Protein
View in Explore- UniProt accession
- M4T0J5 [UniProt]
- Protein name
- LamG-like jellyroll fold domain-containing protein
- RBP type
-
TF
- Protein sequence
-
PVAKLRYTIGAATTNIEVIDVSAATDSPVPAGTFVVGDNYQVGSEIFLVNSVTDGSESTTIGVTRGQNGTAAAAQQEDAPLYGTAISVTNALTLSKTAGTYQSTPGLFDIQLNDVIIGSQSGVVARVTSTATYQDPTTQEFIGQVNISEGSSFFGLLFNRIASQTYPNVILDDISSSQVNVVQFDDNATAFNSNFPANEQINNYVIPYDNASGDFDADEIIRNYKIDYGNNIGDFQVENGVVRKLTFTDKIGDGFFAAGQIIRTRDTKAEVIGYNSAINTVYLGKIGRSQRNGQDYFQWTWEAGAYINTYNEKFGSSCLALSAGLSDHTFVSGVADGIVAGGGATGTYTAATGTSYNPATGAMTLEIGNHSLTTSNTVTIADNAVTFTCDQDGDTSNKSYPRSTDPASGTALAISAVTSTTITVNVGAVPIDEYISTPSSSEFAFGTSAYTIELWVKPLSASLSGTKTLLDFRTQATDVAGRLYLEAGQVRFNSNNVDVATSGLTTLNNNVWYHIAVVRSSTSSGGTKLYIDGVERGVGIDANNYAAKPLRIGGDYAGANEFAGYIDELRVSTTNRYTTAFTAPTGMFQGDATTKLLLHFDGEEGQTYVEDWSGGESFTADEYFNNDAILATSRSSTGIGVTGFTGNSHRYINAADNIILNKDFIANEAVYIMKNRYPYFTVPGGEINCEDDVRDILDALVNDLRNGSNDKIWDASALYVNRTVNPITLSHVESEIAETLYTLEKTQEIVEYVINNTPWEVQGDHGLTQKFDTSITESSYATATTFTPSGATYDPATGLMVITSNSHGLVAPSSKTATGATYTATTGVLQITSNSHGLSNGDRIKLADNSLTFTCTMDGNTAQKTYPRANDPASQGWLEVSNVATNTFEVNVGKSPTVNYTPTTATYNPATGIAVITLPENNLEVGQNVQIAQNALTFSRGSGSNGSVPTAATTSYEITQNGATSTATAATYDPASGQLVVTVANHGFTTSDKIRIEDNSLTFTCTKDGNFENKTYPRSTDPFSGRWLRPTAVTTNTFTVNVGPSSAADQYVHTFVSATANGIVKKDNTITVDLGTSGDTSAHTFASATTNGVVAGGNYTHTFVSATTNGITVAGDSVFLATESIVFTCTEDGNTEQKSYPRKSDPAAKQVLVITAADTNTFTVNVGASGQNDQYAHTFVSASSGAVTKSEYNLNDCTDVINTVDNLMSIVSDTLDNASQDPAVDHLGSVTKKLPAYKFLGGTVNAFRETPFDISYHDANNDVFYSNRIDTDAQYRFRDAANLIRANRSAIVDKAAYDMLQRYPDLAQDMPRNQGGGSTDGTVRCKTDLGQILDGIADDIESGGNEKTVQAANFYLGNNDILLHIRLQVFQSVYAHERLAFYAKQAITGDLTYDNTDAIIVGDWGITQDAGGCANVKTAIDNLVTVINDVIAPTGNDFHVSADRLYFNRQYLAEEVTGYTRTEFQYDLNGVTYNAFTYADELARQANIEAILLGVISDLQTGGTNSTIAEIEKYLTASLQIKDIEDEILAFVYSLQKLKEIGRFAIRNRVYDFNSGFTNPDYAALYSDENAYRDTETVSDIEKVVYRFEDLIDITIGILAPGGNISRSASKNILYNLNYYKEEIQNQVNSQFGSGAWVYNAFIDRIITDMVHDIVTTDTKVKQTAYKITFTSLTGNFQLGEVIRSSGGGYATVLEWNEETNLLIVGAFTGTAWSASDTLTGRTSSATATVSTVGSVYDWYSEPTNVQTLDHAKTLVSNISGQVSGTNLFTNPEALAINWQVNSNGGVDSLLITDNAISAPDGTLTAEKFFAANNNGGVHDTFRDYNLTAFETFDSSTLTFDTTNESFDTGAVGVSETQTFTSSIFVKAAGSASVRFGIILDDGTTAEQNIFFDLNLSTGAIGSLFIPQGGITGDAYGAVPLGDGWYRLFITATFSFGFSVLRTSIIANSASGAQSWTGNGNTGIYLWGAKLTKFALDPYTATSGKIFYSDNEFNIKNFALDLLDGFIAQALAGTLTSPSPNAGFYSFYSSTAASDYTTDSITALARYATNIIRQQIKTGTYFTSLDVQNAISLPAKTFGERDEVIGLGGGLKTTDFVYGQSSNAYAEVETLNENSGKIVQIYKRFRIDGDITDGPFTMNETVAKQGAPSVTGVVYGFHEDENYKYLDVRVTAGPWAVTDTIVGAENSTTAQISAIENRLHIIDLKGDFTNDIPFKGYTSGETAQPTGFIKNQAAVLSNTGGTLRVDTETLLGTFEKNSVVYPESSRQYIDVIKYDGFDAQIGQRIASTGYVRFGISIISGLNTFTVGNRLYKVVSGNQVSSVYAIITEVDLDNNYIYAVDFQGELTNGDVVGDYGIAGNFPVGYASITTRVVTAGAAAALIQDIKTVGTQKRLYLSDIAGTFSTRDGIKSADNYKSVVSAKEDLKARVKRSSKGFDGTQTNFDLTIENGTSYLPDPAGHLLVFINGILQPPGATNAYTAFSNQIQFTEAPDIGASFTGFYVGKLRQLDDISFEFDSLRQSFNLKRNEVFYSLTLTEGVQSSVIRPENNIIVSLNGVIQEPGIGFEIVGSRIIFSEIPRFGSTFVAFSYVGSEADVDAAEVVPPVEPGDFIRIQGETDDREVAVIESSNSLITFDYLGSVFGQDALAQAQITSGFIDDVQVTGGGSGYTSRPTVRIDSISGFDGNIKALVGVSGVEMSNAGSGYQNPGIDVETSVPDDWTAPNLADYGEEAVDPEIL
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 2736 AA molecular weight: 293378,25120 Da isoelectric point: 4,44233 aromaticity: 0,09978 hydropathy: -0,17482
Domains
Domains [InterPro]
DC_1553
STR
1–227
STR
1–227
IPR013320
STR
421–574
STR
421–574
G3DSA:2.60.120.200
STR
429–579
STR
429–579
PF13385
LEC
433–573
LEC
433–573
IPR006558
LEC
448–584
LEC
448–584
DC_0419
STR
535–816
STR
535–816
1
2736
Architecture
STR 1-227 | STR 321-1091 | RBD 1092-1572 | RBD 1828-2735 |
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Cyanophage Syn2 [NCBI] |
536473 | Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Pontusvirus > Pontusvirus syn19 |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AGH56294.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
HQ634190
[NCBI]
CDS location
range 1 -> 8213
strand +
strand +
CDS
CACCCGTCGCAAAACTGCGCTACACTATCGGTGCTGCAACCACTAATATTGAGGTAATTGATGTATCTGCTGCCACAGATTCACCTGTTCCTGCAGGAACATTCGTTGTTGGCGATAACTATCAAGTCGGTTCCGAAATCTTCTTAGTCAACTCTGTTACTGATGGTAGTGAATCCACTACTATTGGAGTAACTAGAGGTCAAAATGGAACCGCTGCTGCAGCTCAGCAAGAAGATGCTCCTTTATATGGAACTGCTATTTCTGTTACTAATGCACTTACTTTAAGTAAGACTGCTGGTACATATCAGTCCACACCTGGATTGTTTGATATTCAACTTAATGATGTTATTATCGGTTCTCAGTCGGGTGTTGTTGCAAGAGTTACTTCTACTGCCACATATCAAGATCCTACAACTCAAGAGTTTATCGGTCAGGTCAATATTTCTGAGGGTTCTTCTTTCTTCGGTCTGCTGTTTAACAGAATTGCATCCCAGACATATCCTAATGTAATCCTTGACGATATTTCCTCTTCTCAAGTCAATGTTGTTCAGTTTGATGATAATGCAACTGCATTTAACTCTAACTTCCCTGCAAATGAACAGATTAATAATTATGTAATTCCTTATGATAATGCATCTGGAGATTTTGATGCTGATGAAATTATCCGCAACTATAAAATTGACTACGGTAATAATATTGGCGATTTCCAAGTAGAGAACGGTGTTGTTAGAAAACTAACATTCACTGACAAAATTGGTGATGGTTTCTTTGCTGCTGGTCAAATCATTAGAACCCGTGATACAAAAGCAGAAGTTATCGGTTATAACTCTGCTATTAACACCGTTTATCTTGGTAAGATTGGTCGCTCACAACGTAATGGTCAAGATTACTTCCAGTGGACATGGGAAGCAGGTGCTTACATCAATACTTACAATGAGAAGTTTGGATCTTCCTGTTTAGCACTTTCTGCTGGTCTTTCTGATCATACATTTGTAAGTGGTGTTGCTGATGGTATTGTTGCTGGCGGTGGTGCTACAGGCACATATACTGCTGCTACAGGCACCTCATATAACCCTGCAACGGGTGCAATGACCCTTGAGATTGGTAATCACTCTCTTACCACTTCTAACACTGTCACAATCGCAGATAACGCTGTTACATTCACATGTGATCAAGACGGAGATACTTCTAATAAGTCGTATCCTCGTTCTACTGATCCTGCATCTGGTACAGCACTTGCTATCAGTGCAGTAACTTCTACTACGATTACAGTGAACGTCGGTGCTGTTCCTATCGATGAATACATCAGCACTCCATCATCTAGTGAGTTTGCGTTTGGAACCTCTGCATATACAATTGAACTTTGGGTGAAACCTCTTTCTGCTTCCTTGAGTGGAACTAAGACTCTTCTCGACTTCCGCACTCAGGCAACTGATGTTGCTGGTCGTTTGTATCTTGAAGCTGGTCAAGTTCGTTTCAATTCAAATAATGTAGATGTTGCAACTTCTGGTCTGACCACATTGAATAACAATGTTTGGTATCATATTGCGGTTGTTCGCTCTTCTACTTCTTCTGGAGGCACTAAACTGTATATTGATGGTGTTGAAAGAGGTGTTGGTATTGATGCTAATAACTATGCTGCTAAACCTCTTAGAATCGGTGGTGACTATGCAGGCGCAAACGAATTTGCTGGTTATATTGATGAACTTCGCGTTTCTACAACTAACCGTTATACCACCGCATTTACTGCTCCTACAGGAATGTTCCAAGGTGATGCAACTACAAAACTCCTCCTTCACTTTGACGGAGAAGAAGGTCAAACTTATGTTGAAGACTGGTCTGGTGGCGAGTCCTTCACTGCAGATGAGTACTTCAATAATGATGCAATCCTAGCAACATCTAGATCCTCCACAGGTATCGGAGTTACTGGATTCACTGGCAACTCTCATCGTTATATTAACGCTGCAGATAACATTATTCTCAATAAGGACTTTATTGCGAATGAAGCAGTTTATATCATGAAGAATCGCTATCCTTATTTCACTGTTCCTGGTGGAGAAATCAATTGTGAGGATGATGTCCGTGATATTCTCGACGCTCTTGTAAATGACTTGAGAAATGGTAGTAATGATAAAATCTGGGATGCTTCTGCACTGTATGTTAATAGAACAGTCAATCCAATCACATTGAGTCATGTTGAAAGTGAAATTGCTGAAACTCTCTATACATTAGAAAAAACTCAGGAGATTGTTGAATATGTAATCAATAATACACCCTGGGAAGTACAGGGTGATCATGGTCTCACTCAGAAGTTTGATACTTCTATTACTGAGTCTTCTTACGCAACTGCAACCACATTCACACCTTCTGGTGCAACATATGATCCTGCAACGGGTCTCATGGTTATTACCTCTAATAGTCATGGTTTAGTTGCTCCTAGCAGTAAGACTGCAACAGGTGCAACATATACTGCAACCACAGGTGTTCTTCAAATCACTTCTAACAGTCACGGTCTTTCTAATGGTGACAGAATCAAGTTGGCAGATAACTCTCTGACCTTTACTTGCACCATGGATGGTAATACTGCTCAGAAGACTTATCCTCGTGCAAATGATCCTGCTTCTCAGGGTTGGTTGGAAGTTTCTAACGTTGCTACGAATACATTTGAAGTTAATGTTGGCAAGTCTCCTACTGTTAACTATACTCCGACCACAGCAACTTACAATCCTGCTACAGGTATTGCAGTAATTACACTTCCTGAGAATAATTTGGAAGTTGGTCAAAATGTTCAAATTGCTCAAAATGCACTTACATTCAGCAGAGGGTCTGGATCTAATGGATCTGTTCCCACTGCAGCGACAACCTCGTATGAAATTACTCAGAATGGTGCAACAAGTACCGCAACAGCGGCAACATATGATCCTGCATCGGGTCAACTTGTAGTTACCGTTGCAAACCACGGATTCACCACTAGTGATAAGATTAGAATTGAAGATAATTCTTTGACATTCACCTGCACTAAGGATGGTAACTTTGAGAATAAGACTTATCCTCGTTCTACCGATCCTTTCTCTGGTAGATGGTTACGTCCGACTGCAGTAACTACTAATACGTTTACTGTCAACGTTGGTCCTTCTTCTGCTGCTGATCAATATGTTCACACGTTTGTGAGTGCAACAGCAAATGGCATCGTTAAGAAAGACAATACAATCACTGTTGATCTTGGAACTTCTGGAGATACTTCAGCACATACCTTTGCATCTGCAACTACAAACGGTGTTGTTGCTGGTGGTAACTACACTCATACCTTCGTAAGCGCAACCACCAATGGTATTACGGTTGCTGGCGATTCTGTATTCCTTGCAACTGAGTCGATTGTATTCACTTGCACCGAAGATGGTAATACTGAGCAGAAATCGTATCCTAGAAAGTCTGATCCTGCTGCAAAACAAGTTCTTGTTATTACTGCTGCTGACACTAATACATTCACAGTAAATGTTGGTGCGTCTGGGCAGAATGATCAATATGCACATACTTTCGTATCTGCAAGTAGTGGTGCAGTAACTAAGTCTGAATACAATCTCAACGATTGCACAGATGTTATTAACACAGTTGACAACTTAATGTCTATTGTTAGTGATACCTTAGATAATGCAAGTCAAGATCCTGCTGTTGATCATCTTGGATCTGTTACTAAGAAACTTCCTGCTTACAAGTTCCTTGGTGGAACAGTCAATGCATTTAGAGAGACTCCTTTCGATATTTCTTATCATGATGCAAACAATGATGTATTCTATAGTAATAGAATTGACACTGATGCACAATATCGCTTTAGAGATGCTGCTAACCTGATTAGAGCAAACAGATCTGCTATCGTTGACAAAGCGGCATATGATATGCTGCAGCGTTATCCTGATCTTGCACAGGATATGCCTCGTAACCAAGGTGGTGGTAGCACTGACGGTACTGTTCGTTGTAAGACTGACTTGGGTCAGATCTTGGATGGAATTGCAGACGATATTGAAAGTGGTGGTAATGAGAAGACTGTTCAGGCAGCAAACTTCTATCTTGGTAATAATGATATCCTTCTCCACATTCGCTTACAGGTATTCCAATCTGTTTACGCACATGAGCGTCTTGCATTCTATGCAAAACAAGCGATTACAGGTGATTTGACTTATGATAATACCGATGCGATTATTGTTGGTGATTGGGGTATTACTCAGGATGCTGGTGGATGTGCAAACGTCAAGACAGCAATTGATAATTTGGTAACTGTTATCAATGATGTCATTGCTCCTACAGGTAATGATTTCCATGTTTCTGCAGATCGTTTGTATTTCAACAGACAGTATCTGGCAGAAGAGGTAACTGGTTATACCAGAACTGAATTCCAATATGATTTGAACGGTGTTACTTACAATGCATTCACATATGCTGATGAATTGGCAAGACAGGCAAATATAGAGGCAATTCTTCTTGGCGTTATTTCTGACTTGCAGACAGGTGGTACTAACAGCACTATTGCAGAAATTGAAAAATATCTGACTGCATCTCTTCAAATCAAGGATATCGAAGATGAAATTCTCGCCTTTGTTTATTCACTTCAAAAACTGAAGGAAATTGGTCGTTTTGCAATCAGAAATAGAGTATATGATTTCAACTCTGGATTTACCAATCCTGATTATGCAGCACTTTACAGTGATGAAAATGCATATCGCGATACTGAAACTGTAAGCGATATTGAAAAGGTTGTATACAGATTTGAAGATCTTATTGATATTACTATCGGTATTCTTGCACCTGGAGGTAATATTAGTCGCAGTGCATCCAAGAATATTCTTTATAACTTGAATTATTATAAAGAAGAGATTCAGAATCAGGTCAACTCTCAGTTTGGTTCTGGTGCATGGGTATATAACGCTTTCATTGATAGAATCATTACTGATATGGTTCATGATATTGTTACAACTGACACTAAGGTCAAGCAAACTGCATAT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Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
f22b3c0955fcc0c2d30ee7e43dcc99facdfaed7fd102d1fdca326a5d4ce7013b
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50