Genbank accession
AZU98196.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MYSIKTDLDVSGNGTINKDLLVKGNAVVKGDLKVEGTVDFAHATFTQIDVSGTANLKDITSTGTAALTTVSVSGNTTLGDASTDTLNVKATSTFDAPVTLNGNVTQTTGTAAFKATSVDSLTVAGESQLNGDLVMGTGTKATMKDLETDTLKVNGDSVIGGTLNVTGASTFGDVVINGTLSGNYTMDAGNFNSIKVAQLSDLNNVNIKGTTTITGNITASNSTMNLKHLYMRGADAIIDFDYADPSRPTDIKSSVEPYQISSNYFLSKNIKSNAAEIGVVGGTEGLHAIGRANIDYLNITGNSTIGDQTQLQVAGKSIFTGKTTVGDLEITGSVTGLSFSDLNVDSLTVSGLSQLQGGVSVGGNITGSTTSIASFSTITVRDGTGGNHGIIQFAYSDENRPTDIKSSIEPYQISSNNFLGKELKTNSAEIGVVGGTEGLHAIGKATIDYLKIAGNSTIGTASPQLEVTGKSILGDVDFTGTVTGLTVDVSGQDLTPNSVTTAAGVVGETLESKTTTKVGTNLTVGGTASVTGNASFGGDVNVTGQTVTVKDLVVTGSVTGVTAEANVDGLDIAPNSVTSTTYVKSATLEVSGASTLQDVTVKGTISGDAGAAVQVNKLNSAGTITATGNISAPSAQFTGSDVALDVTNNATIGGTLNVTGKTTVGDLTVTGTLIPGNLDLSQTDIASQSITTTGNANIGGDLVVTGTVDLSSADVSVKSLTTPGIVTSTDLVNASKLPVLNSNTITATEIDATDLTVTGQSVVKDLSASGKVTAGSVQTATITNADGITLSNNTTASGDLTVNGTLVLAGALDLSSVDIEAKSIHTTENASFDGNLSVGGTVDLTGADVTAISFTASDTVKTNTFPVLSSTTATIANATVTDLNATTSKVGTLTATGNTTLAGLTAGASVLESATVTGDATINGNITSTNSTVAIDKNTSVTGDLAVSGTLTAGVIDLSTTDVSVKSLDSLGNAHVAGDLTVDGQFDLSATNLQAASLASTGNTTVGADLVLTTGIITGSPKISGTLNVTGATTLAGLNAGSSTLNSATVTTTLNVSGATTLADLSATSATAGTLSTTGKATLNSAEIATNAVVKGNLTIEGILLPQGGLDLTGADIEANSITLAAGASVGSTLNVTGLSTLAGVNSGNHSITGTLNVSGESKLSDVSVGNNLTVTGTTTLTDNLTVNGANTTLKKTKTDNLHVGTLTWDEAKYIAEIGGDVHISGNIDVDGLITADLDLTGRSIAPRQVTTSADVTVGTTLNVIGQSTMASAIIGDVGSVNNNLQINGNTVCTGDFTVQGKIIGTLDQSTSDVVAKSVTASTFVKAATAEITSTSSFGGKVTASAGVSVTGGTTSDTITTTGLATLDSAKVTTSLGVTGDTTVGGTLGVTGETTLSATTISSLTVSGESGFTGKATFVDLESTGSITAKDVTITGTLNTDIADLVTSSVTTSKYEVKAAASEVVGATWTPDGSSNVYNITLSEPTLDIPTFPYRQGYAGSWFIYVTQPAAGGCTINWVPPFGLIGDSKINEAANSVSICQVVYSGVGDKLDVFIAQRNL
Physico‐chemical
properties
protein length:1560 AA
molecular weight: 155795,18040 Da
isoelectric point:4,28858
aromaticity:0,03269
hydropathy:0,12353

Domains

Domains [InterPro]
AZU98196.1
1 1560
Architecture
STR
STR
RBD
STR 1-791 | STR 861-1208 | RBD 1209-1560
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Salmonella phage Munch
[NCBI]
2500169 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Salmonella
[NCBI]
590 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AZU98196.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MK268344.1 [NCBI]
CDS location
range 140830 -> 145512
strand -
CDS
ATGTATTCTATTAAAACTGATCTAGACGTTTCTGGGAATGGTACAATCAATAAAGATCTACTTGTTAAAGGTAATGCTGTCGTTAAAGGTGATCTTAAAGTTGAAGGTACGGTGGACTTTGCACATGCAACGTTTACCCAAATTGACGTTTCTGGAACAGCTAACCTTAAAGATATTACATCTACTGGAACAGCAGCACTAACTACTGTCTCAGTATCCGGTAATACCACATTAGGCGATGCAAGTACAGATACACTAAATGTAAAAGCCACAAGCACATTTGATGCACCTGTGACTTTAAACGGTAACGTCACACAAACTACCGGAACTGCTGCATTTAAAGCAACTTCTGTTGATTCATTAACCGTAGCTGGTGAATCTCAATTAAACGGTGACCTAGTAATGGGAACTGGTACAAAAGCTACGATGAAAGATTTAGAAACTGATACATTAAAAGTAAATGGTGATTCAGTAATCGGTGGAACACTAAATGTTACAGGTGCAAGTACCTTTGGTGATGTTGTTATTAACGGTACACTTTCAGGTAACTACACAATGGATGCTGGTAATTTTAACAGCATTAAAGTAGCACAATTAAGTGATCTAAACAACGTAAACATTAAAGGTACTACAACTATTACCGGTAATATTACCGCATCTAATAGTACTATGAACCTAAAACACCTATATATGCGTGGTGCTGATGCTATTATCGATTTCGATTATGCTGACCCATCTCGCCCAACTGATATTAAATCAAGTGTTGAACCATATCAAATTAGTTCTAACTATTTCCTAAGTAAAAATATCAAATCTAATGCTGCTGAAATCGGTGTTGTTGGTGGTACTGAAGGACTACATGCTATCGGTAGAGCAAACATTGATTATCTAAACATTACTGGTAACAGTACTATTGGTGATCAAACACAACTACAAGTTGCTGGTAAATCAATTTTCACTGGTAAAACAACTGTTGGTGATTTAGAAATTACTGGTTCTGTAACAGGTCTATCCTTTAGTGATCTAAATGTAGATTCTCTAACTGTTTCTGGTTTATCTCAACTACAGGGTGGTGTATCCGTAGGTGGAAACATTACTGGTTCTACAACCTCCATCGCATCATTCAGTACTATTACTGTTCGAGATGGCACTGGTGGTAATCACGGTATTATTCAATTTGCTTATTCTGATGAGAATCGCCCAACTGATATTAAATCAAGTATTGAGCCATATCAAATTAGTTCTAACAACTTCCTTGGTAAAGAACTAAAAACTAATTCCGCTGAAATCGGTGTTGTTGGTGGTACTGAAGGTCTACATGCTATTGGTAAAGCAACTATTGATTACTTAAAAATTGCTGGTAATAGTACAATTGGTACTGCATCACCACAATTGGAAGTAACTGGTAAGTCAATTCTTGGTGATGTTGATTTCACTGGTACTGTAACTGGTCTAACTGTTGATGTTTCTGGTCAAGACCTAACACCAAACTCAGTAACAACTGCTGCTGGTGTTGTTGGTGAAACTCTAGAATCTAAAACTACAACTAAAGTTGGAACCAACCTAACTGTAGGTGGCACTGCATCTGTAACCGGAAATGCCTCTTTTGGTGGCGATGTAAATGTAACTGGTCAAACTGTAACCGTCAAAGATTTAGTAGTAACTGGTTCCGTTACTGGTGTAACTGCTGAAGCTAACGTAGATGGTCTAGATATTGCTCCTAATTCTGTAACTTCTACTACCTATGTTAAATCAGCAACACTAGAAGTTTCCGGTGCAAGTACATTACAAGACGTGACAGTAAAAGGTACTATTAGTGGTGATGCTGGGGCTGCGGTTCAAGTTAATAAACTAAATTCCGCTGGTACTATTACAGCAACTGGTAACATTTCTGCACCGTCTGCACAATTTACTGGTTCTGATGTAGCACTAGACGTTACAAATAACGCAACAATCGGTGGTACTTTAAATGTAACTGGTAAAACAACTGTTGGTGATCTAACAGTAACTGGAACTCTCATTCCGGGTAATCTTGATCTATCACAAACTGATATTGCATCACAATCTATTACTACTACTGGTAATGCAAATATCGGTGGCGATTTAGTTGTTACTGGTACTGTAGATTTATCTTCTGCTGATGTTAGTGTTAAATCCTTAACTACTCCGGGTATTGTAACTTCAACTGATTTGGTTAATGCTAGCAAACTACCTGTATTAAACTCTAATACAATAACTGCAACCGAAATTGATGCAACAGACCTTACCGTAACTGGTCAATCAGTTGTTAAAGATCTATCTGCAAGTGGTAAAGTTACTGCTGGTTCAGTTCAGACTGCAACTATTACAAATGCTGATGGTATTACATTATCAAACAATACTACCGCTTCTGGTGATCTAACTGTTAATGGTACTCTAGTTTTAGCTGGTGCTCTTGATTTAAGTTCTGTAGATATTGAAGCAAAATCAATTCATACAACTGAAAACGCATCATTCGACGGTAACCTATCAGTCGGTGGAACAGTTGACTTAACTGGTGCTGATGTAACAGCTATTAGTTTCACTGCATCTGATACTGTTAAGACTAATACATTCCCTGTATTATCTTCAACTACTGCAACAATTGCAAATGCAACTGTCACAGATTTGAATGCAACAACTTCTAAAGTTGGAACATTAACTGCAACTGGTAATACCACTCTTGCTGGTCTCACTGCTGGTGCAAGTGTGTTAGAATCTGCAACTGTAACTGGTGATGCAACAATCAATGGTAATATTACATCAACTAATAGTACTGTTGCAATTGATAAAAATACTTCAGTAACTGGCGATCTAGCCGTGTCTGGTACATTAACTGCTGGTGTTATTGATTTAAGTACAACTGATGTATCTGTTAAATCTCTAGATTCTCTAGGTAATGCACACGTTGCTGGTGATTTAACCGTTGATGGTCAATTCGATCTAAGTGCAACTAATCTACAGGCTGCATCTCTAGCAAGTACCGGGAATACTACAGTTGGTGCAGATCTAGTACTAACAACTGGAATTATTACTGGTTCTCCAAAAATTAGTGGCACATTAAATGTAACTGGTGCAACTACACTTGCTGGTTTAAATGCTGGTTCTAGTACTCTAAATTCTGCAACTGTAACTACTACATTAAATGTATCTGGTGCAACTACACTTGCTGATCTATCAGCTACTTCAGCAACTGCGGGTACACTAAGCACAACTGGTAAAGCAACTCTTAATTCTGCGGAAATTGCAACAAACGCGGTAGTTAAGGGAAATCTAACAATTGAAGGTATCCTACTACCTCAAGGTGGTTTAGACCTAACTGGTGCAGATATTGAAGCAAATAGTATTACACTAGCTGCTGGTGCATCTGTTGGCTCAACCTTAAATGTTACAGGTCTAAGTACACTAGCTGGTGTTAACTCAGGTAATCATTCTATTACTGGAACTTTAAATGTTTCTGGTGAAAGTAAACTAAGTGATGTTTCTGTTGGTAATAACTTAACTGTTACGGGTACTACTACTCTAACTGATAACTTAACAGTAAACGGTGCAAACACCACATTGAAGAAAACTAAAACTGACAATCTACATGTTGGTACTCTAACTTGGGATGAAGCGAAATATATTGCTGAAATTGGCGGTGACGTCCATATTAGTGGTAATATCGATGTTGATGGTTTAATCACTGCTGACCTTGACTTAACTGGTCGTTCTATTGCACCACGTCAGGTTACAACATCTGCTGATGTAACTGTTGGTACAACTTTAAATGTTATCGGTCAAAGTACTATGGCATCTGCTATCATTGGTGATGTTGGTTCTGTGAATAACAACCTACAAATTAATGGTAATACTGTATGTACTGGTGACTTCACAGTACAAGGTAAAATTATCGGTACACTAGACCAATCAACATCTGACGTTGTTGCTAAGTCTGTTACTGCTTCTACTTTTGTTAAAGCCGCAACTGCTGAAATTACTTCTACATCTTCATTTGGTGGTAAAGTGACTGCTTCTGCTGGTGTTAGTGTAACAGGTGGTACAACCTCAGATACTATTACTACCACAGGTCTAGCAACACTAGATTCTGCCAAAGTAACTACTTCACTTGGTGTTACTGGTGATACTACTGTTGGTGGTACTTTAGGCGTTACTGGTGAAACTACATTATCTGCAACTACCATTAGTTCACTAACTGTAAGTGGTGAAAGTGGATTTACTGGTAAAGCAACGTTTGTAGATCTTGAAAGTACTGGTTCTATTACTGCTAAGGATGTAACCATTACTGGTACTCTAAATACTGATATTGCTGATCTAGTAACAAGTTCTGTAACAACTAGCAAATACGAAGTTAAAGCCGCAGCGTCTGAAGTTGTTGGTGCAACATGGACACCTGATGGTTCTAGTAACGTGTATAACATTACTTTATCTGAACCAACATTGGATATTCCAACATTCCCATATCGTCAAGGATATGCTGGTTCTTGGTTCATTTATGTTACTCAGCCAGCAGCGGGCGGTTGCACAATAAATTGGGTTCCACCGTTTGGTCTAATTGGTGATTCTAAAATCAACGAAGCAGCAAACTCCGTATCCATCTGTCAAGTAGTTTACAGTGGTGTTGGTGATAAACTCGATGTGTTCATTGCACAACGTAATCTATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
03a1a335de7bd71a4bc04e97dfc45f543dbe7fb6255e3261512e394691acd9ca
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5263
Oligomeric State monomer
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete genome sequence of Salmonella myophage Munch Crosby,S.T., O'Leary,C.J., Xie,Y., Gill,J. and Liu,M. 1988 GenBank