Protein

View in Explore
Genbank accession
URY11361.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,85
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKVAGVNPTAAQLAEGELAINLKDRTLFTKDDLGNIISLGFAKGGDINGNVTQTGDYLQNGTYNLNGNQFVYAGKYIEFLPKTAGNGAWANQHTNKAPIFTDLSSTTSTSEYHPLIKQRYKDGTFSVGTLVSEGSFRVHYIDSTAPDNSKHWVFNRNGNFIVDSGSIEVRAGNISASGNINSANGIVSAPQVNTKTIVLDTKAFGQYDSQSLVQYVYPGTGEENGINYLRKVRAKSGGTIYHEIASAQTGKNDEISWWTGNTLTTKLMGLRNDGAMVLRRSLAIGTITTDENTNNYGSPTPMGERYIALGDAATGLKYIKQGVYDLVGNWNSVASITPDSFRSTRKGIFGRSEDQGATWIMPGTNAALLSVQTQADNNNAGDGQTHIGYNAGGKMSHYFRGKGKTNINTQEGVDVNPGILKLTTGGESISFNAATGSINSTLAFRLNKGIIIDGPDNQGFQFNAPTAADGTRSIYWNSGTRPGQNKSPVTVKAWGNSFNATGDKSRETIFEIGDGQGYHFYSQRAAPTNDETVGPVLMQVSGSLNAKGTLTATGNLYVGGLSTHEGAVTMNNGLNLTGGSSITGQVKIGGTADALRIWNAKYGAIFRRSEDSLYIIPTPRDAGESGGISNLRPFYISLSDGKVSMDHDVDIGGGRFKVETSGTTSGQRITVNTASDAIRINAPTQESSNFIQGRKADVPKWYLGIGDGGNVVRMHSYTYSHGIALNSDTVDIAKPLRIGSTQIGTDGNITGGTGNFANLNTTINNLKTDIVSSYPIGAPIPWPTDTPPEGYAIMEGQTFDAGLYPKLAAVYPSGALPDMRGQTIKGKPSGRAVLSTEADGVKSHTHSASASSTDLGTKTTSSFDYGSKTTSSFDYGTKTSNTTGNHNHTVSGNTSSAGAHQHARSGPQMQGGIPTSIFYDGYNSAGPNGNAKITGTVSGATASSNMAKTSSDGAHTHSWSGTTSSTGNHAHTVGIGAHTHSVGIGAHSHTVAIGSHGHTITVNATGNTENTVKNIAFNYIVRLA
Physico‐chemical
properties
protein length:1035 AA
molecular weight: 109093,94670 Da
isoelectric point:8,79931
aromaticity:0,07729
hydropathy:-0,43256

Domains

Domains [InterPro]
DC_0538
STR
1–1033
DC_0538
IPR048390
ATT
511–647
IPR048390 G3DSA:6.20.80.10 SSF88874 SSF88874
IPR048388
ATT
688–762
IPR048388 IPR037053
IPR051934
Unmapped
738–1035
IPR051934
IPR011083
ATT
788–835
IPR011083
URY11361.1
1 1035
Architecture
STR
ATT
STR
ATT
STR
ATT
STR
STR 1-510 | ATT 511-647 | STR 648-687 | ATT 688-762 | STR 763-782 | ATT 783-836 | STR 837-1034 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Shigella phage ESh15
[NCBI] 		2950760 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Shigella sp.
[NCBI] 		625 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
URY11361.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
ON528725.1 [NCBI]
CDS location
range 131409 -> 134516
strand +
CDS
ATGGCTACATTAAAACAGATACAATTTAAAAGAAGCAAAGTAGCAGGAGTTAATCCTACTGCAGCACAATTAGCCGAAGGCGAATTAGCGATAAACTTAAAAGATCGAACTCTTTTTACTAAAGATGACCTCGGTAATATTATTAGCCTAGGCTTTGCTAAGGGTGGTGATATTAACGGTAATGTAACTCAAACCGGCGATTATTTACAAAACGGCACATATAATCTTAATGGAAATCAGTTCGTTTATGCAGGAAAGTATATTGAATTTTTGCCAAAAACTGCTGGAAATGGCGCTTGGGCTAACCAACACACAAATAAAGCCCCTATCTTTACAGATTTGAGTTCAACTACTTCAACTTCTGAATACCACCCTTTGATTAAGCAACGTTATAAAGACGGTACTTTTTCAGTAGGTACATTAGTAAGCGAAGGCTCATTTAGAGTTCATTATATTGATTCTACAGCTCCAGACAATTCTAAACACTGGGTCTTTAACCGTAATGGTAATTTTATTGTAGATTCTGGTAGTATTGAGGTCCGCGCAGGTAATATTTCTGCGTCAGGCAATATTAACTCCGCTAATGGTATAGTTTCTGCTCCACAAGTTAATACGAAAACCATTGTTTTAGACACAAAAGCATTCGGACAATATGATTCACAGTCATTAGTTCAATATGTTTATCCTGGAACAGGTGAAGAAAACGGTATAAACTATCTTCGTAAAGTTCGAGCTAAATCAGGCGGAACTATTTACCATGAAATCGCTTCGGCTCAAACTGGTAAGAATGATGAAATTTCTTGGTGGACCGGAAATACACTTACTACTAAATTAATGGGTCTTCGTAATGATGGCGCAATGGTATTACGTCGTTCACTTGCTATTGGCACAATTACCACTGATGAAAATACTAACAACTACGGTTCTCCTACTCCAATGGGAGAAAGATATATTGCTTTGGGCGATGCTGCAACCGGTTTAAAATACATTAAGCAGGGTGTTTATGATTTAGTAGGTAATTGGAATTCTGTTGCGTCTATTACTCCAGATAGTTTCCGTAGTACTCGTAAAGGTATATTTGGTCGTTCTGAGGACCAAGGCGCAACTTGGATAATGCCTGGTACAAATGCTGCTCTCTTGTCTGTTCAAACACAAGCTGATAATAACAACGCTGGAGACGGTCAAACTCATATTGGGTACAATGCTGGCGGCAAAATGAGTCATTATTTCCGCGGTAAAGGCAAAACTAATATTAATACTCAGGAAGGTGTAGACGTTAACCCAGGTATATTGAAGTTAACCACCGGCGGTGAAAGTATTAGCTTTAATGCCGCAACTGGAAGTATTAATTCTACATTAGCTTTTCGTCTTAATAAAGGCATAATTATTGATGGACCTGATAATCAGGGATTCCAGTTTAACGCTCCGACGGCTGCAGATGGTACTAGAAGTATATACTGGAACAGTGGTACTCGCCCAGGTCAAAACAAAAGCCCTGTTACAGTTAAAGCATGGGGTAATTCATTTAATGCCACCGGTGATAAATCTCGTGAAACCATTTTTGAAATTGGTGACGGCCAAGGGTATCATTTTTACTCTCAACGTGCCGCGCCTACAAATGATGAAACTGTTGGCCCTGTATTAATGCAAGTTTCAGGTTCTTTAAATGCAAAAGGAACATTGACCGCCACTGGCAACCTTTATGTGGGAGGATTGAGTACACATGAAGGTGCTGTGACCATGAATAATGGACTTAATTTAACTGGTGGTTCTTCTATTACTGGCCAAGTTAAAATCGGTGGAACAGCAGATGCATTGAGAATTTGGAACGCTAAATACGGTGCTATTTTCCGTCGTTCAGAAGATTCGTTGTATATAATTCCAACTCCGCGGGATGCTGGTGAATCAGGTGGTATTTCTAATTTGCGTCCGTTCTATATTTCATTAAGTGATGGTAAAGTCAGCATGGATCATGATGTTGATATCGGTGGTGGAAGATTTAAAGTAGAAACTAGTGGAACAACATCAGGGCAACGTATTACAGTTAATACTGCCTCCGATGCTATTAGAATAAATGCCCCAACACAAGAATCTTCTAACTTCATCCAAGGACGTAAAGCAGATGTTCCGAAATGGTATTTAGGTATTGGCGATGGCGGCAACGTCGTTCGTATGCACAGTTACACCTACTCCCATGGTATTGCATTAAACTCTGATACGGTTGATATAGCTAAACCTCTTAGAATAGGTTCAACCCAGATTGGTACTGATGGTAACATAACTGGCGGCACTGGTAATTTTGCTAACTTGAATACCACAATAAATAACCTTAAGACAGATATCGTCTCGAGTTACCCAATTGGTGCTCCGATTCCTTGGCCTACTGATACACCTCCTGAAGGTTATGCCATAATGGAAGGTCAAACATTTGATGCTGGCTTGTATCCTAAGTTAGCTGCGGTGTATCCTTCCGGCGCTCTGCCTGATATGCGTGGACAAACGATTAAAGGTAAACCATCTGGGCGTGCTGTATTAAGTACAGAAGCAGACGGTGTTAAGTCACACACTCATAGTGCAAGTGCATCAAGCACAGATTTGGGTACTAAGACCACTTCTAGTTTTGATTACGGTAGCAAAACGACTTCAAGCTTTGATTATGGTACTAAGACCAGTAATACCACTGGCAACCACAACCATACAGTGAGTGGTAATACTAGTTCAGCAGGAGCTCACCAACACGCTCGTTCAGGCCCTCAAATGCAAGGCGGCATACCCACTAGCATATTCTATGATGGATACAATAGCGCGGGTCCAAACGGCAACGCTAAAATCACTGGAACCGTGAGTGGTGCTACTGCATCGTCGAATATGGCCAAAACTTCTTCAGACGGTGCCCACACCCATAGTTGGTCAGGAACTACTAGCTCTACGGGTAACCATGCTCATACTGTGGGTATTGGTGCTCATACCCATTCGGTAGGTATTGGTGCTCATTCTCATACTGTTGCAATTGGTTCCCATGGACATACAATAACTGTAAATGCCACAGGAAATACAGAAAACACAGTTAAAAACATTGCTTTTAACTATATCGTTCGTTTAGCATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
9b5053d671fec332e0149e8303e1d660339984200516071e307e371a2af0152d
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5314
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Design of a bacteriophage cocktail active against Shigella species and testing of its therapeutic potential in Galleria mellonella Filippov,A.A., Su,W., Kevorkian,R.T., Sergueev,K.V., Srijan,A., He,Y., Lurchachaiwong,W., McGann,P.T., Ellison,D.W., Swierczewski,B.E. and Nikolich,M.P. — — GenBank