Protein
View in Explore- Genbank accession
- CAD2272893.1 [GenBank]
- Protein name
- L-shaped tail fiber protein
- RBP type
-
TFTSPTF
- Protein sequence
-
MADQNLKQIQFKRTSTENKAPGADIVARGEIVLNTHGRTLAIYTKDEADNVVQLAGKGVPFLDTAGNLNVDGTTTLKDNVTISPNKAINFEASDLSGALVRHITGKCANNDGWYIGAGGASDQGFLEIGTYDNGNEPIYFVQRTGGTAQAEVRRLALLDGFGDTSIPGDLRLTGKTVKISNGSTLTLEMGVGSNDAYIKNLRGTGVLQLTNDSNLTFRNSQVYYAMNGRGPGKSGTLLTNVENNRQAWQYVISAATAGTPRWVKVATIKHPGDASSQLDLMITGGIDSGHGRHYVDFITLSGRNLTSWSTSNLDNWVEWRRMGSPNKGNVPEYYVVKNDAATDSEASFDFYAKVPRYGNGLYVTVLNTAGYNGQDSGKVIIYETGQDTGATTPSGSILVSMKQIFDSIAKPDFGDTTGTLPVNRGGTGATNVGDARNNLGLGTAAVRDVGEGAGNVLENGAYGLGGNGGKSINDIVSNADMLTRLKAYGGTFWRGVTKSGVSVQNGLYSHGSGIFMNAGDTMSAINIDYASAKVRVYAANNSSLAAGNVNYNELYGTANKPTKADVGLGNLTNDTQVKKAGDTMTGDLAAPNLHASGTGTASVYVNAGSGNAHVWFRTNANERGVIWATPNTADLGQINIRAKTTGDVSAGDFSFRSDGRFDVPVAVKIGGAAMLTKDGNITSGSLFGGNLNNYLTSIKNDIVAGDNKQVSKTGDTMTGNLTINANLKVENPNGTMVDLGSENSDKYSRLTLARKVGSGATVAMLKVTPEGHVQFGYQDAVATPAPTKYILVKSNGLEVEGDLVFNQTYCGAEDAINITDKTNDLNNMVIKGSDLGTRLLYKCTSTGGASNILNRPTSDGNFVLEVLSLRKISDTDWTCKQTFTTKNGNVEGTYVRYCQNGTWSVWKEVVAGVQPINLGGTGATSVAAARNNLGVGEGQTVSFGGLNVNGIGTNDPVIEFKNGAKVREGQGTGMGALILSASPSTTGKYLALRPYGDASSVDIKVKANGSSEALLEWSYGPGIRSNSTGAFVIYAKTGQALHLRPNGDNSNQATVIDQNGKMTVGGEFEAQNSKITGNLNVSEDNRMIVLGRNTDIGLVKKSNMPGKMAISKSNSFTVMVSTNTNNQINPADTFNDIFKVDADGNQTVYGNSQINRQLTVSSSATVNGVINANGGIIVPTTKYVQIADAPTQNNQATNKKYVDDKVASAISNAGDTYLPLTGGTVTGRLTITGDQLKATSLWTTGDAAVNGVLTVDGKARFNQEFSVSTSVNVQNDGNSHVFFRKANGAEKGLIWADDPGNVSIRTAGASGPVWNFWNSGSCQFPGAISNYNGISTTTNYPAGQPNGTYNNTAGLVTRFSNGAYASIYFQEYVGNYHQAILNVNGFGRDDNFYFRAGGDFFCTRNGSFDNVEIRSDRRAKSDIKVIENALEKVEKLTGNTYELHNTSGGTTRSAGLIAQEVQEVLPEAVTQDIEADGGLLRLNYNSVIALLVESVKELSAEVKELKSQLK
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1510 AA molecular weight: 159702,26020 Da isoelectric point: 6,22014 aromaticity: 0,07351 hydropathy: -0,33662
Domains
Domains [InterPro]
DC_1942
ATT
4–621
ATT
4–621
DC_0468
STR
485–1200
STR
485–1200
IPR030392
CHP
1415–1509
CHP
1415–1509
1
1510
Architecture
ATT 4-621 | STR 622-1200 | RBD 1201-1510
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Tail Spike Domain Segmentation
Tail Spike Domain Segmentation
This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.
Domain Layout
1
1510
| Domain | Start | End | Length (AA) | Confidence |
|---|---|---|---|---|
| N-terminal | 1 | 1092 | 1092 | 0,1072 |
| Central domain | 1093 | 1291 | 200 | 0,3653 |
| C-terminal | 1292 | 1510 | 218 | 0,8949 |
Note: Constraints were applied during segmentation.
Fixed 18 C-terminal predictions appearing before Central domain
Fixed 18 C-terminal predictions appearing before Central domain
Legend:
N-terminal
Central domain
C-terminal
3D Structure with Domain Coloring
The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).
Domain Coloring
N-terminal
1-1092
1-1092
Central
1093-1291
1093-1291
C-terminal
1292-1510
1292-1510
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Klebsiella phage vB_KpnM_311F [NCBI] |
2697092 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CAD2272893.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
LR877331.1
[NCBI]
CDS location
range 70259 -> 74791
strand -
strand -
CDS
ATGGCCGATCAAAACTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAACTAGCACAGAGAATAAAGCACCAGGTGCAGATATCGTAGCCCGTGGCGAAATCGTGTTGAATACACACGGGCGTACTCTTGCCATTTACACTAAAGATGAAGCCGATAACGTTGTTCAGCTTGCAGGTAAAGGTGTTCCTTTCTTAGATACTGCAGGTAATCTTAATGTTGATGGAACTACTACGTTAAAAGACAATGTAACCATTTCTCCGAATAAAGCGATCAATTTTGAAGCTTCGGATTTAAGCGGAGCATTAGTACGTCATATCACCGGTAAGTGTGCTAATAATGATGGCTGGTACATTGGAGCTGGTGGTGCATCTGACCAGGGATTTCTTGAAATCGGTACGTATGATAACGGAAATGAACCAATTTATTTTGTTCAAAGAACTGGCGGCACGGCCCAAGCTGAAGTTCGTCGTTTAGCATTATTAGATGGGTTTGGCGATACTTCTATACCTGGGGACCTTCGTTTAACTGGTAAAACAGTAAAAATTTCAAACGGCAGCACTCTTACTTTGGAAATGGGTGTAGGTTCTAATGACGCATACATTAAAAACCTGAGAGGAACTGGTGTTCTTCAATTAACCAATGACAGTAATCTGACATTCAGAAATTCGCAGGTTTATTACGCCATGAACGGAAGAGGTCCTGGTAAATCCGGCACTCTTCTGACGAATGTAGAAAACAACCGTCAAGCATGGCAATACGTAATTTCTGCTGCAACTGCTGGAACTCCACGTTGGGTTAAAGTAGCTACAATTAAACACCCAGGAGATGCGTCTTCACAGTTAGATTTAATGATTACAGGTGGAATTGATTCTGGACACGGAAGACATTATGTTGATTTTATCACGCTATCTGGTCGCAATTTAACATCCTGGAGCACTAGCAATTTAGATAACTGGGTTGAATGGCGCAGGATGGGTTCTCCTAATAAAGGAAACGTTCCAGAATATTACGTTGTTAAAAACGATGCTGCTACAGATTCAGAGGCTTCATTTGATTTTTACGCTAAAGTTCCTCGATATGGCAATGGGCTTTATGTTACAGTGCTTAACACTGCTGGATACAACGGACAAGACAGCGGTAAAGTAATTATCTATGAAACCGGCCAAGATACTGGTGCTACTACACCATCTGGAAGCATTCTTGTTTCGATGAAACAAATTTTTGACAGTATCGCAAAACCAGATTTCGGCGATACTACCGGTACTCTTCCGGTTAACCGTGGTGGTACAGGTGCTACTAACGTAGGAGATGCTAGAAATAACTTAGGTCTTGGTACTGCGGCCGTTCGCGATGTTGGTGAAGGTGCTGGTAATGTTTTAGAAAATGGCGCTTATGGCTTAGGTGGCAACGGTGGTAAATCCATCAATGACATTGTCTCTAACGCTGATATGTTGACTCGTTTAAAAGCATACGGCGGTACTTTCTGGCGTGGTGTTACTAAATCTGGCGTTAGTGTTCAAAACGGTCTTTATAGTCATGGCTCTGGTATTTTTATGAATGCGGGTGATACCATGTCAGCTATTAATATCGACTACGCTAGTGCTAAAGTTCGTGTATATGCAGCTAACAACAGTAGTCTTGCCGCAGGAAATGTTAACTACAATGAACTTTATGGTACAGCAAACAAACCGACAAAGGCTGATGTCGGACTTGGTAATCTGACAAACGATACCCAAGTTAAGAAAGCTGGCGACACCATGACAGGTGATTTAGCTGCACCTAATTTACATGCTTCCGGCACCGGTACTGCATCAGTGTATGTTAATGCAGGAAGCGGAAATGCTCATGTATGGTTTAGAACAAACGCCAATGAACGCGGTGTAATTTGGGCAACTCCAAATACAGCGGATTTAGGACAAATTAATATTCGCGCAAAAACTACTGGAGATGTTTCTGCTGGTGATTTTAGCTTCCGTTCTGACGGTCGATTTGATGTTCCTGTAGCAGTTAAAATTGGTGGAGCAGCAATGCTAACCAAAGACGGAAACATTACCTCAGGTTCATTGTTTGGTGGTAACCTTAACAACTATTTGACCTCTATTAAAAATGACATTGTTGCTGGTGATAATAAGCAAGTAAGTAAGACTGGTGACACCATGACCGGTAACTTGACTATTAACGCTAACTTAAAGGTCGAAAATCCTAATGGAACGATGGTTGATTTAGGTTCAGAGAACTCTGATAAGTATAGCAGATTAACCCTTGCTCGTAAAGTTGGTAGCGGTGCTACCGTAGCAATGCTTAAAGTTACTCCTGAAGGACACGTGCAATTTGGCTATCAAGATGCAGTTGCTACTCCAGCTCCTACCAAGTACATCCTGGTTAAATCTAACGGCCTTGAGGTAGAAGGTGATTTGGTTTTTAATCAGACTTATTGTGGTGCTGAAGATGCAATTAATATTACTGATAAGACTAATGACCTTAACAACATGGTTATTAAAGGCAGTGATTTAGGTACTCGTCTATTATACAAGTGTACTTCTACCGGCGGTGCTTCTAATATATTGAACAGACCTACCTCTGATGGCAACTTTGTTCTTGAAGTTCTTTCTTTGCGTAAAATTTCTGATACCGATTGGACGTGCAAACAGACCTTTACTACAAAGAACGGTAATGTTGAAGGTACATATGTTCGATACTGTCAAAACGGTACATGGTCTGTATGGAAAGAGGTTGTTGCTGGTGTTCAACCGATCAATTTAGGCGGTACTGGAGCAACATCTGTAGCTGCTGCTCGTAATAACCTTGGTGTTGGTGAAGGACAAACAGTATCATTTGGTGGATTGAATGTCAATGGTATTGGAACTAACGATCCAGTCATCGAATTTAAGAATGGCGCTAAGGTTCGTGAAGGCCAAGGTACCGGTATGGGTGCATTGATTTTATCAGCTTCTCCATCTACGACTGGAAAATACCTTGCGTTACGTCCTTACGGGGACGCATCTAGTGTTGACATTAAAGTAAAAGCCAATGGCTCGAGCGAAGCATTACTTGAGTGGTCTTATGGCCCTGGTATTCGTTCAAATTCAACTGGCGCTTTTGTTATCTACGCAAAAACTGGACAGGCGCTTCATTTAAGACCTAACGGTGATAATTCTAACCAAGCAACAGTTATCGATCAGAACGGTAAAATGACAGTCGGCGGTGAGTTCGAGGCTCAGAACTCAAAAATCACAGGTAACCTGAACGTATCTGAAGATAACAGAATGATTGTTCTTGGCAGAAATACCGATATCGGTTTAGTCAAGAAAAGTAATATGCCAGGAAAAATGGCTATCAGTAAATCTAACTCGTTTACTGTTATGGTGTCAACCAATACTAACAATCAGATTAATCCTGCTGATACGTTTAACGATATATTCAAAGTTGACGCTGATGGAAACCAAACGGTCTATGGAAACTCACAGATTAACCGACAACTGACAGTATCAAGCTCGGCGACAGTTAATGGCGTTATTAATGCCAACGGCGGTATTATTGTTCCTACTACTAAGTATGTGCAAATTGCCGATGCTCCTACACAGAATAACCAAGCCACCAACAAGAAATATGTTGATGATAAGGTTGCTTCTGCTATTAGTAACGCTGGCGATACTTATCTTCCGTTAACTGGTGGTACCGTAACTGGGCGGTTAACAATTACAGGTGATCAGTTAAAAGCTACCTCTCTGTGGACTACCGGAGACGCTGCAGTTAACGGTGTTTTAACGGTTGATGGAAAAGCTAGATTTAATCAAGAATTTAGTGTATCCACTTCAGTTAACGTCCAGAATGATGGTAACAGCCATGTGTTCTTCCGTAAAGCAAACGGCGCAGAAAAAGGACTTATTTGGGCTGATGATCCTGGTAACGTTAGTATAAGAACAGCTGGTGCTTCTGGTCCGGTATGGAATTTCTGGAATAGTGGTTCTTGCCAATTCCCAGGAGCTATTTCTAACTATAACGGAATTAGTACCACTACTAATTATCCTGCAGGACAACCTAATGGTACATATAACAATACCGCAGGACTAGTAACTAGATTTAGTAATGGTGCTTATGCTTCAATATACTTCCAAGAGTATGTAGGAAACTATCACCAGGCTATTCTTAATGTTAATGGATTCGGTCGAGATGACAATTTCTATTTCAGGGCTGGCGGCGACTTCTTCTGTACTCGTAACGGGTCATTCGATAACGTAGAGATTCGTTCTGACCGTAGAGCTAAATCTGATATTAAAGTTATTGAAAATGCTTTGGAAAAAGTAGAAAAACTAACCGGTAATACTTATGAGCTTCACAACACATCCGGTGGTACTACTCGTTCTGCGGGTTTAATCGCGCAGGAAGTTCAAGAAGTTCTTCCGGAAGCAGTTACTCAGGATATTGAAGCAGACGGGGGTTTATTGCGTCTGAATTACAACTCAGTAATTGCACTTCTCGTTGAATCTGTTAAAGAGCTTTCTGCTGAGGTTAAAGAGCTTAAATCTCAACTGAAATAA
Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
f72483d7963f372439d30d1773b0411512c48a7fe7dfccc7c9b2eab6ea66b927
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50