Protein
View in Explore- Genbank accession
- AZU98196.1 [GenBank]
- Protein name
- long tail fiber
- RBP type
-
TFTF
- Protein sequence
-
MYSIKTDLDVSGNGTINKDLLVKGNAVVKGDLKVEGTVDFAHATFTQIDVSGTANLKDITSTGTAALTTVSVSGNTTLGDASTDTLNVKATSTFDAPVTLNGNVTQTTGTAAFKATSVDSLTVAGESQLNGDLVMGTGTKATMKDLETDTLKVNGDSVIGGTLNVTGASTFGDVVINGTLSGNYTMDAGNFNSIKVAQLSDLNNVNIKGTTTITGNITASNSTMNLKHLYMRGADAIIDFDYADPSRPTDIKSSVEPYQISSNYFLSKNIKSNAAEIGVVGGTEGLHAIGRANIDYLNITGNSTIGDQTQLQVAGKSIFTGKTTVGDLEITGSVTGLSFSDLNVDSLTVSGLSQLQGGVSVGGNITGSTTSIASFSTITVRDGTGGNHGIIQFAYSDENRPTDIKSSIEPYQISSNNFLGKELKTNSAEIGVVGGTEGLHAIGKATIDYLKIAGNSTIGTASPQLEVTGKSILGDVDFTGTVTGLTVDVSGQDLTPNSVTTAAGVVGETLESKTTTKVGTNLTVGGTASVTGNASFGGDVNVTGQTVTVKDLVVTGSVTGVTAEANVDGLDIAPNSVTSTTYVKSATLEVSGASTLQDVTVKGTISGDAGAAVQVNKLNSAGTITATGNISAPSAQFTGSDVALDVTNNATIGGTLNVTGKTTVGDLTVTGTLIPGNLDLSQTDIASQSITTTGNANIGGDLVVTGTVDLSSADVSVKSLTTPGIVTSTDLVNASKLPVLNSNTITATEIDATDLTVTGQSVVKDLSASGKVTAGSVQTATITNADGITLSNNTTASGDLTVNGTLVLAGALDLSSVDIEAKSIHTTENASFDGNLSVGGTVDLTGADVTAISFTASDTVKTNTFPVLSSTTATIANATVTDLNATTSKVGTLTATGNTTLAGLTAGASVLESATVTGDATINGNITSTNSTVAIDKNTSVTGDLAVSGTLTAGVIDLSTTDVSVKSLDSLGNAHVAGDLTVDGQFDLSATNLQAASLASTGNTTVGADLVLTTGIITGSPKISGTLNVTGATTLAGLNAGSSTLNSATVTTTLNVSGATTLADLSATSATAGTLSTTGKATLNSAEIATNAVVKGNLTIEGILLPQGGLDLTGADIEANSITLAAGASVGSTLNVTGLSTLAGVNSGNHSITGTLNVSGESKLSDVSVGNNLTVTGTTTLTDNLTVNGANTTLKKTKTDNLHVGTLTWDEAKYIAEIGGDVHISGNIDVDGLITADLDLTGRSIAPRQVTTSADVTVGTTLNVIGQSTMASAIIGDVGSVNNNLQINGNTVCTGDFTVQGKIIGTLDQSTSDVVAKSVTASTFVKAATAEITSTSSFGGKVTASAGVSVTGGTTSDTITTTGLATLDSAKVTTSLGVTGDTTVGGTLGVTGETTLSATTISSLTVSGESGFTGKATFVDLESTGSITAKDVTITGTLNTDIADLVTSSVTTSKYEVKAAASEVVGATWTPDGSSNVYNITLSEPTLDIPTFPYRQGYAGSWFIYVTQPAAGGCTINWVPPFGLIGDSKINEAANSVSICQVVYSGVGDKLDVFIAQRNL
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1560 AA molecular weight: 155795,18040 Da isoelectric point: 4,28858 aromaticity: 0,03269 hydropathy: 0,12353
Domains
Domains [InterPro]
DC_0092
STR
1–171
STR
1–171
DC_0092
STR
150–332
STR
150–332
1
1560
Architecture
STR 1-791 | STR 861-1208 | RBD 1209-1560
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Salmonella phage Munch [NCBI] |
2500169 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host |
Salmonella [NCBI] |
590 | cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AZU98196.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
MK268344.1
[NCBI]
CDS location
range 140830 -> 145512
strand -
strand -
CDS
ATGTATTCTATTAAAACTGATCTAGACGTTTCTGGGAATGGTACAATCAATAAAGATCTACTTGTTAAAGGTAATGCTGTCGTTAAAGGTGATCTTAAAGTTGAAGGTACGGTGGACTTTGCACATGCAACGTTTACCCAAATTGACGTTTCTGGAACAGCTAACCTTAAAGATATTACATCTACTGGAACAGCAGCACTAACTACTGTCTCAGTATCCGGTAATACCACATTAGGCGATGCAAGTACAGATACACTAAATGTAAAAGCCACAAGCACATTTGATGCACCTGTGACTTTAAACGGTAACGTCACACAAACTACCGGAACTGCTGCATTTAAAGCAACTTCTGTTGATTCATTAACCGTAGCTGGTGAATCTCAATTAAACGGTGACCTAGTAATGGGAACTGGTACAAAAGCTACGATGAAAGATTTAGAAACTGATACATTAAAAGTAAATGGTGATTCAGTAATCGGTGGAACACTAAATGTTACAGGTGCAAGTACCTTTGGTGATGTTGTTATTAACGGTACACTTTCAGGTAACTACACAATGGATGCTGGTAATTTTAACAGCATTAAAGTAGCACAATTAAGTGATCTAAACAACGTAAACATTAAAGGTACTACAACTATTACCGGTAATATTACCGCATCTAATAGTACTATGAACCTAAAACACCTATATATGCGTGGTGCTGATGCTATTATCGATTTCGATTATGCTGACCCATCTCGCCCAACTGATATTAAATCAAGTGTTGAACCATATCAAATTAGTTCTAACTATTTCCTAAGTAAAAATATCAAATCTAATGCTGCTGAAATCGGTGTTGTTGGTGGTACTGAAGGACTACATGCTATCGGTAGAGCAAACATTGATTATCTAAACATTACTGGTAACAGTACTATTGGTGATCAAACACAACTACAAGTTGCTGGTAAATCAATTTTCACTGGTAAAACAACTGTTGGTGATTTAGAAATTACTGGTTCTGTAACAGGTCTATCCTTTAGTGATCTAAATGTAGATTCTCTAACTGTTTCTGGTTTATCTCAACTACAGGGTGGTGTATCCGTAGGTGGAAACATTACTGGTTCTACAACCTCCATCGCATCATTCAGTACTATTACTGTTCGAGATGGCACTGGTGGTAATCACGGTATTATTCAATTTGCTTATTCTGATGAGAATCGCCCAACTGATATTAAATCAAGTATTGAGCCATATCAAATTAGTTCTAACAACTTCCTTGGTAAAGAACTAAAAACTAATTCCGCTGAAATCGGTGTTGTTGGTGGTACTGAAGGTCTACATGCTATTGGTAAAGCAACTATTGATTACTTAAAAATTGCTGGTAATAGTACAATTGGTACTGCATCACCACAATTGGAAGTAACTGGTAAGTCAATTCTTGGTGATGTTGATTTCACTGGTACTGTAACTGGTCTAACTGTTGATGTTTCTGGTCAAGACCTAACACCAAACTCAGTAACAACTGCTGCTGGTGTTGTTGGTGAAACTCTAGAATCTAAAACTACAACTAAAGTTGGAACCAACCTAACTGTAGGTGGCACTGCATCTGTAACCGGAAATGCCTCTTTTGGTGGCGATGTAAATGTAACTGGTCAAACTGTAACCGTCAAAGATTTAGTAGTAACTGGTTCCGTTACTGGTGTAACTGCTGAAGCTAACGTAGATGGTCTAGATATTGCTCCTAATTCTGTAACTTCTACTACCTATGTTAAATCAGCAACACTAGAAGTTTCCGGTGCAAGTACATTACAAGACGTGACAGTAAAAGGTACTATTAGTGGTGATGCTGGGGCTGCGGTTCAAGTTAATAAACTAAATTCCGCTGGTACTATTACAGCAACTGGTAACATTTCTGCACCGTCTGCACAATTTACTGGTTCTGATGTAGCACTAGACGTTACAAATAACGCAACAATCGGTGGTACTTTAAATGTAACTGGTAAAACAACTGTTGGTGATCTAACAGTAACTGGAACTCTCATTCCGGGTAATCTTGATCTATCACAAACTGATATTGCATCACAATCTATTACTACTACTGGTAATGCAAATATCGGTGGCGATTTAGTTGTTACTGGTACTGTAGATTTATCTTCTGCTGATGTTAGTGTTAAATCCTTAACTACTCCGGGTATTGTAACTTCAACTGATTTGGTTAATGCTAGCAAACTACCTGTATTAAACTCTAATACAATAACTGCAACCGAAATTGATGCAACAGACCTTACCGTAACTGGTCAATCAGTTGTTAAAGATCTATCTGCAAGTGGTAAAGTTACTGCTGGTTCAGTTCAGACTGCAACTATTACAAATGCTGATGGTATTACATTATCAAACAATACTACCGCTTCTGGTGATCTAACTGTTAATGGTACTCTAGTTTTAGCTGGTGCTCTTGATTTAAGTTCTGTAGATATTGAAGCAAAATCAATTCATACAACTGAAAACGCATCATTCGACGGTAACCTATCAGTCGGTGGAACAGTTGACTTAACTGGTGCTGATGTAACAGCTATTAGTTTCACTGCATCTGATACTGTTAAGACTAATACATTCCCTGTATTATCTTCAACTACTGCAACAATTGCAAATGCAACTGTCACAGATTTGAATGCAACAACTTCTAAAGTTGGAACATTAACTGCAACTGGTAATACCACTCTTGCTGGTCTCACTGCTGGTGCAAGTGTGTTAGAATCTGCAACTGTAACTGGTGATGCAACAATCAATGGTAATATTACATCAACTAATAGTACTGTTGCAATTGATAAAAATACTTCAGTAACTGGCGATCTAGCCGTGTCTGGTACATTAACTGCTGGTGTTATTGATTTAAGTACAACTGATGTATCTGTTAAATCTCTAGATTCTCTAGGTAATGCACACGTTGCTGGTGATTTAACCGTTGATGGTCAATTCGATCTAAGTGCAACTAATCTACAGGCTGCATCTCTAGCAAGTACCGGGAATACTACAGTTGGTGCAGATCTAGTACTAACAACTGGAATTATTACTGGTTCTCCAAAAATTAGTGGCACATTAAATGTAACTGGTGCAACTACACTTGCTGGTTTAAATGCTGGTTCTAGTACTCTAAATTCTGCAACTGTAACTACTACATTAAATGTATCTGGTGCAACTACACTTGCTGATCTATCAGCTACTTCAGCAACTGCGGGTACACTAAGCACAACTGGTAAAGCAACTCTTAATTCTGCGGAAATTGCAACAAACGCGGTAGTTAAGGGAAATCTAACAATTGAAGGTATCCTACTACCTCAAGGTGGTTTAGACCTAACTGGTGCAGATATTGAAGCAAATAGTATTACACTAGCTGCTGGTGCATCTGTTGGCTCAACCTTAAATGTTACAGGTCTAAGTACACTAGCTGGTGTTAACTCAGGTAATCATTCTATTACTGGAACTTTAAATGTTTCTGGTGAAAGTAAACTAAGTGATGTTTCTGTTGGTAATAACTTAACTGTTACGGGTACTACTACTCTAACTGATAACTTAACAGTAAACGGTGCAAACACCACATTGAAGAAAACTAAAACTGACAATCTACATGTTGGTACTCTAACTTGGGATGAAGCGAAATATATTGCTGAAATTGGCGGTGACGTCCATATTAGTGGTAATATCGATGTTGATGGTTTAATCACTGCTGACCTTGACTTAACTGGTCGTTCTATTGCACCACGTCAGGTTACAACATCTGCTGATGTAACTGTTGGTACAACTTTAAATGTTATCGGTCAAAGTACTATGGCATCTGCTATCATTGGTGATGTTGGTTCTGTGAATAACAACCTACAAATTAATGGTAATACTGTATGTACTGGTGACTTCACAGTACAAGGTAAAATTATCGGTACACTAGACCAATCAACATCTGACGTTGTTGCTAAGTCTGTTACTGCTTCTACTTTTGTTAAAGCCGCAACTGCTGAAATTACTTCTACATCTTCATTTGGTGGTAAAGTGACTGCTTCTGCTGGTGTTAGTGTAACAGGTGGTACAACCTCAGATACTATTACTACCACAGGTCTAGCAACACTAGATTCTGCCAAAGTAACTACTTCACTTGGTGTTACTGGTGATACTACTGTTGGTGGTACTTTAGGCGTTACTGGTGAAACTACATTATCTGCAACTACCATTAGTTCACTAACTGTAAGTGGTGAAAGTGGATTTACTGGTAAAGCAACGTTTGTAGATCTTGAAAGTACTGGTTCTATTACTGCTAAGGATGTAACCATTACTGGTACTCTAAATACTGATATTGCTGATCTAGTAACAAGTTCTGTAACAACTAGCAAATACGAAGTTAAAGCCGCAGCGTCTGAAGTTGTTGGTGCAACATGGACACCTGATGGTTCTAGTAACGTGTATAACATTACTTTATCTGAACCAACATTGGATATTCCAACATTCCCATATCGTCAAGGATATGCTGGTTCTTGGTTCATTTATGTTACTCAGCCAGCAGCGGGCGGTTGCACAATAAATTGGGTTCCACCGTTTGGTCTAATTGGTGATTCTAAAATCAACGAAGCAGCAAACTCCGTATCCATCTGTCAAGTAGTTTACAGTGGTGTTGGTGATAAACTCGATGTGTTCATTGCACAACGTAATCTATAA
Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
03a1a335de7bd71a4bc04e97dfc45f543dbe7fb6255e3261512e394691acd9ca
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Complete genome sequence of Salmonella myophage Munch | Crosby,S.T., O'Leary,C.J., Xie,Y., Gill,J. and Liu,M. | 1988 | — | GenBank |