Protein

View in Explore

Genbank accession

XTQ13600.1 [GenBank]

Protein name

tail fiber protein

RBP type

Evidence GenBank

Probability 1,00

Evidence RBPdetect2

Probability 0,95

Protein sequence

MYSIKTDLDVSGNSTVGKDLLVKGNAVFSNDLTVNGEVSFANAVFTAITAGSVNVTGALDVAGKATLSGGADVSGAATFAGNITAADGTTAKFDNLEANSGSFNSVESTDITSTGTATFKDVNISGTLGGTFNLSDINATTLNVSGASALTGSVTLGANITGLASTANFRDIRIGPNEAGQAYRLNFGYTVPGQRPTVLLQNEVQSELMSPAKLNVLQTATFGDSSLSTYGITGNGLNKLDYVTISGNAIQSPTTPLLEVTKGKTKVVDLEVTGIATIPNIESSGTANFNNINVSGTIGGSFDLDDIQATTLSVSGASALTGAVTLGANITGLASTATFKAINLGQNTADANVKLGFAYTAPSARPTVLLANEVQSELMSPAKLNVLQTATFGSAALSTYGITGNGLNKLDYLTITGNATQNPATPQLQVGGKAILNDVEFTGTVTGLTVDVSGQDLTPKSVVAAEAMKGQTLESVGQTTVGSSLQVGGTATVTGALSAASGTFSGDVSGSKGIFSGSVSGTSATFTGDVSGDNATFSGDLSAVAGTFSGDVTVTGQTITVKDLVVTGTSTGVTAIADVDGLDIAPNKVDVTTTLSVAGESTLAGVTATSINSTGAIAGTAISGSTITATGEISGASSVVTGLSKSGSVETGALKASSVETAIISNTAGVSITNNTSIAGNLSVTGTVTPGAIDLSTTDIDAKSLTTTEGANIGGDLVVAGTVDLSAADVAVKSLTSSGAVISSEGTVSSVLPKLSSTEANITTVTATTANATTLNVTGTSTLAGVNASGAITSATNITATGVLKGASVETASISNADGVAINNNTTITGNLDVSGTLTPGAIDLSTTDISSKSLTTTEGATIGGDLVVAGTVDLSAADVSVKSLASAETITSAGVITVSDTVNSSTLPKLITTDATIGAVHAATIETTGSSTLKQVSATEVTATSIVLNSVGEGLRVDNDANINGILSVNNITSTNDTIAIAKSAAITGDLTVSGTVTPGAIDLSTTDISSKSLSTTEGATIGGDLVVNGSIDLSSSNVSAITLASSGNTTVGGNLVLTTGVVTGSPSVSGNLSVAGTAAVTGATTLTDIVNIGKKVTVSTGGIQVVAGGINTDAILVSGDTTLNNTTVNTTLNVTGQSTVAALSAASLNVSGDSTVQKLTVEGELVPQGGIDLTGADISANSLATASTITATGLSTLSGGVSTTNVTASGTVNAGSLDVTNNATVGGTLGVTGALTSGPLSVTGIANITGVTTVGSLVSGAVSGSTGTFSSTLGVTGAATFDNDVTVEGVFTPAGGLDLTTSDITAKSLSVSETIHSDGAASFGGNTTVGGTLGVTGAVTAPSATLSGTGTALAVTNNATIGGTLGVTGQASLGSIVTSGVSATSGSFSTTLGVTGAATFGNDVTVVGTLTPGSLDLTGADISAKTLTLSETLNATGNTTLGGTLGVTGLATIGGTLTSGAVTAPSATLNGSGTGLAVTNNATVGGTLGVVGQTTLGSVKTGATLTVGTPLGEQPETVQIMPDTYIAGKLRVEGGINADIDVGGQTLEPFAVIASDSLSSAGNITAGAAIISSSATIGEVGSQNNNLIVNGNVVNNGNFTVTGVLNAQLNQADSDVAVKSLTATNNVAAGTTLSAGTAITAGTSITATGLLKGNTLEVTTTGSFGGAVTMSSGANITGTVGITAGDLTVGGNISATGTAGFGATTVSTITTSGLATLASTSVTGNATVGGTLAVTGSLTANGNVTLGDAAADVLTVNATSSFKENAVFDKAVTVTGELTTTNANLTTTTVTTKKYDVIPTQVTSSVIAPTGTWTPDGTSNVYFITLDQDTTLAPITGLIGGGKAASVYIYVKQDTTGNRNFTTDGTYAVVDGELNKTAGSVTIYQVIYDGVSPVTDLFIAQRTA

Physico‐chemical properties

protein length:	1906 AA
molecular weight:	184923,88870 Da
isoelectric point:	4,09499
aromaticity:	0,02833
hydropathy:	0,29512

Domains

Domains [InterPro]

DC_0092
STR
1–279

DC_0092 DC_0062 DC_0092 DC_0931

DC_0092
STR
252–594

DC_0092 DC_0062 IPR058970

XTQ13600.1

1 1906

Architecture

STR

RBD

STR 1-1123 | STR 1238-1389 | RBD 1494-1906

Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Domains [InterPro]

Domain ID	Category	Cluster	Start	End	Layer	Name	Pref Zone	Confidence	Evidence	Support
DC_0092	STR	DC_0092	1	279	Novel HMM	DC_0092	Central	Low	Positional only	72 proteins / 72 hits
DC_0092	STR	DC_0092	252	594	Novel HMM	DC_0092	Central	Low	Positional only	72 proteins / 72 hits
DC_0062	STR	DC_0062	512	820	Novel HMM	DC_0062	Central	Low	Positional only	50 proteins / 50 hits
DC_0062	STR	DC_0062	801	1123	Novel HMM	DC_0062	Central	Low	Positional only	50 proteins / 50 hits
DC_0092	STR	DC_0092	1238	1389	Novel HMM	DC_0092	Central	Low	Positional only	72 proteins / 72 hits
DC_0931	RBD	DC_0931	1494	1906	Novel HMM	DC_0931	C-terminal	Low	Positional only	65 proteins / 65 hits
IPR058970	RBD	DC_0552	1815	1894	InterPro cluster	Putative phage tail fibre, C-terminal domain	C-terminal	Low	Positional only	292 proteins / 292 hits

Taxonomy

	Name	Taxonomy ID	Lineage
Phage	Escherichia phage WPEC3 [NCBI]	3421660	Viruses >
Host	Escherichia coli [NCBI]	562	cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession

XTQ13600.1 [NCBI]

Genbank nucleotide accession

PV611058.1 [NCBI]

CDS location

range 230450 -> 236170
strand +

CDS

ATGTACTCGATTAAAACGGATCTTGATGTATCTGGTAATTCCACGGTAGGTAAGGATCTTTTGGTCAAAGGTAATGCAGTATTCAGTAATGACCTAACGGTTAATGGGGAAGTGTCTTTTGCTAACGCAGTATTCACTGCAATTACCGCTGGTTCTGTGAATGTCACAGGTGCATTGGATGTTGCTGGTAAGGCAACCTTATCCGGTGGTGCTGATGTTTCAGGTGCTGCGACATTTGCAGGAAACATTACTGCTGCTGACGGCACAACTGCAAAATTTGATAACTTAGAAGCTAATTCAGGATCATTTAATTCTGTTGAATCAACTGATATTACTTCAACTGGCACAGCAACTTTTAAAGATGTAAACATTTCTGGTACACTTGGTGGTACTTTTAATCTTTCTGATATTAATGCTACAACACTTAATGTGTCTGGTGCTTCAGCACTAACTGGTTCAGTCACATTGGGTGCAAATATCACTGGTCTTGCAAGTACTGCAAACTTCCGTGATATTCGTATCGGGCCTAATGAAGCAGGTCAAGCATATAGACTAAACTTTGGTTACACCGTTCCAGGACAACGACCAACCGTTCTTCTACAGAACGAAGTTCAATCCGAACTAATGTCACCAGCTAAGTTGAATGTTCTACAAACTGCAACATTTGGTGATTCTTCACTTTCAACTTACGGTATTACAGGTAATGGTTTAAACAAATTAGATTATGTAACTATTTCTGGTAACGCAATTCAATCACCAACCACTCCTTTACTTGAAGTAACTAAAGGTAAAACTAAAGTTGTTGATTTAGAAGTAACTGGTATAGCAACTATTCCTAATATCGAAAGTTCTGGTACTGCAAACTTTAACAACATCAACGTATCTGGAACTATTGGTGGTAGTTTTGATTTAGATGATATACAAGCAACAACATTATCAGTATCCGGTGCTTCAGCACTAACTGGTGCAGTTACATTGGGTGCAAACATCACTGGTCTAGCAAGTACTGCAACATTCAAAGCAATCAATTTGGGTCAAAATACCGCTGATGCTAACGTTAAGCTAGGTTTTGCATATACTGCACCTAGTGCACGTCCAACAGTCTTGTTAGCAAACGAAGTTCAATCTGAACTAATGTCTCCTGCTAAGTTGAACGTTCTACAAACTGCAACCTTCGGTTCTGCTGCACTATCTACCTATGGTATTACTGGTAATGGTCTAAACAAATTAGATTATCTAACAATCACTGGTAACGCAACACAAAACCCTGCAACTCCACAACTTCAAGTTGGTGGTAAAGCAATTCTTAATGATGTTGAATTTACAGGTACTGTAACTGGCCTAACTGTTGATGTGAGTGGACAAGATCTAACTCCTAAATCAGTAGTTGCTGCTGAAGCAATGAAAGGTCAAACTCTTGAATCAGTTGGTCAAACAACTGTAGGTTCATCTCTACAAGTTGGTGGTACTGCAACTGTTACTGGTGCATTATCTGCTGCCTCTGGTACTTTCAGTGGTGATGTTAGTGGTTCTAAAGGTATCTTCAGTGGTAGCGTATCCGGTACAAGTGCAACCTTTACTGGGGATGTTAGCGGTGATAACGCAACCTTTAGTGGCGATTTATCTGCTGTAGCTGGTACTTTCAGTGGTGATGTAACCGTAACTGGTCAAACAATCACGGTTAAAGACTTGGTAGTAACTGGAACTTCAACTGGTGTAACTGCAATCGCTGACGTTGACGGTCTTGATATTGCTCCAAACAAAGTTGATGTTACAACAACTCTATCTGTTGCTGGTGAATCAACTCTTGCTGGTGTTACAGCAACTTCAATCAATAGTACTGGTGCAATTGCAGGTACTGCAATTTCTGGCTCTACTATTACAGCAACTGGTGAAATTTCTGGTGCATCATCTGTAGTAACTGGTCTTTCTAAATCTGGTAGCGTTGAAACTGGTGCTCTAAAGGCATCTTCTGTTGAAACTGCAATCATTAGTAACACTGCTGGTGTGTCAATAACAAACAACACTTCAATTGCAGGTAATCTATCTGTGACTGGGACTGTTACCCCTGGTGCAATTGACCTAAGTACTACTGATATTGATGCTAAGTCTCTAACAACTACTGAAGGTGCTAACATTGGTGGTGACCTAGTTGTTGCAGGTACAGTTGATCTAAGTGCTGCTGACGTTGCTGTTAAATCTCTAACCAGTTCTGGTGCAGTTATTAGTTCTGAAGGTACTGTAAGTAGTGTTCTACCTAAACTTTCCAGTACTGAAGCTAATATTACCACAGTAACTGCAACCACTGCAAATGCTACCACACTAAATGTAACTGGTACATCAACTCTAGCTGGTGTTAACGCTTCTGGTGCTATTACTTCTGCAACTAACATTACCGCTACTGGTGTATTAAAAGGTGCATCTGTTGAAACTGCGTCAATCAGCAATGCTGATGGTGTAGCAATTAACAATAACACTACAATCACTGGTAATTTGGACGTATCTGGGACATTGACCCCTGGTGCAATTGACCTAAGCACCACTGATATTAGTTCTAAGTCTCTAACCACAACTGAAGGTGCTACAATTGGTGGCGATCTTGTGGTAGCAGGTACTGTTGACCTAAGTGCTGCTGATGTGTCTGTGAAATCTCTTGCAAGTGCAGAGACAATTACAAGTGCTGGTGTTATTACAGTTTCGGATACAGTGAATTCTAGCACTCTACCAAAACTAATTACTACTGATGCAACTATTGGTGCTGTCCATGCAGCTACTATTGAAACAACTGGTTCAAGCACACTAAAACAAGTATCTGCTACTGAAGTAACAGCTACAAGTATTGTACTAAATTCAGTTGGTGAAGGTTTACGTGTTGACAATGATGCAAACATTAATGGTATATTAAGTGTTAATAATATTACTTCTACCAATGATACTATTGCAATTGCGAAAAGTGCAGCTATTACTGGTGATCTGACCGTATCTGGTACTGTTACTCCTGGTGCAATTGACCTAAGTACTACCGATATTAGTTCTAAATCCCTAAGTACTACTGAAGGTGCTACAATTGGTGGTGACCTAGTTGTTAATGGTTCAATTGATTTAAGTTCTTCCAATGTTTCAGCAATTACCCTTGCTAGTTCTGGTAATACTACCGTTGGTGGTAACCTAGTACTAACAACTGGTGTTGTAACTGGCAGCCCATCTGTATCTGGTAACCTTTCAGTTGCAGGTACTGCGGCAGTAACTGGTGCAACTACCCTAACTGATATCGTAAATATCGGTAAGAAAGTAACTGTAAGCACTGGTGGTATTCAAGTAGTTGCAGGTGGTATTAATACCGACGCTATATTAGTATCCGGTGATACAACTTTAAACAACACTACTGTAAACACTACCTTAAATGTAACTGGTCAAAGTACAGTTGCTGCACTAAGTGCTGCATCTTTGAATGTATCTGGTGATAGTACTGTTCAAAAACTAACAGTTGAAGGTGAATTGGTTCCACAAGGTGGTATCGACCTAACTGGTGCAGATATTTCTGCTAATAGTCTTGCAACTGCTTCAACAATCACTGCAACTGGACTAAGCACACTAAGTGGTGGTGTAAGTACTACTAATGTTACTGCATCTGGTACAGTGAATGCTGGTAGTTTGGATGTTACTAACAACGCAACCGTTGGTGGTACATTAGGTGTAACTGGTGCATTAACTTCTGGTCCATTGAGTGTAACAGGTATTGCGAATATTACTGGTGTAACAACTGTTGGTTCATTGGTTTCCGGTGCTGTATCTGGTAGTACTGGTACATTTAGTTCAACATTAGGTGTAACTGGTGCAGCTACATTTGACAATGACGTAACTGTTGAAGGTGTATTCACCCCAGCAGGTGGTTTAGACCTAACAACTTCTGATATTACAGCTAAGAGTTTGTCAGTATCTGAAACTATTCACTCTGATGGTGCAGCTTCCTTTGGTGGTAACACAACAGTAGGTGGTACATTGGGTGTAACTGGTGCAGTAACTGCTCCATCGGCAACCCTAAGCGGTACTGGTACTGCACTAGCAGTAACTAATAATGCAACTATTGGTGGTACATTGGGTGTAACTGGTCAAGCATCACTTGGTTCTATAGTAACTTCTGGTGTATCTGCAACAAGTGGCTCTTTCAGCACTACTCTTGGCGTTACTGGTGCTGCGACATTTGGAAACGATGTAACTGTAGTTGGAACACTAACTCCTGGTAGCTTAGATCTAACTGGTGCAGATATCTCTGCTAAAACACTAACTCTATCTGAAACATTAAATGCGACAGGTAATACTACCCTTGGTGGAACATTAGGTGTAACTGGTTTAGCAACAATTGGTGGAACACTAACGTCTGGTGCAGTAACTGCTCCATCTGCAACCTTGAATGGTTCAGGAACTGGTCTAGCAGTAACTAACAACGCAACCGTTGGTGGTACATTAGGTGTAGTTGGTCAAACAACACTAGGTTCTGTTAAAACTGGTGCAACTCTAACAGTTGGTACACCATTAGGTGAGCAGCCTGAAACTGTACAGATTATGCCAGACACTTATATTGCTGGTAAACTACGTGTTGAGGGTGGTATTAACGCAGATATCGATGTTGGTGGACAAACACTAGAACCGTTTGCAGTAATAGCATCTGATTCTTTATCTTCTGCTGGTAATATTACTGCTGGTGCAGCAATTATTTCAAGTTCTGCAACAATTGGTGAAGTCGGTTCACAAAACAACAACCTAATCGTTAATGGTAACGTTGTAAACAACGGTAACTTCACTGTTACTGGCGTACTAAATGCACAATTGAACCAAGCAGATTCCGATGTAGCTGTTAAGTCTTTGACTGCAACTAACAACGTTGCGGCTGGAACCACATTAAGTGCAGGTACTGCAATTACTGCTGGTACTTCCATCACTGCAACTGGATTACTTAAAGGTAATACTTTAGAAGTTACTACTACTGGTTCATTTGGTGGTGCAGTAACTATGTCAAGTGGTGCAAACATCACTGGTACAGTGGGTATTACTGCTGGTGACCTAACAGTAGGTGGTAATATCTCTGCAACTGGGACTGCTGGATTCGGTGCAACAACCGTTTCTACAATTACAACATCAGGTTTGGCTACACTTGCAAGTACATCCGTTACTGGTAACGCAACAGTAGGTGGAACACTAGCAGTAACAGGATCACTAACTGCGAATGGTAACGTAACATTAGGTGACGCAGCGGCTGACGTTCTAACCGTTAATGCAACTTCATCATTTAAAGAAAATGCTGTGTTTGATAAGGCAGTAACAGTAACTGGTGAACTAACCACTACTAATGCTAACTTAACTACTACAACAGTAACTACCAAAAAGTATGATGTAATCCCAACTCAAGTTACATCATCAGTAATTGCTCCAACCGGAACATGGACTCCAGATGGTACAAGTAACGTGTACTTCATCACTCTAGACCAAGATACCACGTTGGCTCCAATTACTGGCCTAATTGGTGGTGGTAAAGCTGCATCAGTATACATCTATGTTAAACAAGATACAACTGGTAACAGAAACTTTACAACTGATGGTACTTATGCTGTTGTTGATGGTGAACTAAACAAAACTGCTGGTAGCGTAACCATTTACCAAGTAATTTATGATGGTGTAAGTCCAGTTACTGATTTGTTCATTGCACAACGTACTGCTTAA

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID

cfbb33fd1454d874c3a63d81c63026b391f2692868882f4ba58ecab3fc949daa

ColabFold

Source ColabFold

Method ColabFold

Resolution 0,4724

Oligomeric State monomer

Download PDB

Model Confidence

Very high
pLDDT > 90

High
90 > pLDDT > 70

Low
70 > pLDDT > 50

Very low
pLDDT < 50

Protein

Domains

Domains [InterPro]

Domains [InterPro]

Taxonomy

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

Predicted Aligned Error (PAE)

Model Confidence