCTTATCTTTTCAAACCGCTTATGGCAATTTTGGGAAGCTGGCAACGAAGAACGTGGCATCAGAGTAGAACCATCAACTGGTCGTTTCCATGCACAAGCCGGCGACTTTATTATGCGTCGTTATACAACTGGTGCACCGATTACTTTCATTCTTCCTAAGTATGCGAATCAGGGTGATATTGTCAAATCTGTTGATATCGATGGCCTGGGACCAACATTCCACCTGATGGTTGAAACCTTTGACTCCAGTTCCAGTCTTGGTAAAGCTGGACAGCATCAAATGGAATTCCGCACCACAGGTGATGGCTTCTTTGTTTATAATGCCGCCGAAAAACTTTGGTATGTTTGGGACGGTGATTTTAAAACTCGTCTTCGCGTTATTCGTGATAACGTTAAACTTTTACCGAACGAAAGTGTCATTGTATTTGGTGAAGATAACTCAACTCCAGCGACGATTAATATCGATTTGCCAACGGATGTTTTGCAAGGTGACATTGTTAAAATTGCACTGAACTATCTCCGCAAATCACAGACTGTTAATATAAGAGCTGCTGCTGGTGATAAGATTGCATCCGACATTAAATTGTTGCAATTCCCTAAACGCTCCGAGTATCCACCAGATACAACTTGGGTATTTGTTGATTCATTGACCTTTAATGGTGACATCAGTTATACTCCGGTTATTGAATTGTCTTATGCAGAAGATAAAGTGTCTGGAACAAGTTATTGGGTTGTTGCTCAAAACGTTCCGACTGTTGAACGAGTTGACTCATTAAATGATTCCACGCGTGCTCGTCTTGGTGTTATTGCCCTGGCAAACCAGACTCAGGCAAACGTTGACCATGAAAATAACCCAGAAAAAGAACTAGCAATTACTCCTCAGACTTTGGCCAACCGTGTTGCTAAAGAGAACCAACGAGGCATTGCCAGAATCGCAACGACTGCCCAGGTAAATCAGAACAGTGATTTTGCATTTGTTGACGATGTAATTATTTCTCCGAAAAAACTCAATGAACGTACGGCAACAGAAACGAGACGTGGGCTCGCAGAACTCGCCACACAGCAAGAAACTGATGCAGGTGTAGATGATACCACAATTATCACTCCAAAGAAACTGCAAGCGCGTCAGGGCTCAGAATCGCTGTCCGGTATCGTGACTTACGTCCCGACCACTGGTGCAACTCCAGCTGCTTCGCGTGAATTAAATGGTACAAACGTTTATAATAAGAATACCACTAATCTGGTAATTTCTCCGAAAGCTCTTGACCAATACAAAGCTACTTACACTCAACAGGGCGCAGTTATTCTGGCCGTTGAAAGTGAAGTAATTGCAGGTACATCACAAGCTGGCTGGTCAAACGCTGTTGTTACTCCGGAGATGTTGCATCGTAAAACAGCTCTTGATTCTCGTATTGGTTTAATCGAGATTGCCACTCAGACAGAAACAAATGCAGGAACCGATTATACCAGAGCTGTGACTCCTAAAACGTTAAATGACCGTAAAGCATCAGAAACGTTAACCGGCATAGCCGAGATTGCTACGCAATCAGAATTTGATACTGGAACTGATGATACTCGTATCTCAACTCCATTAAAAATTAAAACTAGATTTAATAATACTGCTCGTACTTCTGTTAATGCATTAAGTGGTTTAGTAGAAACAGGGACGCTCTGGGACCATTATAGCCTGAATATTCTTGAAGCAAATGAGACTCAACGTGGTACAGCAAGATTAGCAACTCAGGGTGAAGTCAATACCGGCACTGACGATAAAACAATCGTTACCCCGCTTAAATTGATGTCGAAAAAAGCTACTGAAAATGCCGAAGGTATTGTTCGCATCGCGACAAACGCAGAAGCAACAGCAGGCACATCAAAAGTCTTGGCCATCAGTCCGTCTGCGCTGAAATATATTGCACAAACAGAAACAACTTGGGAAGCATCTGAAACACTGCGCGGATTTGTTCGTTTATCTTCTGGCACAGCTACTTCGGCCGCAACTACAACGACCGGTGCAGGATTTACATATGAGGGTGGTGTATATACCCCGGACCCAAGTAAACTGGTTAGCTATGCGAAATCTGGATATGCAGTTTCGCCTTACGAATTAAACCGCGTATTGCAAAACTTCTTACCGATAAATGCGATGGCTGTTAATGCTGAAAAACTGGATAACCTCGATTCGACCCAGTTTATTCGTCGTGATATTGCTCAGACTGTTGAAGGTGTATTAACCCTTACTAAGCAGACAAATATCTCTGCTCCGGTTGTATCGACGAGCACTGCGGTGTTTACTGATGTAACGGCTGGTACTTCGACGTTCGGAACTGTGAATGTTGTTAATGGAACTAACAAGTGGAAAATCACTGCTCCTTCCACCGGAACGACAATGACTATTGGTGATACGACTAACGTATTGACATTAAACACCGCCTCGGGTAATGTTGCTGTACTGAACAACCTTAGTGCCGGAAACGATGTTCAAGCCAAAAATAATTACGTTCTAAATGGTCGTACTATTGCAACCACGACGGGTGAAGCTTCTGGCGCAACTCTAGCCCTGGGTGATAACTCGCAGAATTTGGTGCTCAAAACTCTTGATGCTGGTAATATCATAGCAAATGGTGGCGGTGCATTTAAAGTCCTGACCGAGAAAAACGCTGTTGAGATTGTTGATAGAAACTTTGTTAACCAAGCGGGCGATACAATGTCTGGTGTGCTCCGTGTGAATGCTCCGGTCCGTGTATTCGGTACGAAACCAAGTCTTATCGCACAAGCCCCAACTGCTGATACTGTCGGCTTCTGGTCTGTTGATATTAATGATGAACCGACTTATAGTCAGTTCCCTGGCTATTGGACAATGAAGTTAAAACGTCAGGTAAACATTGATACAGTTCAAACCAAACCTGCTGGGGTGACTGATGAAGTTTGGAATGCCTCTGGTTGGTTAACCGAAAACGGAACTTTTGCTTCTCCTGCTATTCGTTATCGTTTGGATGATGGTTCTTTCGGCGATGAGGTTTTGGGTAGTTCTGGGCAAAAACTTCGTGGTACATGGTTTGACTATTCTGTTCGTGATAAACAAATTAAATATCCTGGTACATTAACTCAGTTTGGTAATACGCTGGATTCGTGCTATCAAGATTGGGTTTGTTATCCAACTGGATTGAACGGTGGTACTATTCGTTATACTCGTACATGGCAGAAAAATAAATCAGCATGGACGACTTTCGCAATGGTTTATACCGCGGATAACCCTCCGTCTGCAGAGGATGTTGGTGCATTACCGGCTGACAACACAACGATGGGGAACTTAACCATTCTTGATTGGTTGCGTATCGGTAACGTGCGTATCATCCCAGACCCGACCACTAAATCCGTTAAGTTTGAATGGATTGAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
dd5ca7f81970e44aa364892c3bc1b216cb0f543589b476dbe01a0f2208528b65
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5477
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Genome sequences of avian pathogenic Escherichia coli bacteriophages UPEC01, UPEC03, UPEC06 and UPEC07 Kazibwe,G., Hinkley,T.C., Le Ny,A.-L.M. and Nakavuma,J.L. 2022-03-17 — GenBank