Protein

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Genbank accession
QEM42473.1 [GenBank]
Protein name
L-shaped tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,78
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,97
Protein sequence
MADQNLKQIQFKRTSTENKAPGADIVARGEIALNTHGRTLAIYTKDENDKVVQLAGKGVPFLDTSGTLSVGGTTTLKDNVTISPNKAISFETTDLSGEITRHIVGKCATNDGWYIGSGGTSNSGILEIGTIDDGNETIQFVQRGAGNIEARKLVLLDGSGNTTLPGDLRLTTNKAVKISNGSDLVLEMGVGANDVYIKNQRGIGVLQLTNDSNLTFRSSQVYYAMDGRGPGKSGTLLTNVENERQLKQDNFPITTGSETRWTKVALLKDPGSSQSRLQLMVTNGGNYGSTYSSIDFIDCSARNFPSSLTSSNIRNHLQVRRLGNPALDDTNQLRYSLILTSEGLELWFMQRAFIGGVKVALLSIAGGTEYYLPNGYTSSSTAPEGLVESTAIRIYDEFNKPNIDGGTEGILPISRGGTGGTSSAAARNNLGLGTAAIRDVGESTGNLLENGAYGLGGNGGKSINDIISNADMLNRLKAYGGTFWRGVTKSGVSVQNGLYSHGSGIFMNAGDTMSAINIDYASAKVRVYAANNSGLAAGNVNYNELYGTANKPSKADVGLGNLTNDTQVKKAGDTMTGDLTVPNLHASGTGTASVYVNAGTGNAHVWFRTDGNERGVIWATPNTTDLGQINIRAKTTAGVSAGDFSFRSDGRLDVPVAVKIGGAAMLTKDGNITSGSMFGGNLNNYLTSIKNDITAGDSKQVSKTGDTMTGNLTINANLKVENPNGTMVDLGSENSDKYSRLTLARKIGDGSAVAMLKITPEGHVQFGYQTAVATPAPSKYILVKPDGLAVEGDLVFNQTYRGAEDAVDISDKTIDLNSLIIRFSDLGTRQLYKCRSSGGGSNISNKPTSDGNFVLEVLSLRKVSDTDWSCKQTFTTKNDAVEGVYVRYGQNGGWSAWKEVVAGVQPINLGGTGATSVASARNNLGVGEGQTVTFGGLKVNGIGTNDPYLTFKNGAAVREAQGGSTGALLISASSTAAAGAKYIAFRPFGDSSNSEIRVKANGSDPLLEWSYGPGIRSNDSGAFVVYAKTGQALHLRPNGDSASQATVIDQNGKMVVGGEFEAQNSKITGNLNVSEDNRMIVLGKNSDIGLVKKNGMPGKMAISKSNSFTVMASTNTNNQINPADTFNDIFKVDADGNQTVYGNAQINRQLTVSSAATVTGTINANGGIIVPTTKYVQIADAPTQNNQATNKKYVDDKVASAISNAGDTYLPLAGGTVTGRLIITGDQLKTTSLWVTGASALNGNLEVGGNVVSNTGIGSFVGAVDVKAPAVDNGTTHLWFRHSNGGERGVIYMPGNNNTMMGLRAASSEWQFHGATGQITGPGARWTLHSDGNLQSSLFTSYGVGGEGYINNWVPGVANKVSNDNIWAWRISQGAFDVGMYIMAATHNDWTGSQEFTPGQTIAGSNLFWTTSDGGDWDYGAKRLSGTWMACGFSANRNNVHRTTIWKRIA
Physico‐chemical
properties
protein length:1450 AA
molecular weight: 152706,97470 Da
isoelectric point:7,22102
aromaticity:0,07034
hydropathy:-0,30241

Domains

Domains [InterPro]
DC_1942
ATT
4–605
DC_1942 cd19958 DC_0749
DC_1159
STR
443–1124
DC_1159
QEM42473.1
1 1450
Architecture
ATT
STR
RBD
ATT 4-605 | STR 606-1124 | RBD 1167-1413 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
QEM42473.1
1 1450
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 344 344 0,0849
Central domain 345 543 200 0,2230
C-terminal 544 1450 906 0,6974
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-344
Central
345-543
C-terminal
544-1450

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Klebsiella phage EI
[NCBI] 		2601625 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Klebsiella pneumoniae
[NCBI] 		573 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QEM42473.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MN106245.1 [NCBI]
CDS location
range 156006 -> 160358
strand +
CDS
ATGGCCGATCAAAACTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAACTAGCACAGAGAATAAAGCACCAGGTGCAGATATCGTAGCCCGTGGCGAAATCGCATTGAATACCCATGGTCGTACTCTTGCCATTTATACTAAAGATGAAAATGATAAAGTAGTACAGTTAGCTGGTAAAGGTGTTCCATTTTTAGATACCTCCGGTACCCTTAGTGTTGGTGGAACCACCACATTAAAAGATAACGTTACTATTTCTCCAAATAAAGCAATTAGTTTTGAAACCACTGATTTAAGCGGTGAAATAACACGCCATATTGTCGGTAAATGCGCTACTAATGATGGGTGGTATATTGGATCCGGTGGTACAAGCAATAGCGGTATTCTTGAGATCGGTACTATTGACGACGGGAATGAAACCATCCAATTCGTACAGCGTGGGGCCGGAAATATAGAAGCCAGAAAATTAGTTTTACTTGATGGCTCTGGTAATACTACTCTTCCAGGCGATTTAAGATTAACTACTAATAAAGCCGTTAAAATTAGTAATGGAAGTGACCTTGTTCTTGAAATGGGTGTAGGCGCTAATGACGTTTATATTAAAAACCAGCGAGGCATAGGGGTTCTTCAACTAACTAATGATAGTAATCTGACGTTTAGAAGTTCCCAGGTTTATTACGCCATGGATGGAAGAGGTCCTGGTAAATCCGGTACTCTTCTGACAAACGTAGAAAATGAGCGCCAGCTTAAACAGGATAATTTCCCTATAACTACCGGTTCCGAAACTAGATGGACTAAAGTTGCTCTTTTAAAAGACCCTGGATCAAGCCAGAGCCGCCTGCAATTAATGGTGACTAATGGCGGTAATTATGGCAGTACTTACAGCTCTATCGACTTTATCGATTGTAGCGCTAGAAACTTTCCATCTTCGTTAACAAGCAGTAACATTCGTAACCACCTACAGGTCCGTCGTCTCGGTAATCCAGCGCTTGATGACACAAACCAATTGCGTTATAGTTTAATTCTTACCTCTGAAGGTTTAGAACTGTGGTTTATGCAACGAGCATTCATCGGTGGTGTTAAAGTTGCACTGTTATCTATTGCTGGTGGTACTGAATATTATCTACCTAACGGTTACACGTCTTCTTCAACTGCACCAGAAGGTTTAGTTGAGAGTACAGCTATTCGTATCTATGATGAATTTAACAAGCCTAACATTGACGGTGGTACTGAGGGTATTCTGCCTATTAGCAGAGGCGGTACCGGCGGCACTTCTTCTGCTGCTGCTCGTAATAACTTAGGTCTAGGTACTGCTGCTATTCGCGACGTCGGCGAATCCACCGGCAACCTTTTAGAAAACGGTGCTTACGGTTTAGGTGGTAATGGTGGTAAATCCATCAACGACATTATCTCTAATGCGGATATGCTGAATCGTTTAAAAGCATATGGCGGTACTTTCTGGCGTGGTGTTACTAAATCTGGTGTTAGCGTTCAAAATGGCCTTTATAGCCACGGCTCCGGTATTTTTATGAATGCTGGTGATACCATGTCAGCTATTAATATCGACTATGCTAGTGCTAAAGTTCGTGTATATGCAGCTAACAACAGTGGTCTTGCTGCAGGAAATGTTAACTATAACGAACTTTACGGTACAGCAAATAAACCGTCTAAGGCCGACGTAGGGCTTGGTAATCTGACAAACGACACCCAGGTTAAAAAAGCCGGCGACACCATGACCGGTGATTTGACGGTTCCTAATTTACATGCTTCCGGTACCGGCACCGCATCGGTATATGTTAATGCCGGGACTGGGAATGCACATGTATGGTTTAGAACCGATGGTAATGAACGCGGTGTAATCTGGGCAACACCTAATACTACGGATTTAGGTCAGATTAATATTCGTGCAAAAACCACAGCTGGTGTTTCTGCTGGTGATTTTAGCTTCCGTTCTGATGGCCGCCTTGATGTCCCTGTAGCGGTTAAAATTGGCGGTGCCGCAATGTTAACTAAAGACGGGAACATCACCTCCGGCTCTATGTTTGGTGGTAACCTTAACAACTACTTGACTTCTATTAAAAATGATATCACCGCTGGTGATAGTAAGCAAGTAAGTAAAACCGGTGACACAATGACCGGCAACTTGACTATTAATGCTAACTTAAAAGTCGAAAACCCTAATGGAACAATGGTTGATTTAGGTTCAGAGAACTCAGACAAGTACAGCAGACTGACCCTCGCGCGAAAAATTGGTGACGGCTCAGCTGTGGCAATGCTTAAAATTACTCCTGAAGGACACGTACAATTTGGGTATCAAACTGCAGTTGCTACTCCAGCTCCTAGCAAGTACATCCTAGTTAAACCCGACGGTCTTGCTGTAGAAGGCGATTTGGTTTTTAATCAGACATATCGTGGCGCTGAAGATGCAGTTGATATTTCTGATAAGACTATCGACCTTAATAGTCTGATTATTAGGTTCAGTGATTTAGGTACTCGCCAATTGTATAAATGTAGGTCGTCTGGTGGCGGAAGTAATATATCAAACAAACCTACCTCTGATGGCAACTTTGTTCTTGAAGTTCTGTCTTTGCGTAAGGTTTCTGATACCGATTGGTCGTGTAAGCAGACCTTTACCACAAAGAACGATGCCGTTGAAGGTGTATATGTTCGCTACGGACAAAACGGCGGATGGTCTGCCTGGAAAGAGGTTGTCGCAGGTGTTCAACCGATTAATCTTGGCGGTACTGGAGCAACTTCTGTAGCTTCTGCTCGTAATAACCTTGGCGTTGGCGAAGGTCAAACGGTGACGTTCGGCGGATTGAAAGTTAACGGTATTGGAACAAATGACCCCTATCTAACATTTAAAAATGGGGCCGCAGTTCGCGAAGCCCAAGGTGGTAGTACCGGTGCATTACTCATATCAGCTTCTTCTACAGCCGCGGCAGGAGCTAAATATATTGCTTTTAGGCCATTCGGTGATTCGTCCAATTCTGAGATTAGAGTTAAAGCTAATGGTTCTGATCCTCTGCTTGAATGGTCTTATGGCCCAGGCATTCGTTCAAACGACTCTGGTGCTTTTGTTGTCTATGCAAAAACAGGTCAGGCACTCCATTTAAGACCGAACGGCGACAGTGCGAGCCAAGCTACTGTTATCGATCAGAATGGTAAAATGGTTGTCGGTGGTGAGTTCGAGGCGCAGAACTCGAAAATCACAGGCAACCTGAACGTCTCTGAAGATAACAGAATGATCGTTCTTGGTAAAAACTCTGATATAGGTTTAGTCAAGAAAAACGGTATGCCAGGAAAAATGGCTATCAGTAAATCTAATTCGTTTACTGTTATGGCATCAACCAATACCAATAACCAAATTAATCCTGCTGACACGTTTAACGACATATTCAAGGTAGATGCTGACGGAAACCAAACTGTTTATGGAAATGCCCAAATCAATAGACAGTTAACTGTTTCTAGTGCAGCCACTGTTACGGGTACTATTAATGCCAACGGCGGTATTATTGTTCCTACTACCAAGTATGTTCAAATTGCCGATGCTCCTACGCAGAATAACCAAGCCACTAACAAGAAATATGTTGATGATAAGGTTGCTTCTGCTATTAGTAATGCTGGCGACACGTATCTTCCATTAGCGGGTGGTACTGTAACTGGTAGATTAATAATTACAGGTGATCAGTTAAAAACTACATCGCTCTGGGTTACCGGAGCTTCGGCCCTTAACGGTAATTTAGAAGTAGGCGGTAATGTTGTTAGTAATACTGGTATTGGTAGTTTTGTTGGTGCTGTAGATGTTAAGGCCCCTGCCGTAGATAATGGTACAACGCACCTTTGGTTCCGACATTCTAATGGTGGCGAGCGTGGTGTGATTTACATGCCAGGTAACAATAATACCATGATGGGATTAAGAGCCGCTTCTAGTGAATGGCAATTCCACGGTGCTACAGGACAAATTACTGGCCCTGGAGCGCGTTGGACGTTGCATTCTGACGGTAACTTACAATCTAGCCTATTCACTTCATATGGTGTAGGTGGCGAAGGTTATATTAATAACTGGGTTCCTGGCGTAGCTAATAAGGTATCTAATGATAATATTTGGGCCTGGCGTATTAGTCAAGGCGCATTTGATGTCGGTATGTATATTATGGCAGCTACCCACAATGACTGGACTGGATCTCAGGAATTTACACCAGGGCAAACTATAGCAGGAAGTAATCTTTTTTGGACAACCTCTGATGGTGGAGATTGGGATTATGGCGCTAAACGCCTTTCTGGTACTTGGATGGCATGTGGATTCTCTGCTAACCGTAATAATGTCCACCGCACAACTATTTGGAAAAGAATTGCATGA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
80fbd6be2f5e40650519511dbd1f2066a1a56042aeb64fb48035c6e35d19b6f9
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,4901
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete Genome Sequence of Klebsiella pneumoniae Myophage EI Michalik,J., Lessor,L., Liu,M. and Gill,J. 2019-09-26 — GenBank