Protein
View in Explore- Genbank accession
- AOV58275.1 [GenBank]
- Protein name
- short tail fiber protein
- RBP type
-
TF
- Protein sequence
-
MPLTRLDNLYSSKTGKYLYVSPDDFNATDELDNRGNSPLRPFKTIQRAFIEVARYSYLPGKDNDRFDQFSIMLMPGNHFIDNRPGLVDTANPESRYFDSGNLIEANKQLIVDRAAVEIFVQHPDFFHPGDNQTDDGSRYADAYRLVQLNRKEIVDKSAAHIAVEFPDFFYPGGNGTSEAEYRFKDGYRLIQQNKQEIVDRAAAEIAVAHPDFFFPGDPADDPVYRFKDAYRLIQQNRQEIIDTAWTTMQAGANTADPSDEAKCKRDIGLLVDYIGVDLVKGGNEYTRKFTLKYFQGGVFSYIISEAAATVDAYNAARDLMIQAMKNQLTITDSTITIDPNACANVESAITTLTQIVTDAFNAADASGIPVETTGSDLTNEAKCKRDLGLFVDYLGLDLISGGNEYVRRHAGTYFVNGSPISNGLVGEEAQSITAFNKARDLMISAVQNILLVQDSTITVDGGGCANVQSAITTLTAILTTVINDGNLSQLPAETLGSFASANEIECKRDLGEYIDALSLDVALAGGNRYTRKYLKTYFNEAGTQFITGSLESEQSESIAAFNKARDLMISAFRNELFAKDSTITADPNGTPLCADVASMLGNLAAIVETVLTDGNLSQLPAETVTDHETAGEQKCKRDIGFIVDGVLADIRNGGNSNIISVAKTYFDRDGNPIADGIVGEEAESITAYNKARDMMKLAVTNSLYDKDLTISPGPAIAGANTPDIEYDESGNPGACIDVQTSIQTLVAILTDVINAGSLSVLASVQVTGVVPVFDYNRALQEWQDDSILDLGNPDNVLYKFNSTEGGCIVPRGCSLIGYDLRRTIVRPLYVPDPVDGDQERTGIFKLTGGCYLWQFTIKDGDLSENSPLYDQADKVGKVYYKKNSTDLKIPEYSHHKICIMTYAGNEELDRFYEKVGRAFAQFQPTIDDGELEALVQETRIVGPLSDTRTVESIEVVDIPGTSTARFTVTTKIEHGYFKGQYIAVINSGLSDEVNGTFKVDTIDDNNPKVFTYIIPITAAGLGLVSGITYTTANGLGTNAVIQAEIDSVESASPYVFNCSIRSTWGQCGMWADGSKATGFKSMVVAQYTGVSLQKDDRAFIRYDRFTNTWNQASLTDAFATVPYHAKGDAYWKDEWRNFHIRASDDSFIQCVSVFAVGFHDHFLMESGGDMSITNSNSNFGNTSLHSVGFKGFAFNQDKGGYIDAIIPPKVVNTAAEGTSTLQYYTLDIEASNDQANHNKLYLAGDTNQDPSSRPAASIGGYRLGAKQDDRLYVKLPGSGAGGKNTYHATLEPSGVKTYKSSLSSLTPPSLNINFDLDGDGNDDFNMAYDAANLIEKNRSYLAEETYGYITTLYPALLTNSSLTITKCERDMGFIIDAVVKDLRVGGNINTIYAAESYISGGNVSYVDGELTETLLAYDHLRRLSFGAIRNFNLLIKNCTTVNGSATVTVGDTSGLVPGMNVSHYSQTDFTNGKLDEGSTRLGTLLDSNSPVIIDQIVNATTITIKDVNTDQPFNAGGDSTTAWFYFENVNRYSSSQRVVDEDITQDTDYPECNNITTAIQNLYDVVNLILNGNGNQVTRVEPIIDSAQLIGRATVFTIDTGNGQTDPHGLQTGTPVRLVPRALNDQVDKRLVRLPRGFETNRTYYVIAPGRLTAPGVFNGTSEFDNTAGTKLMLAATKENASAGIYIYSSETEAVDPQVEILVQQYVLDDQYDLHRYVCNVSGIYIETDVPHIFDVPIPNVPAQQIFFATSGDASSQLPTIAGASTVPTNVYYYPRFETPNKFSVHTSQADAQAGTNAVIFTSGSGSDFVVYGNKKTSPLRYDPVSFNRWYINVKDESSGGLDPDAILTRFHAADFLDGTGNLFTPDTFFERIEDERTPLDRIYRLRYVIPKYLSTVREPLNGYVIKTRTDDRRRLKPQRFILEPFSNGAPTIAQFENPARPAEKLGQSLATLNAAGVDISGNFYDPYENPLQIEFESKIAVTIQSARVGSNFADEDRLELTVFDHTIINQQLKNEIFTIVEIGSPQGAGIQTSIYNSDDANYVSWTGNCSGSGFVHGYYQADLTAFIILKNITGKLDFDASNPTTFVQNNGTFFDLNGQKDAWPTQISRSERKNYLYRIEGANVYTVVPGDKVTTPGGDTYTISAVEDVPDIDDTFYIFDVETIQEQIPLQQEGVYYLTAVRGNISPYPLGAGVGTNFHYYKFSQPISNLYPLDYKNDPLWFQIDDSGNRDLTKLDPPASVAAADNYVHGLVTLNDYKYSETKEAVTDMLATRPFANFQFTNSTADVNAKVIDNRIRAQEGNASVGSENRQIPISGDSVYPLQSRYYTELRRPSIARSGNHTFEYLGFGPGNYSTGFPLRQEVVLSDKQDFYAQAKREDGGIVFYTGLNSNGDLYIGNRKINAITGEETFLEQAALEDSGDDSDSIGALVTTFDNAVTFNDKVTIEGETFLNNPVQINVDPLDGDSLRILSLTQSGDDPTQDRTAFRNRLDGDIVLTKNSINAAVYRFNPRGTVETPGQSYTWRTHVAGGFPSNITPNNTGLLAAGGTAWYTAQNVTYGSSITPTAGDILYKGLEVNRSGSLGWIYTNFFTEIPDASIFSLTSDNTTTIEIQWGAGVSNQQLNVKVGETLRISNFSNTFFNGSWKVLASAFDPLASTCKIQLFNQIAQNVYDWSAEGPGAKIEISLSRWKELGVIGAEALRTDTDTFGDFRLGINTIGRSAKEATNVANVSVDTDPRANLDVVGTAFISGKTLVTYDNTGLVDVNNYFAEASNAKTYFTVDNAFLVGGESDDPDAIATVRISTSDPASVTSTYQTGGRFGINTSIGGLAERELDRNFVVYGDARITGNTLIEDDLSIDGGDLNSTAETFQFLNTNVDFFIGLGAAESLSLGNTTQSDQSISVGMNVADTASHTLRIGGNAGSTTLEIHKRSKSAFVDIASVEDAITSNCSINIGGGAPNLATSTYIGTYQTKVAGTLEIAAFAGSSTARIFTLAAEANLFDGAATTSVNIGANAASVDIAGLGGFTTVRNSLKVQGSTTSDGTITLSGGLNAGIIKINRARFSTSTGDHQVGSLEDPNITFLKYYETGKKIDTGGVAPWGSDTFLLAGGQIAAVDSISPTNSSDWVANVLYDNLQATTTGNGTGALFNVEIDGSGDVTISLVAPGSGYSDNDPLTITSDQLGGAAGGQDLTFRVNQVNASGELYYLPITAPAPDDFKIGDLLLIDRGHPQAVDSVDSNGATVAADQQYSEIVQVTALINVTDPTDTLGYRLGVKRGVDGTATRADHPDESIIAKLDKSANASYITGFDLDNNGELDTGNTSAGVSTADIRIGVAEFGGTLTTNDYLILDNIEIVKVAELISTDIQSLRVTDGGTPATEVFRVDSTTGNTKLNGRLSVGQGFDKFVVEGTNGNTTIAGTLTVNNTLKVRGATVEGVEFFRLTNGGSTSITERTTLEVDTATGDLTINGGDIKVFGEDGTTEKLTFENSTGDLTVTGTLSAVGDGTATFGGDITVTGDITINGGDLTVNSSGDEIFAVDERGGMTIASIENYITRTGGRKWEYTAEQTVQTEPNVNYFVNASQNTVVKLPPLGDCLIGDMIRIIDIGGLLTYNMSMIVRAPSDVNVQGGTDNTGTALMSGVSNSGNLVGDGYDGGELIVQTPYAAFTLIFAGSSTPTGQTAVPGGKVGWYIAEV
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 3693 AA molecular weight: 398940,79860 Da isoelectric point: 4,50343 aromaticity: 0,09098 hydropathy: -0,24411
Domains
Domains [InterPro]
DC_0066
STR
1–200
STR
1–200
IPR038719
Unmapped
184–339
Unmapped
184–339
DC_0231
STR
246–339
STR
246–339
1
3693
Architecture
STR 1-200 | STR 227-3693
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Synechococcus phage S-CAM1 [NCBI] |
754037 | Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Anaposvirus > Anaposvirus socalone |
| Host |
Synechococcus sp. [NCBI] |
1131 | cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Cyanobacteriota/Melainabacteria group > Cyanobacteriota > Cyanophyceae |
| Host |
Synechococcus sp. WH 7803 [NCBI] |
32051 | Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus > |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AOV58275.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
KU686196.1
[NCBI]
CDS location
range 19866 -> 30947
strand +
strand +
CDS
ATGCCTCTTACAAGACTTGATAACCTTTACTCAAGTAAAACAGGTAAGTATCTATACGTATCACCAGATGACTTTAACGCGACAGACGAGTTAGACAACCGAGGCAATTCACCTCTCCGTCCGTTTAAAACTATTCAACGTGCTTTTATTGAAGTAGCACGTTATTCTTACTTGCCTGGTAAGGATAATGACAGGTTTGACCAGTTCAGCATTATGCTGATGCCTGGTAACCACTTTATTGATAACCGCCCTGGTCTTGTAGACACTGCTAACCCAGAATCTAGATATTTTGACTCTGGCAACCTGATTGAAGCAAATAAGCAGTTGATCGTTGATCGTGCTGCTGTAGAAATTTTCGTACAACACCCTGATTTCTTCCATCCTGGTGACAACCAAACTGATGATGGGTCTCGATATGCTGACGCATATCGTCTAGTACAGTTAAATCGTAAGGAAATTGTAGATAAATCTGCTGCACATATTGCAGTAGAGTTTCCTGACTTCTTCTATCCTGGTGGCAACGGTACATCCGAAGCAGAGTACAGATTTAAAGATGGATATCGTCTAATCCAGCAGAACAAGCAAGAGATTGTTGATAGAGCAGCAGCAGAGATCGCTGTAGCACACCCTGATTTCTTCTTCCCTGGTGACCCTGCAGACGATCCTGTATACAGATTTAAGGATGCATATCGTCTGATTCAGCAGAACAGACAGGAGATCATTGACACTGCATGGACAACCATGCAAGCAGGTGCTAACACTGCAGATCCTTCTGATGAAGCAAAGTGTAAGCGTGACATCGGTCTTCTGGTTGATTACATTGGTGTTGACCTTGTAAAAGGTGGTAACGAGTATACTCGTAAGTTCACCCTGAAGTATTTCCAAGGTGGTGTATTCTCTTACATCATTAGTGAAGCAGCTGCTACCGTCGATGCATATAATGCTGCTAGGGATCTGATGATCCAAGCAATGAAGAATCAGTTGACGATCACTGATTCTACTATCACAATTGACCCTAACGCATGTGCTAACGTAGAGTCTGCAATCACGACTCTTACACAGATCGTTACTGATGCATTTAATGCTGCTGACGCATCGGGAATTCCCGTAGAAACAACTGGTTCTGATCTTACAAATGAAGCAAAATGCAAACGTGACCTGGGTTTATTTGTTGACTATCTTGGGCTCGATCTCATTAGTGGTGGTAACGAGTACGTTCGCCGTCATGCTGGCACATATTTTGTTAACGGATCCCCAATTTCTAACGGACTCGTAGGAGAAGAGGCACAAAGTATCACTGCTTTCAATAAAGCGCGTGATCTGATGATTTCTGCTGTCCAGAATATTCTTCTGGTTCAGGATTCTACGATTACAGTTGACGGTGGTGGTTGTGCTAACGTACAGTCTGCTATCACAACTCTAACTGCAATTTTGACGACTGTCATCAATGATGGCAATCTATCTCAACTACCTGCAGAAACTCTAGGATCCTTTGCTAGTGCAAATGAAATCGAGTGTAAGCGTGACCTTGGTGAGTACATCGATGCTCTCTCCCTTGACGTTGCACTTGCTGGTGGTAACAGATATACCCGTAAGTATCTGAAGACATACTTCAATGAGGCAGGTACACAGTTTATTACTGGATCTCTAGAAAGTGAGCAGTCGGAGTCTATTGCTGCCTTCAATAAGGCAAGAGACCTGATGATCTCGGCATTCAGAAATGAACTATTCGCCAAAGATTCTACAATTACTGCTGATCCTAACGGTACTCCTCTATGTGCTGATGTTGCTAGCATGCTGGGCAACCTTGCAGCTATTGTCGAGACTGTTCTAACTGACGGCAATCTCTCTCAACTTCCTGCTGAAACTGTTACTGATCACGAAACTGCTGGTGAGCAGAAGTGTAAGCGTGACATCGGATTCATTGTTGATGGTGTACTTGCTGACATCAGAAATGGTGGTAACAGCAACATCATCTCTGTTGCAAAGACTTACTTTGATAGAGATGGAAATCCAATTGCTGATGGTATTGTAGGCGAAGAGGCAGAAAGCATCACCGCTTACAACAAAGCGCGTGACATGATGAAACTGGCAGTCACGAACTCCTTATATGATAAGGATCTGACTATCTCCCCTGGTCCTGCTATTGCAGGCGCTAACACCCCTGACATCGAGTATGACGAGTCTGGTAACCCTGGTGCATGTATTGACGTTCAGACGAGCATCCAGACCCTTGTAGCGATCCTGACGGACGTTATCAATGCTGGTAGTCTTTCTGTTCTTGCATCGGTTCAGGTTACTGGTGTTGTTCCTGTATTTGATTACAACAGAGCACTTCAGGAGTGGCAGGATGACAGCATCCTTGACCTAGGCAACCCCGACAACGTACTTTACAAGTTCAACTCTACCGAGGGCGGTTGTATCGTTCCCAGAGGTTGTTCTCTGATCGGTTATGACCTCCGTCGCACCATTGTCAGACCTCTGTATGTTCCCGATCCTGTAGATGGCGATCAAGAGAGAACTGGTATCTTCAAACTGACTGGTGGTTGTTACCTGTGGCAGTTCACTATCAAGGATGGTGACCTCTCCGAGAACTCCCCACTATATGATCAAGCAGACAAGGTAGGTAAGGTTTACTACAAGAAGAACTCTACGGATCTGAAGATTCCCGAGTATTCTCACCATAAGATCTGCATCATGACCTATGCAGGTAATGAAGAACTAGATCGTTTCTATGAGAAAGTTGGTAGAGCATTTGCACAGTTCCAACCTACCATTGATGATGGTGAACTAGAAGCACTGGTACAAGAGACCAGAATTGTTGGTCCTCTATCTGATACCAGAACGGTTGAAAGTATTGAAGTTGTTGACATTCCTGGCACTTCTACTGCTAGATTTACTGTCACTACCAAGATTGAACACGGTTACTTCAAAGGTCAGTACATCGCTGTTATCAACAGTGGACTATCTGATGAAGTCAACGGAACATTCAAGGTTGATACCATTGATGATAACAATCCAAAGGTATTCACCTACATCATTCCTATCACCGCTGCTGGTCTAGGACTGGTTTCTGGTATCACTTACACCACTGCTAATGGTCTTGGCACCAATGCAGTCATTCAGGCAGAGATTGACTCCGTTGAGTCTGCATCTCCTTATGTCTTTAACTGCTCCATTCGTTCCACCTGGGGTCAGTGTGGTATGTGGGCAGATGGATCCAAGGCAACTGGATTCAAATCGATGGTTGTTGCACAGTACACGGGTGTTTCGCTACAGAAAGACGACCGTGCATTCATCCGCTACGACAGATTTACTAACACTTGGAACCAAGCATCACTAACTGATGCATTTGCAACTGTTCCTTACCACGCCAAGGGTGATGCATATTGGAAGGATGAGTGGAGAAACTTCCACATTCGTGCTTCTGATGACTCCTTCATCCAGTGCGTCTCGGTCTTCGCTGTTGGTTTCCACGATCACTTCCTGATGGAAAGTGGTGGTGACATGTCTATCACCAACTCGAACTCTAACTTCGGTAACACCTCACTTCACTCTGTTGGATTCAAAGGATTTGCATTCAACCAGGACAAGGGTGGTTACATTGATGCTATCATTCCTCCCAAGGTTGTTAACACTGCTGCAGAAGGAACTTCTACTCTACAGTATTACACCCTTGATATTGAAGCATCTAATGATCAAGCAAACCACAACAAACTATATCTCGCAGGTGATACCAATCAAGATCCATCTTCTAGACCTGCTGCATCCATCGGTGGTTACAGACTAGGTGCCAAGCAAGATGACAGACTCTATGTTAAACTACCTGGCAGTGGCGCAGGTGGTAAGAACACTTATCATGCAACTCTAGAACCATCTGGTGTCAAGACTTATAAGTCATCGCTGTCTAGTCTTACACCTCCTAGTCTCAACATCAACTTTGACCTAGATGGTGATGGTAACGATGACTTTAACATGGCATATGATGCTGCTAATCTCATCGAGAAGAACAGATCATATCTAGCAGAAGAAACTTATGGATACATCACTACGCTGTATCCTGCTCTGCTGACCAATTCTTCCCTGACTATCACCAAGTGTGAAAGAGACATGGGATTCATTATTGATGCTGTTGTTAAAGACCTTCGTGTCGGCGGTAACATCAATACAATCTATGCTGCAGAATCTTACATCTCTGGCGGTAACGTATCGTATGTCGATGGAGAATTAACTGAAACACTACTGGCATATGATCACTTGAGAAGATTGTCGTTCGGTGCTATCCGTAACTTCAATCTACTGATCAAGAATTGTACCACTGTTAATGGATCTGCAACCGTAACTGTTGGTGATACTTCTGGTCTTGTACCTGGCATGAATGTCAGTCACTACAGTCAAACCGACTTTACCAATGGTAAGTTGGATGAGGGTTCCACTCGCCTTGGAACTCTACTAGATTCCAACTCTCCTGTAATTATTGATCAGATTGTTAATGCTACAACGATCACTATTAAGGACGTTAATACCGACCAACCATTTAATGCTGGTGGTGATAGCACTACTGCATGGTTCTACTTTGAAAACGTCAACCGTTATTCTTCATCGCAGCGTGTAGTTGATGAAGACATCACCCAGGATACAGATTATCCAGAGTGTAATAACATCACCACTGCTATTCAGAACCTGTATGATGTTGTCAATCTAATTCTCAATGGCAACGGAAATCAGGTAACTAGAGTTGAACCAATCATTGATTCTGCTCAACTTATTGGTAGAGCGACAGTATTCACTATTGATACTGGTAATGGTCAAACTGACCCTCATGGACTACAAACTGGCACTCCTGTCAGACTAGTCCCAAGAGCACTTAATGATCAGGTTGATAAGCGTCTTGTCAGACTACCAAGAGGATTTGAAACTAACAGAACATACTATGTGATCGCTCCTGGCAGATTGACAGCTCCTGGTGTATTCAATGGCACCAGTGAGTTTGACAACAC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Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
2841ac4746cf35845572e8ecb9a1d54765b9923c9f2ed45842e542dee16230ef
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50