Protein

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Genbank accession
YP_009798320.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,84
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,85
Protein sequence
MSRSSFVEVNITNPTKLAQDSQDTANTAVKGVTDLNDPNLMSVIEKQNNVVQFAGLTSQYNVLVQNAKDEGINTDSLTTAYNNLNKFMIDVLTDPDHASDVDRKTYKNYQDAYNSELAKIQTALKNNTDSKFTSAASATSQAASTASQAASQAQSAVDYTNSQIASQASAVSEASKSASEASSQANSALDTATSATAEITKLKGGSTLTIAELENGLGTKVSNDTFTTYQTQTASQFAETVKEADFQTYQTQTSKLIEAKVDNGTYQTDKTQTAKDIASKVSSSDFESYQTQTDGMIASKVSKKDANNVNLIPYSSNFSDSLEGWQLAGWGATDKKLLVTTHTFYQNGTGKLLYLNTAQNATCAAGSLRFSVLPNTKYTFQFKAFASSNVIGANVFFLSRSYGSTSDYDTVHGLFKNLVTSPSHIDQYTVTFTTGANDNEGYIRVDNIGSNNGASSGLFFTELKMEPGDTATNYIYGGQDSMISQTINDVLIKVSKDDLIDEINLQAGNTLISSSGQLTLSGKSVFLDSVDPVIMKSANIDTLLVGKKLTAADIAANTFTTNNGTFTVDSNGLVTATSLIIRGSTNLVYNSSLSGGNGTYIPGWNMNGEGYYSDTVLYDGLPAIAWASTTTGWDNYATTYYQPVTQTGIPYSASGTFRDYGSASGMSFQCALAFFTDKNSNSRISGFKGFNYTATGGDSGSIYFTIDNVVAPSNAKYVALQFWAYNGKGHVAWSQPMLTQTAHSTGYQPDAGNVVSAGTVLGSIISGSTINATTFHGGDLINNANNTSNFYPFTIEPTGKASTTLFNSMDALRTEMSGGGLRTMYRAINASGSQYEAYDGNFSGDAISLNSGFTNGKDTSFSQSVSGNQLTGQVVLSPLNGIHLWGSTQSIHFSGLQMNGTGVTFNSYGNIIADQASTWWRVTNFSGSDIANFGTDTSGNNPIQFNRELDVGNIQINTGHTVTSADKGAIHFAKGGGGTVDIYAGAVHYTSLVNSSLLSVKRDVKKADTAYWAQLVNAIDLATYQYKTDDNTSHIRLSGIVDDVNETKQWQLPDIFINRDENGKLSGVDNSVLLNAALATIQEQQKQISALNGHNMELESRLNKLEDKLNE
Physico‐chemical
properties
protein length:1111 AA
molecular weight: 118854,92890 Da
isoelectric point:4,87033
aromaticity:0,09181
hydropathy:-0,34095

Domains

Domains [InterPro]
DC_1418
STR
3–582
DC_1418 DC_1194
IPR030392
CHP
996–1095
IPR030392
Coil
Unmapped
1081–1108
Coil
YP_009798320.1
1 1111
Architecture
STR
STR
STR 3-582 | STR 713-1104 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Lactobacillus phage Nyseid
[NCBI] 		2079432 Uroviricota > Caudoviricetes > Tybeckvirinae > Lenusvirus nyseid >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_009798320.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_047925.1 [NCBI]
CDS location
range 51002 -> 54337
strand -
CDS
ATGTCAAGAAGTTCATTTGTCGAAGTTAATATTACCAATCCGACAAAACTTGCACAGGACTCCCAAGACACAGCAAACACTGCTGTAAAAGGAGTTACGGATTTAAATGATCCTAACTTGATGTCTGTGATTGAAAAACAAAATAACGTCGTACAATTTGCGGGATTGACGTCACAATACAATGTACTTGTTCAAAATGCAAAGGATGAAGGAATCAATACAGATTCTTTAACCACCGCATATAATAATTTAAACAAGTTCATGATTGATGTGTTGACAGATCCAGATCACGCCAGTGATGTAGATCGAAAGACTTATAAAAATTATCAAGACGCCTATAATTCAGAACTTGCAAAGATACAAACAGCCTTAAAGAATAATACAGACAGTAAGTTTACAAGTGCAGCTAGTGCCACTAGTCAAGCAGCGTCGACAGCCAGTCAGGCGGCCAGTCAAGCACAATCTGCTGTTGATTACACCAACAGTCAGATTGCTTCACAAGCAAGTGCTGTTTCAGAAGCTTCTAAGAGCGCTTCCGAAGCTTCATCGCAAGCTAATAGCGCTCTTGACACTGCCACTAGCGCCACTGCTGAAATCACAAAACTAAAAGGTGGCTCAACCTTAACCATTGCAGAATTAGAGAATGGTTTGGGTACGAAGGTTTCTAACGATACATTCACAACGTACCAGACACAAACTGCTAGTCAGTTTGCGGAGACAGTTAAAGAGGCCGACTTTCAAACTTACCAAACTCAAACAAGCAAATTGATTGAGGCAAAGGTTGATAACGGAACTTATCAAACAGACAAAACTCAAACGGCTAAAGATATTGCTTCAAAAGTTTCTTCTAGCGATTTTGAATCTTATCAAACGCAAACAGATGGTATGATTGCCAGCAAGGTTTCTAAGAAAGACGCCAACAACGTTAACTTAATACCTTACTCTAGCAACTTTTCAGATTCTTTAGAAGGTTGGCAATTAGCGGGCTGGGGAGCAACTGATAAAAAACTATTGGTAACTACTCACACTTTCTACCAAAATGGTACTGGAAAGCTATTATACCTCAATACAGCGCAGAACGCAACTTGCGCCGCTGGCTCATTACGTTTTTCAGTATTACCAAACACAAAGTATACGTTCCAATTTAAAGCGTTTGCTTCATCTAATGTTATTGGGGCCAATGTATTTTTCCTGTCACGTTCTTATGGTTCCACCAGTGATTATGATACAGTCCATGGTTTATTCAAGAATCTGGTAACTTCTCCGTCACATATAGACCAGTATACAGTTACGTTTACGACTGGTGCTAATGACAATGAGGGTTATATCAGAGTTGATAATATCGGTTCTAACAATGGAGCTTCTTCTGGCTTATTCTTTACTGAGCTAAAGATGGAACCAGGTGACACTGCGACAAACTATATTTATGGTGGTCAAGACTCCATGATTTCACAGACAATTAACGACGTGTTAATTAAGGTGTCAAAAGACGACCTAATTGACGAAATCAACTTACAAGCTGGTAACACTTTGATTTCATCTAGTGGTCAATTAACATTATCTGGAAAAAGTGTTTTCCTTGATAGTGTCGACCCTGTTATTATGAAAAGCGCGAATATTGACACACTCCTTGTTGGCAAGAAATTGACAGCGGCTGACATCGCGGCCAATACTTTTACGACTAACAACGGGACTTTCACAGTAGACTCGAACGGTCTTGTCACCGCCACAAGTTTAATCATTCGTGGTTCAACAAACTTAGTTTATAATTCATCGTTGTCTGGCGGCAACGGGACATATATTCCTGGTTGGAATATGAATGGTGAAGGTTACTATTCCGACACCGTTTTATACGATGGTTTGCCAGCTATAGCCTGGGCAAGCACGACGACAGGTTGGGATAATTACGCGACGACCTATTATCAGCCTGTGACACAGACTGGTATTCCGTATAGTGCTTCTGGAACTTTCAGAGACTACGGTTCTGCTAGTGGAATGTCGTTCCAATGTGCTCTAGCGTTCTTCACTGATAAGAATAGTAATTCACGTATTAGTGGTTTTAAGGGGTTTAACTACACAGCAACTGGTGGGGATAGTGGCAGTATTTATTTCACCATTGATAACGTGGTCGCCCCAAGCAACGCCAAGTACGTGGCTTTGCAATTTTGGGCTTATAACGGTAAGGGACACGTCGCGTGGAGTCAACCAATGTTGACACAAACTGCTCATTCAACTGGCTACCAACCAGACGCCGGTAATGTTGTTAGTGCCGGTACTGTTTTAGGTAGTATCATTAGCGGTTCAACCATTAATGCAACTACTTTTCACGGTGGAGACCTTATCAATAATGCTAATAATACTAGTAATTTTTATCCGTTTACCATCGAACCTACTGGCAAAGCTTCTACGACGTTATTTAACTCGATGGACGCTCTAAGGACAGAGATGAGTGGTGGCGGTTTAAGAACTATGTACCGTGCTATAAATGCTTCTGGTAGTCAATACGAGGCTTATGATGGTAACTTTAGTGGTGATGCAATCTCGCTAAACTCTGGATTTACGAATGGTAAAGACACGTCGTTCTCGCAATCTGTTTCTGGTAATCAACTAACAGGTCAAGTTGTTCTTAGCCCACTAAACGGAATCCACCTGTGGGGTAGCACACAATCTATTCATTTTAGCGGTCTTCAAATGAATGGCACAGGTGTTACGTTTAACAGTTATGGAAATATCATTGCAGACCAAGCTTCTACTTGGTGGCGAGTTACCAATTTTTCAGGATCTGATATTGCGAACTTTGGTACAGACACGTCTGGAAACAATCCTATTCAGTTTAATCGCGAACTAGACGTCGGAAATATCCAGATTAATACTGGTCACACAGTTACTAGTGCTGATAAGGGCGCTATCCACTTTGCTAAAGGCGGAGGTGGAACTGTTGATATTTATGCTGGTGCAGTTCATTACACAAGCCTTGTTAATTCATCACTACTTAGTGTTAAGCGAGACGTAAAGAAAGCAGATACTGCTTACTGGGCACAATTAGTTAATGCGATTGATTTAGCAACCTATCAATATAAAACAGATGATAACACCAGTCACATTAGGTTGTCTGGTATCGTTGATGACGTTAACGAAACAAAGCAGTGGCAGTTACCAGACATTTTTATTAATCGTGATGAAAATGGAAAACTAAGCGGTGTTGATAACAGTGTGCTGTTAAATGCCGCTTTAGCAACTATCCAAGAACAACAAAAACAAATTTCTGCCTTGAACGGCCATAATATGGAACTAGAATCAAGGTTAAACAAACTGGAGGACAAATTAAATGAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
752744486e5a0e4e2cbe1d461dc618319a48d12b68919c327a95578f0fc7bee5
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6085
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Lactobacillus phages that infect wine-derived L. plantarum strains Kyrkou,I. and Hestbjerg Hansen,L. 2018-12-03 — GenBank