Protein
View in Explore- Genbank accession
- UPI30851.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TFTFTF
- Protein sequence
-
MARSAFVEVNITNPTKLAQDSQDTADKAVQGVTDLNDPNLMSVIEKQNNVVQFAGLTSQYNVLVQNAKDEGIDTTAVTTAYNNLSKFMADVLADPDHASDVDRVTYKKYQDAYNEELAKLQSALQNNANNKFNSAANATSQAASTASQAASQAQSAVDYTNSQIASQASAVSEASKNASEASSQANSALDMASGANTEITKLKGGSTLTIAELEDGLGKKVSNDTFTTYQTQTASQFAETVKEADFTTYQTQTSKLIESKVDNGTYQTDKTQTAKDIASKVSSSDFETYQTQTDGMIASKVSKKDANNVNLIPYSSNFSDSLEGWQLMAWGATDRKLLVTTHSFYKNGTGKLLYLNTAQNATSAAGSLRFSVLPNTKYTFQFKAFASSNVVGANVYFLSRAYGSTSDYDTAHGLFNNLVTSPSHIDQYTVTFTTGANDNEGYIRVDNIGSNNGASSGLFFTELKMEPGDTATNYIYGGQDSMISQMSNDIILRVTKDDLIDQINIQAGNTLISSSGQLTLSGKSVFLDSIDPVIMKSANIDTLLVGKKLTAADIAANTFTTNNGTFTVDSNGLVTATSLIIRGSTNLVYNASLSGGNGSYIPGWGISNNGYYSNQVLHDGVPSIGYHNNTGAGVWANFAQSKLYSLNGKTGLPYSASVWFLEVGSDTNLKYQFTLAFFDANGNRLDSGFIGNTWNGIGSRQDWRYVTINNAISPSNAVYVAIQYWAYNGSGYGLFSSPMLTQTAQSTGYQPDTGNVVSAGTVLGSTISGSTINATTFHGGDLINNANNTSNFYPFTIEPTGKASTTLFNSMDALRTEMSGGGLRTMYRAINASGSQYEAYDGNFSGDAISLNSGFTNGKDTSFSQSVSGNQLTGQVVLSPLNGIHLWGSTQSIHFSGLQMNGTGVTFNSYGNIIADQASTWWRVTNFSGSDIANFGTDTSGNNPIQFNRELDIGNIQINTGHTVTSADKGAIHFAKGGGGTVDIYAGAVHYTSLVNSSLLSVKRDVKKADTAYWAQLVNAIDLATYQYKTDDNTSHIRLSGIVDDVNETKQWQLPDIFINRDENGKLSGVDNSVLLNAALATIQEQQKQISALNGHNMELESRLNKLEGKLNE
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1113 AA molecular weight: 119215,38340 Da isoelectric point: 4,92205 aromaticity: 0,09075 hydropathy: -0,34412
Domains
Domains [InterPro]
Coil
Unmapped
106–130
Unmapped
106–130
IPR030392
CHP
998–1097
CHP
998–1097
DC_1334
RBD
1024–1113
RBD
1024–1113
1
1113
Architecture
STR 198-1041 | RBD 1042-1113
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Lactiplantibacillus phage Gut-P1 [NCBI] |
2933275 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host |
Lactiplantibacillus plantarum [NCBI] |
1590 | cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Bacillota > Bacilli > Lactobacillales |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
UPI30851.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
ON117106.1
[NCBI]
CDS location
range 55820 -> 59161
strand -
strand -
CDS
ATGGCAAGAAGTGCATTTGTCGAAGTTAATATTACTAATCCTACCAAACTAGCACAAGATTCACAAGACACTGCCGACAAAGCAGTTCAGGGTGTTACAGATTTAAATGACCCTAATTTAATGTCTGTGATTGAAAAGCAGAACAACGTCGTGCAATTTGCTGGTTTAACATCTCAGTATAACGTTCTTGTACAGAACGCCAAAGATGAGGGGATTGACACAACTGCTGTAACCACAGCGTATAACAACTTAAGCAAATTTATGGCTGACGTTCTGGCAGACCCTGACCATGCTAGTGACGTTGACCGTGTAACATACAAAAAATATCAGGACGCTTACAACGAAGAGTTAGCAAAGCTTCAAAGTGCCCTGCAAAATAACGCTAACAACAAATTTAATAGTGCCGCCAATGCCACAAGTCAGGCGGCTTCAACAGCTAGTCAAGCAGCTAGTCAAGCACAGTCTGCTGTTGATTACACCAACAGTCAGATTGCTTCACAAGCAAGTGCCGTTTCAGAAGCTTCTAAGAATGCTTCCGAAGCTTCGTCACAAGCTAACAGCGCTCTTGATATGGCGAGTGGTGCAAACACTGAAATCACCAAGTTAAAAGGTGGTTCAACCTTAACCATCGCAGAGCTAGAAGACGGTCTAGGTAAAAAAGTTTCTAATGATACATTCACAACGTATCAAACACAAACTGCTAGTCAGTTCGCAGAAACAGTTAAAGAAGCTGACTTTACAACTTACCAAACTCAAACTAGTAAGTTAATCGAATCGAAGGTTGATAACGGAACTTACCAGACAGATAAGACACAAACAGCTAAAGACATTGCTTCAAAAGTTTCTTCTAGCGATTTTGAGACTTATCAAACACAAACAGATGGCATGATTGCCAGTAAGGTTTCTAAGAAAGACGCTAATAATGTCAACTTAATACCTTACTCTAGCAACTTTTCAGATTCATTAGAAGGTTGGCAATTAATGGCATGGGGTGCAACTGATAGAAAACTATTGGTAACTACTCACAGTTTCTATAAAAATGGAACTGGGAAGTTATTATACCTCAATACAGCACAGAACGCAACTTCTGCCGCTGGTTCATTACGTTTCTCGGTATTACCAAATACTAAATACACGTTCCAATTTAAGGCGTTTGCTTCATCTAACGTTGTTGGAGCTAATGTGTATTTCTTGTCACGTGCTTATGGTTCGACCAGTGATTACGACACAGCTCATGGCCTATTTAATAATCTAGTGACTTCTCCATCGCATATTGACCAGTACACAGTTACATTTACAACTGGGGCTAATGATAATGAAGGTTATATCAGAGTTGATAATATAGGTTCTAATAACGGAGCTTCTTCTGGTTTGTTCTTTACTGAACTCAAAATGGAGCCGGGTGATACTGCAACGAATTATATTTACGGTGGTCAAGATTCTATGATTTCTCAAATGTCTAATGACATTATTTTAAGAGTAACCAAAGACGACTTGATTGACCAAATCAATATTCAGGCCGGTAACACCTTAATTTCATCTAGTGGTCAGCTAACATTATCTGGTAAAAGTGTTTTTCTTGATAGTATTGACCCCGTTATTATGAAAAGTGCTAATATCGACACGCTCCTTGTTGGTAAAAAATTAACAGCGGCAGACATTGCGGCCAATACTTTTACAACTAACAATGGAACTTTCACGGTAGACTCAAATGGTCTTGTCACAGCCACAAGTTTAATTATTCGTGGTTCCACAAACCTAGTTTATAACGCGTCATTATCTGGTGGTAACGGTTCATATATCCCGGGGTGGGGTATAAGTAATAATGGATATTATTCAAACCAAGTGTTACACGATGGCGTGCCATCTATTGGATATCATAACAACACAGGCGCTGGGGTTTGGGCAAACTTTGCCCAATCTAAACTATATTCATTAAATGGTAAAACTGGTCTTCCTTATAGTGCGTCAGTTTGGTTCCTTGAGGTTGGTAGTGATACAAACCTCAAGTATCAATTTACACTGGCCTTCTTTGATGCCAACGGTAACCGATTGGATAGTGGATTTATTGGTAACACGTGGAACGGCATTGGCTCACGACAGGATTGGCGTTATGTGACAATCAATAATGCAATCTCACCAAGCAATGCAGTATACGTCGCCATCCAATATTGGGCTTATAACGGTAGTGGATATGGCTTGTTTAGCTCACCTATGCTAACTCAGACTGCACAATCAACTGGTTACCAGCCAGATACAGGTAATGTCGTTAGTGCTGGTACTGTTTTAGGTAGTACCATTAGCGGTTCAACCATCAATGCGACTACTTTTCACGGTGGCGACCTTATCAACAATGCTAATAACACCAGCAATTTCTATCCGTTTACTATCGAGCCTACTGGTAAAGCTTCTACGACGTTGTTTAACTCGATGGACGCCCTAAGGACAGAGATGAGTGGTGGCGGTTTAAGAACCATGTATCGTGCTATAAATGCTTCTGGTAGTCAATACGAGGCTTATGATGGTAACTTTAGTGGTGATGCAATCTCGCTAAACTCTGGATTTACGAATGGTAAAGATACGTCGTTCTCGCAATCTGTTTCTGGTAATCAACTAACGGGTCAGGTTGTTCTTAGCCCACTAAACGGAATCCACCTGTGGGGTAGCACACAATCTATTCATTTTAGCGGGCTTCAAATGAATGGTACAGGTGTTACGTTTAACAGTTATGGAAATATCATTGCAGACCAAGCTTCTACTTGGTGGCGAGTTACCAATTTTTCAGGGTCTGATATTGCGAACTTTGGTACAGATACATCTGGAAACAACCCTATTCAGTTTAATCGCGAACTAGACATCGGAAATATTCAGATTAATACTGGTCACACAGTTACTAGTGCTGACAAGGGCGCTATTCACTTTGCTAAAGGTGGGGGCGGAACTGTTGATATTTACGCTGGCGCAGTTCATTACACAAGCCTTGTTAATTCATCACTACTTAGTGTTAAACGAGACGTAAAGAAAGCAGATACTGCTTACTGGGCACAATTAGTTAATGCGATTGATTTAGCAACCTATCAATATAAAACAGATGATAACACCAGTCACATTAGGTTGTCTGGTATTGTTGATGACGTTAACGAAACAAAGCAGTGGCAGTTACCAGACATTTTTATTAATCGTGATGAAAATGGAAAACTAAGCGGTGTTGATAACAGTGTACTGTTGAATGCCGCTTTAGCAACTATCCAAGAACAACAAAAACAAATTTCTGCCTTGAACGGCCATAATATGGAACTAGAATCAAGGTTAAACAAACTGGAGGGCAAATTAAATGAATAA
Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
ce81343b39960b6e239de2bb3bd534c65893051a6f1d2bc680689dafd3ac075c
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50