Protein

View in Explore
Genbank accession
BBI90569.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
Protein sequence
MFITQDNRILNNNDTLYFENTSVGLSSSRNVYLVSDTKLTSLQIKYKLDDSFSNDFKIYSLNRWSYTITITTGTVVAGTFSVHGHSITVTATDTPTTVASKLKTVMDSSNKYYSVSVNAGVVTVIPTQSGQTVDNHLSNGTTTSNGITFDTAGVAPTDILTIVSEQNLTNVDYFERSGKHVYKINLLFSPQYETGVHDEQYSFAHNSQVDIVYNNGTAKTHSIKVNGRCQHIDGKLTVALQNFKKYLNEDYYQAFFDSKLNTNEQDQVLLNRKKREYLMVMFEMTGFIGAYKSLLTAIEYFGWGQLLELKEYWKSISSNQYKLTSIKNQVLDKIDKQLTGFKKSNQMSLTYKVNDFKGNFDSDGLPIYENVLTDTDTVITKLYSLKAVLECDFLTLNTKIFDITGEIQAVVGHELNIWLNSSTITDVRLNENVNSDIEWSVKDKVIDIEEHQVIVDAFAFETDNTTAGSEKLKFLTPTPTSTAFNKTYFDVLKVLDDTSTLADFEYATQYARLDFGLIELDVTKIETSLYTSFRYLVYLWGSTTELFKSNTKPISQLGGGIKCGIQKVGSFRLVLALFDHYGGMSVVGLNEAIQVRNKPINFRIAKHSIVDTAGEYKDLRLHSTMEDLVSTDTDKSNVVDSISETLDVNTYNPLTNMPTMTVLKHYETKFDMHSVYSQVRELNSIPATKTKGLPVSIWGYKYGTMIYDIIGNGNQGNRYLRLRLFDHHNWSEVSLSYDTTTYPTPERFLIRFIELLNGQPSTSPFAKFTYDINYYSNNPQGNQSDGRPMLRIKAKEPSFTLNMFSYDVQKSFAHTDFTGAIDTTDIMIFSTVDTSNIIQHNGRNTRSNLVVKVGSKTLTMDKPYANIDELITDLDAWRTAQSVKELSYWKGDSNTLVVTCQADFSLKHNQFGHYVDIFRGAVGTRLEYIQDGTDIKLGEPVYAFVDDNSKLNSANVSWVLKDSLTNQVITTQYAQAFRYVMVKQGSFTLECTSTDKYGTTTTIKQGVYLVDMV
Physico‐chemical
properties
protein length:1013 AA
molecular weight: 114467,37120 Da
isoelectric point:5,67346
aromaticity:0,11155
hydropathy:-0,31293

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
BBI90569.1
1 1013
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 681 681 0,8124
Central domain 682 905 225 0,2063
C-terminal 906 1013 107 0,2086
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-681
Central
682-905
C-terminal
906-1013

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Tenacibaculum phage PTm1
[NCBI] 		2547425 Uroviricota > Caudoviricetes > Shirahamavirus >
Host Tenacibaculum maritimum
[NCBI] 		107401 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > FCB group > Bacteroidota/Chlorobiota group > Bacteroidota

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
BBI90569.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
AP019524 [NCBI]
CDS location
range 130450 -> 133491
strand +
CDS
ATGTTCATAACCCAAGATAATAGAATACTAAATAATAACGACACACTTTATTTTGAAAATACTAGTGTAGGATTATCTTCATCTAGAAATGTTTATTTAGTATCTGACACTAAGTTAACATCACTACAGATAAAATATAAATTAGATGATTCATTCTCTAATGATTTTAAGATATATTCATTAAATCGTTGGTCATATACCATTACAATAACAACTGGAACTGTTGTGGCTGGAACATTTAGCGTTCACGGTCACTCTATTACAGTTACTGCTACAGATACACCTACAACTGTAGCATCTAAGTTAAAAACTGTTATGGATTCATCAAATAAATATTATTCTGTTAGTGTAAATGCTGGTGTAGTTACTGTAATACCAACACAAAGTGGACAAACAGTTGATAATCATTTATCGAATGGAACAACAACATCTAATGGTATTACCTTTGATACTGCTGGTGTAGCACCAACAGATATATTAACTATAGTATCCGAACAAAACTTAACCAACGTAGATTACTTTGAACGAAGTGGCAAACATGTTTATAAGATAAATTTACTATTTTCACCACAATATGAAACTGGTGTACATGATGAGCAATATTCATTTGCACACAATTCACAGGTAGATATTGTATATAATAATGGAACAGCAAAGACACATTCAATTAAAGTTAATGGTAGATGTCAACACATAGATGGTAAGTTAACCGTTGCGTTACAAAACTTCAAAAAATACTTAAATGAGGATTACTATCAGGCATTTTTTGATAGTAAACTAAACACCAATGAACAAGACCAAGTTTTACTAAACAGGAAAAAACGAGAATATTTAATGGTTATGTTCGAAATGACAGGTTTTATTGGTGCATATAAGTCACTATTAACAGCTATTGAATATTTTGGTTGGGGTCAATTATTAGAACTTAAAGAATATTGGAAGTCTATAAGTTCTAATCAATATAAATTAACTAGCATAAAGAATCAGGTACTTGATAAGATTGATAAGCAATTGACAGGGTTTAAGAAATCTAACCAAATGTCGTTAACATATAAGGTTAATGATTTCAAGGGTAATTTTGATTCTGATGGATTACCCATTTATGAAAATGTATTGACAGACACCGACACAGTAATTACTAAATTATATAGTCTAAAGGCTGTATTGGAGTGTGATTTTTTAACGTTAAATACTAAGATTTTTGATATAACTGGTGAAATACAAGCAGTTGTTGGACATGAGTTAAATATATGGTTAAATTCATCAACAATAACAGATGTTAGATTGAATGAAAACGTTAATAGTGATATTGAGTGGAGTGTAAAGGATAAAGTAATAGATATTGAAGAACACCAAGTAATTGTTGATGCATTTGCATTTGAAACAGATAATACAACAGCAGGTTCAGAAAAATTAAAATTCTTAACACCAACACCGACCTCAACCGCATTTAACAAAACATATTTTGATGTATTAAAGGTTTTAGATGATACAAGCACCTTAGCTGACTTTGAGTATGCTACACAATATGCTAGATTAGATTTTGGTTTAATTGAATTAGACGTTACCAAAATAGAAACATCACTATACACATCATTTAGATATCTTGTTTATTTGTGGGGGTCTACCACAGAACTATTTAAGAGTAATACTAAGCCTATTTCACAACTTGGTGGAGGTATTAAGTGTGGTATACAAAAAGTTGGTTCATTTAGGCTCGTATTAGCGTTATTTGACCATTATGGTGGAATGTCTGTTGTTGGATTAAATGAAGCTATACAAGTAAGAAATAAACCAATAAACTTTAGGATTGCGAAACACTCTATAGTTGATACTGCTGGTGAATATAAAGATTTACGTTTACATTCAACAATGGAAGATTTAGTTTCAACTGATACGGATAAATCAAATGTTGTTGATAGTATTTCCGAGACACTAGATGTGAACACATACAACCCATTAACCAATATGCCAACAATGACGGTTTTGAAGCACTATGAAACTAAGTTTGATATGCATAGTGTATATTCACAAGTTCGTGAATTAAATTCTATACCTGCAACTAAAACAAAGGGGTTACCAGTAAGTATATGGGGTTATAAATACGGTACAATGATTTATGATATCATTGGAAATGGTAATCAAGGTAATAGATATTTACGTTTACGATTATTCGACCATCATAATTGGAGTGAGGTTAGTTTATCTTATGATACAACAACATACCCAACACCTGAGAGATTCTTAATACGTTTTATTGAATTATTAAATGGGCAACCAAGTACGTCACCATTCGCTAAGTTTACGTATGATATAAATTATTATAGTAATAATCCACAAGGGAATCAAAGTGATGGTAGACCAATGTTAAGGATAAAGGCGAAAGAGCCATCATTCACATTGAATATGTTTAGTTATGATGTACAAAAATCTTTTGCTCATACAGATTTTACTGGTGCTATTGATACCACGGATATTATGATATTCTCTACAGTTGATACTAGTAACATTATCCAACATAATGGAAGAAATACAAGGTCTAATTTAGTTGTTAAGGTTGGTTCTAAAACACTTACAATGGATAAACCTTATGCTAATATTGATGAACTAATTACAGACTTAGATGCATGGAGAACAGCACAATCAGTAAAAGAATTATCATACTGGAAAGGGGATTCTAATACATTAGTTGTTACATGTCAAGCTGATTTTAGTTTAAAACATAATCAATTTGGACATTATGTTGATATTTTTAGAGGTGCTGTAGGTACACGATTAGAGTATATTCAAGATGGTACTGATATAAAATTAGGTGAACCAGTTTATGCATTTGTTGATGATAATTCAAAATTAAATTCAGCAAACGTTAGTTGGGTGTTAAAGGATTCTTTAACAAATCAAGTTATAACAACTCAATATGCACAAGCATTTAGATATGTTATGGTTAAACAAGGTTCATTTACCTTAGAATGTACATCAACTGATAAATACGGAACAACAACCACAATAAAACAAGGTGTATATCTTGTTGATATGGTTTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
34861cb68d7532c539dca59f6d198dcd3aab3b74af0103cf1a44021082da0ae2
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,4329
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50