Protein

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Genbank accession
QGZ18224.1 [GenBank]
Protein name
central tail fiber J
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,89
Protein sequence
MGGIVEAIVNVVTSFIGWLIPIPDIPEFDTPEEERGVLINKQSNNAQIPIVYGRRQVGITRVFVESSGTDNQYLYMAGVLCEGEIEEVEQVFIDDKRVFFDDALDHGIVREVTGADSNFFKDSSHIQVQAFNGTETQVASSILTNSTNWTSNHKLSGVAYLAFRFKWNQDIFSSIPQVRVTLKGKKIFDPRDSATKWTPNSALVLLDYLRNNRYGKGLPDSAFESDFASFKTSANDADTLIQPRTTSVTEVAGLYRENYNGYHGDYPSYFTNRSITSTGTTTNISGVNPGIRKSHKYLGYFTAPSSASFFFRTASDDGSAVYVGDASQTVDNLSKQIEANRDTKLVVNNRGLHGNQGQEGSKTLVSGSVYPVIIIFGNNDGPGNLDFDWKVSGGTYSKSLSSNFTNGKGVTDVIPAIIKFESNAVVDTNQKVIDNVKKLLNPMRSLFTYNNGVYKLKIEGTGSAVKTITADHVVGGAKVLGERKNNKFNRVIGTYVNPYKNWQNDTVSFPPADDSNVVTEFKHATMLSADNDTLLEGNFQFPNVTNTFNAEALCEVILRRSRNQLQIQLTLTSEFLELEIGDIVAITYASGGFNAKPFRVLGIEINEDLTVNVQLFEHQDNFYDFNTKNPLPTIPDTTLPNPNSIQAPSISIADELFELFDGSVVSKLIVTITSTDAFADQFEVEYKESTSSDYRLMRRGSNTIVEKYPVKEGLIYDVRVRAINAVGVKSTYTTGQHEVNSAFTPPDNVTNYSIDVVGDKLYHSFDAVTNLDLDFYEIRFTSNTSETAYANTTVLVPRIGRPATSVTTPFVGTGKYFIKAVDKFGIRSTDFASQVISAQVVGDKIESVQTLTEHSAFTGTKSNVVAVSNNLQLDTSINFDSHTGNFDDGLGFFDGGSGAIVSSGTYDFANAFDFNSVLKFNVLLSSFIVNNINFVNNFDSASGNFDARQGLFDGGSNASIDTNAILQISTSQDASTYTSFQDFKAGDFVARAVKFRLKLTSSNTQESPQVSALALKLSLPIRTEKGSNISSTTSTSGKTITFGSEYYQTPSLTVIGQNMATGDFFTITSKGTASFVVEFFNSSGSTVDRTFDYQAIGIGQKQ
Physico‐chemical
properties
protein length:1102 AA
molecular weight: 120688,53360 Da
isoelectric point:5,04198
aromaticity:0,10708
hydropathy:-0,24564

Domains

Domains [InterPro]
DC_1879
ATT
1–265
DC_1879 SSF56988 DC_1836
G3DSA:2.60.120.1560
Unmapped
216–411
G3DSA:2.60.120.1560 DC_0129
DC_0331
STR
223–432
DC_0331
IPR037524
RBD
249–403
IPR037524
IPR018871
RBD
296–388
IPR018871
QGZ18224.1
1 1102
Architecture
ATT
STR
RBD
ATT 1-265 | STR 266-889 | RBD 890-1098 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Pelagibacter phage HTVC112P
[NCBI] 		2686462 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Candidatus Pelagibacter sp. HTCC7211
[NCBI] 		439493 Pseudomonadota > Alphaproteobacteria > Candidatus Pelagibacterales > Candidatus Pelagibacteraceae > Candidatus Pelagibacter >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QGZ18224.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MN698246.1 [NCBI]
CDS location
range 22838 -> 26146
strand +
CDS
ATGGGTGGAATAGTTGAAGCTATTGTTAATGTTGTAACAAGTTTTATTGGGTGGCTTATTCCTATTCCTGATATTCCTGAGTTTGATACACCAGAAGAAGAAAGAGGTGTATTAATTAACAAGCAATCTAACAATGCACAAATCCCTATTGTTTATGGCAGACGACAAGTTGGAATTACTAGAGTATTTGTAGAATCATCAGGAACAGATAATCAATACTTATATATGGCTGGAGTTCTTTGCGAGGGAGAGATTGAAGAAGTCGAACAAGTATTTATAGATGATAAAAGAGTTTTTTTTGATGATGCTTTAGATCATGGAATAGTAAGAGAAGTTACAGGAGCAGATTCTAATTTTTTTAAAGATAGTTCACATATACAAGTACAAGCATTTAATGGAACAGAAACACAAGTTGCATCATCAATATTAACTAACTCTACTAATTGGACATCTAATCATAAATTAAGTGGTGTTGCATATTTAGCTTTTAGGTTTAAATGGAATCAAGATATATTTAGTTCTATTCCACAAGTAAGAGTAACATTAAAAGGTAAAAAAATTTTTGACCCTAGAGATAGTGCAACTAAATGGACACCAAACTCTGCATTAGTATTATTAGATTATTTAAGAAATAATAGATATGGAAAAGGTTTACCAGATAGTGCTTTTGAATCTGATTTTGCATCTTTTAAAACTTCTGCAAATGATGCTGATACTTTAATCCAACCAAGAACGACAAGTGTAACAGAAGTTGCTGGTTTATATAGAGAAAATTATAATGGTTATCATGGAGATTATCCAAGTTATTTTACAAATAGGTCTATAACCTCTACAGGAACAACCACAAATATTAGTGGTGTAAATCCAGGTATTAGAAAATCACATAAATATTTAGGATATTTTACAGCACCTAGTTCTGCAAGTTTCTTTTTTAGAACAGCCTCTGATGATGGTTCTGCTGTTTATGTTGGAGATGCAAGTCAAACTGTAGATAATTTATCAAAACAAATAGAAGCTAATAGAGATACTAAATTAGTTGTCAACAATAGAGGTTTGCATGGAAATCAAGGTCAAGAGGGAAGTAAAACTTTAGTTAGTGGTTCAGTTTATCCTGTTATTATTATTTTTGGTAATAATGATGGCCCTGGTAATTTAGACTTTGATTGGAAAGTAAGTGGTGGTACTTATAGCAAGAGTTTATCTTCTAATTTTACTAATGGCAAAGGTGTAACAGATGTTATTCCAGCTATTATTAAATTTGAATCTAATGCAGTTGTAGATACTAATCAAAAAGTAATTGATAATGTAAAAAAACTTTTAAATCCAATGCGATCATTATTTACTTATAATAATGGTGTTTATAAACTTAAAATTGAGGGTACAGGTTCAGCAGTTAAAACTATAACAGCAGATCATGTAGTAGGTGGTGCTAAAGTATTAGGAGAAAGAAAAAATAATAAATTTAATCGTGTAATAGGAACATATGTAAACCCATATAAGAACTGGCAGAATGATACAGTTTCATTTCCACCAGCAGATGACAGTAATGTTGTAACAGAATTTAAACACGCAACTATGCTTTCAGCAGATAACGATACTTTGCTAGAGGGTAATTTTCAATTTCCTAATGTAACTAATACTTTTAATGCAGAGGCTTTATGTGAGGTAATTTTAAGAAGATCAAGAAACCAATTACAAATACAATTAACTTTAACATCAGAATTTTTAGAATTAGAAATAGGCGATATAGTTGCAATCACTTATGCTAGTGGTGGATTTAATGCTAAACCTTTTAGAGTATTAGGTATTGAAATAAATGAAGATTTAACTGTTAATGTTCAGTTGTTTGAGCATCAAGATAATTTTTATGATTTTAATACTAAAAATCCTTTACCAACAATACCAGATACAACTTTACCTAATCCAAATTCTATACAAGCACCATCAATATCTATTGCAGATGAATTGTTTGAACTATTTGATGGTTCAGTTGTTTCTAAATTAATTGTTACTATTACAAGTACAGATGCTTTTGCAGATCAGTTTGAAGTGGAATACAAAGAATCAACTTCATCTGATTATAGATTAATGCGTAGAGGCTCAAATACTATTGTAGAAAAATATCCTGTTAAAGAGGGTCTTATCTATGATGTAAGAGTAAGAGCAATAAATGCTGTAGGTGTTAAATCCACTTACACAACAGGACAGCATGAAGTTAATAGTGCATTTACTCCACCAGATAATGTAACTAATTATTCAATAGATGTAGTTGGCGATAAACTTTATCATTCTTTTGATGCTGTAACTAACCTTGATCTTGATTTTTATGAAATAAGATTTACTTCAAACACAAGTGAAACAGCTTATGCAAACACAACTGTTTTAGTACCAAGAATAGGTAGGCCAGCAACAAGTGTTACAACACCATTTGTAGGAACAGGAAAATACTTTATAAAAGCTGTAGATAAATTTGGAATAAGATCAACAGACTTTGCAAGTCAAGTTATATCAGCACAAGTTGTTGGAGATAAAATTGAATCAGTACAAACATTAACAGAACATTCTGCATTTACAGGAACTAAATCTAATGTTGTAGCTGTATCAAATAATTTACAATTAGATACTTCTATCAACTTTGACAGCCACACAGGTAACTTTGATGATGGTTTAGGTTTCTTTGATGGTGGTTCAGGTGCAATAGTTTCATCTGGTACTTATGATTTTGCAAACGCTTTTGATTTTAATTCTGTTTTAAAATTTAATGTTCTTTTAAGTTCATTTATTGTTAATAATATTAACTTTGTAAATAATTTTGATTCTGCGTCAGGAAACTTTGATGCAAGGCAAGGATTGTTTGATGGTGGTTCTAATGCCTCTATAGATACAAATGCAATATTACAAATATCTACTTCTCAAGATGCCTCAACCTATACTTCATTTCAAGATTTTAAAGCTGGAGATTTTGTTGCTAGAGCAGTTAAGTTTAGATTAAAATTGACATCTAGCAATACACAAGAAAGCCCACAAGTTTCAGCATTAGCACTTAAATTATCATTACCTATCAGAACTGAAAAAGGTAGTAATATTTCTAGTACAACAAGCACATCAGGAAAAACTATTACTTTTGGTTCAGAGTATTATCAAACTCCATCATTAACTGTCATAGGTCAAAACATGGCAACGGGAGATTTCTTTACAATTACCTCTAAAGGAACTGCATCTTTCGTGGTTGAATTTTTTAACAGTTCTGGTAGTACTGTTGATAGAACTTTCGATTATCAGGCAATCGGAATTGGACAAAAACAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
e0f90d021c518a14c24f09ebf44741f83b29a62b472aa90f72a77d053420e4d9
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2717
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Novel pelagiphages prevail in the ocean Zhang,Z., Qin,F., Chen,F., Chu,X., Luo,H., Zhang,R., Du,S., Tian,Z. and Zhao,Y. 2019 — GenBank