Protein

View in Explore
UniProt accession
A0A1D8KQM2 [UniProt]
Protein name
Baseplate wedge tail fiber connector
RBP type
TF
Evidence UniProt/TrEMBL
Probability 1,00
Protein sequence
MAKQSLNIGTTANDNTGDTLRSGGDKINDNFDELYTALGNNASLSISLANPATGQVLKYNGSSFVAANFNALTSALDVSGNSIISSSNGNITLAPNGTGDVVITAGSQTTTFDGATGGVGFGSTISYKNEYTALGNAPAAATFPGYFYTVDGDDNPYVNINITGGGVGDTRAKLLTEYSSIDDLSDVDITTSAPTSNQVLKWNGTKFVPADDAAGAGQQNIFASVAGDTGTTTANSVTDTLTIAGGTDIVTSVSGDTVTVAFNGTLTTTFAALTDTDVPSITQGDSLYWNGSDWVVTRSPMTWWEVGANGANHFTINGPGFSSPTDDPTLYVIRGMTYAFDNTANGTNHPFRIQSTAGLSGTPYTTGQSGSGTSVLYWTVPMDAPNTLYYQCTIHALMNGTINVLI
Physico‐chemical
properties
protein length:406 AA
molecular weight: 41916,16060 Da
isoelectric point:4,05003
aromaticity:0,08867
hydropathy:-0,12414

Domains

Domains [InterPro]
IPR036240
STR
1–59
IPR036240 IPR008972
DC_0210
STR
1–406
DC_0210
IPR008987
ATT
3–101
IPR008987 IPR008972
G3DSA:1.20.5.960
Unmapped
13–45
G3DSA:1.20.5.960
A0A1D8KQM2
1 406
Architecture
ATT
STR
ATT 1-101 | STR 102-406
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage S-CAM22
[NCBI] 		1883365 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Alisovirus > Alisovirus socal22
Host Synechococcus sp.
[NCBI] 		1131 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Cyanobacteriota/Melainabacteria group > Cyanobacteriota > Cyanophyceae

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AOV60912.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KU686207 [NCBI]
CDS location
range 69202 -> 70422
strand +
CDS
ATGGCTAAACAATCCCTAAACATTGGTACTACAGCTAATGATAACACTGGTGATACACTGAGAAGTGGTGGTGATAAAATTAATGATAATTTTGATGAATTGTATACCGCTTTAGGTAATAACGCTTCTCTCAGTATATCACTTGCAAACCCAGCTACAGGGCAGGTACTGAAGTATAACGGCAGCAGTTTTGTTGCTGCTAATTTTAATGCATTAACTTCTGCGTTAGATGTTTCTGGAAATAGTATTATTTCTTCTTCAAATGGAAATATTACACTTGCTCCTAATGGAACTGGGGATGTTGTCATTACTGCAGGATCTCAAACTACTACATTTGATGGTGCTACTGGAGGTGTAGGTTTTGGATCTACAATTTCGTATAAAAATGAATATACTGCGCTAGGAAATGCTCCTGCTGCAGCAACATTTCCTGGATATTTTTATACTGTAGATGGTGATGATAATCCATATGTAAATATCAATATTACTGGTGGTGGTGTTGGTGATACTAGGGCAAAACTTCTCACAGAATATTCAAGTATCGACGATCTTTCTGATGTTGATATCACCACTAGTGCTCCCACAAGTAATCAAGTATTGAAGTGGAATGGAACTAAATTTGTTCCTGCTGATGATGCTGCTGGAGCAGGACAGCAGAATATCTTTGCTTCTGTTGCTGGAGATACTGGAACCACTACGGCAAACTCTGTTACTGATACTCTGACAATTGCTGGTGGAACTGACATTGTAACTTCTGTTTCTGGAGATACAGTTACAGTTGCATTTAATGGAACTTTAACTACAACTTTTGCTGCATTAACTGATACTGATGTTCCTTCTATTACCCAAGGTGATTCTTTATATTGGAATGGTTCTGATTGGGTTGTAACTCGTAGTCCAATGACTTGGTGGGAAGTTGGTGCTAATGGTGCAAACCATTTTACGATTAATGGTCCTGGATTCTCTTCTCCTACTGATGATCCGACTCTTTATGTTATTAGAGGAATGACATACGCATTTGATAATACTGCAAACGGCACTAATCACCCTTTCAGAATTCAAAGCACTGCTGGTCTTTCTGGAACTCCATATACTACAGGTCAATCTGGTAGTGGAACAAGTGTGCTTTATTGGACTGTTCCTATGGATGCTCCTAATACTCTTTACTATCAATGCACCATTCATGCACTGATGAATGGTACTATTAACGTATTAATCTGA
Genbank protein accession
AOV61126.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KU686208 [NCBI]
CDS location
range 69366 -> 70586
strand +
CDS
ATGGCTAAACAATCCCTAAACATTGGTACTACAGCTAATGATAACACTGGTGATACACTGAGAAGTGGTGGTGATAAAATTAATGATAATTTTGATGAATTGTATACCGCTTTAGGTAATAACGCTTCTCTCAGTATATCACTTGCAAACCCAGCTACAGGGCAGGTACTGAAGTATAACGGCAGCAGTTTCGTTGCTGCTAATTTTAATGCATTAACTTCTGCGTTAGATGTTTCTGGAAATAGTATTATTTCTTCTTCAAATGGAAATATTACACTTGCTCCTAATGGAACTGGGGATGTTGTCATTACTGCAGGATCTCAAACTACTACATTTGATGGTGCTACTGGAGGTGTAGGTTTTGGATCTACAATTTCGTATAAAAATGAATATACTGCGCTAGGAAATGCTCCTGCTGCAGCAACATTTCCTGGATATTTTTATACTGTAGATGGTGATGATAATCCATATGTAAATATCAATATTACTGGTGGTGGTGTTGGTGATACTAGGGCAAAACTTCTCACAGAATATTCAAGTATCGACGATCTTTCTGATGTTGATATCACCACTAGTGCTCCCACAAGTAATCAAGTATTAAAGTGGAATGGAACTAAATTTGTTCCTGCTGATGATGCTGCTGGAGCAGGACAGCAGAATATCTTTGCTTCTGTTGCTGGAGATACTGGAACCACTACGGCAAACTCTGTTACTGATACTCTGACAATTGCTGGTGGAACTGACATTGTAACTTCTGTTTCTGGAGATACAGTTACAGTTGCATTTAATGGAACTTTAACTACAACTTTTGCTGCATTAACTGATACTGATGTTCCTTCTATTACCCAAGGTGATTCTTTATATTGGAATGGTTCTGATTGGGTTGTAACTCGTAGTCCAATGACTTGGTGGGAAGTTGGTGCTAATGGTGCAAACCATTTTACGATTAATGGTCCTGGATTCTCTTCTCCTACTGATGATCCGACTCTTTATGTTATTAGAGGAATGACATACGCATTTGATAATACTGCAAACGGCACTAATCACCCTTTCAGAATTCAAAGCACTGCTGGTCTTTCTGGAACTCCATATACTACAGGTCAATCTGGTAGTGGAACAAGTGTGCTTTATTGGACTGTTCCTATGGATGCTCCTAATACTCTTTACTATCAATGCACCATTCATGCACTGATGAATGGTACTATTAACGTATTAATCTGA
Genbank protein accession
AOV61340.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KU686209 [NCBI]
CDS location
range 69316 -> 70536
strand +
CDS
ATGGCTAAACAATCCCTAAACATTGGTACTACAGCTAATGATAACACTGGTGATACACTGAGAAGTGGTGGTGATAAAATTAATGATAATTTTGATGAATTGTATACCGCTTTAGGTAATAACGCTTCTCTCAGTATATCACTTGCAAACCCAGCTACAGGGCAGGTACTGAAGTATAACGGCAGCAGTTTTGTTGCTGCTAATTTTAATGCATTAACTTCTGCGTTAGATGTTTCTGGAAATAGTATTATTTCTTCTTCAAATGGAAATATTACACTTGCTCCTAATGGAACTGGGGATGTTGTCATTACTGCAGGATCTCAAACTACTACATTTGATGGTGCTACTGGAGGTGTAGGTTTTGGATCTACAATTTCGTATAAAAATGAATATACTGCGCTAGGAAATGCTCCTGCTGCAGCAACATTTCCTGGATATTTTTATACTGTAGATGGTGATGATAATCCATATGTAAATATCAATATTACTGGTGGTGGTGTTGGTGATACTAGGGCAAAACTTCTCACAGAATATTCAAGTATCGACGATCTTTCTGATGTTGATATCACCACTAGTGCTCCCACAAGTAATCAAGTATTGAAGTGGAATGGAACTAAATTTGTTCCTGCTGATGATGCTGCTGGAGCAGGACAGCAGAATATCTTTGCTTCTGTTGCTGGAGATACTGGAACCACTACGGCAAACTCTGTTACTGATACTCTGACAATTGCTGGTGGAACTGACATTGTAACTTCTGTTTCTGGAGATACAGTTACAGTTGCATTTAATGGAACTTTAACTACAACTTTTGCTGCATTAACTGATACTGATGTTCCTTCTATTACCCAAGGTGATTCTTTATATTGGAATGGTTCTGATTGGGTTGTAACTCGTAGTCCAATGACTTGGTGGGAAGTTGGTGCTAATGGTGCAAACCATTTTACGATTAATGGTCCTGGATTCTCTTCTCCTACTGATGATCCGACTCTTTATGTTATTAGAGGAATGACATACGCATTTGATAATACTGCAAACGGCACTAATCACCCTTTCAGAATTCAAAGCACTGCTGGTCTTTCTGGAACTCCATATACTACAGGTCAATCTGGTAGTGGAACAAGTGTGCTTTATTGGACTGTTCCTATGGATGCTCCTAATACTCTTTACTATCAATGCACCATTCATGCACTGATGAATGGTACTATTAACGTATTAATCTGA

Genome Context

Genome Context

Gene Ontology

Description Category Evidence (source)
GO:0019076 viral release from host cell Biological Process IEA:InterPro (UniProt)

Tertiary structure

PDB ID
6123d304b0d6a0042311cbb7081cbeb92a4813cea3f452518a526ede5420733a
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,7153
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50