Protein

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Genbank accession
QBX31103.1 [GenBank]
Protein name
endopeptidase
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,76
Protein sequence
MYTFLDQFDNEYGAIATIEITNAVNGEKSIKGDIYSNDAVLNNLDKGWRLRFQDEYFVIVYAKPKDVGDKIQLSFDAVHQFFWDFSKKVANEQLKDGSHTFQAYLDFIFKDTGYRYNLEQNVKAFEKQSFGYKSKLALFNDIISTSSVEFQVNGKVVRILEKTGTDLSTVVRKNFNMNELIIEKHIGGFITYQKGFGKWHNPDDHSKGRLEVEYESPLAKEFGRLEGEPVIDERYTDTQSLLARVRRNVEDSYTISTQIDLEDLIRAGYHYKQPIAGDYIMAINETLGFQEKLRIVSFTSRYDSKGTLISHKVTCNDIGSVKKQSTSYTKLSKSVSESNQLVQDALIKANKAMVTADGKNTAYFGTEFPLDNPKGSLTKGDIFYRKVGDRTLMYFWNGSDWEDNPVLNDVESFKKDIDSQLKTVTETMQRNDAEHQKGIDDLFEKAGVNKSLADEAKRVGEQAKLDAANALSKALDYKNEAIAEAQRLDTVERQATETKLATTKSQAVAEADKLVNDAKTTLETQISGANKAISDAKQALESQVSGISTEISKTNDTIKTLATKADVDKTNQRVTQAESSITQQAGQITQKANQSTVDTLSGRVKNAETSITQQANQIALKANTTDVNVLTNRVGTAEATLNIHSNQIALKASQSDVNSAKSRLQNAESSLTVQAGEIAQRVKTSDFNQAKQRLATAESKITQLGDKITTEISKVEGKIPSSIGGRNLLAKKWFRKGLSSEQFTLKAWAEPLISYKTLNTVLEEGKTYTLSFDWEVIGKSTVSTIFQLTLGFLVYSHSHQKSRKELNISRAVSIGDKGRFELTFVCPPLFDDSNLLAYTNRYAEGSNIDYDTVKFSNVNLVEGTIAYKQWLQPIEDIEETFSSVRTLITQTAEGQEQLSTKLTETQGKVTNAETRINQLVNDVSSKVSQTDFDSIKKTVQSNSTAITQNKNAIGLKAEKTYIDGVKTTASNALAKAQSNAQSISQTKADLKITSDAVATKVSKLDFDVATRRLTNAETTIRTQAGQIEQRLTKTQVEQAITSKGYATNTIVQNLVKETTDGFERKITETKGLIPTEMGGRNLILNYENRIIYEYNSPINVIRETDITVPEWGATNAHRLALTTSKVGTFGYMASGRTAQLGHQMYLDGTRYTGSIYLKNNGSTAFRVSINTVSSKTVMPGQSLRLSITDRGDSKRYVQFTFVSDVANAPIDFTYWHPQIEVGELMSSASPAPEDTITTIKFNEVKDTVDSHSRTIGDIQGNISSVVMTASGLLSRVNSTETGLTTVQSQLAGSWAVRNLTSSGTVLNQLNLNRDGSVKIDGKLVQITGTTYIQDGVITSAKIANLDAAKITTGTLNAANVNIVNLNANKLVGLDANFIRSKIEMAMIDWMKGKTITAQNNAMRINLNDANITFNSNATINFNSAYNALVRRKGTHTAFVHFNDVSASSDGGVGSLYASIGVTSSGDGINSQSSGRFAGLRAFRGARGTEHNATVDQVEIYGDRIVLKDDFSYNRGFEFRPTTLKNGDFIDMNYLVGAVRALSRCWIHWNNVSWNPASNDLRNAVVREYNNYMKDL
Physico‐chemical
properties
protein length:1575 AA
molecular weight: 174171,84560 Da
isoelectric point:7,86722
aromaticity:0,07746
hydropathy:-0,45117

Domains

Domains [InterPro]
DC_1353
STR
1–891
DC_1353 Coil DC_1746
G3DSA:3.55.50.40
STR
79–164
G3DSA:3.55.50.40 Coil Coil DC_1955 IPR012892
QBX31103.1
1 1575
Architecture
STR
RBD
STR 1-1326 | RBD 1327-1532 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Streptococcus phage Javan616
[NCBI] 		2548282 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Streptococcus thoraltensis DSM_12221
[NCBI] 		1123318 Bacillota > Bacilli > Lactobacillales > Streptococcaceae > Streptococcus > Streptococcus thoraltensis

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QBX31103.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MK448993 [NCBI]
CDS location
range 30354 -> 35081
strand +
CDS
TTGTACACGTTTTTAGACCAATTTGATAATGAATATGGTGCCATCGCAACGATTGAGATTACAAACGCTGTTAATGGCGAGAAGTCAATAAAAGGTGATATCTATTCAAATGATGCAGTACTTAATAACTTAGATAAGGGTTGGCGTTTACGGTTCCAAGATGAGTATTTTGTTATTGTATATGCGAAGCCTAAAGATGTTGGCGACAAGATTCAATTATCTTTTGACGCGGTTCATCAGTTCTTTTGGGATTTTTCAAAAAAAGTCGCTAATGAACAGTTGAAGGATGGCTCGCATACTTTCCAAGCTTATCTTGATTTTATCTTTAAAGATACTGGTTATCGCTATAATCTGGAACAAAATGTAAAAGCTTTTGAAAAACAATCTTTTGGATATAAGTCTAAATTAGCTTTATTTAACGATATCATTTCTACCTCCAGCGTAGAGTTTCAAGTAAACGGTAAGGTTGTTAGAATCCTAGAAAAAACTGGGACAGATCTATCGACAGTCGTGCGAAAAAACTTCAATATGAATGAGTTAATCATCGAAAAACATATCGGTGGTTTTATTACTTATCAAAAAGGGTTTGGAAAGTGGCATAATCCTGATGATCACAGTAAAGGTCGTCTTGAAGTTGAATACGAATCACCATTAGCGAAGGAATTCGGTCGGTTGGAAGGTGAGCCAGTTATTGATGAGAGATATACTGATACACAATCTTTGTTGGCTAGAGTTCGTCGCAATGTCGAAGATTCTTATACAATTTCCACCCAAATTGATCTTGAAGATTTAATACGAGCTGGCTATCATTACAAACAGCCTATTGCAGGCGACTACATCATGGCTATTAATGAAACACTAGGTTTTCAAGAAAAGCTACGCATCGTTTCGTTCACTAGCCGGTATGATTCCAAAGGAACTTTAATTTCCCATAAAGTCACTTGTAATGACATCGGTTCAGTCAAAAAACAATCAACGTCTTATACTAAGTTATCTAAATCAGTAAGTGAGTCTAATCAATTAGTGCAAGATGCATTAATTAAAGCTAATAAAGCTATGGTTACTGCAGATGGTAAAAATACTGCTTACTTTGGCACAGAGTTTCCTCTTGACAATCCAAAAGGAAGTTTGACTAAAGGTGATATTTTCTACCGAAAAGTCGGCGATAGAACTTTGATGTATTTTTGGAATGGCAGTGACTGGGAAGATAATCCTGTTTTAAACGATGTCGAATCTTTTAAAAAGGATATCGATTCTCAATTAAAAACAGTCACCGAAACCATGCAACGCAATGACGCTGAACATCAAAAAGGCATTGATGATTTGTTCGAAAAAGCTGGCGTCAATAAGTCGCTAGCTGATGAAGCGAAGCGAGTTGGTGAGCAAGCTAAGTTAGATGCGGCTAATGCTTTATCGAAGGCTTTAGACTACAAAAATGAAGCTATTGCAGAAGCGCAGAGACTAGACACAGTTGAAAGACAAGCAACGGAAACTAAACTGGCAACAACTAAAAGTCAAGCTGTGGCGGAAGCTGATAAATTAGTAAATGATGCAAAGACGACGCTAGAAACACAGATTTCTGGTGCTAACAAAGCTATTTCAGACGCAAAACAAGCGTTAGAAAGTCAAGTTTCTGGAATTTCTACGGAAATCTCTAAAACCAATGACACTATTAAGACTTTAGCCACTAAGGCAGATGTTGATAAGACTAATCAGCGTGTCACACAAGCCGAAAGCTCTATCACCCAGCAAGCTGGTCAAATTACGCAAAAAGCCAACCAAAGCACTGTAGATACTTTGTCAGGGCGTGTGAAAAATGCTGAAACAAGTATCACACAACAAGCTAATCAGATTGCTCTAAAAGCAAACACTACTGATGTTAATGTTTTAACTAACAGGGTTGGTACAGCAGAAGCAACTCTAAACATACACTCTAATCAAATAGCGTTAAAAGCTAGCCAGTCAGATGTTAATAGTGCGAAGTCACGTTTGCAAAATGCTGAATCGAGTTTGACCGTTCAAGCTGGTGAGATAGCACAGCGTGTCAAAACCAGTGACTTTAATCAAGCTAAACAACGACTTGCAACAGCCGAAAGTAAGATTACCCAGTTGGGAGATAAGATTACTACCGAAATCAGCAAAGTTGAGGGAAAAATTCCATCATCGATTGGAGGAAGAAATCTTCTTGCCAAGAAATGGTTTAGGAAAGGTCTTTCGAGTGAACAATTTACGCTAAAGGCTTGGGCTGAACCACTAATATCCTATAAAACCTTGAACACTGTCCTAGAAGAAGGGAAAACCTATACTCTTAGTTTTGACTGGGAAGTTATTGGGAAAAGTACAGTGTCAACGATCTTTCAGTTGACGCTAGGATTTTTGGTATACAGTCATTCACATCAAAAATCTCGTAAGGAACTTAATATTTCTCGGGCAGTTTCTATCGGGGATAAAGGACGGTTTGAATTAACGTTTGTTTGTCCGCCACTTTTTGATGACAGTAACCTTTTAGCTTATACCAATCGCTATGCCGAAGGAAGTAATATTGATTATGATACGGTGAAATTCTCCAACGTTAATCTAGTTGAAGGAACTATTGCATACAAGCAATGGCTACAACCAATTGAGGATATTGAAGAGACATTTAGTTCTGTAAGAACGCTAATTACCCAAACTGCTGAAGGTCAAGAACAGTTATCAACGAAACTGACAGAAACGCAAGGAAAAGTGACTAATGCTGAAACTAGAATCAATCAGTTAGTTAACGACGTATCTAGCAAGGTCTCACAAACTGATTTTGACAGTATTAAAAAGACTGTACAGAGTAATAGTACTGCTATTACGCAAAATAAAAACGCAATTGGACTGAAAGCCGAAAAAACCTATATCGACGGTGTAAAAACGACCGCTAGTAATGCCCTTGCAAAAGCACAATCAAACGCTCAATCCATTAGTCAAACAAAAGCTGATTTGAAGATTACATCTGATGCGGTTGCGACCAAAGTGTCCAAATTGGATTTTGATGTAGCAACTAGACGATTAACTAATGCTGAGACAACTATCAGGACTCAAGCGGGTCAAATCGAACAGAGACTGACAAAAACACAAGTAGAGCAAGCTATTACATCTAAAGGCTATGCAACAAATACCATCGTCCAAAATCTCGTCAAAGAAACGACTGATGGTTTTGAGAGAAAAATCACTGAAACAAAAGGGTTGATTCCTACAGAAATGGGTGGGCGTAATCTTATTTTAAATTATGAAAATAGGATAATTTATGAATATAACTCACCGATAAACGTCATCAGAGAGACCGACATCACAGTGCCAGAGTGGGGAGCTACAAATGCTCATAGACTTGCGCTGACAACAAGTAAGGTGGGGACATTTGGCTATATGGCATCTGGACGTACAGCGCAGTTAGGTCATCAGATGTACCTCGATGGTACTAGATATACCGGATCCATTTATCTTAAAAATAATGGCAGTACTGCTTTCAGAGTTTCTATCAATACGGTATCCTCAAAGACGGTGATGCCTGGTCAATCATTGAGGTTATCGATTACTGATAGGGGTGACTCTAAACGATATGTACAGTTTACTTTTGTCAGTGATGTTGCTAATGCTCCTATTGATTTTACTTATTGGCATCCACAAATTGAAGTCGGTGAGTTGATGAGTTCAGCTTCTCCTGCTCCAGAAGACACGATCACAACTATTAAATTCAATGAAGTCAAAGACACTGTTGACAGCCATAGTCGTACCATAGGGGATATACAAGGCAATATTAGTTCTGTCGTTATGACGGCTAGTGGATTGCTCAGTCGGGTAAATAGTACAGAGACGGGATTAACCACAGTGCAGTCACAACTTGCTGGCTCGTGGGCAGTGCGTAATCTGACCAGTTCTGGAACGGTGCTTAACCAACTAAATTTAAATCGTGATGGTTCTGTAAAGATTGATGGTAAATTAGTGCAAATCACTGGGACGACCTATATCCAAGATGGCGTCATTACGTCTGCTAAAATAGCTAATTTGGATGCGGCTAAGATAACCACCGGGACACTAAATGCAGCCAATGTTAATATCGTTAATCTCAACGCCAATAAGCTTGTTGGGCTGGATGCCAACTTTATCAGATCCAAGATTGAAATGGCAATGATTGATTGGATGAAAGGCAAGACAATCACAGCGCAAAATAACGCTATGAGAATTAATCTTAATGATGCTAATATCACCTTTAACTCAAATGCGACAATTAATTTTAATTCTGCCTACAATGCTTTAGTCAGAAGAAAAGGCACTCACACGGCCTTTGTGCATTTCAATGATGTTTCGGCATCTTCAGATGGTGGCGTAGGTAGTCTGTATGCTTCAATCGGTGTAACCTCTTCTGGTGATGGTATTAACTCTCAGTCATCGGGTCGATTTGCAGGTTTAAGGGCATTTCGTGGCGCAAGAGGTACTGAACATAATGCCACAGTTGACCAGGTCGAAATTTACGGAGATAGAATTGTCTTAAAAGACGATTTTAGCTACAACCGTGGTTTTGAGTTTCGACCAACTACTTTAAAAAATGGGGATTTTATTGATATGAATTACCTTGTTGGCGCTGTGCGTGCTCTTAGTCGATGTTGGATTCACTGGAATAATGTGTCTTGGAATCCAGCAAGTAATGATTTAAGGAATGCTGTCGTTAGAGAATATAACAATTACATGAAAGATTTATAG

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
71105b0ecc5be0c1399ac9d0dce1ea41bb28695a9ff584bd94ec843af6354759
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7255
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Prophages and satellite prophages are widespread among Streptococcus species and may play a role in pneumococcal pathogenesis Rezaei Javan,R., Ramos-Sevillano,E., Akter,A., Brown,J. and Brueggemann,A.B. 2018-12-20 — GenBank