Protein

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Genbank accession
QPI13863.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber, proximal subunit
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,69
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,52
Protein sequence
MAQAPKLAFRATEGLDAAGEKIINVQKTTHPTATDKSTIHDGVSVDFFVEYNGIQQFDATRTYPKHMTVIYDRRPYYAKNDITTAGPFKASDWQSLRVDPTWISQVSHGAQEILLEAGQYVITVSEYASYNFKLPNNPVVGDTVVIKDGTGSVGRLPTTFNSSKPIRLGGSSDLSQDVTIYTQTHPLATAVFIYTNTNVWDLQILDAGKSAKAARANDAASPYLMQAGQSWYRKTSTGPIFMKLPKYANNGDTVHVYDLDNANVTNPTTFTTDSGTINGKPSPFKPTTIGDGVFVYEAANNNWVVYDSDIRGRVEVIGSSKNLLPNSYYAMNANSATQVDLTLPTNAGVGDMITISLKSVRRGQTVKIKTEKVRPDGLGAIILNGFETIAKYSSQGTALGSAFKRSKELTYLGTTSNLPVITMFHYGDGEWMMFESTNNVERVDPANRDRAGVAPLATVIEAQAMANHNQEAIITPETLASRTALDNRTGIAALANLGDAQKDGTTGLDHTKIVTVQRMDNRFATETRRGVAEIASQSEANGSTDDERIITAKKLDTRKATPTQSGIAFTVNPGGTPATTRTGNGTGVFDMNDVAKIVTPKVLADYKATENQLGTVFLATESEVKGGNVAPSQGPTVVTPEMLGKRVALETNHGLISIATQAETDTGTNDTKAVTPKKLNERRGSETLSGVSRFATKAEFEAGTKEIPLDAAVAANVKGQLAVSPDKVKDFFSAVRTSVNSTSGLTQDGNIWGKLALNIVVPTETQRGTPRIATQLEVNAGALNDVFVSPVKFINTRATYDQIGTTKFAADSVMKAKNSDIDAVSVNKLVNAFETYPEYAANDVKRGTIRNVKDAEAFAGDDTVGSSKPFTDYIHNGFAISPRSMIYALRNYLPLKATAQNSLQLGGVNASSWMRRDIAQTVTGSMTFVPNQAFNADVSIAGRLTNTGTGYFNSVATDGSSTPQLSLGDGAKVTSAVIRFNAGLIANRNNWQLIAGGNSDWAGNDEFVIATLHATPRKVLTLKGDGAISTMNTLTVGTNLNVLNQIQVNGTGFASKLDATTFRVGTTDLDIKLFTKDANFNGLTVTKPGGANATILNTGNFTQHLDSTYVKRTGGVESYMSGPLVYSQGGAVSTDIAGSAGVYTWLTEIADTKNPSSYPNGNWSMAISTKAIYDTYPGGGSPTVADKPGVGTLVQFGLNNNRIIQHWYLKDSSVWYTRSGLGNTFTPWARVYTSERPPVAEEIAGVMQEGKETDFLRVKQYIDIGNVRIRANNATRTVEFEWIGQ
Physico‐chemical
properties
protein length:1285 AA
molecular weight: 138043,78930 Da
isoelectric point:7,25160
aromaticity:0,07860
hydropathy:-0,30506

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Serratia phage 4S
[NCBI] 		2787015 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Serratia marcescens
[NCBI] 		615 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QPI13863.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MW082584 [NCBI]
CDS location
range 64337 -> 68194
strand -
CDS
ATGGCCCAGGCACCAAAATTAGCATTCCGAGCTACAGAAGGGCTCGATGCCGCTGGTGAGAAAATCATCAACGTACAGAAAACCACGCATCCTACTGCAACTGATAAATCAACAATCCATGATGGTGTGTCTGTAGATTTCTTCGTAGAATATAACGGCATTCAACAGTTTGATGCAACTCGTACTTATCCAAAGCACATGACGGTTATCTATGATCGCCGGCCGTATTATGCTAAAAACGATATTACGACTGCAGGTCCTTTCAAGGCATCAGACTGGCAATCATTACGTGTTGACCCGACTTGGATCAGTCAAGTTTCTCATGGCGCACAAGAAATTTTATTAGAAGCTGGCCAGTATGTAATTACCGTTTCTGAGTATGCTTCATACAACTTTAAGCTACCAAACAACCCAGTAGTTGGCGACACTGTAGTTATTAAAGACGGAACTGGTAGTGTTGGTAGATTGCCAACTACATTTAACTCCAGTAAACCGATAAGACTCGGTGGATCTTCAGATCTTTCTCAAGATGTAACGATTTACACCCAGACACATCCATTAGCAACTGCTGTATTCATTTACACTAATACTAATGTTTGGGACTTACAGATTTTAGATGCGGGTAAATCAGCTAAAGCTGCAAGAGCAAACGATGCAGCCAGCCCATATTTAATGCAGGCAGGCCAGTCTTGGTATCGTAAGACTTCAACTGGCCCTATTTTCATGAAACTGCCTAAGTATGCTAATAACGGCGATACTGTGCATGTTTATGATTTAGATAATGCCAACGTTACGAACCCAACTACATTTACTACTGATAGCGGCACCATCAATGGTAAACCTAGCCCATTCAAGCCGACTACAATTGGCGATGGGGTGTTCGTTTATGAAGCTGCTAATAATAACTGGGTTGTTTATGATTCAGATATTCGTGGTCGTGTAGAAGTTATTGGTTCTAGCAAAAACCTTCTGCCTAACAGCTATTATGCAATGAACGCAAACTCAGCAACTCAGGTTGATTTGACATTGCCTACAAATGCTGGTGTTGGCGACATGATTACGATTTCTCTGAAATCTGTTCGTCGTGGTCAGACAGTTAAAATAAAAACCGAAAAGGTTCGTCCTGATGGCTTAGGTGCTATTATCTTAAACGGTTTTGAGACTATTGCTAAGTATTCTTCTCAAGGTACTGCATTAGGTTCAGCGTTTAAACGTTCTAAAGAGCTAACTTATTTGGGTACAACTTCAAATCTTCCTGTTATTACCATGTTCCATTACGGTGATGGCGAATGGATGATGTTTGAAAGCACTAATAACGTAGAACGTGTTGATCCAGCCAATCGTGATCGTGCGGGTGTTGCTCCATTGGCTACTGTGATTGAAGCTCAGGCAATGGCTAACCATAATCAAGAAGCGATCATTACGCCAGAGACTTTAGCATCTCGTACTGCTTTAGATAATCGTACAGGTATTGCTGCACTGGCTAATTTAGGCGATGCTCAGAAAGATGGTACAACTGGTCTGGATCATACTAAGATCGTAACCGTTCAACGTATGGATAATCGTTTTGCTACCGAGACTCGTCGAGGTGTAGCTGAAATTGCGTCCCAGAGTGAGGCTAATGGTTCTACTGATGACGAACGTATTATCACAGCCAAAAAATTAGACACTCGTAAGGCGACTCCTACACAATCTGGTATTGCATTCACTGTTAACCCAGGTGGTACTCCTGCTACTACTCGTACAGGCAATGGTACTGGTGTATTTGATATGAATGATGTTGCTAAGATCGTAACACCAAAAGTGTTAGCCGATTATAAAGCAACAGAGAACCAGTTAGGTACCGTTTTCCTGGCTACTGAATCTGAAGTTAAAGGTGGTAATGTTGCTCCTTCACAAGGTCCAACTGTTGTTACTCCTGAAATGTTAGGTAAGCGTGTTGCTTTAGAAACCAACCACGGTTTAATTTCTATTGCAACTCAAGCCGAAACCGATACTGGGACTAATGATACCAAAGCCGTTACTCCTAAAAAGTTAAACGAGCGTCGTGGTTCTGAAACTTTAAGTGGTGTTTCTCGTTTTGCTACTAAAGCTGAATTTGAAGCCGGTACTAAAGAAATTCCTTTGGACGCTGCTGTTGCTGCTAACGTTAAAGGCCAATTGGCCGTATCTCCGGATAAAGTTAAAGATTTCTTCAGTGCTGTTCGTACTTCTGTTAATTCAACTTCCGGTTTAACTCAAGATGGAAATATCTGGGGTAAATTAGCATTAAACATCGTTGTTCCTACTGAAACTCAACGTGGTACTCCAAGGATTGCTACTCAGTTAGAAGTTAATGCAGGTGCTCTTAATGATGTATTTGTGAGTCCAGTCAAGTTCATTAATACTCGTGCTACGTATGATCAAATCGGTACTACTAAGTTTGCTGCCGATTCTGTCATGAAAGCCAAAAACTCTGACATTGATGCTGTTTCGGTCAACAAATTGGTTAATGCCTTTGAGACATACCCTGAATATGCAGCAAACGATGTTAAACGTGGTACTATTCGTAATGTTAAAGATGCAGAAGCTTTCGCTGGTGATGACACTGTAGGTTCTTCTAAGCCGTTCACTGATTATATTCATAACGGATTTGCAATTAGCCCTAGAAGTATGATCTACGCTTTGCGTAATTACTTACCTCTCAAAGCTACTGCTCAGAACTCATTACAGTTAGGTGGCGTTAATGCTTCAAGTTGGATGAGAAGAGATATTGCTCAGACCGTAACAGGTTCGATGACTTTTGTTCCTAATCAAGCGTTTAATGCAGATGTTTCTATAGCAGGCCGCTTAACTAATACTGGGACCGGTTATTTCAACTCAGTTGCAACTGACGGTTCTAGTACACCACAACTTAGTTTGGGTGACGGTGCTAAAGTCACATCAGCCGTTATTAGATTTAACGCAGGTCTTATTGCCAATAGAAATAACTGGCAATTGATTGCAGGCGGAAATAGTGATTGGGCTGGTAATGACGAGTTTGTTATTGCGACTTTACACGCTACACCAAGAAAAGTTCTTACTTTGAAAGGTGATGGCGCCATTAGCACAATGAACACCTTAACAGTGGGTACCAACCTTAATGTTTTGAACCAAATCCAAGTTAATGGTACCGGATTTGCATCCAAACTTGATGCAACAACGTTTAGAGTCGGTACAACAGACCTTGATATTAAACTCTTTACTAAAGATGCTAATTTCAACGGTTTGACTGTTACTAAACCAGGTGGTGCAAATGCTACGATTTTGAACACTGGTAACTTCACTCAGCATTTGGATTCAACTTACGTTAAGCGTACTGGCGGTGTTGAAAGCTATATGAGTGGACCTCTGGTTTATTCACAAGGTGGCGCTGTTAGTACTGATATCGCTGGATCGGCAGGTGTTTATACTTGGTTGACTGAAATTGCTGATACCAAGAACCCGTCAAGTTATCCTAACGGTAACTGGTCTATGGCTATTAGTACAAAGGCTATTTACGACACTTATCCAGGTGGTGGGTCTCCAACTGTAGCCGATAAACCAGGCGTTGGCACCTTAGTCCAATTCGGGTTAAATAACAACCGAATTATCCAACATTGGTATTTGAAAGATAGTTCAGTATGGTATACTCGTTCAGGATTAGGTAATACATTTACTCCTTGGGCTCGTGTTTATACATCAGAACGTCCACCTGTTGCAGAAGAAATAGCTGGTGTAATGCAAGAAGGTAAGGAAACCGATTTCTTACGTGTTAAACAGTATATAGATATTGGCAATGTTCGTATTCGCGCCAATAATGCAACTCGTACTGTTGAGTTCGAATGGATTGGTCAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
e377ef8896d56eb5258a50a13d248c33bc96cc9b61d4a6d06ad4659aa8cd0412
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5206
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50