Protein

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Genbank accession
XRX15620.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,89
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MADYKLSQLNSIDTIRSEDLLHIRVKKRPEMLGDEDRRMTYQDFLASFKLERFVQIAGSNMTGDLGIVKLLYGGKIVFDPTGSSEITIGDVLKTFKLNASGLKLTIADSSRSATVYHTLNKPSPNELGMRTNEENDARYARLAANNIFTSQQTIQANGEGIRLKNSSENSPLYIRGQDSAGENRWYIGNGSGGDNVTIRNHKTDCEVILSSVVAINKTLSITGQVKPSDFSNLDARYFTQTVANQRFAQLAGNNTFTGANTFRTMSIISNAAAITLQCASANESLYLLAKDYQGGNLWYVGKGSSGDGVTIYNYTTNTSLVLDAAGVSANKNVRITGQVQPSDWANIDSRYIPAGTLSNLAKLSDVNTFRSAQVIKQNGPVLQLRNTIQDRELYISAHNADDVRKWYIGNGDANPARLIIHNDRTATTIYMQDDFLLNKTVRITGQVQPSDFSNLDARYYTQSVANSRYMLAVSTGSGTEAGDGDGIAWNARTGLYNVTGKSGGSTQLVYQMFIGGGSTPTAQLKFSYRNGGVWYRTARDGYGFENSWAKIYTDQDKPTPSDIGAYTKAETDQKIAEAISDSTDLNKIYPVGIVTWFNSNVNPNTALPGLTWTYLNNGVGRTIRIAAANGSDVATTGGSDSVTLSVGNLPSHTHSFSATTSSFDYGTKTSSTTGNHNHNRGNMEISGVVGWFRSDNSAFYTASGAFQMGSSQASHGFTGSNFTYGAAADFHASRTWTGATNTTGNHSHTVGIGAHSHTVSGNTGGTGSGSAFSVTNQFYKLMAWVRTA
Physico‐chemical
properties
protein length:788 AA
molecular weight: 85119,98090 Da
isoelectric point:8,61016
aromaticity:0,09264
hydropathy:-0,40939

Domains

Domains [InterPro]
DC_0032
ATT
1–263
DC_0032 G3DSA:6.20.80.10 DC_1993
G3DSA:6.20.80.10
STR
157–217
G3DSA:6.20.80.10 DC_1993 G3DSA:6.20.80.10 IPR022246
IPR048388
ATT
158–246
IPR048388 IPR048388 IPR048388
XRX15620.1
1 788
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT
STR
ATT 1-263 | STR 264-273 | ATT 274-357 | STR 358-380 | ATT 381-472 | STR 473-784 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage HMD-P10
[NCBI] 		3415625 Viruses >
Host Escherichia coli
[NCBI] 		562 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XRX15620.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV469800.1 [NCBI]
CDS location
range 14826 -> 17192
strand +
CDS
ATGGCAGATTACAAATTGAGTCAGTTAAACTCAATCGACACAATTCGTTCAGAAGACCTATTGCATATCAGAGTTAAGAAAAGACCTGAAATGTTGGGTGACGAAGACCGTAGAATGACCTATCAAGACTTCTTAGCTTCCTTCAAACTAGAAAGGTTTGTTCAGATTGCTGGGAGTAATATGACTGGGGATTTAGGTATTGTCAAGCTACTTTACGGTGGAAAGATTGTATTTGACCCTACAGGCTCTTCTGAGATTACTATTGGGGATGTTTTAAAGACTTTTAAACTTAATGCAAGTGGCCTTAAACTCACTATTGCAGACTCTTCAAGGTCAGCAACTGTTTATCACACTCTGAATAAGCCAAGCCCTAATGAGCTTGGTATGAGAACTAATGAAGAGAATGATGCAAGATATGCAAGGCTTGCTGCAAATAACATCTTTACATCCCAACAAACTATCCAAGCAAATGGTGAAGGTATTAGGTTAAAAAACTCTTCTGAGAACTCACCGTTGTATATCAGAGGTCAGGATAGTGCTGGTGAGAATAGATGGTATATCGGTAATGGTTCAGGGGGTGATAATGTTACTATCCGCAACCACAAGACAGACTGTGAAGTTATTCTATCTAGTGTCGTGGCTATCAATAAAACATTAAGCATCACTGGTCAAGTCAAACCTTCAGATTTCTCTAACTTAGATGCTAGATACTTCACTCAGACAGTTGCTAATCAGAGATTTGCACAGTTAGCTGGTAATAACACTTTTACAGGTGCTAATACATTTAGGACTATGAGTATTATCTCAAATGCTGCTGCTATCACACTACAATGTGCATCAGCAAATGAATCCCTGTATCTACTTGCAAAAGATTATCAAGGTGGTAACTTATGGTATGTTGGTAAAGGTAGCTCAGGTGATGGTGTAACTATCTACAACTATACCACTAACACCTCTTTGGTCTTAGATGCTGCTGGAGTATCAGCAAATAAAAATGTCAGAATCACTGGTCAAGTTCAACCTTCAGATTGGGCTAATATTGACTCTAGATACATTCCAGCAGGGACTTTGAGTAACCTTGCTAAACTGAGTGATGTGAATACTTTTAGGTCTGCGCAAGTTATTAAACAGAATGGTCCAGTGTTGCAGCTAAGGAATACTATTCAGGACAGGGAGCTATATATCTCTGCTCATAATGCTGATGATGTTAGAAAGTGGTACATCGGTAACGGGGATGCTAACCCAGCAAGGCTTATTATCCACAACGACAGAACTGCAACTACGATTTATATGCAAGACGATTTCTTGCTGAATAAAACAGTTAGAATCACTGGTCAAGTTCAACCTTCAGATTTCTCTAACTTAGATGCTAGATATTATACGCAATCTGTAGCAAACTCTAGGTACATGCTTGCTGTCTCTACTGGTTCTGGTACAGAGGCTGGTGATGGTGATGGTATTGCTTGGAATGCTAGGACTGGTCTGTATAATGTTACAGGGAAATCTGGTGGTTCAACACAGCTAGTTTATCAAATGTTTATCGGTGGTGGCTCAACACCAACTGCACAGTTGAAGTTTAGCTACAGGAATGGTGGTGTCTGGTATAGGACAGCAAGAGATGGCTATGGATTTGAGAATAGCTGGGCTAAAATCTATACAGACCAAGATAAGCCAACCCCTTCAGATATCGGTGCATACACTAAAGCTGAAACTGACCAGAAGATTGCAGAAGCAATTAGTGACTCTACAGACCTGAATAAAATCTATCCAGTAGGTATTGTAACGTGGTTTAACAGTAATGTTAACCCTAATACAGCACTTCCTGGTCTAACTTGGACGTACCTGAATAATGGTGTTGGCAGAACTATTAGGATTGCAGCAGCAAATGGTTCAGATGTTGCTACAACTGGTGGTTCAGACTCTGTAACGTTATCTGTTGGTAACTTACCTTCACACACACATAGTTTCTCTGCTACCACTTCATCATTTGATTATGGTACTAAGACTTCTAGCACAACTGGTAACCATAACCACAACAGAGGTAACATGGAAATTTCTGGTGTGGTTGGTTGGTTCAGAAGTGATAACAGTGCATTCTACACTGCGAGCGGTGCGTTTCAGATGGGTAGTTCTCAGGCTTCACATGGCTTCACAGGCTCTAACTTCACTTACGGTGCTGCTGCTGATTTCCACGCGTCAAGAACTTGGACAGGTGCAACCAACACAACAGGTAACCATAGCCATACTGTAGGTATTGGTGCTCACAGCCACACAGTTAGTGGTAACACAGGTGGTACTGGTTCTGGTTCAGCATTTAGTGTTACTAACCAGTTCTACAAGTTAATGGCTTGGGTAAGAACTGCTTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
f40f0d02236f4dd6b66707cc84a223ad057c99a37235e4780e9abb1abf4399fb
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6843
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50