Protein

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Genbank accession
QEM41943.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MATKKTKLPKPAGMNAQNRIGVLDLNELDDLFDDVGETTKPGDPVTDFKSGLKEGFLGGLKTKDIVRNFLRSAAPDGFARLFGAYDDVMASVTDIKDTVERVNASDLDYLGRKAQDYLPQLKDRIPNALYENISDTLTRKVEQYQYEVDSQRDQIAIRRRRQENDDANVIKAALDQNTLVSRENFQRSEQGAVARAAVERAERGIRDKVSAGRFDFMSRSMGMAVDSLTRLVGYNEQVNYGIQRKGLELQFRTYMGIRDLVKVQEANLELQNKAYEALVRNTGLPDYKKGNVGDLTSFGSGRGRGNILGRLAGGAAQGLHGFLGGYGNKVNERVASGLGGRLSEIVAGLRMGDMAGSSVWDNRYKFAGQIAGEYGADILKSSIVPWAGRKVRPTMEKLSNRFGGRHHQVGYALDNVPAYLQEFVNNYQNTYGFRGVIRDAIMPFVPQYHLNDRLENGNYQTIDQGAAFNQLTQRSIVEVIPGYLSRQLQELRMIRTGRDDIEREVFDITTGRFEVQSLSDDRLQKKIIPAAAIRSASGAINDTLNLMDEEGKLSPAARKALGERMLRDASTNRRFDPEAYLKAGGYMDGLDATTTDEIQRFFKSKFQYDDKGKMADNADNHRLRDEYSRAFLDIRSVSRDPVKEVHRLINAGQTEPLRMLGIIITEQGQDRINYNRIWEIMRSGVTDTNPWVNGDYQPEASGDMNDKNFFGPAYPGAAKANALNAMHRFRNKHAPQEDRIKKELSRYSRIAQGKFQYLNNKHGAGIQDFANNMRNGQFGPYVAGLQGAWNNAGIMGQDLYSKSRAKFGEHMDQFQNDPTQYAIGQKDKIIDVFTKFNPNEPIIKGIDFVQGNLVDFNTKKIIESVHDITGKVVSTTGMTVLTASEVAQGLFDKKGMRLELPAFMSNAADKIRGALMGGQTPPAQQFAEGENAQQKQAAEDDKHDWYLDGEQEPTISARGLKNGEYFNADGDQINSMQDIKGDVLDKNGSIIATAKELASGLWSRATRKRWRLTKTGRRLANVAGWGAKFMATNTSTLAWSALKFGAKTAIGMGSALFNFTIETQNAYLPGDDVPVLERRLVNAGKYFDDKGRVIENFGDVYGTIFNERGEPVIEPSLYKDLKNYDGTKHILAKNKGIIRKTVWRGIRAARSKYIDASMKYMGWALKKTGKFYGGAAKKVLGGFAKAGGNVLGRIFERVPYEDFETTDQVLLGRILETLQAQVPEKLRAGSWQDKAEKAKEGAAGLMDKLKGKGDGDTGKAENKVLKGLSDGLKGIFSKLTGTEGEEGSGAFDVLMGGGMKGGAKGRLMGLAKRAVPWILGGTAATVGTGAMAYGYSKDGMDAKQTGILTAMSLNPLGQLTARYILKPIFGQMNDQRAEFRRLRMLQYGITDHDQQQKVSALEDAFDRVTERTEEPDFNISGVGGKAILDILGIDVKNEVQVMRMSRWLEMRFRPVFLTWVKALAKLKKNEVKLVDIDSKFPQELKGPLVKAVKISVSGDTPMQYRVDPFSEEGELEDTIPAADQLWKALYVRYKAGEKKDDTVPATAANTEVATKAQDIAKKAADTATGKTAPSPMDPTKSAMPLAAAKKAFPGLGGSTGAPIVATSAATTKLTALQSIRMRAYGLEVLSFYNVYPLLNAEAMVFDGLSIQGGVPEFRGDLESIMQETAPLFGKDIVGNDEDRSTYYDWFVGRFMPVARAYYGAMRNSTQGTTIANMESKLKPSDAVIVGNAVLGVTNWDGSSVWQVDSIFPIKGSKDDLKKMAEADLEQLKKDASKDIMSTPTQSAGDQAAGTQNAAAGGSFAERAMASISNTWESAKETVSNAWSNTKAAGAKAMDYVSDAAANTQYKLGMAGEVSATGRTYGTLTKGNGGAWEQIPYPKANKSRQAAAETFQAVAAMVGIPVELLFIFASLESGFDYTVKAKTSSATGWFQFINSTWDAMLAKHGSKFGIPPDDAQRSLRVDPRINALMGACFLKDNYTYLKDALGRDPTDVDLYIAHFMGPGGARKFLTRNQDTIGASVFPEAASANRPIFYKKGGQPRTLGEIYQMFEEKIAKHRGGAEGSSVATQEAGKTMTPEEATEEQAKANAKASAAELWNTDDSNNAGNAAVAREEAYSATGTAAQTPVLPGITPMNPVGGTTTSGTNPSADSGGNVIQAQQEAALQAAQQQNSTRQAEVRRNNEKAQQIDDIQAEQLKTLIEMRDHLKRLVQLNEQKDSSIKEASKTQAGGNNSMTSTLMRTTAAQNRPSPLSLT
Physico‐chemical
properties
protein length:2256 AA
molecular weight: 247029,86090 Da
isoelectric point:8,94268
aromaticity:0,07934
hydropathy:-0,50687

Domains

Domains [InterPro]
DC_0124
STR
1–918
DC_0124 G3DSA:1.10.530.10 DC_0834
DC_0124
STR
900–2032
DC_0124 Coil
IPR023346
STR
1892–2025
IPR023346
QEM41943.1
1 2256
Architecture
STR
RBD
STR 1-2032 | RBD 2033-2256
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Pseudomonas phage vB_PaeM_PS119XW
[NCBI] 		2601632 Uroviricota > Caudoviricetes > Chimalliviridae > Pawinskivirus PS119XW >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QEM41943.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MN103543.1 [NCBI]
CDS location
range 189105 -> 195875
strand +
CDS
ATGGCTACAAAAAAGACCAAGCTGCCAAAACCTGCTGGGATGAATGCCCAGAACAGAATTGGTGTACTTGACCTTAATGAGCTGGACGACCTGTTTGATGATGTCGGTGAAACCACCAAACCTGGTGATCCAGTAACCGATTTCAAATCTGGTCTGAAAGAGGGCTTCCTCGGTGGATTGAAAACCAAAGACATCGTAAGGAATTTCTTACGAAGCGCAGCGCCTGATGGTTTCGCGCGTCTTTTTGGTGCCTATGATGATGTAATGGCTTCGGTAACCGATATCAAAGATACGGTCGAGAGAGTCAATGCATCCGACCTAGATTACCTTGGTCGTAAAGCACAGGATTATCTACCCCAGTTAAAAGATCGCATTCCAAATGCCTTATACGAAAATATCTCTGATACGCTCACCAGAAAGGTTGAACAATATCAGTACGAAGTGGATTCCCAAAGGGACCAAATCGCTATTCGTCGTCGTCGGCAAGAAAATGATGATGCAAATGTAATTAAAGCTGCTCTCGATCAGAATACGCTGGTAAGCAGAGAAAACTTCCAACGTAGCGAACAGGGTGCAGTTGCCCGTGCTGCTGTTGAAAGAGCAGAACGTGGAATTCGTGATAAAGTAAGTGCAGGGCGCTTTGACTTTATGTCCCGCTCGATGGGGATGGCTGTAGATAGTCTGACACGTCTTGTAGGATATAACGAACAAGTTAATTATGGAATTCAACGTAAAGGTCTTGAACTTCAATTCCGTACCTACATGGGTATTCGGGATCTTGTTAAAGTACAAGAAGCTAACCTTGAATTGCAGAATAAGGCTTATGAAGCATTAGTTCGTAATACCGGGCTACCTGACTATAAGAAAGGTAATGTTGGTGATTTAACCAGCTTCGGTTCAGGGCGCGGGCGCGGTAATATTCTCGGACGCCTAGCTGGCGGAGCTGCACAAGGCCTTCATGGTTTCTTAGGTGGTTACGGTAATAAAGTAAACGAACGTGTTGCCAGTGGCCTGGGCGGACGTCTATCGGAGATCGTCGCTGGGTTACGCATGGGCGACATGGCTGGTTCATCCGTTTGGGATAACCGTTATAAGTTCGCTGGTCAAATCGCCGGTGAATACGGGGCAGATATCCTTAAGTCGTCTATTGTTCCATGGGCAGGTCGTAAAGTTCGTCCAACTATGGAAAAACTATCCAACCGTTTTGGTGGACGACATCATCAGGTTGGTTATGCCCTAGATAACGTTCCAGCATATTTGCAAGAGTTCGTTAATAACTATCAAAACACTTATGGTTTCCGTGGAGTTATCCGCGATGCTATTATGCCATTCGTTCCTCAGTATCACCTGAATGATCGTCTGGAAAACGGAAACTATCAAACAATTGATCAAGGCGCGGCCTTTAACCAATTGACACAGCGTAGTATCGTTGAAGTCATCCCTGGTTACTTGTCTCGTCAGCTTCAAGAATTGCGAATGATTCGTACTGGTCGCGATGATATCGAGCGTGAAGTATTCGATATTACAACTGGTCGATTCGAAGTTCAATCGCTGTCGGACGACCGTCTTCAGAAGAAGATTATTCCAGCAGCTGCGATTCGAAGTGCTAGTGGTGCTATTAACGACACATTGAATTTGATGGACGAAGAAGGTAAACTTTCTCCAGCTGCACGTAAGGCACTTGGGGAACGTATGCTTCGAGATGCATCTACTAACCGTAGATTCGATCCAGAAGCTTACCTTAAAGCTGGCGGTTATATGGATGGCTTAGATGCCACCACCACAGATGAAATTCAAAGGTTCTTCAAGAGTAAGTTCCAGTACGACGATAAAGGTAAAATGGCGGATAACGCTGATAACCATCGTCTACGTGATGAATACTCGCGTGCCTTCCTCGATATTCGTTCTGTAAGTCGTGACCCAGTTAAAGAAGTACATCGTCTAATTAATGCCGGTCAAACCGAGCCTCTTCGGATGCTTGGCATTATCATTACTGAACAAGGTCAAGATAGAATAAACTATAACCGTATTTGGGAAATCATGCGCTCCGGCGTGACTGATACAAACCCATGGGTTAATGGTGACTATCAACCTGAAGCTTCTGGTGATATGAATGATAAGAACTTCTTTGGTCCTGCTTACCCAGGTGCAGCTAAAGCCAATGCGCTTAATGCAATGCACCGCTTCCGGAATAAGCATGCTCCACAGGAAGATCGAATCAAGAAAGAACTATCGCGCTATAGCCGTATTGCTCAAGGTAAATTCCAGTACCTGAACAATAAACACGGTGCCGGTATCCAAGACTTTGCTAACAACATGCGAAATGGCCAATTTGGTCCTTACGTAGCTGGTCTGCAAGGAGCTTGGAATAATGCGGGTATTATGGGTCAAGATCTCTATTCTAAGTCTCGTGCTAAGTTTGGAGAACACATGGATCAGTTCCAGAATGATCCAACCCAATATGCAATCGGTCAGAAAGATAAGATCATCGATGTGTTCACGAAGTTTAATCCAAATGAACCCATTATTAAAGGTATTGATTTTGTTCAAGGTAACCTTGTTGACTTTAATACCAAAAAGATCATCGAATCTGTACACGACATTACCGGTAAGGTTGTTTCTACAACTGGCATGACGGTTCTAACAGCATCTGAAGTTGCCCAAGGTCTGTTTGATAAGAAAGGAATGCGTCTTGAATTACCTGCCTTCATGAGCAATGCAGCGGACAAAATCCGCGGTGCTCTAATGGGTGGACAAACTCCTCCGGCTCAACAGTTTGCTGAAGGTGAAAACGCACAGCAAAAACAAGCAGCTGAAGATGATAAGCATGACTGGTATTTGGATGGTGAGCAAGAACCTACTATCTCTGCTCGTGGTCTAAAGAACGGCGAATACTTCAACGCAGATGGTGACCAGATTAATTCGATGCAAGACATCAAAGGTGATGTACTTGATAAGAATGGATCTATCATTGCAACTGCTAAGGAACTAGCTTCTGGTCTATGGTCGCGTGCTACTCGTAAACGTTGGCGTCTTACTAAGACAGGTCGGCGTCTAGCAAATGTAGCGGGCTGGGGTGCCAAGTTCATGGCAACGAATACATCTACCTTAGCGTGGTCCGCACTGAAGTTTGGTGCTAAGACTGCGATCGGTATGGGTTCGGCCCTATTCAATTTCACGATTGAAACTCAGAATGCTTATTTACCTGGTGACGATGTACCTGTACTCGAACGAAGACTGGTTAACGCTGGTAAGTACTTCGACGATAAAGGTCGCGTAATTGAAAACTTTGGTGATGTGTATGGCACGATCTTTAACGAGAGAGGCGAACCTGTAATAGAACCATCTCTGTATAAAGACCTTAAGAACTACGACGGTACCAAACATATCTTAGCTAAGAATAAAGGTATCATCCGTAAGACTGTATGGCGTGGTATTCGCGCTGCTCGTTCGAAGTATATCGATGCTTCCATGAAGTACATGGGTTGGGCATTGAAGAAGACGGGTAAGTTCTATGGAGGTGCAGCTAAGAAAGTGTTAGGTGGTTTCGCTAAAGCGGGTGGTAACGTTCTTGGACGTATCTTTGAACGCGTACCATACGAAGACTTCGAAACAACTGATCAAGTACTATTGGGTCGCATTCTTGAAACTCTTCAAGCACAAGTTCCAGAAAAGCTCCGGGCTGGTAGTTGGCAGGATAAAGCAGAAAAGGCCAAAGAAGGCGCTGCTGGCTTGATGGATAAATTGAAGGGTAAGGGAGATGGCGATACCGGTAAAGCTGAAAATAAAGTCCTGAAGGGATTGTCAGATGGACTTAAAGGTATCTTCAGTAAACTTACCGGTACAGAAGGTGAAGAAGGCTCTGGTGCGTTCGACGTGCTGATGGGCGGTGGTATGAAAGGTGGCGCTAAAGGTCGTTTAATGGGCCTTGCTAAACGCGCAGTTCCTTGGATACTTGGTGGTACAGCTGCCACAGTGGGTACAGGTGCTATGGCTTATGGTTATAGCAAAGATGGAATGGATGCAAAGCAGACAGGTATTCTGACTGCAATGAGTCTTAATCCACTTGGACAATTAACTGCTCGCTATATCCTGAAACCTATCTTTGGTCAGATGAACGATCAAAGAGCAGAGTTCCGCCGACTCAGAATGCTACAGTACGGTATTACCGATCACGATCAACAACAGAAAGTTTCTGCACTTGAAGATGCTTTTGATCGCGTAACCGAACGGACAGAAGAACCCGACTTTAATATCAGTGGAGTTGGTGGTAAGGCTATTCTTGATATTCTTGGCATCGATGTTAAGAATGAAGTTCAAGTAATGCGTATGTCCCGCTGGTTGGAAATGCGTTTCCGTCCGGTCTTCTTGACTTGGGTTAAAGCACTAGCTAAACTCAAAAAGAATGAAGTCAAACTCGTTGACATTGATAGTAAGTTCCCTCAAGAATTGAAAGGACCATTAGTTAAAGCTGTTAAGATTTCTGTATCGGGTGATACACCAATGCAGTATCGTGTTGACCCATTCTCCGAAGAAGGCGAATTGGAAGACACTATCCCAGCAGCTGATCAACTTTGGAAAGCTCTATACGTTCGTTATAAAGCGGGCGAGAAGAAAGATGATACGGTACCTGCTACAGCGGCTAATACCGAAGTAGCTACCAAAGCTCAGGATATCGCCAAGAAAGCGGCAGATACAGCAACTGGTAAAACCGCACCGAGTCCAATGGATCCTACTAAGTCAGCAATGCCCTTGGCTGCTGCTAAGAAGGCTTTCCCTGGTCTGGGTGGTTCAACAGGTGCTCCAATCGTTGCGACTTCGGCAGCTACTACTAAGCTAACTGCACTCCAATCCATCCGGATGCGTGCCTACGGTTTGGAAGTACTGAGTTTCTACAACGTCTATCCTCTTCTCAATGCTGAAGCAATGGTATTCGATGGTCTATCTATTCAGGGCGGTGTTCCTGAATTCCGTGGTGACCTAGAATCGATCATGCAGGA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Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
9ef9f601c142fa6515a137639948799a8c0cf09f1145c4cdc8bbf34ba6e52aee
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5015
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
A distant relative of Phikzvirus genus phages from a therapeutic phage collection Hejnowicz,M.S., Dabrowski,K., Gawor,J., Weber-Dabrowska,B., Gromadka,R. and Lobocka,M.B. 2011-03 — GenBank