Protein

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Genbank accession
WMM94969.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,75
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MANSFVRYTGNGTTTTYAIPFSYRSEDDLSATVAGVNITAYTLDAAGTNLTFTTAPANGAAIEIRRTTSQSTKLVDYVSGAVLTENDLDTDSDQAFFMSQEAIDNANDVISLDNADFQWDTQNKRLKNVANPTDNQDAVTKYYLENTWLSPANKTALTTVNDNISNINAVNSNASNINSAVSNATNINTVATNITSVNTVADDITKVIAVANDLAEAVSEVETVADDLNEATSEIDTVATNITNVNNVGNNISNVNTVAGISSNVTTVAGNNANVSTVAGISSNVTTVAGISSDVTSVANDATDIGTVATDISNVNTVAGISGNVTTVAGISSNVTSVANNSSNINSVAGNATNINTVAGNNSNISTVAGVSSNVTTVAGISSDVTAVAGDATDIGTVATDLAGSDNIGTVAGSISNVNAVGGSITNVNTVASNISGVNSFGERYRVSSSAPSTSLDIGDLYFDTTANELKVYKSSGWANAGSTVNGTSERFNYTATGGQTTFTGSDNNGNTLGYDAGFIDVYLNGSKLLNGTDVTVTSGTSVVLASGATAGDVIDIVTYGTFSVATLNADNLSSGTVPDARITGTYTGITGLDLTDNSKIRLGTGNDLEIFHNGTNSIIENKTGDLILRTPDAESIFLRDAGGNNLAQFNDNSGVNLYHNASVKLATTSTGVDVTGDLTVDTNTLYVDSTNNRVGIGTTSPGYNLVVKNNSGTSTIRVESSDNYRIDIQATSGTGTIRTTGSYPLVLNTNQTERMRIDSSGNVGIGTSSPSNPLEIAGSGTPININSTNDEVKKIQFENSGTAVGYIGSSSGTPFRLLNGSGTEHMRIDSSGRVGIGVTNLNRNLAIGTLGTKTDTGTKYVMNIGQTSESSSHAGLGVYFVGHASASNRKWKFQPVENGVANDGIIEFNPDGGRFRANNGIQLGGNTDANKLDDYEEGTWTPTINSVSGFTNTNVDFDYNTYTKIGNLVNIRTHIQFPNSSGNVSVGDFAYIRGLPFAPSVQDNTMMNAYRYNNSNNASAFVTTATTTNEVRWVVSFVNGSPLRNGGRVSVNFFYRTDA
Physico‐chemical
properties
protein length:1060 AA
molecular weight: 110040,96950 Da
isoelectric point:4,36236
aromaticity:0,06226
hydropathy:-0,21387

Domains

Domains [InterPro]
DC_1263
ATT
1–325
DC_1263 DC_0467
IPR005604
ATT
3–120
IPR005604 Coil DC_0467
WMM94969.1
1 1060
Architecture
ATT
STR
ATT 1-325 | STR 341-1060
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
WMM94969.1
1 1060
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 180 180 0,9607
Central domain 181 447 268 0,6055
C-terminal 448 1060 612 0,7368
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-180
Central
181-447
C-terminal
448-1060

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Pelagibacter phage HTVC168P
[NCBI] 		3072838 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Candidatus Pelagibacter sp. HTCC7211
[NCBI] 		439493 Pseudomonadota > Alphaproteobacteria > Candidatus Pelagibacterales > Candidatus Pelagibacteraceae > Candidatus Pelagibacter >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WMM94969.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OR420735.1 [NCBI]
CDS location
range 29067 -> 32249
strand +
CDS
ATGGCAAATTCATTCGTAAGATACACCGGAAACGGTACAACTACTACATACGCTATTCCTTTTAGTTACCGTAGTGAAGACGATTTATCAGCTACAGTAGCAGGTGTTAATATTACAGCGTATACTTTAGATGCCGCAGGTACTAATCTTACATTTACAACTGCGCCGGCTAATGGTGCGGCTATCGAAATAAGAAGAACAACAAGTCAATCAACAAAATTAGTTGATTATGTTTCAGGTGCGGTTTTAACTGAAAACGATTTAGATACTGATAGTGACCAAGCGTTCTTTATGTCCCAAGAGGCTATTGATAATGCTAATGATGTAATTTCTTTAGATAATGCAGATTTTCAGTGGGACACACAAAATAAAAGATTAAAAAATGTTGCTAACCCAACAGATAATCAAGATGCAGTTACAAAATATTATCTAGAAAACACTTGGTTATCTCCTGCAAACAAAACAGCTTTAACTACAGTTAATGATAATATTTCTAATATTAATGCTGTAAACAGTAACGCTTCAAATATTAACTCAGCAGTTTCTAACGCTACAAACATCAACACAGTAGCTACTAACATAACTTCAGTTAATACAGTAGCAGATGATATTACAAAGGTTATCGCTGTAGCTAATGATTTAGCAGAAGCAGTTTCAGAAGTAGAAACTGTAGCTGATGATTTAAATGAAGCTACAAGTGAGATTGATACTGTTGCTACAAATATTACAAATGTAAATAATGTTGGAAACAATATATCTAATGTAAACACAGTAGCAGGTATATCTAGCAATGTAACTACAGTTGCAGGAAACAACGCTAATGTTTCTACAGTAGCAGGTATTTCTAGTAATGTTACAACAGTAGCAGGAATTTCTTCAGATGTAACTTCAGTTGCTAATGATGCAACAGATATTGGAACAGTAGCCACAGATATATCAAACGTAAATACAGTTGCAGGTATCTCTGGTAATGTGACTACAGTTGCAGGGATTTCTTCAAATGTAACTTCAGTAGCTAACAACTCATCAAACATAAATTCAGTAGCAGGTAATGCTACAAACATTAATACTGTTGCAGGAAATAATTCTAACATCAGTACAGTTGCAGGAGTATCTTCTAATGTAACGACAGTTGCAGGAATATCTTCAGACGTAACAGCAGTAGCAGGTGATGCTACAGACATTGGAACTGTAGCTACAGATTTAGCAGGTTCAGATAATATTGGAACTGTTGCAGGTTCAATTTCTAATGTTAATGCAGTTGGTGGTTCGATTACCAATGTAAACACAGTTGCATCTAATATATCTGGCGTAAACAGTTTCGGAGAAAGATACAGAGTTTCATCTTCAGCACCAAGCACAAGTCTTGATATAGGTGATTTATATTTCGACACAACTGCCAACGAATTAAAAGTTTACAAATCAAGTGGTTGGGCTAATGCAGGAAGTACAGTTAATGGAACTTCAGAAAGATTTAATTACACAGCTACAGGTGGACAAACTACATTTACAGGTTCAGACAATAATGGAAATACTTTAGGGTATGACGCAGGATTTATTGATGTTTATCTAAACGGTTCTAAATTATTAAACGGAACAGATGTTACAGTTACATCAGGTACATCAGTAGTATTAGCTAGTGGTGCAACAGCAGGTGACGTTATTGACATTGTAACTTATGGAACATTCTCAGTAGCAACACTAAACGCAGACAACTTGTCTAGTGGTACAGTACCAGATGCTAGAATTACTGGAACATACACAGGAATTACTGGATTAGATTTAACTGATAACAGCAAGATAAGATTAGGAACTGGAAATGATTTAGAAATTTTCCATAATGGAACTAACTCAATTATTGAAAATAAAACAGGAGATTTAATTTTAAGAACACCAGATGCAGAAAGTATATTTTTAAGAGATGCAGGTGGTAATAATCTTGCACAATTTAATGATAATAGTGGTGTAAATCTTTATCACAATGCAAGTGTAAAATTAGCAACAACATCTACTGGTGTTGATGTTACAGGAGACTTAACAGTTGATACGAATACTTTATATGTAGATAGCACAAATAATAGAGTTGGGATTGGTACAACTTCTCCAGGATATAATTTAGTAGTAAAAAATAATAGTGGTACTTCAACTATAAGAGTTGAGAGTAGTGATAATTACAGAATAGATATTCAAGCAACTAGTGGCACAGGAACTATTAGAACAACTGGCTCATATCCTTTAGTATTAAATACTAACCAAACAGAACGTATGCGTATTGATAGCTCTGGTAATGTAGGTATTGGTACAAGTTCTCCATCAAATCCATTAGAAATTGCAGGTAGTGGAACACCAATTAACATTAATAGTACAAATGATGAAGTTAAGAAAATTCAATTTGAAAACAGTGGAACTGCTGTTGGATATATAGGCAGTAGTTCTGGAACTCCATTTAGACTTTTAAATGGAAGTGGTACTGAACATATGCGTATAGATAGCTCTGGTAGAGTAGGTATTGGAGTTACAAATCTAAATCGTAATTTAGCTATTGGAACTCTTGGAACAAAAACTGATACAGGCACTAAGTATGTAATGAACATTGGACAAACTAGCGAAAGTAGTAGTCATGCAGGATTAGGTGTTTATTTTGTTGGTCATGCTTCAGCAAGTAATAGAAAATGGAAATTTCAACCAGTTGAAAATGGTGTAGCTAATGATGGTATAATTGAATTTAATCCTGATGGTGGAAGATTTAGAGCTAATAATGGTATTCAATTAGGTGGAAATACAGACGCAAACAAATTAGACGATTACGAAGAAGGAACTTGGACACCTACTATTAATTCTGTATCTGGATTTACTAATACAAATGTAGATTTTGATTACAACACTTATACAAAAATAGGTAATTTAGTTAATATTAGAACACACATTCAATTTCCAAATTCAAGTGGAAATGTATCAGTGGGTGATTTTGCTTACATAAGAGGATTACCTTTTGCTCCATCAGTTCAAGACAATACAATGATGAATGCATACAGATATAACAATTCTAATAATGCTTCAGCATTTGTAACAACAGCAACTACTACAAATGAAGTTAGGTGGGTTGTAAGTTTTGTTAATGGTTCACCATTAAGAAATGGTGGCAGAGTTTCAGTAAACTTTTTTTATAGAACAGATGCTTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
c08a847af381d111634203d6d8de9f18ae3796c2d1ee31988f76915b4e76a093
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6483
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50