Protein

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Genbank accession
XYM57507.1 [GenBank]
Protein name
short tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,88
Protein sequence
MATQTVTYDVAGTYNIVLPTNVKSLTYEMRGASGGKTGPGVSFSPNFTAGAEINGGPGEKITGVLDAVACSGKTLVVQIGTKGFAGTTNTGVDGSASGGTGAFNGGAGGSQPGGESSNVTASGGGGGGGSATTVSVDNGYILIAGGGGGAGGATYDTWDSQNRTPNGSAVTPGTVGTVLNASAGQAGGNGNVDANAGSGGGGGGNNGNNYNDGGNGGASVLSGNHIGGNHGFKGGSYRDTNFVTEASTSANAFTDNDGFFELTYETGDPPNVQFSVSPAAVIVNGTGATLSWECTGDAASAPTSVTLNGNNVAFVDTLAVNPNATTTYTIVATGPGGVTSDSIVLTVIPEGDPLNNEFVTTYGTGTHTLQVPAGTTNAFVTIAAGRGGSGGSDSGGSGCGGGAGRVGQFRLKDDGAGNPYGTAGSLNQTIYQNTTVTVPADINEVNYVIQGGKGGDTAAFTLGKLGQRISGVLTNVAGETLSIVVGGNGGDGNSAVDLGSPGQGYNDGGQGGANSTISATYTTVPLYRYFNSTTNDHFTGLDVAPPAGYVNEGQIANVFTDPQPPGTVVVQDNEPGKPASTYTAYAFPNNGTPPFFIDVTEIPTTVIYAKTNGTDVLWTSNAAEGNGDTPPYTLDTTNNAFGYAFYAPTSPVTLTVDGATSTRGGGGGGSSAIHIGATTLVVAGGGGGAGGPDACGTLDQTAGQGNGILYTTGARTDGLDGDDAQQNGGGGGGGGAGGGWTPTNLAGDGGGPCEGGTGGQTGNGYYNLSYSQNAGVLTQGDNFNSGDGYVTLSGAGNNNWNLLIRVGDQGSNGASGSPGNKPGGQGGTGAGGFMDGGAGGTDSQGGGWSGSGAGGGAGSGIWDVDNNRWFASAGGGGGGGGGSWNRSCSGTAASGGAWQATTNVSAADGGTGSSAGGDGGGGGGGGGGHSGGGGGGSGVDNSFGGSSGGSGTSRYDNNALELLQGGSTNSASGYAIVSFSVPPQIAYFRANDDNTATDVYEGDVVTLSWSTLFNGVETASFAEINQGIGSVDVGESSTTVVAPATTTTYTLTVSNAGVFSQMAVTLNVLAPDNIPDIFTFDSIFDADLSTQYISNEVTITGIQVDVTGSASNGAFMSVNGGAFTQNTVTISNGDTVRLRMTSPGTYTTTLTSTVTIGLTSSQWNITTVQEPGQFPNAFEFENVIDAPTESYVQSNQITITGITVPVLVSAPTNGFESSVNGSAFSTSQKVINNGEILILRYLTSDILGETASTYVTVGDSPNKNWSVTNVTTADQDPDYFDFVNVVGATAATMTESLPQVIAGINVPTPISFVRSEGGITSSGGVEFRVGTGPWQTSGNINVNDSVQIRTTSSPDPGGEVEVDVTIGSLTDVWKVITTTAGDQIPDAFFFINQTNQVPNSFVYSNTVLVQGLTAAANITVTGGSFKVGNGGWVTTGQINNGETLRLRILTPNGLNQTGNMSITVGP
Physico‐chemical
properties
protein length:1466 AA
molecular weight: 144593,84280 Da
isoelectric point:4,05003
aromaticity:0,07367
hydropathy:-0,18492

Domains

Domains [InterPro]
DC_0346
STR
1–739
DC_0346 DC_2069
XYM57507.1
1 1466
Architecture
STR
STR
STR 1-739 | STR 870-1311 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage Sf-CH1b
[NCBI] 		3413213 Viruses >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XYM57507.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV340850.1 [NCBI]
CDS location
range 38736 -> 43136
strand +
CDS
ATGGCAACTCAAACAGTCACCTACGATGTAGCAGGTACATACAATATTGTTTTACCAACTAATGTGAAGTCTCTCACATATGAGATGCGTGGTGCTTCTGGTGGTAAAACTGGTCCTGGTGTTTCTTTTAGTCCAAATTTTACTGCTGGTGCTGAAATTAACGGAGGACCAGGAGAAAAAATTACTGGTGTTCTTGATGCTGTTGCTTGTTCTGGTAAAACATTAGTAGTTCAGATTGGAACAAAAGGATTTGCTGGAACTACTAATACTGGTGTTGATGGTAGTGCATCTGGAGGTACTGGTGCATTTAATGGTGGAGCAGGTGGATCACAACCTGGCGGTGAATCTAGTAATGTTACTGCTTCTGGTGGAGGTGGTGGTGGAGGTTCTGCAACTACTGTTAGTGTAGATAATGGATATATTCTCATCGCTGGTGGCGGTGGAGGAGCAGGTGGTGCTACTTATGATACATGGGATTCTCAAAATAGAACTCCAAACGGATCTGCTGTTACTCCTGGCACAGTAGGAACTGTATTGAATGCATCTGCGGGTCAAGCAGGTGGTAATGGAAATGTTGATGCTAACGCTGGATCAGGCGGTGGCGGTGGTGGAAATAATGGAAACAATTATAATGATGGTGGTAATGGTGGTGCTTCTGTTTTATCTGGTAACCATATTGGTGGTAACCATGGATTTAAAGGTGGTAGTTATAGAGACACAAATTTTGTAACTGAAGCATCTACAAGTGCTAATGCATTCACTGATAATGATGGATTCTTTGAGTTGACATATGAAACTGGAGACCCACCTAATGTCCAGTTTAGTGTTTCTCCTGCTGCTGTTATTGTTAATGGAACAGGTGCTACGCTTTCGTGGGAATGTACAGGTGATGCAGCATCTGCTCCTACGAGTGTTACCTTGAATGGTAATAATGTTGCTTTTGTTGATACTTTAGCTGTTAATCCAAATGCCACTACAACGTATACTATTGTTGCTACTGGTCCTGGTGGAGTTACCAGTGATAGTATTGTATTGACTGTTATACCTGAAGGTGATCCATTAAACAATGAGTTTGTTACCACATATGGTACTGGCACACATACTCTACAAGTTCCTGCAGGTACAACGAATGCATTCGTAACTATTGCTGCTGGTAGAGGTGGATCAGGTGGTTCTGATTCGGGTGGTTCTGGTTGTGGCGGTGGTGCAGGTAGAGTAGGACAATTTAGATTAAAAGATGATGGTGCAGGTAATCCATATGGTACTGCAGGGTCACTTAATCAAACAATTTATCAGAATACTACAGTTACTGTTCCTGCAGATATCAATGAAGTTAATTATGTAATTCAAGGTGGTAAAGGTGGAGATACAGCAGCATTTACTCTCGGAAAATTAGGACAAAGAATTTCTGGTGTATTGACAAATGTTGCTGGAGAAACTTTAAGTATTGTTGTTGGTGGTAATGGTGGTGATGGTAACTCTGCTGTTGATCTAGGATCGCCAGGTCAGGGATATAATGATGGTGGTCAAGGTGGTGCAAATTCTACAATCAGTGCTACATATACAACTGTTCCTCTGTACAGGTATTTTAATTCTACTACTAATGATCACTTTACTGGTTTAGATGTTGCACCACCTGCTGGATATGTCAATGAAGGACAGATTGCAAATGTATTCACTGATCCACAACCACCAGGAACAGTTGTTGTTCAAGACAATGAACCAGGAAAACCAGCTAGTACATATACTGCATATGCTTTTCCTAATAATGGTACACCGCCATTCTTTATTGATGTAACTGAAATTCCAACAACCGTCATTTATGCAAAGACAAATGGAACTGATGTTTTGTGGACATCTAATGCAGCAGAAGGAAATGGTGATACCCCACCATATACATTAGATACAACAAATAATGCATTTGGATATGCATTTTATGCACCAACTTCCCCTGTTACTTTAACTGTTGATGGTGCTACTAGCACAAGAGGCGGCGGTGGTGGTGGATCCAGTGCCATTCATATTGGTGCTACCACACTAGTTGTTGCAGGTGGTGGCGGTGGTGCTGGTGGTCCCGATGCTTGTGGAACACTAGATCAGACTGCTGGACAAGGTAATGGTATTTTATACACTACTGGTGCTAGAACAGACGGACTAGATGGCGACGACGCACAGCAAAATGGCGGCGGTGGCGGCGGCGGTGGAGCAGGTGGTGGTTGGACACCTACTAATCTTGCTGGTGATGGTGGCGGACCATGTGAAGGTGGCACTGGTGGTCAAACAGGAAATGGATATTACAATCTATCTTATTCTCAGAATGCTGGTGTTCTAACTCAAGGAGATAACTTTAACAGTGGTGATGGGTATGTAACTCTTTCTGGTGCTGGAAATAATAACTGGAATTTGTTAATTAGAGTAGGAGATCAGGGATCTAATGGTGCATCTGGTTCTCCTGGCAACAAACCTGGAGGTCAAGGTGGTACTGGAGCAGGTGGTTTTATGGATGGCGGCGCAGGTGGTACTGACAGTCAAGGTGGAGGATGGTCTGGTTCTGGCGCAGGTGGTGGTGCAGGATCTGGTATTTGGGATGTAGATAATAATCGTTGGTTTGCTTCTGCTGGTGGCGGCGGTGGAGGTGGAGGTGGTTCTTGGAACCGTAGTTGTTCTGGAACTGCTGCCTCTGGTGGTGCATGGCAAGCTACTACTAATGTAAGTGCTGCTGATGGTGGCACTGGATCTTCTGCTGGTGGTGACGGCGGCGGAGGTGGCGGAGGTGGCGGCGGTCATTCAGGTGGCGGCGGTGGTGGTTCTGGTGTTGACAATAGTTTTGGTGGTTCTTCTGGTGGATCTGGAACATCGCGTTATGATAACAATGCATTGGAATTATTACAAGGTGGTAGTACAAACAGTGCTAGTGGTTATGCAATCGTTTCATTCTCTGTTCCACCACAGATTGCATACTTTAGAGCAAATGATGATAATACTGCTACTGATGTATATGAGGGAGATGTCGTAACACTATCTTGGAGTACATTATTCAATGGTGTTGAAACAGCATCTTTTGCTGAAATTAATCAAGGTATTGGTAGTGTTGATGTTGGTGAATCATCAACAACGGTTGTTGCTCCTGCTACAACAACAACCTACACACTAACAGTAAGTAATGCTGGTGTGTTTTCACAGATGGCTGTTACACTTAATGTGTTGGCACCAGACAATATTCCTGATATTTTTACTTTCGATAGTATTTTTGACGCTGACTTAAGTACACAATACATCAGTAATGAGGTTACAATTACTGGCATTCAAGTAGATGTGACTGGTTCTGCATCTAATGGTGCATTCATGTCAGTAAATGGTGGTGCATTTACACAGAATACGGTAACTATTAGTAATGGAGATACTGTAAGACTTAGAATGACTTCTCCTGGCACATATACCACAACATTGACCAGCACAGTTACTATTGGATTAACTAGTTCTCAGTGGAACATTACTACTGTACAAGAACCTGGACAGTTCCCTAATGCATTTGAATTTGAAAATGTTATAGATGCTCCAACTGAGTCATATGTACAGAGTAATCAGATTACAATTACTGGTATTACTGTTCCAGTTCTTGTATCTGCTCCTACAAATGGATTTGAAAGTTCTGTTAACGGCAGTGCGTTTAGTACATCACAGAAGGTTATTAACAATGGAGAAATTTTAATTCTTAGATATCTTACCAGTGATATCTTAGGTGAAACTGCATCCACTTATGTTACTGTTGGTGATAGTCCAAACAAAAACTGGTCAGTTACTAATGTCACAACTGCTGATCAAGATCCAGATTATTTTGACTTTGTTAATGTTGTTGGTGCAACTGCCGCTACCATGACCGAGAGTTTACCTCAGGTCATCGCTGGCATCAATGTTCCTACACCAATATCATTTGTTAGATCAGAAGGTGGAATTACATCAAGTGGTGGAGTAGAGTTTAGAGTAGGCACTGGTCCATGGCAAACCAGTGGAAATATTAATGTAAATGATTCTGTCCAAATAAGAACTACTTCTAGTCCCGATCCTGGTGGTGAAGTAGAGGTAGATGTTACCATCGGATCTCTTACTGATGTTTGGAAAGTTATTACTACTACAGCTGGTGATCAGATTCCAGATGCTTTCTTCTTTATTAATCAAACTAATCAAGTACCAAACTCATTTGTTTACAGTAACACTGTTCTTGTACAAGGTCTTACTGCTGCAGCAAATATTACAGTAACTGGAGGTAGTTTCAAGGTTGGTAATGGTGGTTGGGTAACTACAGGGCAAATAAATAACGGTGAGACATTGCGTTTAAGAATACTTACACCTAATGGTCTCAATCAAACAGGAAATATGTCAATCACAGTTGGTCCATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
44f5d9bab5af02f42face5ced04cc0c443ec9a548c42ce6ad4bbafb85694825b
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,6107
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50