Genbank accession
UVD36933.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,83
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKTAGQRPAASVLAEGELAINLKDRTLFTKDDSGNIIDLSITAGGNISGNITQTGDYTQTGKFNLIGPQIVASGGYIEFNYRTTGSGAWSGQHTAKAPIFVDLSSATSTSEYNPIIKQRFKDGTFSLGTLVSEGSLKIHYIDETGQSKYWTFARSGNFQVDSGNLLVSGGYLVAQSNIETRTGSLIGPSVVTKNISFDTKAFGQYDSQSLVQYVYPGTGETNGINYLRKFRAKSGGTIYHELASAQTGKSDELSWWTGNTAVNKQMGLRNDGSLVLRRSLAIGTITTDENINNYGSTGAMGECYIVIGDAATGVSYKRSGVYDLVANGLSIASITPDSFRSTRKALFGRSEDQGGTWTMPGTNAAFLSVQTQADENSAGDGQTHIGYNSGGKMNHYFRGKGKTNINTQEGMEVNPGILKIVTGANNVMFYADGGITSTKQLSIYNGVYLAANNSTAGLTFAPTTTIDGTKQILWEGGKRAGQNKSYVTVKAWGNSFNASGDRNRETVFEVADGQGYYFYSQRVAPSGSETTGPVVTQFAGAVNARGSIITDGSFKVNGLSTLVGNVTMSNGLFVQGGSSVTGQVKIGGTADALRIWNAEYGAIFRRSESNLYIIPTPKDAGESGGISNLRPLIIELNTGTVKMSHDVHLGDSGSGTGLLQVSNSLKTIKMICPVTINERNAALTLDSPSSSSANYLQGSKAGTRSWYVGLGGAGNDLSLYSQSYGHGLVISDNFVSITKPFKVGNAQLGTDGNITNGSGNFANLNTTLNRKVNSGFITYGATAGWYKFATVTMPQSTSTVFFKIAGGSGFNSGLFTQCNIAEIVLRTSNERPADLNAVLYTRTIGSAFKDIAVNNVSGDTYDIYVSAGTYCNQLTCEWTCTENATVSVIGINSSTQSPVDALPDTAVNGQVANVLNNLVDRGKVKRYEADSEIAINNQTGIRIRSNGDKTGSIATMLRNDGGSFYILFTDKNATDGAATVNGDWNSKRPFAINLTTGEVLMNNGIAVRSAALFYNSINVKDNGSINFDKSGANPRNMRIFHAGDASRGNRIEIADETNYIAYFEKAPGGANRFVVNNATVAGVNQMNSFGININNALGGNSIAFGDNDTGIKQNGDGLLDIYANGVQTFRFQNGDLYSYKNINAPNVYIRSDIRLKSNFKPIENALDKVEKLNGVIYDKAEYIGGEAIETEAGIVAQTLQDVLPEAVRETEDSKGNKILTVSSQAQIALLVEAVKTLSSRVKELESKLM
Physico‐chemical
properties
protein length:1260 AA
molecular weight: 134345,92440 Da
isoelectric point:8,12535
aromaticity:0,08571
hydropathy:-0,27262

Domains

Domains [InterPro]
DC_1954
STR
1–1259
IPR048388
ATT
694–766
UVD36933.1
1 1260
Architecture
STR
ATT
STR
ATT
STR
STR 1-508 | ATT 509-645 | STR 646-693 | ATT 694-766 | STR 767-1259 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
UVD36933.1
1 1260
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 758 758 0,0460
Central domain 759 959 202 0,6973
C-terminal 960 1260 300 0,8118
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-758
Central
759-959
C-terminal
960-1260

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Shigella phage A2
[NCBI]
2973502 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Shigella flexneri 2a
[NCBI]
42897 Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacteriales > Enterobacteriaceae > Shigella

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
UVD36933.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OP197928 [NCBI]
CDS location
range 153447 -> 157229
strand +
CDS
ATGGCTACTTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAAGCAAAACTGCAGGTCAACGTCCTGCTGCTTCAGTATTAGCCGAAGGTGAATTGGCTATAAACTTAAAAGACCGTACTCTTTTTACTAAAGATGACTCGGGAAATATTATTGATTTAAGCATTACCGCTGGCGGTAATATTAGTGGAAATATCACTCAAACTGGCGATTATACACAGACTGGAAAATTTAATTTAATTGGTCCGCAAATTGTAGCAAGCGGTGGATATATTGAGTTTAATTATCGTACTACTGGAAGTGGGGCTTGGTCCGGTCAACACACTGCAAAAGCTCCAATTTTTGTAGATTTAAGCTCAGCTACTTCCACATCTGAATATAATCCTATAATTAAACAGCGCTTTAAAGATGGAACTTTTTCATTAGGTACTTTAGTTTCTGAAGGTTCGTTGAAGATTCATTATATTGATGAAACTGGTCAATCTAAATATTGGACATTTGCGCGCTCAGGTAATTTTCAAGTTGATTCTGGTAATTTATTAGTATCTGGTGGGTATTTAGTCGCTCAGAGTAATATTGAAACAAGAACAGGTTCTTTGATTGGTCCATCTGTTGTAACTAAAAATATTTCATTTGATACGAAAGCGTTTGGACAATACGATTCGCAGTCATTAGTTCAATATGTTTATCCTGGAACTGGTGAAACAAACGGAATTAATTACCTTCGTAAATTCCGTGCAAAATCTGGTGGTACGATTTATCATGAATTAGCTTCTGCACAAACCGGAAAAAGTGATGAACTGTCTTGGTGGACCGGTAATACAGCCGTTAATAAACAAATGGGCCTTCGCAATGATGGGTCTTTAGTGTTGCGACGCTCACTCGCAATTGGTACAATTACAACAGATGAAAACATTAATAATTACGGCTCCACTGGAGCAATGGGTGAATGCTATATAGTCATTGGAGATGCCGCAACTGGTGTATCATATAAAAGATCTGGTGTATATGATTTAGTTGCTAATGGTCTTTCTATCGCGTCTATTACTCCTGATAGTTTCCGTAGTACTCGTAAAGCGTTATTTGGACGTTCAGAAGACCAAGGCGGAACCTGGACAATGCCTGGAACGAATGCTGCATTTTTATCAGTTCAAACACAGGCTGATGAAAACAGTGCTGGAGACGGTCAGACACATATTGGCTATAATTCAGGCGGAAAAATGAACCACTATTTCCGCGGCAAAGGCAAAACTAATATTAATACTCAAGAAGGCATGGAAGTTAACCCGGGTATTCTTAAAATAGTAACCGGTGCAAATAATGTAATGTTTTATGCTGATGGCGGTATTACATCCACTAAGCAGCTTTCAATATATAATGGTGTATATTTAGCAGCTAATAATTCTACTGCTGGGCTAACATTCGCTCCAACTACTACAATTGATGGCACTAAGCAAATTTTGTGGGAAGGTGGTAAGCGCGCTGGACAGAATAAAAGCTATGTAACTGTTAAAGCGTGGGGTAATTCATTTAACGCATCTGGCGATCGTAATCGTGAAACAGTTTTTGAAGTAGCTGACGGACAAGGTTATTATTTTTATTCCCAGCGTGTAGCCCCAAGCGGCTCAGAAACTACTGGTCCTGTTGTAACTCAGTTTGCTGGAGCTGTTAATGCTAGAGGAAGTATTATTACTGACGGAAGTTTTAAAGTTAATGGATTGAGCACTTTAGTCGGTAATGTTACCATGTCTAATGGTTTGTTTGTCCAAGGTGGTTCTTCTGTTACTGGACAAGTTAAAATCGGCGGAACTGCTGATGCATTAAGAATTTGGAATGCCGAATATGGTGCTATTTTCCGTCGCTCAGAAAGTAATCTTTATATTATCCCGACTCCTAAAGATGCTGGAGAATCTGGTGGTATAAGTAATCTTAGACCATTGATAATAGAACTGAACACTGGCACAGTTAAAATGTCGCATGATGTTCATTTAGGAGATTCTGGATCTGGTACAGGATTATTACAAGTAAGTAATAGTCTTAAAACTATTAAAATGATATGTCCAGTAACTATTAATGAACGCAATGCAGCGCTTACTCTAGATTCTCCTTCATCTTCTTCTGCTAATTATTTGCAGGGTTCTAAAGCTGGAACTAGATCGTGGTATGTTGGTCTTGGTGGTGCTGGAAATGATTTATCACTTTATAGCCAATCTTATGGGCATGGTCTTGTTATAAGTGATAATTTCGTGTCAATCACTAAACCCTTTAAAGTCGGAAATGCCCAACTAGGAACTGACGGTAATATTACCAACGGTTCAGGAAACTTTGCTAACTTAAATACCACGTTAAATCGTAAAGTTAATTCTGGATTTATTACTTATGGAGCAACTGCTGGATGGTATAAGTTTGCAACAGTAACAATGCCACAATCCACTTCGACAGTCTTCTTTAAAATAGCCGGTGGTTCTGGATTTAATAGCGGATTATTCACACAATGTAATATTGCTGAAATTGTTTTACGTACTAGCAATGAAAGACCTGCTGACTTAAATGCTGTATTATACACAAGAACAATTGGATCTGCATTTAAAGATATTGCAGTTAATAACGTCTCTGGAGATACATATGACATTTATGTTTCTGCCGGAACATATTGCAATCAATTAACTTGTGAATGGACATGTACTGAAAACGCTACGGTTAGTGTTATTGGTATTAACTCATCTACACAATCGCCTGTAGATGCTCTTCCAGACACAGCAGTTAACGGTCAAGTTGCTAATGTTCTTAATAACTTGGTTGATCGCGGTAAAGTTAAACGTTACGAAGCTGATTCTGAAATAGCTATTAATAACCAAACCGGCATTCGTATTAGAAGCAACGGCGATAAAACTGGTTCTATTGCTACAATGCTACGAAATGATGGCGGTAGTTTTTATATTCTGTTTACAGATAAAAATGCCACCGATGGCGCAGCAACTGTTAACGGCGATTGGAATAGTAAGCGTCCTTTCGCAATTAACTTAACAACCGGTGAAGTGCTAATGAATAACGGTATAGCTGTTCGCAGCGCTGCTTTATTCTATAATAGCATAAACGTCAAAGATAATGGTTCTATTAACTTTGATAAATCAGGCGCTAACCCTAGAAATATGAGAATATTTCATGCTGGCGATGCTTCTCGCGGTAACCGTATTGAAATTGCCGATGAAACTAACTATATTGCTTACTTTGAAAAAGCTCCAGGTGGAGCTAACCGCTTTGTAGTAAATAATGCTACTGTGGCTGGTGTTAATCAAATGAATTCATTTGGTATTAACATCAATAACGCACTTGGTGGAAACAGTATAGCATTTGGTGATAATGACACGGGTATTAAGCAAAACGGCGATGGATTATTAGACATTTATGCGAATGGTGTGCAAACGTTCCGTTTCCAAAACGGTGATTTGTACTCATATAAAAATATAAATGCCCCAAACGTTTATATTCGTTCTGATATTCGCTTAAAATCTAATTTCAAACCTATCGAAAATGCACTTGATAAAGTTGAAAAACTCAATGGTGTCATTTATGATAAAGCTGAATACATCGGTGGAGAGGCAATTGAAACTGAAGCGGGTATTGTGGCTCAAACGTTACAAGACGTTTTACCAGAAGCTGTCCGTGAAACAGAAGACAGCAAGGGTAATAAAATACTCACTGTTTCTTCTCAAGCCCAGATTGCTCTTCTGGTTGAAGCTGTGAAAACACTTTCTTCTCGTGTAAAAGAACTTGAATCTAAACTTATGTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
7b12ad4b0faafe905fd00d62ea7149480c2b6d676fbcc87cc852890eaf68bca9
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5288
Oligomeric State monomer
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50