Protein

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Genbank accession
QBJ03595.1 [GenBank]
Protein name
capsid and scaffold protein
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,67
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MKQLILVGNQKVKFQDTETIISLTLVSDGNTVTIDKNKTYSVKIKNGTGYVKSLDATPNTTNNMVTFSTSGFDGLPVDAYFIELWVIDTNGQTIYPSDSFIELDITANATGVEGQVLPAITMQEFEERFSTLQSDLEAKVSTLIGPTGATGNGISGVSTQYQLGTDGVNVPTGTWSDTPSTPTDTLPYMWTRNVTTYTDKSTHTSYNISAKGTQGNNFTIQGSTSSIAGLPSIGTDGEGYMVGTELYVWTNGKWNDIVNMKGVQGDQGIQGIQGVKGDTGTGIQSTSTDYELSSQGVEVPNTGWSTTIPVTTNDLPYLWTRVTITFTDSSQHVIYFTSNKGDKGDKGDTGEKGDTGANLAVKGAVDKATSLPSTGNSEGDAYLVGTDLYVYTSGAWKDCGPIVAENTVLYNADGSLNVNGTNFTYVQDLRNGKIQYNDGTKNVQVTPMDADKEASDILAARTYTDSSVSALSTNVDTKLSSKANTADLSTGLATKADDSKVVHDNHDNTITANGASYDLSKSGLAPISYWSSGSFNDLPLGTVFANSTVMTDGPDTIRVFTTTTFYSTQWGGRRVQIAIADSTNLMYFRVYEGVTWRSWTLLSDDSKVVHSTDMRKPASDVSGIDEVNALQTQVDNSAVGTNLAIGTNQEYSMGYGIPTTTWEDGYAYEKLPTTINNGEILPQDPGFWYTLTQGVTYTQTIWFETDANVKDLSAAQITWYTAAGHDFQPAIVQKLGQNSYKVVSTHTWPGKGDNNVRLFDIENLDSAFDFSTGTYLKFGKLKLEKGSVATDWCPNPEDKVNVADMRKPASDVAGIEEVNAKQDKIGYTPADDSKVAHLSGANNFDTLPTVNNTPLLTSDKLPDNIVKQGDVIGNINYAMYLASYPTTVGQLVVADGTVDSTKTKFITTTNSYPIPPNVTSMIWETPQINMPLLVGNVIAFYDNSGNFISANAYDATTSYQLINIPKNAYSFKISCGSNSLNSVKLFSGSSYIDSSPYPIVMGVRIKDKMAATTDDVTTAISTATANMVDSSKPTNFTDNVTFANTPKMSNGDPLITASQTGDVSKLLTKDKSNYVNAINELSSIVDRFYPVASQAIPTDNVSYSNQGLVYNYDPSNNTVIFRKNDPSYSINYDTSVVGTNFTENSGGAAPLGGIRIYFGFKAIHYINGTEGTLSDINYYVLDPTSTAKSGELGLLKGIPYYLTGENFTVGSNYTIDFSGNGMNLSTSGNNRISPKLIISNKGNGVLNITPYHGEDFKDDKSEGYWIYPYITKMVSYSVDTTAMKALPDGYSYDYVKDTNPSSTGNYLTAWGQGSYQYKFDLNNLGNGYSIDSMGSSITINVSIKGIDKSFPSGYSVFDGYKSSQFPSNAFTTYPGDNQDAVGISYINLLWKLSKEDIISGSSYTAYYQAISGTGNSAFYAIKLVINNDNTISIYAIAPFINDDSTTYDPSKSMSVSSRHSSFSSTSITAISIINNA
Physico‐chemical
properties
protein length:1476 AA
molecular weight: 159343,97420 Da
isoelectric point:4,57903
aromaticity:0,10163
hydropathy:-0,33902

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
QBJ03595.1
1 1476
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 652 652 0,9978
Central domain 653 1465 814 0,3425
C-terminal 1466 1476 10 0,0617
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-652
Central
653-1465
C-terminal
1466-1476

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Lactobacillus phage 3-521
[NCBI] 		2510943 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Lactobacillus brevis
[NCBI] 		1580 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Bacillota > Bacilli > Lactobacillales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QBJ03595.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MK504444 [NCBI]
CDS location
range 40760 -> 45190
strand +
CDS
GTGAAACAACTAATTTTAGTCGGTAATCAAAAAGTAAAATTTCAAGATACAGAAACAATTATATCTCTTACATTAGTATCCGATGGAAACACAGTTACTATTGATAAGAATAAGACGTACAGTGTCAAGATTAAAAATGGTACAGGGTATGTTAAATCACTTGATGCTACACCAAATACTACTAATAACATGGTAACATTTAGTACTTCAGGTTTTGATGGCTTACCAGTTGATGCTTATTTTATTGAACTTTGGGTAATTGATACTAATGGTCAAACTATTTATCCTAGTGATAGTTTTATTGAGTTAGATATAACAGCTAATGCTACTGGAGTAGAAGGACAAGTATTACCAGCAATTACTATGCAGGAATTTGAGGAACGGTTTAGTACCTTACAATCTGATTTGGAAGCTAAGGTAAGTACATTAATTGGACCAACAGGGGCAACGGGTAATGGTATTAGTGGGGTATCTACTCAGTATCAATTAGGTACTGATGGGGTTAATGTACCAACAGGTACTTGGAGTGATACACCAAGTACTCCTACAGATACCTTACCTTATATGTGGACGAGAAATGTAACAACCTATACAGATAAAAGTACACATACAAGTTACAATATTAGTGCCAAAGGGACTCAAGGTAATAACTTTACTATTCAAGGAAGTACTAGTAGTATCGCCGGGTTGCCAAGTATAGGTACTGATGGTGAAGGATACATGGTTGGTACAGAACTTTATGTCTGGACTAATGGCAAATGGAATGATATTGTTAACATGAAAGGGGTTCAAGGAGACCAGGGTATCCAAGGTATTCAAGGGGTTAAAGGGGATACTGGTACTGGTATTCAGAGTACAAGTACTGATTATGAGTTAAGTTCTCAAGGGGTAGAAGTTCCTAATACGGGATGGAGTACCACTATTCCAGTTACTACAAATGACCTACCTTATCTTTGGACCAGAGTTACTATTACATTTACAGACAGCAGTCAACATGTGATATACTTTACTTCTAATAAGGGGGATAAAGGAGATAAAGGAGATACCGGAGAAAAGGGAGATACTGGTGCTAATCTAGCCGTTAAAGGTGCGGTTGATAAGGCTACTAGCCTACCTTCTACTGGTAATTCAGAAGGAGATGCCTATTTAGTAGGAACCGACTTGTACGTTTACACAAGCGGTGCTTGGAAAGACTGTGGTCCAATTGTGGCAGAAAATACAGTTTTGTACAATGCTGATGGCAGTCTTAATGTAAATGGAACTAACTTTACTTATGTACAAGACTTAAGAAATGGTAAGATACAGTACAATGACGGTACTAAGAATGTACAAGTAACTCCAATGGACGCTGATAAGGAAGCTTCTGATATACTAGCTGCTAGAACTTATACAGATAGTTCTGTTAGTGCCTTAAGTACAAATGTGGATACCAAATTGAGTTCTAAGGCTAATACAGCGGACTTGAGTACAGGGTTGGCAACCAAAGCAGATGATAGCAAAGTAGTTCATGATAACCATGACAATACGATTACAGCTAACGGAGCTTCTTACGACTTATCAAAATCAGGTCTTGCACCAATTAGTTATTGGAGTTCTGGTTCATTTAATGATTTACCTTTAGGAACTGTTTTTGCAAATTCTACTGTAATGACGGATGGTCCTGATACAATTCGTGTATTCACCACAACCACATTTTACTCTACTCAGTGGGGTGGTAGAAGAGTACAAATAGCAATTGCTGATAGTACAAATCTCATGTACTTTAGAGTTTATGAAGGTGTAACTTGGCGTAGTTGGACGTTATTATCTGACGATTCCAAAGTTGTTCACAGTACTGACATGCGTAAACCTGCTAGCGACGTATCTGGAATTGATGAAGTTAATGCATTGCAAACTCAAGTTGATAACAGTGCTGTAGGAACTAATCTAGCCATTGGTACTAATCAGGAATATTCAATGGGTTATGGAATTCCTACTACGACGTGGGAAGATGGCTATGCTTACGAGAAGTTACCAACAACTATTAATAACGGTGAAATTCTTCCGCAAGACCCCGGCTTTTGGTATACCCTGACTCAGGGGGTAACCTATACTCAAACAATATGGTTTGAGACTGATGCAAATGTCAAAGACTTGAGTGCAGCTCAAATTACATGGTACACGGCGGCAGGGCATGATTTTCAACCGGCAATAGTTCAAAAGCTAGGTCAAAATAGCTATAAGGTTGTATCAACGCACACGTGGCCAGGTAAGGGTGATAATAATGTGCGATTATTTGATATTGAAAATTTAGATTCCGCTTTTGATTTCAGCACAGGGACCTATTTGAAGTTCGGCAAGTTGAAGCTGGAAAAGGGCAGTGTGGCTACTGATTGGTGTCCTAATCCAGAGGATAAAGTAAATGTAGCCGACATGCGTAAACCAGCTAGCGACGTAGCGGGAATTGAAGAGGTTAACGCCAAACAAGATAAAATTGGTTACACACCTGCTGATGATTCCAAAGTAGCCCACCTATCTGGTGCTAACAATTTTGACACCCTTCCAACTGTCAACAATACACCTTTATTAACTTCTGATAAGTTGCCTGATAATATTGTCAAGCAAGGCGATGTTATTGGAAACATTAATTATGCAATGTATTTAGCATCTTATCCAACAACAGTAGGCCAATTAGTTGTTGCTGATGGAACGGTTGATTCAACTAAAACAAAATTTATCACAACAACTAACAGCTATCCAATTCCACCAAATGTTACTAGTATGATATGGGAAACTCCACAAATTAATATGCCTCTTTTAGTAGGAAATGTAATTGCCTTCTATGATAATTCAGGTAACTTTATTTCAGCAAATGCTTATGATGCAACCACTTCATATCAATTAATAAATATTCCTAAAAATGCATACAGCTTTAAGATTTCTTGTGGTAGTAACAGTCTTAATAGCGTTAAGTTATTTTCTGGGTCAAGCTATATTGATTCATCACCTTATCCAATTGTAATGGGGGTAAGAATTAAAGATAAAATGGCTGCAACAACTGATGATGTTACAACTGCTATCAGCACCGCTACGGCTAACATGGTTGACTCCAGCAAGCCTACAAATTTTACTGATAATGTAACTTTTGCTAATACTCCTAAGATGAGTAATGGTGACCCATTAATTACTGCTAGTCAAACTGGCGATGTAAGTAAATTACTCACCAAGGATAAATCAAATTATGTTAATGCTATAAATGAATTATCATCAATAGTGGATAGATTTTATCCAGTAGCTTCACAAGCTATTCCTACTGATAATGTATCTTATTCAAACCAGGGCTTGGTATACAATTATGACCCTAGTAATAATACAGTTATCTTTAGAAAAAATGACCCTAGCTATTCCATAAACTACGATACTTCAGTTGTAGGTACTAACTTTACTGAGAACTCAGGAGGGGCAGCTCCACTGGGTGGAATAAGGATATACTTTGGATTTAAGGCGATACATTATATAAATGGAACTGAGGGTACCTTGAGTGACATAAATTATTATGTATTGGACCCTACTAGTACTGCCAAAAGTGGAGAATTAGGACTATTAAAGGGTATTCCTTACTACCTTACTGGTGAAAACTTTACTGTTGGGTCAAATTATACTATAGACTTTAGTGGTAATGGAATGAATCTATCAACCTCTGGTAACAATAGAATATCTCCTAAATTAATTATAAGTAATAAAGGTAATGGGGTATTAAATATAACTCCATACCATGGTGAAGATTTTAAGGATGATAAATCTGAAGGTTACTGGATTTATCCATATATAACTAAAATGGTAAGCTACTCTGTTGATACTACTGCTATGAAAGCACTCCCTGATGGATACTCGTATGATTACGTAAAGGATACTAATCCTAGCAGTACTGGAAATTACTTAACGGCTTGGGGGCAAGGTTCCTATCAATATAAGTTTGATTTAAATAACTTAGGCAATGGATACAGCATCGATAGTATGGGGAGTTCAATAACTATTAACGTGTCCATAAAAGGTATTGATAAATCATTTCCTAGTGGGTACTCTGTTTTCGATGGGTATAAATCATCACAATTTCCTAGTAATGCATTTACTACGTATCCTGGTGATAATCAGGACGCAGTAGGAATTAGTTATATAAACCTACTATGGAAATTATCTAAAGAAGATATAATATCAGGTAGTAGTTACACTGCTTACTATCAAGCAATATCTGGAACTGGAAACTCTGCTTTTTATGCTATTAAGCTAGTGATAAATAATGATAATACTATTAGCATATATGCTATTGCTCCCTTTATAAATGATGATAGTACTACTTATGACCCATCTAAAAGCATGTCTGTATCTAGTAGGCACTCCTCATTTTCTAGTACTAGTATTACTGCAATATCAATAATTAATAATGCATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
d7ff31cb2a88d5d963d7a88e4d6a55d048fa51a311d924a9a0f3ab73727346e6
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5876
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Isolation of virulent Lactobacillus brevis phages Feyereisen,M., Mahony,J., O'Sullivan,T. and van Sinderen,D. 2019-04-26 — GenBank