Protein

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Genbank accession
QBX25313.1 [GenBank]
Protein name
tail assembly protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,91
Protein sequence
MQIVVHDNKMRKVTILNNRIQKSLSFSNDSWHRYLAQGVNTFDFVIPKFYNGKIHDDVDYITDDAHFSFRYRNRNYVFYVETLTQDDFSFTLSCNDRNLELTKEQANPFTSDKAQKFEWYLENMGLLALAGMKLGNNEIGNLTRTLSFENQETKLARLQSLCAEFDAEFEFVNELNKDGSFKQTLLNVYHEADDTHHSVGRLRNDVLLRYGKDVKGVQVVSDKSQLFNAGRFTGADGLTIKDLEKSVKDEDGREEFYTRKGNDMIYAPLSADKYPSKLTNGDNWTRKDFSTEYTNANDLLAYALKTIKQYAYPILTYTATIQSNFLSNYDDLELGDTVKIIDNNFKDGLLLQARVSEQVISFSNPNNNSLVFSNYVKLKNQISDALKARMARLAEEAQPYTIKFSSDNGMTFKNHKGETTVIATLQKGSRDIKANWKWSVNNELLSSTDSLTISASGFEKTLTVAVAAIVGGQVVTTDQITFTNVNDGAGIKKITPLYGSSEDGETTNNWSTNAKAATKSEPYVLGKFITELTDGTQIETNNFVAAVRSPEFDEVERFKQGIYKEIEEVDAQLAAQSEAHNQAVAEILAQATSVEDLASEAKRIGQQAIANAISVANQLSTARQALQSEIETAKTQAGDVAKDLLTQAEQLNAQATKQEELTKLTTETKKLVDGQITTISELSKTVAQNGKDITSVQSRTKTVEDTLSGTKITLEQVKVTSDTVKSNLAEYKVSNDGAVAGLRQSIKDANGNISDLKTLVGLVPGKISAAVEAVEAKIPTVFGGRNLAQKTSSDWSTPYTAFSGIANTCPQLYRVLTDGLSVGDTLKSRILLKYTNVVPASGQTAMIWLQGSGNVTSWNAGSYSGSPKKTISGSGEIVFEHEFKINADHLKNSYWNWQFRTDYIASGSLEWKLAKVESGDVFTAWSPAPEDAIEEISSVKSELKLTKEGLTGYFNKTDSNASSISTHTNQISALNNALSAKVSTTDYNKLTDRVSSAESAISVQAGEISKRLTSTQVESAITAKGYQTKAQVDSNITGRGYITSSALQPYATMTALENKVTETAGEYTRLISETKALIPSGEPNLVPNGRPEDGVTEMGNVDVVTHGFYYNSNQKLYRLTTSDTSEITQSFRYFPVERNTDYTLYFKGFNNSAVIHMDVWFLRRVKGSTNTWDNAQKLIDSRKLSISRAEEITVTFNTGGYDEGYIRFDNNGTTVKGTRADLYFGDVCVKKGKSNNGWSPAVADLTTVTAFNKVSETVDEYKRLISSGGSLSKAIQSAEKFEQSIASGGDIYQAIQTAKGLATTVSGANGLSTQVSQLAGSYAIKNLTSSGTVLNQLNLNKDGSVKIDGSLVRITGKTVIDNAVIKSAMIADGQIGTAQIGTIDGATANIININAKNISADGLSGNIIKGGTLRSTNNATNFDLVNGKLNFDTDTASVRRVTSGIPTQFVKFLKSSNGALTVIGSNRDGSESADNDSFAGFKIYSSSTTEVSEIISDQIYFLTGTNNRRGWQMSTITGADNKQISLFPTGDPTKSLIYASDYYIKRNGKNIALIDFITYVNACLKHLQNYTGRTDIWNDFAI
Physico‐chemical
properties
protein length:1582 AA
molecular weight: 173323,02400 Da
isoelectric point:5,71717
aromaticity:0,08407
hydropathy:-0,40291

Domains

Domains [InterPro]
DC_0266
STR
1–672
DC_0266 DC_0899 DC_1626
IPR010572
ENZ
138–376
IPR010572 Coil Coil
Coil
Unmapped
148–168
Coil
QBX25313.1
1 1582
Architecture
STR
STR
RBD
STR 1-672 | STR 833-1133 | RBD 1161-1580 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Streptococcus phage Javan252
[NCBI] 		2548072 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Streptococcus henryi
[NCBI] 		439219 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Bacillota > Bacilli > Lactobacillales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QBX25313.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MK448885 [NCBI]
CDS location
range 29878 -> 34626
strand +
CDS
TTGCAAATTGTAGTTCATGATAACAAAATGCGCAAAGTTACGATTTTGAATAATCGAATCCAAAAATCGCTCTCTTTTTCTAACGATAGCTGGCATAGATATTTGGCTCAAGGGGTCAATACATTTGATTTTGTTATCCCAAAATTTTATAACGGAAAAATACATGATGATGTCGATTATATCACTGACGACGCACATTTTTCTTTCCGTTATCGCAACCGTAACTACGTTTTTTATGTGGAAACACTAACGCAAGACGATTTTAGTTTTACGCTTTCTTGTAACGACCGAAACCTTGAACTAACCAAGGAACAAGCTAATCCATTTACAAGTGATAAAGCCCAGAAATTCGAGTGGTACCTTGAAAATATGGGCTTGCTTGCTCTCGCTGGGATGAAACTCGGAAACAACGAAATCGGCAACTTAACTAGAACTTTGTCGTTTGAAAATCAAGAAACTAAGCTTGCGCGATTGCAATCCCTTTGCGCAGAATTTGACGCAGAATTTGAATTCGTTAACGAACTTAACAAAGATGGCTCGTTTAAGCAGACGCTACTCAATGTCTACCACGAAGCGGACGATACCCATCATAGTGTGGGTCGTCTTAGAAATGATGTTTTGCTACGTTATGGCAAAGATGTTAAGGGAGTGCAAGTTGTTTCTGATAAGTCGCAATTATTTAATGCAGGTAGATTTACTGGGGCTGATGGGCTAACCATAAAAGACCTTGAAAAGTCTGTAAAAGACGAAGACGGGCGTGAAGAATTCTACACTCGCAAAGGCAACGACATGATTTATGCTCCGCTATCTGCTGATAAGTACCCTTCAAAATTGACAAATGGTGACAATTGGACGCGTAAGGATTTTTCAACCGAATACACGAATGCAAACGATTTATTAGCTTACGCACTCAAGACCATTAAGCAATATGCTTATCCTATTTTGACTTACACAGCTACTATCCAATCTAATTTTTTAAGTAATTACGATGATTTGGAATTAGGTGACACAGTCAAAATCATTGATAACAATTTCAAAGACGGGCTACTACTTCAAGCGCGCGTATCAGAACAAGTTATTAGTTTTAGTAATCCTAATAACAACTCACTTGTCTTTTCGAATTATGTCAAACTCAAAAACCAAATTTCCGACGCGTTAAAAGCTCGCATGGCGAGGTTAGCCGAAGAAGCGCAGCCTTACACAATTAAATTTAGCTCAGATAATGGGATGACGTTTAAAAACCACAAAGGCGAGACGACGGTTATAGCTACACTGCAAAAAGGTAGTCGCGACATCAAAGCGAATTGGAAGTGGTCTGTTAATAACGAGCTTTTGAGCTCAACGGATAGCTTGACAATAAGCGCGTCTGGTTTCGAAAAAACTTTAACAGTCGCTGTTGCTGCTATTGTAGGCGGGCAGGTTGTAACAACCGACCAAATAACATTTACCAATGTAAACGATGGCGCAGGAATCAAGAAGATTACACCTCTCTACGGTTCATCTGAAGATGGGGAAACCACAAATAATTGGTCTACGAACGCGAAAGCAGCTACCAAATCAGAACCTTATGTTCTCGGTAAGTTTATTACTGAACTAACAGACGGTACTCAAATAGAGACTAATAACTTTGTCGCTGCGGTGCGTAGTCCAGAATTTGATGAAGTTGAGCGTTTTAAACAAGGAATTTACAAGGAAATAGAAGAAGTCGATGCTCAGCTCGCCGCTCAGTCTGAGGCTCACAATCAGGCTGTTGCTGAGATTTTGGCTCAGGCGACTAGCGTTGAAGACTTAGCTTCTGAAGCTAAGCGGATTGGTCAGCAGGCTATTGCCAACGCTATTTCTGTCGCGAACCAACTTAGCACGGCTCGTCAGGCATTGCAGAGTGAGATTGAGACAGCTAAGACGCAAGCGGGAGATGTTGCTAAAGATTTGCTAACGCAGGCTGAACAGCTTAACGCACAAGCGACGAAGCAAGAGGAGTTGACCAAGCTTACCACTGAGACGAAAAAGCTCGTAGACGGTCAAATAACGACCATTAGCGAGCTGTCTAAAACCGTTGCTCAAAACGGTAAGGACATTACAAGCGTGCAGTCACGTACTAAAACAGTTGAAGATACGCTAAGTGGAACCAAGATAACGCTAGAGCAGGTTAAAGTTACATCTGACACAGTTAAGTCTAATCTTGCGGAATACAAAGTATCAAACGATGGCGCAGTAGCTGGCTTGCGACAGTCAATCAAAGACGCAAATGGCAACATCAGCGACCTTAAGACTTTGGTTGGGTTAGTGCCTGGCAAGATAAGCGCAGCGGTTGAAGCAGTGGAAGCTAAAATACCGACTGTTTTTGGTGGAAGAAATCTTGCTCAAAAGACAAGCTCTGACTGGTCAACTCCTTATACAGCTTTTTCAGGAATCGCAAACACTTGTCCGCAACTGTATAGAGTCTTAACTGACGGCTTATCGGTTGGAGATACGCTAAAATCACGTATTTTACTCAAGTACACTAATGTCGTACCAGCAAGTGGTCAGACAGCTATGATTTGGTTACAAGGTAGCGGAAATGTTACTTCTTGGAATGCAGGGTCATATTCCGGTAGTCCCAAAAAAACAATTAGTGGTAGTGGAGAAATCGTCTTTGAGCATGAATTTAAAATCAATGCAGACCACCTAAAGAATAGTTATTGGAATTGGCAATTCAGAACTGACTATATAGCAAGTGGCTCGCTAGAATGGAAGCTTGCGAAAGTTGAGTCTGGTGATGTCTTTACTGCGTGGTCTCCTGCACCAGAAGATGCCATTGAAGAAATCAGCTCAGTCAAATCAGAGCTTAAGCTGACTAAGGAGGGTTTAACTGGCTACTTTAACAAAACGGATAGCAACGCTAGCTCAATCAGTACACACACTAACCAGATTAGTGCTTTAAATAACGCCTTGTCTGCTAAAGTCTCAACAACTGATTACAACAAGTTGACTGACCGTGTGAGCAGTGCGGAATCAGCTATCAGCGTCCAAGCAGGGGAAATCAGCAAGCGACTAACAAGCACGCAAGTTGAGTCTGCTATAACTGCTAAGGGTTATCAGACTAAAGCGCAGGTCGACAGTAACATCACAGGTCGTGGCTATATCACATCATCAGCGTTACAGCCTTATGCGACAATGACCGCCTTAGAAAATAAGGTTACAGAAACAGCTGGCGAGTATACACGCTTAATAAGCGAGACAAAAGCATTGATACCGAGCGGAGAACCTAACCTTGTGCCAAATGGCAGACCTGAAGACGGTGTAACCGAGATGGGGAACGTGGATGTAGTAACTCATGGTTTTTATTACAATAGCAATCAGAAACTGTATCGGTTGACAACATCAGATACATCAGAAATTACTCAAAGTTTTAGATATTTCCCAGTCGAACGAAATACAGACTACACGCTATATTTTAAAGGCTTTAATAATTCTGCTGTAATTCATATGGATGTCTGGTTTTTAAGGCGCGTTAAAGGTAGCACGAATACTTGGGATAATGCACAGAAATTGATTGATAGCCGTAAGTTATCAATAAGTAGAGCCGAAGAAATCACAGTCACATTTAATACTGGTGGTTACGACGAAGGTTACATACGATTTGATAACAATGGTACAACCGTTAAAGGGACAAGAGCCGACTTGTATTTTGGTGACGTTTGCGTCAAAAAAGGCAAGTCGAACAACGGGTGGAGCCCAGCGGTTGCCGACCTAACCACAGTCACAGCTTTCAACAAAGTTAGTGAGACGGTCGATGAATATAAGCGGTTGATCTCATCTGGTGGTAGCTTATCCAAGGCTATCCAATCGGCTGAGAAATTTGAGCAATCCATTGCAAGCGGTGGGGACATCTACCAAGCTATCCAGACGGCTAAGGGGCTTGCTACAACTGTTAGTGGCGCTAATGGGCTTAGTACGCAGGTCAGTCAGCTTGCGGGGTCTTACGCGATCAAGAATTTGACTAGCTCGGGTACTGTACTTAACCAGCTCAACCTAAACAAGGATGGGTCAGTCAAGATTGATGGTAGCTTGGTACGAATTACTGGTAAAACGGTCATTGATAATGCTGTCATCAAATCCGCTATGATTGCGGATGGTCAAATTGGCACAGCTCAAATTGGTACGATTGATGGTGCTACAGCTAATATCATCAATATCAACGCCAAAAATATCTCTGCCGACGGCTTGAGCGGTAACATCATTAAAGGTGGAACCTTGCGCTCAACCAATAACGCGACCAACTTCGACTTAGTCAATGGTAAGCTCAATTTTGATACGGACACAGCATCCGTGAGACGAGTGACAAGCGGAATACCAACGCAGTTTGTCAAATTCCTCAAAAGTTCCAATGGTGCATTGACCGTGATTGGGTCCAACCGTGATGGTTCGGAAAGTGCTGATAACGATAGCTTTGCAGGTTTTAAAATCTACTCTAGTAGCACTACAGAGGTGTCAGAAATTATCTCTGACCAGATTTACTTTTTGACTGGGACAAATAATAGACGCGGTTGGCAGATGTCTACCATCACGGGTGCTGATAATAAGCAAATCTCGCTATTTCCGACTGGAGACCCAACCAAGAGCTTGATATACGCAAGTGATTACTACATTAAACGAAATGGTAAGAATATCGCTTTGATTGATTTTATCACTTACGTTAATGCTTGCTTAAAACACTTGCAAAACTACACAGGCAGAACTGATATTTGGAACGATTTTGCTATTTAG

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
68b967b53e0839f9ea1595e455b16d44497398d0c9d0c46fd3756e330b4f3022
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7549
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Prophages and satellite prophages are widespread among Streptococcus species and may play a role in pneumococcal pathogenesis Rezaei Javan,R., Ramos-Sevillano,E., Akter,A., Brown,J. and Brueggemann,A.B. 2018-12-20 — GenBank