Protein

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Genbank accession
AGH56085.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,61
Protein sequence
MSNVNKVSQSVNAISPDFIRSDYPLFNKFIEYYYRSQEKTGLGQNIVNEFIQYLDIDKLDIGILDGGTQVVEPITTTSTSIVVESVDQFVEKNGSILIGDEVIYYESTKSAPNIALSPGISYEQVKLKWTVAESQIDSYDGTTRIFPLRTAGNPAAPPTPQHLVVSLYGQILIPGVDYTVSGTNIVYTTAPRTRIPADSSDLTYIFYLGGFIENNILEIDDISGSFGEGKTSFKMTRSGIPYEPIVDEFLIAIYDNQLLIPKQDFYIDRDYFIFENAPLNGRKLALFSIEAPIPSFGANAVGFARVNDDGNLTSISTSVSGSNYRFEYPPKVTINSESGFGASAATLVNGVKSSTLLHGGKGYSDTNPPAVIVEVPTKAGSVPAQLKATVTNGSVSSLEVVSSGSGYTFTPRVTFKQPGGAKLGTLTIGGGQVTGVVPIVDGGSGYTTPPAIYVDEPTGDNSIKASFQAVLTNGVVTSINILNRGQGYETTPRVAIIDPVGAQVLQTRVDGDGRVVGIDLLDGGSGYDDVPSVYIVDNRQNGGSGATATASIFNGKITDINVSAFGSGYSAAEPPEIFIQEPPNARASVDIGLNEVTGYKINKQGSGYSKASFEGCARAASGIVKYTEDGNAVFSNNTTAAAATADTPVKCLDALFIKRLLDKYTEQFLPDVPELDYTKIDVRNAIKSVRDFYTSKGTSFSISYLFKLLYGEEVSVTYPKDQIIKPSASTWSIDTVLRAVLVSGNPINIRDGLLQQDADIADPNILAASALVENYIAIRTSETEIYELVLSEETIQGKFVVPYKTKLAEPLSTTDSIITVDSTIGWPERNGQFLIGGTEVVQYKEKSLNQFIECTRGATVSGPAQVWDSATEVTSNFNVYINKGTDREVLMRVVGIVDAEQTTLTDTGSYYLPGDKLSISKLGGTGNTADLSTWLYNVKKLIEVTSITFDGNIAEVTCSNNHGLLVGDQISIYGANPIIYNGTFLVKNRTSPTVFKYELPQPPAVAPQGNILVSIDLNKGKSDNSAVFNAISPYTTNIQNTFFNDDYVYVASTGIPNYKIGPFPGSALLPGNQRKLNRFPRVSTTISSKNTINPGPIGTWVNGVSIWSYKSSITKTFGSVTSITIDNVGRNYDAASPPTATISGGAGSGATAEVVVNGSLDSIDVTAGGSGYTSSPLVAIVGGGGTGASATAIITKGAVSRILINEGGTGYTSQPQISIVGGGGAGATATAAVRGPIQSINVTNGGASYTSEPSVTLSSGSGAVAQPIVNNGRIISIAIIAAGSGYTTAPEVTIQGVGFGAVAKANIDTDGENAGRVTSIDIINRGIGYVQGTTLINLNSVGEGALFTSNVFQWTYNLQNSTTFDAAQGGVFEGFNNQYGGEYAHLSTPKKLREVLGDGVETLGDGTLQEITDHAVHSPIIGWAFDGNPIYGPYAYQDPTDQQSSIVRLGSSYRVKPSLIYDENTNISPQRTDGPALSDEPAGTFVEDYEYIFNLGELDQYNGRFCKTPEYPEGRYCYFVTIDNSDAGVPVFPYVLGPTFNSVVDSWNLVSDAVQQNIPTGVVRYRDPYENVDIDVERTPNASTNQLTLEDGSLLLFEVEDENRDGVITADETADPDSVLEESPLQLFDYFPAVKFDSKVDIEVETITKFEDASVTGFSIENPGKNYQVDDRLVFDNTDTDGLGVSARISRITGEPISTYNFLNESGVSYGTITTTNPHNMSVGNRIFVDYTPTMNNTNKQYVVRQYKGIEEIVITQTGSGYNSDIPPTLIIDGDGNSGALSAVVNSVGAIEKVDIVNSGSGYTKNPRVILSHPQVFKKADYYVSALNNNDNVKVNDVQLLPNKSAYVCGTTKNAAGNKDVAFIAKISATGSKEWEKTLESDDGEDFAEFQRIYADGTNIWVVGINKPNQSAVAAYNPDIILCKYVEAANGLSATLGFQKGYAGISGSTRADEVTSIIKYSDTRFIIGGFTNTNSSNPYDAFIASIDTSGNFAIKRK
Physico‐chemical
properties
protein length:1997 AA
molecular weight: 213332,66130 Da
isoelectric point:4,58386
aromaticity:0,09114
hydropathy:-0,15573

Domains

Domains [InterPro]
DC_0042
ATT
1–438
DC_0042 DC_1338 DC_1157
DC_0832
ATT
422–543
DC_0832 IPR023366 DC_0695 IPR025924
DC_0115
STR
1473–1995
DC_0115
AGH56085.1
1 1997
Architecture
ATT
ATT
STR
ATT 1-543 | ATT 670-1507 | STR 1508-1995 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage Syn30
[NCBI] 		536474 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Leucotheavirus > Leucotheavirus syn30
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AGH56085.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
HQ634189 [NCBI]
CDS location
range 1 -> 5991
strand -
CDS
ATGAGTAACGTCAATAAGGTCTCGCAATCGGTCAACGCTATTAGTCCCGATTTTATTAGATCAGACTATCCACTTTTCAATAAGTTTATTGAGTATTACTATAGGTCTCAAGAAAAAACGGGCTTGGGACAAAATATTGTTAATGAATTCATTCAATATCTTGATATCGACAAACTTGATATCGGTATCTTGGACGGGGGTACGCAAGTTGTAGAACCTATTACTACAACTTCAACATCTATTGTTGTAGAGAGTGTTGATCAGTTTGTAGAAAAAAATGGTTCTATTTTAATTGGTGATGAAGTAATTTATTATGAAAGTACAAAATCAGCACCAAACATTGCTCTCAGTCCTGGTATTTCCTATGAGCAAGTAAAATTAAAGTGGACTGTTGCTGAGAGTCAAATTGATTCGTATGATGGAACAACTAGGATCTTTCCATTAAGAACTGCTGGTAATCCTGCAGCACCACCAACACCTCAGCATTTAGTTGTTAGTCTTTATGGACAGATTTTAATTCCTGGAGTTGATTATACTGTTAGTGGAACGAATATTGTATATACAACTGCTCCTAGAACTAGAATTCCTGCAGACTCTAGTGATTTAACTTATATCTTCTATCTTGGTGGTTTTATTGAAAATAATATCCTTGAGATTGATGATATTTCTGGTTCTTTTGGAGAAGGTAAAACTTCTTTCAAAATGACAAGATCGGGTATTCCTTATGAACCCATTGTAGATGAGTTTCTCATTGCAATCTATGATAATCAATTGTTGATCCCTAAACAAGATTTTTATATTGATAGAGATTATTTCATTTTTGAAAATGCTCCTCTGAATGGACGAAAACTTGCATTATTCTCAATTGAAGCACCTATTCCTTCTTTTGGTGCAAATGCAGTTGGTTTTGCTCGTGTAAATGATGATGGTAATTTAACTTCTATTTCTACTAGTGTTAGTGGATCAAATTATAGATTTGAGTATCCTCCTAAGGTAACTATTAACTCTGAGTCGGGATTTGGTGCTTCGGCAGCAACTCTGGTTAATGGAGTTAAAAGTTCTACCCTTCTGCATGGTGGTAAAGGATATAGCGATACAAACCCACCTGCGGTTATCGTAGAGGTTCCTACAAAGGCAGGATCTGTTCCTGCACAATTAAAAGCAACTGTCACGAATGGTTCTGTATCTTCACTGGAGGTCGTTAGTTCTGGTAGTGGATATACTTTTACTCCTAGAGTCACATTCAAACAACCTGGTGGAGCAAAATTAGGAACTCTGACTATTGGTGGCGGTCAAGTTACAGGCGTTGTTCCCATTGTTGATGGTGGATCTGGATATACCACACCTCCTGCAATTTATGTTGACGAACCTACTGGAGATAACTCCATTAAGGCATCATTCCAAGCAGTTCTTACTAATGGTGTAGTTACCTCTATCAATATTCTTAATAGAGGTCAAGGATACGAAACCACTCCTAGAGTTGCTATTATCGATCCTGTTGGCGCTCAAGTTCTTCAAACTCGCGTTGATGGAGATGGACGTGTTGTTGGTATTGATCTTCTTGATGGGGGATCTGGATACGATGATGTCCCTTCTGTTTATATTGTAGATAATCGTCAAAATGGTGGAAGTGGAGCAACTGCAACTGCCTCTATTTTCAATGGTAAAATTACTGATATTAATGTATCGGCATTTGGTAGTGGATATAGTGCTGCAGAACCTCCTGAAATTTTTATTCAAGAACCTCCTAATGCTAGAGCGTCTGTAGATATTGGTCTGAATGAAGTAACTGGTTATAAAATTAATAAGCAAGGTAGCGGATACTCAAAGGCATCTTTCGAGGGTTGTGCTAGAGCTGCTAGTGGTATTGTTAAGTATACTGAAGATGGTAACGCAGTATTTTCTAACAATACAACTGCAGCGGCAGCAACTGCAGATACTCCTGTTAAATGTCTAGACGCTCTCTTTATTAAACGACTTCTTGATAAGTATACGGAACAATTCCTTCCCGACGTTCCTGAACTTGACTATACTAAGATTGATGTTAGAAATGCAATTAAAAGTGTAAGAGATTTCTATACTTCTAAAGGTACTTCTTTCAGTATTTCATATCTGTTCAAACTCCTCTATGGTGAAGAAGTTAGCGTAACTTATCCCAAAGATCAGATTATCAAACCATCTGCATCTACATGGTCAATTGATACTGTTTTAAGAGCAGTTTTAGTATCTGGTAATCCTATCAATATTAGAGATGGTTTACTGCAGCAAGATGCCGATATTGCAGATCCTAATATTTTAGCGGCAAGTGCTCTGGTAGAAAATTATATTGCTATTAGAACATCTGAAACTGAAATTTATGAATTGGTTCTCTCCGAAGAAACTATTCAGGGTAAATTTGTAGTTCCTTATAAAACAAAGTTAGCAGAACCTCTTTCTACCACTGATAGTATTATCACTGTAGACTCTACAATTGGTTGGCCAGAAAGAAACGGACAATTCTTGATTGGTGGAACTGAAGTTGTACAATATAAAGAAAAATCCCTAAACCAGTTTATTGAATGTACTCGTGGTGCTACTGTTAGTGGACCTGCTCAAGTTTGGGACTCTGCTACAGAGGTAACTTCAAACTTTAATGTCTACATCAATAAAGGAACTGATAGAGAAGTTCTCATGAGAGTTGTTGGTATCGTTGATGCCGAACAAACGACTCTTACTGATACTGGATCATACTATCTTCCTGGCGATAAATTATCAATTTCTAAGTTAGGTGGTACTGGTAATACTGCTGATCTTTCGACTTGGTTATACAACGTTAAAAAATTAATTGAAGTTACTTCTATTACTTTTGATGGTAATATTGCAGAAGTTACTTGCTCAAATAATCATGGTTTGTTGGTTGGTGACCAGATTTCAATTTATGGTGCAAATCCAATCATTTATAATGGAACATTCTTAGTTAAGAATAGAACTAGTCCTACCGTATTTAAATACGAATTGCCTCAACCCCCTGCTGTTGCTCCACAGGGTAATATTCTAGTTTCTATTGACCTCAACAAAGGTAAGTCTGACAATTCTGCTGTATTTAACGCTATTAGTCCATATACGACTAATATTCAAAATACTTTCTTCAATGATGATTACGTTTATGTTGCATCAACAGGTATTCCCAACTATAAAATTGGACCCTTTCCTGGATCTGCACTTTTACCTGGCAACCAACGTAAATTAAATAGATTCCCTAGAGTATCGACTACAATTTCATCTAAAAATACTATTAACCCTGGTCCTATTGGTACATGGGTTAATGGTGTTTCAATTTGGTCATACAAATCTTCTATTACCAAAACTTTTGGTTCTGTTACCAGTATTACTATTGACAATGTTGGTCGTAACTATGATGCTGCATCTCCACCAACCGCAACTATTTCTGGTGGTGCTGGATCTGGTGCTACAGCAGAGGTTGTAGTTAATGGTTCTCTGGATAGTATTGATGTTACCGCAGGTGGCAGTGGTTATACTTCTTCCCCATTAGTCGCTATTGTTGGCGGCGGTGGAACTGGCGCATCTGCTACTGCGATTATTACTAAGGGTGCAGTTTCTAGAATTCTTATCAATGAGGGCGGTACTGGATATACATCTCAACCTCAAATATCCATTGTTGGTGGTGGAGGAGCGGGAGCAACTGCTACGGCAGCAGTTAGAGGTCCCATTCAATCAATCAATGTCACCAATGGTGGTGCATCATATACTTCTGAACCAAGTGTAACTCTCAGTTCTGGTAGTGGTGCTGTTGCTCAACCAATTGTTAATAATGGTCGAATTATTTCTATTGCTATTATTGCTGCTGGTTCTGGATATACCACAGCACCTGAAGTTACTATTCAAGGTGTTGGTTTTGGCGCAGTAGCAAAAGCAAATATTGATACCGATGGTGAAAATGCTGGTAGGGTCACTAGTATTGATATTATCAACAGAGGTATTGGTTATGTACAAGGAACTACCTTAATCAATTTGAATTCTGTTGGTGAAGGTGCATTGTTTACTTCAAATGTATTCCAGTGGACTTACAACCTTCAAAATTCTACAACTTTTGATGCTGCTCAAGGTGGTGTATTTGAAGGATTTAATAATCAATATGGTGGCGAATATGCTCATCTTTCTACTCCAAAGAAACTTAGAGAAGTATTGGGTGATGGTGTAGAAACTCTTGGTGATGGAACACTTCAAGAAATTACCGATCATGCAGTTCACTCTCCCATTATTGGTTGGGCGTTTGATGGTAATCCAATTTACGGACCTTATGCATATCAAGATCCCACCGATCAGCAGTCTAGTATTGTAAGACTTGGTTCTTCTTATAGAGTAAAACCATCTTTAATCTATGATGAGAATACTAACATTTCTCCTCAAAGAACCGATGGTCCTGCTTTGAGCGATGAACCTGCAGGTACGTTTGTTGAAGACTATGAGTATATCTTCAACTTAGGTGAACTGGATCAATATAACGGACGTTTCTGTAAAACTCCAGAATATCCTGAAGGCAGATATTGTTATTTTGTCACTATCGATAATAGTGATGCTGGTGTACCTGTATTCCCATATGTTCTTGGACCTACTTTCAATTCGGTTGTAGATTCTTGGAATTTGGTCTCAGATGCTGTTCAGCAAAATATTCCTACTGGTGTTGTAAGATATCGCGATCCATACGAGAACGTTGATATTGATGTTGAGAGAACACCTAATGCATCTACCAATCAGTTGACTCTGGAAGATGGTTCATTATTATTGTTTGAAGTGGAAGATGAAAACCGAGATGGCGTAATCACTGCAGATGAAACTGCTGATCCCGACTCTGTTTTGGAAGAATCGCCCTTACAATTGTTTGATTATTTCCCTGCTGTTAAATTTGACTCTAAGGTCGATATTGAAGTTGAAACTATCACTAAATTTGAGGATGCTTCTGTAACAGGATTTTCTATCGAAAACCCAGGCAAAAACTA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Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
644f1fd6ff31a75e5441cbc02abfc15256764e6ba194ab0a1710209552334045
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7888
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
The Genome Sequence of Cyanophage Syn30 Henn,M.R., Sullivan,M.S., Osburne,M.S., Levin,J., Malboeuf,C., Casali,M., Russ,C., Lennon,N., Chapman,S.B., Erlich,R., Young,S.K., Yandava,C., Zeng,Q., Alvarado,L., Anderson,S., Berlin,A., Chen,Z., Freedman,E., Gellesch,M., Goldberg,J., Green,L., Griggs,A., Gujja,S., Heilman,E.R., Heiman,D., Hollinger,A., Howarth,C., Larson,L., Mehta,T., Pearson,M., Roberts,A., Ryan,E., Saif,S., Shea,T., Shenoy,N., Sisk,P., Stolte,C., Sykes,S., White,J., Yu,Q., Coleman,M.L., Huang,K.H., Weigele,P.R., DeFrancesco,A.S., Kern,S.E., Thompson,L.R., Fu,R., Hombeck,B., Chisholm,S.W., Haas,B., Nusbaum,C. and Birren,B. 2011-09-23 — GenBank