Protein
View in Explore- Genbank accession
- AGH07654.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TFTF
- Protein sequence
-
MPLSRLENFLKNAEGNILYVNPSDFDATDSIENRGNSQTRPFKTIQRALIEAARFSYQTGKNNDKIDRTTILAYPGTHYIDNRPGFTVVNNGGNAEFKQRKNAGYEVTSLEQFTTESNFDVLDPNNELYKYNSTEGGAIMPRGTSIIGLDLRKTKLRPLYVPDPQNDDMEYGGVLRVTGTCYFTAFTIFDADITKTAYYDYDSNRKTPSYSHHKLATFTYADGINNVLIDGTDSGLTDLDMYYFKVAKAYGDSSGRPVGDYPTFDDFEPNVDEFRIVGDLQSDPVGVTSIRAGDGNTPTATLTINTNKPHGLFKDTPVLIAGITTAINSYNGSFLVDEVTSNTQFTVQTPNVPANALPTPQEIQNSSVIVESDTVGSASPYIFNVSLRSVFGMNGLDCDGDKATGFKSMVCAQFTGISIQKDDNAFILYNPTTAIFNDTTTVAESDKPLHSNSRAIYKPFYETSHMRTRNNSVIQLVSVFAIAYARHFHAERGGDASITNSNSNFGQTALEATGFRPTSFDRDDVGYITHVIPPREIVREDSTVSWLTIDTRKTIGVGVTERMYLFGYNNEEIIPPAEIDSFKVGARNDDKLFLSLVNTLSGQAVQETYESPIFMQVPSGIGTSGFKEYEVIRNSGVNAIISNVFQFKTTHQLVNGEKVRVFSNTGETPSGIINDKIYFAISGGTLAADRIQLASTFNDAIARRPITGISNGGGKLVIRSTVSDKNPGDPGHPMQFDETTYTINNVPNTVGGWYLTGASNLSNTIYPALVSIGVGVIGEETGTTFLKRRVDNRSLLDRLYRLRYVIPKEHINARAPKPGFILQESKTVGVGSASFLSADLSNPTQLKNVKIIKTASWNAQTISYTTEEPHRLQKGDIVTIRNIDSVNNSTGTFKLGYNGEFGVDNIISTKKFTVTGISTDPGLFLNQVNQRTTQQQIEALPTVQRSKALDSFTVYRVQENKPHVPGTSGQDGVYNITMVCASIPLDKDLGFGVSTKSFQQDVRNLYPQQDRDNYDSDPEPTITHASAAVIGEVITNNKKKSITKESLGYFMQGQQVGFAATGAVITGTGNTTVTLFTDVEHNFNSIKGISIVNPGAGYNNGSGIATVIYAGDLENSALIGRNASAKITISAAGTITDAQLLDGGCGYGIGNTMTVSSFPAGAPSVAGVVSVTSIFNNVGDGLNLSGFEDPKLNGTFKIVDIPTSKSVSVEISTSRNLDPYFKERDDRRVPTYHLANIGVGVTYIDVSRETGLTTVRTDNNHSLVPGNGFVIQGTGNPLFDDRKLVVDGVEEGLPLRSITFNVGIITSGIDTSYSVQSNRLFGTGISANGKSLSAGENNLAGRSSYFYTGISTTINAPLTSTDTTITLSSTEGFKRGDYCMINGEIVRFTSDNINNILRGQFGTLASPAITGTTIKKIKVLAMELRRPSILRASGHTFEYLGYGSGNYSTSLPQKQDRVLSDQETLSAQKKELDGGTVVYTGMNDSGDFFTGYKKLSSITGEEEVLEAPVFTYVGDDAEAETIKRASGVFDGVLIRESLTVEGGDNNNRTSQFYGPVNMTEKLTNTSEDGIETVNLSLRGDAPQGKVFTVGISTPLTAARSGDISFVGVPNAGGYLGHIFAEGEWRRFGAVSQERDRSFYKFDQIGIGQSGVGIFNFKDSLEVNGVAKIKDLFVSGIVTFAANQSFAGVSYDTLVIKKNANFWGYNTTGGISYDGIPWEQHGYYTQVHEAGTSRLYNMEVVGTYVTFKPASAIHVEGPMKSTFAGVSTFSGTLKVGNLESTGGTFNGTFVNADNASFQVLEASTQLYARAGIVTDLHVTVGVVTNGLYADIGITTLSHVGTQYVNENRVFTGIVTNLQVTNSATIANETVTNATITNLIIPNTGSADIEVANIDQITATDITFTDDLIGPDAYFSNDVDSDGLTTRYIGSKYGPNPGVESEQLTIFANAGLYTCISGFAMTMARINMTSGGDGLAAPKVTADVGIITALSAGSNANMTIDAGPAGQIKSFQFESIATNVPPIKTSSSVKCVNLNADLLDGLTMIDNNWTSGASIVGRDSNGSTKVNVITANQFAGGSGAFPNGITGNNANIGGNNTINNLTVTGSFDTSGGTEFAGNAATSTLASNIAIGANRVPYNNANNSTTSSSNFTFNGTTLSVANVTSSFTGDLAGRSTASDTSKIISAGSGGYNVVLTDGLGNNKGLAIDGGITFNGGSNSLTVSGDITAFASDMRLKTNIEKIQGAVAKVCKLSGFTYEFNETGRDLKLPAGKQLGVSAQQVQEIFPEAVAVRPIDEYLTVKYEKLVPVLIEAIKELKEEIESLKSGGYGKA
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 2328 AA molecular weight: 249391,51630 Da isoelectric point: 5,12292 aromaticity: 0,08634 hydropathy: -0,22298
Domains
Domains [InterPro]
DC_0066
STR
1–1908
STR
1–1908
IPR023366
STR
288–356
STR
288–356
IPR030392
CHP
2228–2286
CHP
2228–2286
1
2328
Architecture
STR 1-1908 | RBD 2106-2324 |
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Cyanophage S-SSM6a [NCBI] |
682650 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AGH07654.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
HQ317391.1
[NCBI]
CDS location
range 143275 -> 150261
strand +
strand +
CDS
ATGCCTCTATCAAGATTAGAAAACTTTCTAAAGAACGCTGAGGGTAATATACTCTATGTAAACCCAAGTGACTTTGACGCAACTGATAGTATTGAAAACAGAGGTAACTCTCAGACAAGACCCTTCAAGACTATTCAGAGGGCGCTGATTGAGGCTGCAAGATTTTCATATCAGACTGGTAAAAACAATGATAAGATAGACAGAACAACTATCTTAGCATATCCTGGCACACACTATATTGACAATAGGCCTGGATTTACTGTTGTAAACAATGGTGGTAATGCAGAATTTAAGCAAAGAAAGAACGCTGGATATGAAGTAACCTCTCTCGAACAGTTCACAACAGAGAGTAACTTTGATGTATTAGACCCCAATAACGAACTGTACAAGTATAATAGTACCGAAGGTGGTGCTATCATGCCTAGAGGTACGTCTATCATTGGTTTGGATCTTCGTAAAACCAAACTTAGACCTCTCTATGTTCCTGATCCTCAGAATGATGACATGGAATATGGTGGTGTTCTTAGGGTTACTGGTACTTGTTACTTTACTGCCTTCACCATTTTTGATGCAGACATCACCAAGACTGCATACTACGACTACGATAGTAATAGAAAGACTCCTTCATACTCTCACCATAAGTTAGCGACATTCACCTACGCTGATGGTATCAACAATGTCTTGATTGATGGTACAGATAGTGGACTCACTGACCTTGACATGTATTACTTCAAGGTTGCAAAGGCATACGGTGATTCATCTGGTAGACCAGTTGGAGATTATCCTACATTTGATGACTTTGAACCTAACGTTGATGAATTTAGAATTGTTGGAGACTTACAATCAGACCCAGTAGGTGTTACATCTATCAGAGCTGGTGATGGTAATACACCAACAGCAACTCTGACTATCAATACCAATAAACCACATGGATTATTCAAGGATACTCCTGTTCTAATCGCTGGTATTACGACTGCAATTAACTCCTACAATGGTTCATTCCTTGTAGATGAAGTCACAAGCAATACTCAGTTTACAGTTCAGACTCCAAATGTGCCTGCTAATGCACTACCTACACCACAAGAGATTCAAAACTCTAGTGTTATTGTTGAATCTGACACTGTAGGATCTGCCTCTCCATATATCTTCAACGTATCACTCCGTTCAGTGTTTGGTATGAATGGATTGGATTGTGATGGTGATAAGGCAACTGGTTTCAAATCTATGGTTTGTGCCCAGTTTACTGGTATCTCTATTCAGAAAGATGATAACGCCTTTATCCTTTATAATCCTACTACTGCAATCTTCAATGATACTACTACAGTAGCGGAGTCGGATAAACCACTACATTCAAACTCAAGGGCGATATACAAGCCATTCTATGAAACCTCTCACATGAGGACTAGGAATAACTCTGTTATTCAGTTGGTGTCTGTTTTCGCTATTGCATATGCTAGACACTTCCATGCAGAAAGAGGTGGTGACGCATCAATTACCAACTCCAACTCTAACTTTGGACAGACTGCTCTTGAGGCAACAGGATTTAGACCTACATCATTTGATAGAGATGATGTGGGTTACATCACTCATGTTATTCCGCCAAGAGAGATTGTAAGAGAAGATTCTACAGTATCTTGGTTGACTATCGACACTAGAAAAACTATTGGTGTTGGTGTAACTGAGAGAATGTATCTCTTTGGATACAACAATGAGGAGATCATTCCCCCAGCAGAGATTGATTCATTCAAGGTTGGTGCTAGAAATGATGACAAGTTATTCCTAAGTTTGGTTAATACCTTGTCTGGTCAGGCAGTTCAAGAGACATATGAGTCTCCTATCTTCATGCAAGTGCCGAGTGGTATCGGAACTTCTGGATTTAAAGAGTACGAAGTTATTAGGAACTCTGGTGTAAACGCCATTATATCTAACGTATTCCAATTCAAAACTACTCACCAACTTGTAAATGGTGAGAAGGTCAGAGTATTCAGTAATACTGGTGAGACTCCAAGTGGTATTATCAATGATAAGATTTACTTTGCAATCTCTGGTGGTACACTTGCTGCAGATAGAATTCAGTTGGCATCTACATTCAACGATGCTATTGCTAGACGACCTATCACTGGTATCTCCAATGGTGGTGGTAAGTTAGTCATCAGATCTACTGTATCTGATAAGAACCCTGGCGATCCAGGCCACCCAATGCAGTTTGATGAAACAACCTATACTATCAATAATGTTCCAAATACAGTTGGTGGTTGGTATCTTACAGGTGCATCAAACCTCTCTAACACTATCTACCCTGCTCTTGTTAGTATCGGTGTAGGTGTTATTGGTGAAGAAACTGGAACTACATTCCTCAAGAGAAGAGTTGACAACAGATCTCTACTTGACAGACTGTATAGACTTAGATATGTTATTCCGAAAGAACATATCAATGCTCGTGCTCCTAAGCCTGGTTTCATTTTACAGGAATCTAAGACAGTTGGTGTAGGTAGTGCATCATTCTTGAGTGCAGACTTGAGTAACCCAACTCAACTTAAGAACGTTAAGATCATTAAGACTGCATCTTGGAATGCTCAGACTATTTCATATACAACTGAAGAACCACATAGGTTACAGAAAGGAGACATTGTTACTATCAGGAATATTGATAGTGTAAACAATAGCACAGGAACATTTAAGTTAGGATATAATGGTGAGTTTGGTGTTGACAACATCATTTCAACTAAGAAGTTCACTGTCACTGGTATTAGTACAGATCCAGGCCTGTTCCTTAATCAGGTAAACCAGAGAACTACTCAACAACAGATTGAAGCACTACCTACAGTTCAGAGATCAAAAGCACTTGATAGTTTCACAGTTTATAGAGTACAAGAGAACAAACCTCATGTGCCTGGCACATCTGGACAAGATGGTGTGTACAACATCACTATGGTTTGTGCATCTATTCCACTTGATAAGGATCTTGGATTTGGTGTATCTACTAAGTCTTTCCAACAAGACGTAAGAAATCTATATCCACAACAAGATAGAGATAACTACGATTCTGACCCAGAACCCACTATCACTCATGCTAGTGCGGCAGTTATTGGTGAAGTTATCACTAACAATAAGAAGAAATCTATCACCAAAGAGTCTCTTGGATACTTCATGCAGGGACAACAGGTAGGTTTTGCTGCTACTGGTGCTGTTATTACTGGTACAGGTAATACAACTGTTACTCTGTTTACTGATGTTGAACATAACTTCAACTCTATTAAGGGTATTAGTATTGTAAATCCTGGCGCTGGATATAACAATGGATCAGGTATTGCAACTGTAATCTATGCTGGTGATCTTGAGAATAGTGCCTTAATTGGTAGAAATGCTTCTGCTAAGATTACAATCTCTGCTGCTGGTACTATTACTGACGCACAACTATTAGATGGTGGTTGTGGTTATGGTATCGGTAATACCATGACTGTATCTTCATTCCCTGCTGGCGCTCCTAGTGTCGCTGGTGTAGTGTCAGTCACATCTATCTTCAACAACGTTGGTGATGGATTAAACTTATCTGGTTTTGAAGATCCAAAACTAAATGGTACATTCAAGATCGTAGATATTCCTACATCTAAATCTGTTTCAGTTGAAATATCAACTTCAAGAAACCTTGATCCATACTTCAAAGAGAGAGATGATAGAAGAGTTCCAACATATCACTTAGCAAACATTGGTGTTGGTGTTACTTATATTGATGTTTCTAGAGAGACAGGACTTACAACAGTCAGAACAGATAACAACCACTCACTTGTTCCAGGCAACGGATTTGTAATTCAAGGAACTGGAAACCCATTGTTTGATGATAGAAAGTTAGTTGTTGATGGTGTAGAGGAGGGTCTGCCACTTAGAAGTATTACTTTCAACGTTGGTATCATCACATCTGGTATTGATACATCTTATTCAGTACAATCCAATAGACTGTTCGGTACTGGTATATCTGCAAACGGTAAATCATTGAGTGCTGGTGAGAATAATCTTGCTGGTAGATCTTCTTACTTCTACACAGGTATCTCTACTACAATCAATGCTCCACTGACATCTACTGATACAACCATTACTTTATCATCTACAGAAGGATTCAAACGTGGAGACTACTGTATGATCAATGGTGAGATCGTAAGATTCACCTCTGACAACATTAACAATATTCTTAGAGGTCAGTTTGGTACACTGGCATCGCCTGCCATAACAGGAACTACGATTAAGAAGATCAAAGTTCTTGCTATGGAACTTCGTAGACCTTCGATCCTTCGTGCATCTGGTCATACGTTTGAATATCTTGGTTATGGATCTGGAAACTACTCCACATCATTACCACAGAAACAAGATAGAGTTCTATCTGATCAAGAGACATTATCTGCTCAGAAGAAAGAACTAGATGGTGGTACAGTTGTTTATACTGGTATGAACGACTCTGGAGACTTCTTCACAGGATATAAGAAGTTATCATCTATTACAGGTGAAGAGGAAGTTCTTGAAGCGCCAGTGTTCACATACGTTGGTGATGATGCTGAAGCAGAGACAATCAAGAGAGCATCAGGTGTATTTGATGGAGTATTGATTAGAGAGTCACTCACAGTTGAGGGTGGAGACAATAACAATAGAACATCACAGTTCTATGGTCCTGTCAACATGACAGAGAAACTCACCAATACATCTGAAGATGGTATTGAGACTGTAAACTTATCTCTTAGAGGAGATGCCCCACAGGGTAAAGTGTTTACGGTTGGTATCTCTACTCCATTAACTGCTGCAAGATCAGGTGACATTTCATTTGTTGGTGTTCCTAACGCTGGTGGATACTTAGGTCATATCTTTGCAGAAGGTGAGTGGAGAAGATTTGGTGCAGTATCACAGGAAAGAGATAGATCATTCTATAAGTTTGATCAGATTGGTATTGGACAGTCTGGTGTTGGTATATTTAACTTCAAGGATTCACTCGAAGTCAATGGTGTTGCCAA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Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
97da1d9e9b8862dc87f24f8783e1c9c214883a974ed1f5dcea31e61612cab52b
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| The Genome Sequence of Cyanophage S-SSM6a | Henn,M.R., Sullivan,M.S., Osburne,M.S., Levin,J., Malboeuf,C., Casali,M., Russ,C., Lennon,N., Chapman,S.B., Erlich,R., Young,S.K., Yandava,C., Zeng,Q., Alvarado,L., Anderson,S., Berlin,A., Chen,Z., Freedman,E., Gellesch,M., Goldberg,J., Green,L., Griggs,A., Gujja,S., Heilman,E.R., Heiman,D., Hollinger,A., Howarth,C., Larson,L., Mehta,T., Pearson,M., Roberts,A., Ryan,E., Saif,S., Shea,T., Shenoy,N., Sisk,P., Stolte,C., Sykes,S., White,J., Yu,Q., Coleman,M.L., Huang,K.H., Weigele,P.R., DeFrancesco,A.S., Kern,S.E., Thompson,L.R., Fu,R., Hombeck,B., Chisholm,S.W., Haas,B., Nusbaum,C. and Birren,B. | 2011-09-23 | — | GenBank |