Protein

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Genbank accession
YP_009037527.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein proximal subunit
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,56
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MADIKRKFRAEDGLDAGGDKIVNVALADRTVGTDGVNVDFLVQENTVQVYDSTRGYNKGFVVLYDNRLYQAINDIVSPSGAFNLLQWRAVRTDAQWITVASGTYQLSSGESISVNTGAGNDMVFTLPNAPVDGDTIVLADIGGRTGTVKVQINASVQSILNFRGEQVRTVLMTRPRSQLLFVFSNRLWQMYIIDYGKESITVTPATPHQAQANDFIVLRFTSAAPINITLPRNANNGDIISLVDLDKLNPLYHTIIKTFDDTTSIGEVGTHIVEGRTSSDAFFVFDAANSLWRIWEGDQKSRLRIIRTDSNIRPNEEVLIFGTNNATAETINLTLPTGILTGDTVKISMNYMRKGQTVKIKAAEGDTIASSVALLQFPKRSEYPPDTQWVSVTELEFNGTTSYVPVLELAYIEDTDSDTHYWVVQQNVPTVERVDAGTDATRARLGVIALATQAQANVDLENTPAKEVAITPETLANRTATEARRGIAKIATTAQVNQNSIASFVDDTIVTPKKLNERTATETRRGLAEIATQTETDAGLDDTTIITPKKLQARQGSETLSGIVKYVSTTSATPAETRGAAGTNVYNKDTSTLTISPKALDQYKATYAQQGAVILAVDSEVIAGQSQAGYSHAVVTPETLHKKTSTDGRIGLIEIATQAETNAGTDYTRAVTPKTLNDRKATEGLSGIAELATQVEFDTGTDDTRISTPLKIKTHFDSSDRTSVNSDSGLIEEGTLWNHYTLDISKANETQRGTLRVATQTESNAGTLDDVLITPKKLLGTKSTETSEGVIKVATRAETVTGTSANTAVSPKNLKWIVQNEPTWAATTAIRGFVKTSSGSITFVGNDTVGSTQPLESYEKNSYAISPYELNRVLANYLPLKAKAADANLLDGIDSSQFIRRDIAQTVNGSLTLTKQTNLSAPLVSSSTATFGGSVSANSTLTISNTGTATRLIFEKGPQTGTNPAQTMTIRVWGNQFGGGSDTTRSTVFEVGDETSNHFYSQRNKDGNIAFSINGTVMPININASGLMNVNGVATFGRSVTANGEFISKSANAFRAISGDYGFFIRNDAANTYFMLTASGDQTGGFNGLRPLAINNASGQVTIGEGLIIAKGATINSDGLTVNSRIRSQGTKTSDLYTRAPTSDTVGFWSIDINDSATYNQFPGYFKMVEKTNEVSGLPYLERGEEVKSPGTLTQFGNTLDSLYQDWITYPTTPEARTTRWTRTWQKTKNSWSSFVQVFDGGNPPQPSDIGALPSDNATIGNLTIRDFLRIGNVRVIPDPVNKSVKFEWIE
Physico‐chemical
properties
protein length:1291 AA
molecular weight: 139615,82340 Da
isoelectric point:5,30361
aromaticity:0,07281
hydropathy:-0,30457

Domains

Domains [InterPro]
DC_1986
ATT
15–139
DC_1986 DC_1209
IPR048390
ATT
981–1094
IPR048390 IPR048391
YP_009037527.1
1 1291
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT
STR
ATT 15-139 | STR 343-980 | ATT 981-1094 | STR 1095-1140 | ATT 1141-1239 | STR 1240-1276 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage vB_EcoM_JS09
[NCBI] 		1430444 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Tevenvirinae > Mosigvirus
Host Escherichia coli B
[NCBI] 		37762 Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacteriales > Enterobacteriaceae > Escherichia
Host Pseudomonas putida KT2440 and
[NCBI] 		1481724 Heterolobosea > Eutetramitea > Lyromonadida > Psalteriomonadidae > Monopylocystis >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_009037527.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_024124 [NCBI]
CDS location
range 16624 -> 20499
strand -
CDS
ATGGCCGACATCAAACGTAAGTTCAGAGCCGAAGACGGTCTGGACGCCGGTGGCGACAAGATTGTTAACGTAGCATTAGCCGACCGTACAGTAGGTACTGATGGCGTAAACGTTGACTTCCTGGTACAAGAAAACACCGTTCAAGTATATGATTCTACGCGTGGATATAACAAAGGATTTGTTGTTCTTTATGACAACCGTTTATATCAAGCAATAAATGATATCGTGTCTCCTTCCGGGGCATTTAACCTTTTACAATGGCGTGCAGTTCGTACCGATGCACAATGGATAACTGTAGCTTCTGGGACTTATCAACTTTCTTCAGGTGAATCGATTTCGGTTAACACTGGTGCCGGCAATGATATGGTTTTCACGTTGCCAAATGCGCCGGTTGATGGTGACACTATTGTTTTAGCTGATATCGGTGGAAGAACCGGGACAGTTAAAGTACAGATTAACGCGTCTGTGCAGAGTATTTTAAACTTTAGAGGTGAACAAGTTCGTACAGTTTTAATGACGCGCCCACGTTCACAACTATTGTTTGTGTTTAGTAATCGTTTGTGGCAGATGTATATCATTGATTACGGTAAAGAATCAATCACTGTTACACCTGCTACACCACATCAAGCGCAAGCAAACGATTTTATTGTTCTTCGTTTTACTAGTGCAGCACCAATCAACATTACACTTCCACGTAATGCTAACAATGGTGATATAATCAGCCTAGTTGATTTAGATAAATTAAACCCACTGTATCATACGATTATTAAAACATTTGATGATACAACGTCTATTGGCGAAGTCGGGACTCATATCGTCGAAGGTAGAACTTCTTCTGACGCGTTTTTTGTTTTTGATGCTGCAAATAGTTTATGGCGTATATGGGAAGGCGACCAGAAATCACGTCTTCGTATTATCCGTACAGATTCAAATATTCGCCCAAATGAAGAAGTTCTTATTTTTGGTACAAATAACGCTACAGCAGAAACTATTAACCTTACGCTTCCTACAGGAATTTTGACCGGTGACACTGTTAAAATTTCAATGAACTACATGCGTAAAGGCCAAACAGTAAAAATTAAAGCTGCCGAAGGTGATACAATTGCTTCTTCTGTCGCATTACTTCAGTTCCCTAAACGTTCTGAATATCCACCTGATACTCAATGGGTCTCTGTTACTGAACTAGAATTCAATGGCACTACTTCATATGTTCCTGTATTAGAATTAGCGTATATCGAAGACACCGATTCTGACACTCATTATTGGGTTGTGCAACAGAATGTCCCTACGGTAGAACGTGTTGATGCTGGAACTGATGCTACACGAGCTCGTTTAGGTGTTATTGCTCTTGCTACTCAAGCGCAAGCAAATGTTGATTTAGAGAATACTCCAGCTAAAGAAGTGGCTATTACTCCTGAAACGTTGGCAAATCGTACAGCAACTGAAGCTCGACGTGGTATCGCTAAAATTGCTACAACAGCACAAGTTAACCAGAATTCCATAGCATCATTTGTGGACGATACTATTGTTACGCCTAAAAAACTAAATGAGCGTACAGCAACTGAAACTCGTCGCGGTCTTGCTGAAATTGCTACTCAGACTGAAACCGATGCTGGTCTTGATGACACAACGATTATTACACCTAAGAAATTGCAGGCACGTCAGGGTTCTGAAACACTATCAGGTATAGTTAAATATGTATCAACTACTTCTGCTACTCCTGCTGAAACTCGTGGAGCTGCAGGCACTAATGTTTATAATAAAGACACATCCACGTTAACTATTTCTCCTAAAGCCCTTGACCAATATAAAGCAACTTATGCTCAACAAGGTGCAGTAATTTTAGCTGTTGATAGTGAAGTAATTGCTGGACAATCTCAAGCAGGTTATTCTCACGCTGTAGTAACTCCTGAAACACTACATAAGAAAACTTCTACTGATGGACGTATTGGTTTAATTGAAATTGCTACGCAAGCAGAAACTAATGCTGGGACTGATTATACACGTGCAGTAACGCCTAAGACGTTAAATGATAGGAAAGCTACGGAAGGATTATCCGGCATAGCCGAACTTGCTACGCAAGTTGAATTTGATACTGGAACTGATGATACTCGTATCTCAACTCCACTGAAAATTAAAACTCATTTTGATTCTTCTGACCGTACCAGTGTTAATTCTGATTCCGGACTTATTGAAGAAGGAACCTTGTGGAACCATTATACTCTTGATATTTCTAAAGCAAATGAAACACAACGTGGTACACTTCGAGTAGCGACTCAGACAGAATCTAATGCAGGAACTTTAGATGATGTTCTTATTACTCCTAAAAAGCTTTTAGGGACTAAGTCCACTGAAACGTCTGAAGGCGTAATTAAGGTTGCTACTCGGGCTGAAACTGTAACAGGAACTTCTGCTAATACTGCTGTATCGCCTAAGAATTTAAAATGGATTGTCCAGAATGAACCAACATGGGCTGCTACTACAGCAATTCGTGGATTCGTTAAAACTTCATCCGGTTCTATTACATTTGTTGGTAATGATACAGTTGGTTCAACACAACCTTTAGAATCATATGAAAAAAATAGCTATGCTATATCTCCATATGAATTAAACCGTGTACTTGCTAACTATTTGCCATTAAAAGCAAAAGCTGCTGACGCAAATTTATTAGATGGCATAGATTCATCTCAGTTCATTCGTAGGGATATTGCACAGACGGTTAATGGTTCACTAACCTTAACGAAACAAACTAATCTGAGTGCCCCTCTTGTATCATCTAGTACTGCTACGTTTGGTGGGTCAGTTTCGGCAAATAGTACATTAACTATTTCTAATACTGGAACGGCAACTCGTCTGATTTTTGAGAAAGGACCTCAAACTGGAACTAATCCAGCACAGACGATGACTATCAGAGTTTGGGGAAATCAGTTTGGTGGCGGATCAGATACAACACGTTCTACTGTATTTGAAGTTGGTGATGAAACGTCTAATCATTTTTATTCTCAACGTAATAAAGATGGGAATATAGCGTTTAGCATTAATGGTACTGTGATGCCAATAAACATTAATGCTTCCGGTTTGATGAATGTTAATGGCGTTGCAACATTCGGTCGTTCAGTTACTGCTAATGGCGAATTCATTAGTAAGTCTGCAAATGCTTTCAGAGCAATTAGTGGTGATTACGGATTCTTTATTCGTAATGACGCTGCTAATACCTATTTTATGCTCACTGCATCAGGCGATCAGACTGGCGGATTTAATGGATTACGTCCTTTAGCTATTAATAATGCATCCGGTCAAGTAACGATTGGTGAAGGCTTAATCATTGCCAAAGGTGCTACTATAAATTCAGATGGTTTGACTGTTAACTCTAGAATTCGTTCTCAGGGTACTAAAACATCTGACTTATATACTCGTGCGCCAACATCCGATACTGTAGGATTCTGGTCAATTGATATTAATGATTCAGCCACTTATAACCAGTTCCCTGGTTATTTTAAAATGGTTGAAAAAACTAATGAAGTGTCTGGACTTCCATACTTAGAACGTGGCGAAGAAGTTAAATCTCCTGGTACATTGACTCAGTTTGGTAACACACTTGATTCGCTTTACCAAGATTGGATTACTTATCCAACAACTCCGGAAGCACGTACCACTCGCTGGACTCGTACATGGCAGAAAACTAAAAATTCTTGGTCAAGTTTTGTTCAAGTATTTGATGGGGGTAACCCTCCTCAGCCATCTGATATTGGTGCTTTACCTTCTGATAATGCAACAATCGGAAACTTGACAATAAGGGATTTCTTAAGGATTGGTAATGTCCGCGTTATTCCAGACCCTGTGAATAAATCTGTTAAATTCGAGTGGATTGAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
2a387c4c8aeb7d6d92ce0aed022a99805c0e2181961ffa6e0819cbce6a43d7a8
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,8110
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Isolation and characterization of a novel lytic T4-like coliphage vB_EcoM_JS09 infecting APEC Zhou,Y., Bao,H.D., Zhang,H. and Wang,R. 2010-12 — GenBank