Protein

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Genbank accession
XCO41748.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein proximal subunit
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,60
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,67
Protein sequence
MSDLIKQHFRATNGLDAGGNKVINVAKADRNVMDDGVNVEYLIQENTIQPWANDRGYPEGFAVTMEKRIWVARADIAAPIPPAVNTFKQGEWISMRVDPKWEQYSSGTTELLPGTYANIDTRVNPVTLVLPKNKVEQGDTIVIRDIGGKPGINQALIKVQDSAPAMIFQGSILRELQLTRPYSMLLLTFTSAGWYVTLSDLSSLARTIDSTTLDAATDVGAQVQSSEYIVRYYTSNKKLTVRLPRYANHGDMITFAEPEGKTPLYHFTIKTYDANSSIGTEGTTSWTSKIKGGGVLIYDGPRKVWRINSIDMQQRIKVVTDDVVMQPNEAITIFGANNSTVKTISVTLPTQVAPGDTVRIGMNYMRKGQTVNIVTPPAPAGGTKDKIASTVGLLQFPKRSEYPPDAAWTQVDSLSFNGTSDYPPVLEMAYVEATPNNYWIVSENISSIERVDSTNDTTKARVGVIALATTAQAQATSGHNDDRAITPLTLSQRTATETRTGIAEIATQAEANSTTEDTRIITAKKLNDRLATETMRGVAEIATQDETNGSTVDDRIVTPKKLNARKATATLDGIIQLVNTGGTPGTSRADSGTSNGTGVYDHTDFSKAVTPKTLREYKATELASGCVWLATEAEVRNGTPASNNIPTVVTPAALHAKTSTTKDIGLIRIATQDEANAMSNALGNAAITPATLNGRSASYTQTGITRYAIQEEFDGGSLENVAVNPRKIKDYFSRPARMTTRPEAGLAQAGNLWDGWTLNIQVPTETQRGTPKIATQTLVNAGTDDVDYLTSKKLQAKKGTESAYGIVKYATQADTNTGTANDVAVSPVHLKYVIQTSADWRAQDNVRGTVRVANGAVAWTGNSTTGSDGVAKESNGYAVSPNGLKQALANYLPLNAKADNSALLNGLTSDQFIRRDINQTVNGSLTLTKVTTSSANIETSAILKSSKVETTGDIRISNATARLLLTSDTNAWSVQASANSGRIAFISENDTQNVHLSVYNDSRGVTANVKFEAPVINATTQFQLAGTGVIALAGTNSIRLATSGKGLELASSDAGNIIAAEGSTTYKVLTTKNKDSILDSRYVKSAGDTMTGNLTMNGSALVINGSEGWYDHTTTANTEKYARAGSWTVEIKNSAKLATLPGYVVPIREENPLVPGSMIVTGYEEKTGAGGLLAQISVSSDYTYQTWTPYPSNAEQSAKARTHTMWTRVYNPYIKKFDSWMRVYTSATPPTAADIGAPSSVSTSVKTLEVQEWIKIGPVKIYPDRTSQTVKFEWVGD
Physico‐chemical
properties
protein length:1277 AA
molecular weight: 137417,19530 Da
isoelectric point:6,85600
aromaticity:0,06578
hydropathy:-0,34033

Domains

Domains [InterPro]
DC_1986
ATT
6–130
DC_1986 DC_1209
IPR048391
ATT
1123–1224
IPR048391
XCO41748.1
1 1277
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT 6-130 | STR 356-1122 | ATT 1123-1224 | STR 1225-1270 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Klebsiella phage phi1_146055
[NCBI] 		3232234 Viruses >
Host Klebsiella pneumoniae
[NCBI] 		573 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XCO41748.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PP889504 [NCBI]
CDS location
range 55021 -> 58854
strand +
CDS
ATGAGCGACTTAATCAAACAGCATTTTAGAGCAACCAACGGGCTTGATGCTGGTGGAAACAAAGTAATCAACGTCGCTAAAGCCGATCGTAATGTGATGGACGATGGGGTCAACGTTGAGTATCTTATCCAAGAAAACACCATCCAGCCTTGGGCCAATGATCGTGGGTATCCTGAAGGCTTTGCGGTTACCATGGAAAAACGTATCTGGGTAGCACGTGCAGATATCGCGGCTCCTATCCCGCCGGCAGTAAACACCTTTAAACAAGGTGAGTGGATTTCCATGCGTGTTGACCCTAAGTGGGAGCAGTATAGTTCAGGGACCACAGAACTTTTACCAGGGACCTATGCAAACATCGATACTCGTGTTAATCCGGTTACACTGGTTCTTCCTAAAAATAAAGTAGAACAAGGTGATACGATTGTTATCCGGGACATCGGCGGTAAACCAGGTATCAACCAGGCATTAATTAAAGTACAAGACTCTGCTCCAGCAATGATCTTCCAAGGAAGTATCCTTCGTGAACTGCAGCTGACTCGTCCTTATAGTATGCTTCTGCTGACGTTTACATCGGCCGGGTGGTACGTAACTCTTTCAGATCTGAGTTCTTTGGCTCGTACTATTGATTCTACCACACTGGATGCTGCTACTGATGTTGGCGCTCAAGTACAGAGTTCTGAGTACATTGTACGTTATTATACTTCTAATAAAAAATTAACAGTTCGTCTTCCTCGTTATGCTAACCATGGTGATATGATTACCTTTGCTGAACCGGAAGGCAAAACACCATTATACCATTTTACCATTAAGACTTATGATGCAAATAGTTCTATTGGAACTGAAGGGACTACATCATGGACTTCTAAGATTAAAGGTGGCGGTGTTCTGATTTATGATGGCCCACGTAAGGTATGGCGCATCAATTCTATCGACATGCAGCAACGTATCAAAGTCGTTACTGACGATGTAGTGATGCAACCTAACGAAGCTATTACCATATTTGGTGCTAACAACTCGACCGTAAAAACTATTTCTGTTACTTTGCCTACTCAAGTTGCTCCAGGTGATACTGTTAGAATCGGTATGAACTACATGCGCAAGGGGCAAACGGTCAACATTGTTACTCCCCCTGCTCCGGCCGGTGGCACTAAAGATAAGATAGCATCTACGGTTGGCTTACTTCAGTTCCCTAAACGCTCTGAGTATCCGCCTGATGCCGCGTGGACTCAAGTTGATAGTTTATCATTCAATGGAACTTCGGACTACCCTCCAGTCCTAGAGATGGCCTATGTAGAAGCTACTCCTAATAACTATTGGATCGTTTCAGAAAACATCTCTAGTATAGAGCGCGTTGATTCTACCAATGATACGACTAAAGCCCGTGTAGGCGTTATTGCATTAGCAACTACCGCGCAAGCTCAAGCAACAAGCGGTCATAATGATGATAGGGCTATTACACCCTTAACTTTGTCCCAGCGTACTGCTACTGAGACCCGTACTGGTATTGCTGAAATTGCTACTCAGGCTGAAGCTAATTCAACTACTGAAGACACCCGTATTATTACGGCCAAGAAGTTGAACGATCGTTTAGCTACTGAAACCATGCGTGGTGTTGCTGAAATTGCTACCCAAGATGAAACGAATGGCTCTACTGTAGATGATAGGATCGTTACTCCTAAAAAGCTTAATGCGCGTAAAGCTACTGCTACTCTTGATGGCATCATCCAGCTAGTTAATACAGGTGGTACCCCAGGAACAAGTAGAGCAGATTCAGGTACTTCTAACGGTACTGGTGTGTACGACCACACTGATTTTTCTAAAGCAGTAACTCCTAAAACTTTACGCGAATATAAAGCTACGGAACTTGCCTCCGGATGCGTATGGCTTGCTACTGAAGCAGAAGTTCGTAATGGTACTCCGGCGTCTAATAATATTCCAACTGTTGTTACACCAGCAGCATTACATGCTAAAACTTCTACTACAAAAGATATTGGTTTAATCCGTATCGCTACTCAAGATGAAGCTAATGCAATGTCTAATGCTTTGGGTAATGCAGCTATTACTCCGGCAACATTAAACGGACGGTCGGCAAGTTATACTCAAACAGGTATAACCCGTTATGCTATTCAGGAAGAATTTGATGGTGGGTCTTTAGAAAACGTTGCAGTGAACCCTAGAAAAATTAAAGACTATTTTTCTAGACCAGCTCGTATGACAACAAGGCCCGAAGCTGGGTTGGCCCAAGCCGGAAACTTGTGGGACGGATGGACGCTTAATATCCAGGTTCCAACAGAAACTCAACGTGGTACGCCTAAGATTGCAACTCAGACGCTTGTCAATGCAGGAACCGATGATGTTGATTATCTGACGTCTAAAAAGCTTCAAGCTAAAAAAGGTACTGAATCAGCTTACGGTATTGTTAAATATGCCACTCAGGCTGATACCAATACTGGCACTGCTAATGATGTGGCTGTTTCTCCTGTTCACCTGAAGTATGTTATTCAGACTTCTGCTGATTGGCGTGCACAAGATAACGTTCGTGGTACAGTTCGTGTAGCTAATGGAGCCGTTGCTTGGACTGGTAACAGTACTACAGGTTCTGATGGTGTGGCAAAAGAATCTAATGGCTATGCAGTATCACCTAATGGGCTGAAACAGGCCTTAGCTAATTATCTTCCTTTGAATGCTAAAGCTGATAACTCTGCCTTATTGAACGGCCTTACATCAGATCAGTTTATTCGCCGAGATATTAACCAGACTGTCAACGGTTCTTTAACCTTGACTAAAGTTACTACTTCTTCTGCGAATATTGAAACTTCAGCTATCTTGAAGTCTTCTAAAGTAGAAACTACAGGCGATATCAGAATTTCTAATGCTACAGCTAGATTGCTTTTAACTTCTGATACTAATGCTTGGTCCGTTCAAGCGTCAGCTAACTCAGGTCGTATAGCCTTTATTAGCGAAAATGATACCCAAAACGTCCATTTATCTGTTTACAACGATTCTCGCGGCGTAACAGCTAATGTTAAGTTTGAAGCTCCTGTTATTAATGCCACTACTCAATTCCAGTTAGCTGGAACTGGTGTTATTGCTTTAGCCGGTACGAACTCAATCAGGTTAGCTACCTCTGGCAAAGGTCTTGAACTTGCTTCTAGTGATGCTGGTAATATCATAGCGGCTGAAGGTAGTACAACTTATAAAGTTCTCACTACTAAGAACAAAGATTCTATTCTTGATTCACGGTACGTTAAGTCAGCTGGTGATACAATGACTGGCAACTTAACTATGAACGGTTCTGCTCTTGTTATTAATGGGTCTGAAGGCTGGTACGACCACACTACCACGGCAAACACTGAGAAATATGCAAGAGCTGGTTCTTGGACCGTAGAAATTAAAAACTCTGCTAAGCTGGCCACGCTGCCAGGGTATGTTGTTCCGATCAGAGAAGAGAATCCTTTAGTTCCGGGTTCTATGATCGTAACAGGTTACGAAGAAAAAACAGGCGCCGGCGGTCTTTTAGCTCAGATAAGTGTTTCTTCTGATTATACCTATCAGACATGGACTCCTTATCCATCTAATGCTGAACAGTCAGCTAAAGCAAGAACCCATACCATGTGGACCAGGGTATATAACCCGTATATTAAAAAGTTTGATAGCTGGATGCGTGTATACACTAGCGCCACTCCTCCTACAGCTGCAGATATCGGTGCCCCGAGTTCAGTAAGTACTTCTGTTAAAACCTTGGAAGTTCAAGAATGGATTAAGATTGGCCCTGTCAAGATTTATCCTGATCGTACTTCTCAGACCGTTAAGTTTGAATGGGTAGGTGATTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
fa6714440312e0bef1c6805e4493bfba16de815893c978fbe8885c2d79e213e3
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2847
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
The complete genome of Klebsiella pneumoniae phages Fang,Q., Luo,H., Feng,Y. and Zong,Z. 2016-02 — GenBank