Protein

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Genbank accession
QJT70985.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
Protein sequence
MPVNYTSGELRLSGTVTNAEFYAATSTAGLSRNTENQYELGANMRVMSGADVSGLKNFILALNTYEIYSEDPSIVFNQITFIESEGRTTADRVVFKTAGSGKNPILNDCQFLHNIVGNPGGGDPRYLTMAHIGGASNSVFRASDFSEQEIDGVQLMESGVYRNISGIRVKRFIASLDPDDNAIRVILKDLKQSSKLYGTGGLICAYSGSSVMVVNWDKEILNSGATNNWLDNYNGHLSAHWVYILGSAADEYQNNGAGISQKKNTLHVVKGGYKYYKFINGEGGTFCYFDSRGSSPQACSPTTTRSDMLETDTTLSIPADEEIDFVTQTLTYNRDTGSWVQTNITGHRFLVRKYGYLEISQDLDNPEAVEGSPEAYSPFLMGLDDSIGEVDSTVVAAYTGITINSSAKTITITSGSWTPQKIYDYCKYWLTQNMDVGNFVTASGTNYEYTYRWVLNGSANLQHDPDTHKVTFKDIDIGISPLHLIAGSYVYGVETVSDGVTTYSSREGLVNDVSLGSTHGFNATYRESGCPKIDGGTFTWNGGIITTPTALSVEDGQLLLRKGELDVSSYDSSNSIGPTLWLESAADTLQFENLIVTSNSAREGLIVLFSKEPNTFDNVTMLNGGGLGFGGSTLFETDGTTAKIIEIKNYEATGGQGAARFWRRNYLKLINYNLGSDIEISGMLTAGNSENRGIIDIYREVDFHVTDATATNIEGANVYCIDTDDGNRPANYMGHSWTADKEYLRSTDSTGRTSTIEVNLANMVKTGNNSATTGIVRSYRGLDGDTSDKFKFYFYHYNYLIANTVGTLGGKGILTLQQTMQEDPAITETDSTIVAAYTGIAIDHSAKTITLTSGTWTSNVIYDYVKYNKCLSANVSKPSVLESAIEFSEGRFISRYRILVKHTALFDIGSGHPLTFTSDVATPNLSGEGSITFGSETTVNGITSYDSGTLVNFEKNNTSWYQNPVMVLDGTLVWKGGELEVQSPLITSPDLSMVVDKGTIKVKDHSLTSPYEINFGSDNITLTDFTIDGRGTFIITSDLVISKFTGKNYDGIFPSGKFRGSSTDFLVVRDYEGIGSFKDHTLWRRNKIQWYNSVNGSNIKVLGKETSSSTQHTGISEFWSEIKIHVTDPDNNDQENVRVALKDYDDSNRTDTSSLTGSASSGHYNTGFDYTPDRTYTEVTDVEGLTPIIPVLFAVVDRSVGGAQATPTSDWSYRSKNGDNSDEFEVFVWQYGKNVATSVISLKGAGVKETKLVTTTDINVTETDKSVVSAYTGIGIDHTTKTITISAQRTLAEIYDYLLYDKTTISGVYHPTLGTKVAGIVGATIDIKDYNLIVDGADIVAGSTGFNLLQTTGLITLQNTATIDFNFLDQIGNAIVTIDLPANWNLEGVYPSQNDALAKTNKLPNSNINYKYLTTSEGGNTIWMRIEDSDGQGIAVDSYELPITRGVYETAAVTSTEDSLLNQIRAIVRDTKTITEDIQSETGGGLSQNYFDDFQKRSGYNLATVEEAINVDFSGNLAAYVNMGFRCPVGKKGGSLVPRRGTAISKVRFYVGQAFHIGTNTYMGGTVQFKIWRTNGPGTLADGNFGDVVWQSPETYQLDDLENVGSNSVVGSGYNHVHRSKEFIMESSGMILEEDYYFGFEVITGEALTPINLSDSGHDYGGLYYEHHRLSGWESNSPGYIRYADGGRPVPVDITEYNYNLITQYKLKADIDDIKDVTDKVSFNADNDIIATLDNELTDIMDVSKRAPYVYVDGCPTAEANGAYRLLSTDEVDWLNANGNLDSDIAAGDTAVLDRSQPVYGLDRNEWVLGAMEGEYGYRLFPVQNTTTYYSSNNGFYDLAQEVSGDPTVGKSWYALAGKFDADNLVDGAKVSIMVVLNTPTMLDDVKDRTDQLQFTDQRVDANVPDQLTESEFDTKRLAKKGWR
Physico‐chemical
properties
protein length:1924 AA
molecular weight: 210702,51610 Da
isoelectric point:4,66525
aromaticity:0,10135
hydropathy:-0,33415

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
QJT70985.1
1 1924
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 14 14 0,6995
Central domain 15 254 241 0,9384
C-terminal 255 1924 1669 0,1214
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-14
Central
15-254
C-terminal
255-1924

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Vibrio phage vB_VcorM_GR7B
[NCBI] 		2711165 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QJT70985.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MT366760 [NCBI]
CDS location
range 166674 -> 172448
strand +
CDS
ATGCCAGTTAACTACACGTCTGGGGAACTAAGATTGTCCGGAACGGTAACTAATGCTGAGTTCTACGCTGCAACATCAACAGCGGGACTAAGCCGTAACACTGAAAACCAATATGAACTAGGTGCTAATATGCGCGTTATGTCGGGTGCCGACGTATCCGGACTTAAGAACTTTATACTTGCTCTTAACACCTACGAGATCTATAGTGAAGACCCCTCAATAGTGTTCAACCAGATAACGTTCATCGAGAGTGAGGGGCGTACCACTGCCGACAGGGTAGTATTCAAAACAGCGGGTTCTGGTAAGAACCCTATACTTAATGACTGCCAATTCCTACACAACATAGTGGGTAACCCAGGGGGCGGAGACCCTAGATACTTGACCATGGCACACATTGGGGGTGCTTCCAACAGTGTTTTCCGCGCATCTGATTTCTCGGAACAAGAAATAGACGGTGTCCAACTAATGGAGAGCGGTGTTTACCGTAACATCTCTGGCATACGTGTTAAACGCTTCATCGCCAGTTTAGACCCAGATGATAATGCTATACGAGTTATACTTAAAGACCTAAAACAAAGTTCAAAGTTATACGGGACAGGTGGTTTGATTTGTGCGTATTCTGGTTCATCCGTAATGGTCGTAAACTGGGATAAAGAAATACTTAACTCAGGTGCAACTAACAACTGGTTGGATAACTACAACGGACACCTAAGCGCCCACTGGGTATACATATTGGGTTCTGCTGCGGATGAATATCAAAATAATGGTGCAGGAATTTCACAAAAGAAAAACACTTTACACGTAGTTAAAGGTGGATATAAATATTACAAATTCATTAACGGCGAAGGTGGTACATTCTGCTACTTCGATAGTCGTGGGTCTTCCCCACAAGCGTGCTCCCCTACAACGACACGTTCAGATATGCTGGAAACCGATACAACCCTATCTATTCCAGCAGACGAAGAAATAGACTTCGTTACACAGACCTTAACGTACAACCGTGATACGGGTTCATGGGTACAAACCAACATAACTGGACATAGATTTCTAGTTCGTAAATACGGTTACTTAGAAATAAGTCAAGACCTAGATAATCCGGAAGCCGTAGAAGGATCACCCGAAGCTTATTCACCTTTCTTAATGGGTTTGGATGACTCTATTGGTGAAGTTGATTCAACGGTAGTAGCAGCGTATACAGGAATAACAATTAACAGCTCTGCTAAGACGATAACTATTACTAGCGGGTCTTGGACACCACAAAAGATATACGACTACTGTAAGTATTGGTTAACCCAGAACATGGATGTGGGGAATTTTGTCACAGCATCAGGGACTAATTATGAGTATACTTACAGATGGGTTTTAAATGGAAGCGCCAATCTACAACACGACCCCGATACCCACAAAGTAACTTTTAAAGATATTGATATCGGAATATCACCTTTACATTTGATTGCGGGATCCTACGTGTACGGGGTGGAAACTGTTTCTGACGGTGTAACTACTTATTCCTCACGTGAGGGTCTAGTAAACGACGTAAGCCTAGGTAGTACCCATGGTTTCAACGCTACTTACCGTGAATCAGGTTGCCCAAAAATTGATGGAGGTACCTTTACATGGAACGGCGGTATTATAACTACACCTACTGCACTATCAGTTGAAGACGGTCAACTCTTACTACGTAAAGGTGAACTAGATGTGTCCTCCTATGATTCCTCAAATTCGATAGGACCTACACTGTGGTTAGAATCCGCTGCTGATACACTGCAATTCGAAAACTTAATAGTAACTTCTAATTCTGCACGTGAGGGTCTAATAGTATTATTTTCTAAGGAACCAAATACATTTGATAATGTAACCATGTTGAATGGTGGTGGTTTAGGTTTTGGGGGTTCAACACTTTTCGAGACGGATGGTACAACGGCTAAGATAATAGAAATAAAAAACTATGAAGCAACTGGTGGTCAGGGTGCTGCGAGATTCTGGCGTCGTAACTACCTAAAACTTATTAACTATAATCTAGGGTCTGATATCGAAATTAGCGGTATGTTAACTGCGGGTAACTCGGAAAACAGGGGTATCATTGATATTTACCGTGAGGTTGACTTTCATGTAACGGATGCAACTGCCACCAATATTGAGGGTGCAAATGTCTATTGTATTGACACAGACGATGGTAATAGACCTGCCAACTATATGGGGCACTCATGGACAGCGGATAAAGAATACCTGCGGTCTACTGATTCCACAGGTCGGACTAGTACTATTGAAGTAAACTTAGCTAACATGGTTAAAACTGGTAATAATAGTGCAACTACAGGTATAGTTAGGTCATATAGGGGACTGGACGGGGACACTTCTGACAAATTCAAGTTCTACTTCTACCACTACAATTATCTGATTGCTAATACAGTTGGTACCCTGGGTGGTAAGGGTATACTTACGCTACAGCAAACTATGCAAGAAGACCCAGCTATAACGGAAACAGACTCCACAATAGTAGCGGCATATACGGGTATCGCCATTGACCACAGTGCTAAAACAATAACTTTGACGTCAGGGACGTGGACATCCAACGTTATTTACGACTACGTTAAATATAATAAATGTTTGAGTGCGAATGTAAGTAAACCTTCTGTACTTGAGAGCGCAATAGAATTCAGTGAGGGTAGATTCATATCCCGCTACAGAATTCTAGTGAAGCACACTGCCCTTTTTGATATTGGATCTGGTCATCCTCTAACGTTCACTTCAGACGTAGCAACTCCTAACTTGTCAGGTGAGGGTTCAATTACCTTTGGCTCCGAAACTACAGTTAACGGTATCACTTCTTATGATTCGGGAACACTTGTTAATTTTGAAAAAAATAACACGTCTTGGTATCAGAATCCTGTTATGGTGTTGGATGGTACACTAGTGTGGAAAGGGGGTGAATTAGAAGTACAATCACCCCTGATAACTAGTCCAGACCTAAGCATGGTAGTTGACAAGGGTACCATAAAAGTTAAAGATCACTCATTGACGTCACCTTACGAAATAAACTTTGGCTCTGATAACATCACACTTACAGACTTCACTATTGATGGTCGTGGTACCTTCATTATAACCAGTGACTTAGTAATCAGTAAGTTTACGGGTAAGAACTACGACGGTATATTCCCTTCCGGTAAATTCCGTGGGTCATCAACTGATTTCTTAGTGGTACGTGACTACGAAGGTATTGGTTCATTTAAAGATCACACACTATGGCGACGAAACAAGATACAGTGGTACAACTCAGTTAATGGTTCTAACATAAAAGTACTGGGTAAAGAAACATCTAGTAGCACACAACATACAGGAATATCTGAATTCTGGTCGGAGATAAAGATCCATGTGACCGACCCCGACAACAACGACCAAGAAAATGTTCGTGTGGCTCTAAAAGATTATGATGATTCAAATAGGACTGATACTTCATCCCTTACGGGTTCCGCATCCTCAGGGCATTATAACACTGGTTTTGATTATACACCGGATAGGACGTATACTGAAGTAACCGACGTCGAGGGGCTAACACCTATTATCCCCGTGTTATTCGCAGTGGTAGACAGGTCAGTGGGTGGTGCACAAGCTACACCTACTTCAGATTGGTCATACCGTTCTAAGAACGGTGATAACTCTGATGAATTCGAAGTCTTTGTATGGCAATATGGTAAGAACGTTGCGACATCTGTAATATCATTAAAAGGAGCGGGGGTAAAAGAAACTAAGTTAGTTACAACAACGGATATTAACGTAACAGAAACCGACAAATCAGTTGTCTCCGCCTACACGGGTATAGGTATTGACCACACAACCAAAACAATAACCATTTCTGCACAACGAACGTTGGCAGAGATATACGATTATTTGCTTTATGACAAGACAACTATATCGGGTGTATACCATCCTACGTTGGGTACTAAAGTAGCAGGTATAGTTGGTGCAACAATTGACATCAAAGACTACAATCTTATAGTTGATGGTGCAGACATAGTTGCGGGTTCAACAGGTTTTAACCTGTTGCAAACAACTGGTTTAATAACACTACAGAATACTGCAACGATTGACTTCAACTTCCTAGATCAAATAGGTAACGCGATAGTAACTATTGATTTACCCGCCAACTGGAACTTAGAAGGTGTATATCCTAGTCAAAATGATGCACTGGCAAAAACCAACAAGTTGCCAAATTCGAACATCAACTATAAGTATCTTACAACATCCGAGGGTGGTAACACTATTTGGATGAGGATAGAGGACTCCGATGGTCAGGGTATAGCAGTTGATTCCTACGAGTTGCCTATAACCCGAGGTGTGTATGAAACCGCCGCCGTTACTTCAACCGAAGATAGTTTATTAAACCAGATTCGTGCGATAGTTCGTGATACTAAAACCATTACGGAAGATATACAATCCGAAACTGGAGGGGGTCTATCACAAAATTACTTCGATGACTTCCAAAAGAGAAGTGGTTACAACTTAGCAACTGTTGAAGAAGCTATTAACGTGGACTTTTCTGGTAACTTGGCTGCCTATGTCAACATGGGTTTCCGTTGTCCAGTAGGTAAGAAAGGTGGTAGCTTAGTACCCCGCCGCGGTACTGCTATATCTAAGGTACGTTTCTATGTGGGACAGGCCTTCCACATAGGTACGAACACTTATATGGGTGGTACTGTTCAATTCAAAATATGGCGAACCAATGGCCCTGGTACACTAGCCGACGGTAACTTCGGGGATGTCGTGTGGCAGTCGCCAGAAACTTATCAGTTAGACGACCTGGAAAACGTCGGCTCTAATTCAGTAGTCGGATCTGGCTACAACCACGTCCACCGTTCTAAAGAATTCATCATGGAATCTTCCGGTATGATTCTAGAAGAAGACTATTACTTTGGTTTTGAAGTCATCACGGGTGAAGCGCTAACACCGATAAACCTGAGTGATTCAGGTCATGACTACGGGGGTTTATACTATGAACACCATAGATTGAGTGGTTGGGAGTCTAATAGCCCTGGTTACATACGGTACGCCGACGGTGGTAGACCTGTACCCGTGGATATAACGGAATACAACTACAACTTGATAACTCAGTATAAGCTTAAGGCAGACATCGACGACATTAAGGACGTAACGGATAAAGTATCATTCAACGCAGACAACGACATTATAGCAACTCTTGATAATGAACTCACAGATATCATGGATGTATCTAAACGCGCACCCTACGTTTATGTGGATGGATGCCCGACAGCAGAAGCCAACGGTGCATACAGATTATTGTCCACGGATGAAGTTGATTGGCTGAACGCTAATGGTAACTTAGATTCTGATATTGCGGCAGGTGACACTGCTGTTTTAGATAGGTCACAACCCGTATATGGATTAGACCGGAATGAATGGGTGTTGGGTGCAATGGAAGGTGAATACGGTTATAGACTATTCCCTGTACAAAACACAACTACCTATTATTCTTCCAATAACGGTTTCTACGACCTAGCACAGGAAGTTTCTGGTGACCCCACCGTTGGTAAATCATGGTATGCCTTAGCAGGGAAATTCGACGCTGACAATTTAGTTGATGGTGCTAAAGTTTCCATAATGGTTGTACTTAATACACCTACTATGTTGGATGACGTTAAAGACAGAACTGACCAACTACAATTCACAGATCAACGGGTTGACGCTAATGTACCAGATCAACTTACTGAATCAGAGTTTGATACAAAACGACTGGCTAAGAAAGGGTGGCGCTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
6d38f7d573ab52526817acc2a567e4590332cb53116a4c9ceab762ead2e6a08a
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5261
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Genome sequencing of Vibrio coralliilyticus phages from Hawaiian seawater Richards,G.P. 2017-10-12 — GenBank