Protein

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Genbank accession
UZV40438.1 [GenBank]
Protein name
putative tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,75
Protein sequence
MASTDNSKATSIETNQYIKNPKYTTKEAIDKFVHLLILGRYTEKDLSDALNYCLIRSTESFDSIDSIKKAIEELKKDSEAFKIFIDNTNKLLDAIQEINAEQNTEINKINEFLKTAVTLDTEQTITGAKTFNKIYVSDPTENRQAANAQYVMDYVRNQLSLTIGDLNNLKTESKDLIVNAINEVLDNLNTYEETINETTINQMIDTKLNPLIGRITTIESTVDYTKELAEANKQAIDDLNTKVVDNTSDITDINRRLEEAVFYSKINDTRKTIQLKNYDSISGVSTTGAGINIAMVSKWDKVDLGSTQIPINLNGSETRPTYNDSKEMALMDDVNLKADSNDVYNKSEIDTKLETKANSSSVYNKEDSDARFVSLTEDQSIEGNKIIEGIWEYNGVLSKPKQLATTEYSKNYSETYTNQKVGDLTSLKTEAKDTAVAAINELFDKIGSGDTGGPVDTYTKQEIDSKLDLKADASGVYNKSEIDHKFENITIDDINYAKKDAANIFTKANTFTEAPSVEVDATLDNHVIRKKQFDNNIKEINDKVESVVGDLNSLNNEVSKDNLVNAINSVDDKFKTTAKTNESNTFTGDQTYVDHILLESVPSERNHAVNLGYILDNPGGIKLPDHTALTQNSITEITFGYANPVAYSAQTLKNIFLKDIAGNEYKAIMADVTSFTANPSKEMVVILSRTDYTKNIDVKFDITKTVDELKQYELKEGEVRVILSYDIVSVYSSGYGYGAMFARNANKKDGDLIYDYYFGSQNDITNNRKVSIKIDKLGINTPDIVSISMTTNGSEKLTVKTDTLDPVENTYESVDMTYIHTPVSKIAGDILYSNISQAIKSIHILENNICSLKPAEMDTQLVRLKEFNNIINSMLQSMFGESPVTLKNGDYIDVSFSGSASYGTGYCGYVNIKDTIRDITYKAYKVSSNAFDTTSGTKVIAVLTSDNSKINVTYSDSVSTLESYEVAENEILLEISFYAAKQYSAKYGYGAMLEYWGSVSDLCYDYYMGSNLDMNCPFKITLLKIGSSVKADTIQLGAPTFASSLVMHLRKNTNDVINFLVSTGRKVIGRDGTESGSVYDLVEKSLKPLKVLTSEAHQSINGITTFNNKVYMNINNEKITDSKQLIHKEYLDKNITDNVAYNISNTPLVPYNDVSSLNTKNICVKISATTDSSNYSSGDTVVVSNFKIKLKGDNEYLKPYGVEVIDRENNKIGLNLIGDDTVYNDNDALLSTRPSDFNSSSVDLSSGSNALVTVKTNGAYDYSGVYDIPNPFREYNKKYSLFLSNDGLKNPYYQVDINSSKQVDNISFQLFGTSATNPFLYSKDCKIELFIENTIVKTFNIKGSSGNNSPVNINIDYKDGMFLVSVLDSINYINNRINKNAELLTGSGKPNFSLNPNKIGSLYSDITNKAVYMCIDNTSGANKWVNIVTGDEIKPNLRKIEITCNVRLRSGQYGGCMSGVKIGFDNGYASTKQIVKGLNSGQILLSLDGLGNLSGYSEVSSLTPSSQDIKVDVDTTGIYNDPSYHCVTNIFKEYLGNADQCSLWSDASVKQLKITLLSEKIPNKILYVGDGYYGQTSVSDVKAIWYYVNDDGVKIEGSIDNDLEISNNDSETNDSSYIYAFNIN
Physico‐chemical
properties
protein length:1624 AA
molecular weight: 180207,91800 Da
isoelectric point:4,80292
aromaticity:0,08498
hydropathy:-0,42235

Domains

Domains [InterPro]
DC_0608
ATT
1–438
DC_0608 Coil DC_0946
Coil
Unmapped
181–201
Coil DC_1919
UZV40438.1
1 1624
Architecture
ATT
STR
ATT 1-602 | STR 1322-1460 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Campylobacter phage vB_CjeM_WX1
[NCBI] 		2995678 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Campylobacter jejuni
[NCBI] 		197 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Campylobacterota > Epsilonproteobacteria > Campylobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
UZV40438.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OP654737 [NCBI]
CDS location
range 10056 -> 14930
strand +
CDS
ATGGCTAGCACTGATAATTCTAAAGCTACGAGTATTGAAACAAATCAATATATAAAAAATCCAAAATATACTACAAAGGAAGCTATTGATAAATTTGTTCACCTATTGATCCTGGGTAGATACACCGAAAAAGATTTATCAGATGCTTTGAACTATTGCTTAATTCGCAGTACAGAAAGTTTTGACAGCATAGATTCTATAAAAAAAGCTATAGAAGAACTTAAGAAAGATTCAGAAGCTTTTAAAATATTCATAGATAATACAAATAAACTTTTAGATGCTATCCAAGAAATTAACGCTGAGCAAAATACAGAAATCAATAAAATTAATGAATTCTTAAAAACAGCAGTAACTTTAGATACTGAACAAACTATTACAGGGGCCAAAACATTTAATAAGATTTACGTCTCTGACCCAACTGAAAATAGACAAGCTGCCAATGCTCAGTATGTTATGGATTATGTTAGAAATCAATTAAGTTTAACTATTGGTGATTTAAATAATTTAAAAACTGAATCCAAAGATTTAATTGTTAATGCTATTAACGAAGTTCTTGATAATTTAAATACTTACGAAGAAACTATAAATGAAACTACTATCAATCAAATGATTGATACTAAGTTAAATCCATTAATAGGGCGTATCACGACAATTGAATCTACTGTAGATTATACCAAAGAATTAGCAGAAGCCAATAAGCAAGCTATTGATGATTTAAATACTAAAGTAGTTGATAATACTAGTGATATAACGGATATTAATAGAAGACTTGAAGAAGCTGTTTTCTATAGTAAAATTAATGATACTCGCAAAACTATACAACTTAAAAATTATGACAGCATTTCTGGTGTTAGTACCACAGGTGCTGGTATCAATATTGCTATGGTTTCTAAATGGGATAAAGTAGATTTAGGATCTACTCAAATTCCTATTAACTTAAATGGGTCAGAAACTAGACCAACTTATAACGATTCAAAAGAAATGGCTTTAATGGATGATGTTAACTTAAAAGCCGATTCTAATGACGTTTATAATAAATCTGAAATCGATACCAAATTAGAAACTAAAGCAAATTCAAGTTCAGTTTACAATAAAGAAGATTCTGATGCTAGATTTGTTAGTTTAACTGAAGATCAAAGTATTGAAGGTAATAAAATAATTGAAGGTATTTGGGAATATAATGGGGTATTGTCTAAACCAAAACAACTAGCAACTACAGAGTATTCAAAAAATTATTCTGAAACATATACCAATCAAAAAGTCGGAGATTTAACAAGTCTTAAAACAGAAGCTAAAGATACAGCAGTGGCTGCTATCAACGAATTATTTGATAAGATTGGATCTGGGGACACAGGCGGCCCAGTTGATACTTACACAAAACAAGAAATTGATTCAAAACTTGATCTTAAAGCAGATGCTAGCGGTGTCTATAATAAATCTGAAATTGATCATAAATTTGAAAACATAACTATTGATGATATTAATTATGCAAAGAAAGATGCAGCTAATATTTTTACAAAAGCTAATACTTTTACAGAAGCACCTTCGGTAGAAGTAGATGCAACACTAGATAACCATGTTATTAGAAAAAAACAATTTGACAATAACATAAAAGAAATAAATGATAAAGTTGAATCTGTTGTTGGTGATTTAAATTCATTAAATAATGAAGTTTCTAAAGATAATTTAGTTAATGCTATAAATAGTGTAGATGATAAGTTCAAAACAACAGCTAAAACTAATGAATCAAATACATTTACAGGTGATCAAACTTATGTAGATCATATTTTACTAGAATCTGTTCCTTCTGAAAGAAATCATGCAGTTAATTTGGGATATATTTTAGACAATCCTGGAGGTATAAAACTCCCTGATCATACAGCACTTACACAAAATTCTATCACAGAAATAACATTTGGATATGCAAATCCTGTAGCATACTCTGCACAAACATTAAAAAATATATTCTTAAAAGATATTGCAGGTAATGAATATAAAGCTATTATGGCAGATGTAACATCATTTACAGCAAATCCTTCAAAAGAAATGGTTGTTATACTTTCTAGAACTGATTATACAAAAAATATAGATGTTAAGTTTGACATAACTAAAACAGTTGATGAGCTTAAACAATATGAGCTTAAAGAAGGAGAAGTTAGAGTTATACTATCTTACGATATTGTATCTGTTTATTCTAGTGGATATGGTTATGGAGCTATGTTTGCTAGAAACGCTAATAAAAAAGACGGAGATTTAATATATGATTATTATTTTGGAAGTCAAAATGATATAACAAATAATAGAAAAGTATCTATAAAAATAGATAAACTTGGTATTAATACTCCAGATATTGTAAGTATATCTATGACTACAAATGGTTCTGAAAAATTAACTGTAAAAACAGATACACTAGATCCTGTAGAAAATACATACGAATCTGTGGATATGACTTATATTCATACTCCTGTCAGCAAAATTGCAGGAGATATTCTGTATAGTAATATATCTCAAGCAATTAAATCAATACATATATTAGAAAATAATATCTGCTCTCTAAAACCTGCAGAAATGGATACACAGTTAGTAAGACTTAAAGAGTTCAACAATATAATAAACAGTATGTTGCAATCTATGTTTGGTGAGAGTCCTGTAACCCTAAAAAATGGAGATTACATAGATGTTTCATTTAGTGGTAGTGCAAGCTATGGAACAGGGTATTGTGGGTATGTTAATATAAAAGATACTATAAGAGATATTACATATAAAGCTTATAAAGTATCTTCAAATGCTTTTGATACAACTAGTGGAACTAAAGTTATTGCAGTTCTCACTTCTGATAACAGTAAAATAAATGTAACTTATTCCGATAGTGTATCAACATTAGAATCTTATGAAGTAGCAGAAAATGAGATATTATTAGAAATATCATTTTATGCTGCTAAGCAATATTCTGCTAAATACGGGTATGGAGCTATGTTAGAGTATTGGGGTTCTGTATCTGATTTATGTTATGATTATTATATGGGTTCAAACCTAGATATGAACTGTCCATTTAAAATAACATTGCTCAAAATAGGAAGTTCTGTTAAAGCTGATACTATACAATTGGGTGCTCCTACTTTTGCAAGTTCATTAGTAATGCACCTAAGAAAAAATACAAACGATGTTATTAATTTCCTTGTTTCAACTGGTAGAAAAGTAATAGGAAGGGATGGAACTGAGAGTGGTTCTGTATATGATTTAGTTGAAAAATCATTGAAACCATTAAAAGTTCTAACATCTGAAGCACATCAATCTATAAATGGTATAACTACTTTTAATAATAAAGTGTATATGAATATAAACAATGAAAAAATTACAGACAGCAAACAACTAATACATAAAGAATACCTAGATAAAAATATTACAGACAATGTAGCATATAATATTAGTAATACTCCATTAGTACCTTACAATGATGTTAGTTCTTTAAATACAAAAAATATTTGTGTAAAAATATCTGCGACAACTGATAGCTCTAATTATTCATCTGGTGATACAGTAGTAGTTAGTAATTTCAAGATAAAACTTAAAGGAGATAATGAGTACCTTAAACCTTATGGGGTTGAAGTTATTGATAGAGAAAACAATAAAATAGGTTTAAATTTAATAGGAGATGATACAGTATATAATGATAATGATGCTTTATTATCTACAAGACCTTCTGATTTTAATTCATCTAGTGTAGATCTTTCTAGTGGAAGTAACGCCTTAGTAACTGTTAAAACTAATGGAGCTTATGATTATAGTGGAGTTTATGATATACCAAATCCTTTTAGAGAATATAATAAAAAATACTCTTTATTCTTAAGTAATGATGGGTTAAAAAATCCTTATTACCAAGTTGATATAAATAGCTCCAAACAAGTTGATAATATATCTTTTCAATTATTTGGAACTAGTGCTACAAATCCTTTTTTATATTCTAAAGACTGTAAAATTGAATTGTTTATAGAAAATACTATTGTAAAAACCTTCAATATTAAAGGCAGCTCTGGAAATAATAGTCCTGTGAATATTAATATAGATTATAAAGATGGTATGTTTTTAGTATCTGTTCTTGATTCTATAAATTACATAAATAATAGAATCAATAAAAATGCAGAATTACTTACAGGGTCAGGCAAACCTAATTTTTCATTAAACCCTAACAAAATAGGTTCTCTATACTCTGATATAACTAATAAAGCTGTATATATGTGTATAGATAATACTTCTGGTGCTAATAAATGGGTAAATATAGTAACAGGAGATGAAATTAAACCAAACCTTAGAAAAATAGAAATTACTTGTAATGTAAGATTAAGAAGTGGCCAATATGGTGGTTGTATGAGCGGTGTTAAAATAGGATTTGATAACGGATATGCTTCTACAAAACAAATAGTTAAAGGGTTAAATAGTGGTCAAATATTGCTATCTCTAGATGGGTTGGGTAACCTTTCTGGATATTCTGAAGTTAGTTCTTTAACTCCTAGCAGTCAAGATATAAAAGTTGATGTGGATACTACTGGGATATATAATGACCCTTCATATCATTGTGTTACTAATATATTTAAAGAATACCTTGGCAATGCTGATCAATGTTCGCTATGGTCTGATGCTAGTGTTAAACAGCTTAAAATAACTTTATTATCTGAAAAGATTCCTAATAAAATATTGTATGTAGGAGACGGATATTATGGTCAAACATCTGTTTCTGATGTAAAAGCTATATGGTATTATGTAAATGATGATGGAGTAAAAATAGAAGGCAGTATAGATAATGATTTGGAAATAAGCAATAATGACTCTGAAACAAACGATAGTTCTTATATATATGCGTTCAATATAAATTAG

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
499b3eda9260e0c5bded69aa4e82fd8f07990f6e86c30a8a7ddcac1e749bc36d
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,4347
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50