Protein
View in Explore- Genbank accession
- UVD36933.1 [GenBank]
- Protein name
- hypothetical protein
- RBP type
-
TSPTSPTF
- Protein sequence
-
MATLKQIQFKRSKTAGQRPAASVLAEGELAINLKDRTLFTKDDSGNIIDLSITAGGNISGNITQTGDYTQTGKFNLIGPQIVASGGYIEFNYRTTGSGAWSGQHTAKAPIFVDLSSATSTSEYNPIIKQRFKDGTFSLGTLVSEGSLKIHYIDETGQSKYWTFARSGNFQVDSGNLLVSGGYLVAQSNIETRTGSLIGPSVVTKNISFDTKAFGQYDSQSLVQYVYPGTGETNGINYLRKFRAKSGGTIYHELASAQTGKSDELSWWTGNTAVNKQMGLRNDGSLVLRRSLAIGTITTDENINNYGSTGAMGECYIVIGDAATGVSYKRSGVYDLVANGLSIASITPDSFRSTRKALFGRSEDQGGTWTMPGTNAAFLSVQTQADENSAGDGQTHIGYNSGGKMNHYFRGKGKTNINTQEGMEVNPGILKIVTGANNVMFYADGGITSTKQLSIYNGVYLAANNSTAGLTFAPTTTIDGTKQILWEGGKRAGQNKSYVTVKAWGNSFNASGDRNRETVFEVADGQGYYFYSQRVAPSGSETTGPVVTQFAGAVNARGSIITDGSFKVNGLSTLVGNVTMSNGLFVQGGSSVTGQVKIGGTADALRIWNAEYGAIFRRSESNLYIIPTPKDAGESGGISNLRPLIIELNTGTVKMSHDVHLGDSGSGTGLLQVSNSLKTIKMICPVTINERNAALTLDSPSSSSANYLQGSKAGTRSWYVGLGGAGNDLSLYSQSYGHGLVISDNFVSITKPFKVGNAQLGTDGNITNGSGNFANLNTTLNRKVNSGFITYGATAGWYKFATVTMPQSTSTVFFKIAGGSGFNSGLFTQCNIAEIVLRTSNERPADLNAVLYTRTIGSAFKDIAVNNVSGDTYDIYVSAGTYCNQLTCEWTCTENATVSVIGINSSTQSPVDALPDTAVNGQVANVLNNLVDRGKVKRYEADSEIAINNQTGIRIRSNGDKTGSIATMLRNDGGSFYILFTDKNATDGAATVNGDWNSKRPFAINLTTGEVLMNNGIAVRSAALFYNSINVKDNGSINFDKSGANPRNMRIFHAGDASRGNRIEIADETNYIAYFEKAPGGANRFVVNNATVAGVNQMNSFGININNALGGNSIAFGDNDTGIKQNGDGLLDIYANGVQTFRFQNGDLYSYKNINAPNVYIRSDIRLKSNFKPIENALDKVEKLNGVIYDKAEYIGGEAIETEAGIVAQTLQDVLPEAVRETEDSKGNKILTVSSQAQIALLVEAVKTLSSRVKELESKLM
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1260 AA molecular weight: 134345,92440 Da isoelectric point: 8,12535 aromaticity: 0,08571 hydropathy: -0,27262
Domains
Domains [InterPro]
DC_1954
STR
1–1259
STR
1–1259
IPR048390
ATT
509–645
ATT
509–645
IPR048388
ATT
694–766
ATT
694–766
1
1260
Architecture
STR 1-508 | ATT 509-645 | STR 646-693 | ATT 694-766 | STR 767-1259 |
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Tail Spike Domain Segmentation
Tail Spike Domain Segmentation
This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.
Domain Layout
1
1260
| Domain | Start | End | Length (AA) | Confidence |
|---|---|---|---|---|
| N-terminal | 1 | 758 | 758 | 0,0460 |
| Central domain | 759 | 959 | 202 | 0,6973 |
| C-terminal | 960 | 1260 | 300 | 0,8118 |
Note: Constraints were applied during segmentation.
Fixed 273 C-terminal predictions appearing before Central domain
Fixed 273 C-terminal predictions appearing before Central domain
Legend:
N-terminal
Central domain
C-terminal
3D Structure with Domain Coloring
The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).
Domain Coloring
N-terminal
1-758
1-758
Central
759-959
759-959
C-terminal
960-1260
960-1260
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Shigella phage A2 [NCBI] |
2973502 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host |
Shigella flexneri 2a [NCBI] |
42897 | Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacteriales > Enterobacteriaceae > Shigella |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
UVD36933.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
OP197928
[NCBI]
CDS location
range 153447 -> 157229
strand +
strand +
CDS
ATGGCTACTTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAAGCAAAACTGCAGGTCAACGTCCTGCTGCTTCAGTATTAGCCGAAGGTGAATTGGCTATAAACTTAAAAGACCGTACTCTTTTTACTAAAGATGACTCGGGAAATATTATTGATTTAAGCATTACCGCTGGCGGTAATATTAGTGGAAATATCACTCAAACTGGCGATTATACACAGACTGGAAAATTTAATTTAATTGGTCCGCAAATTGTAGCAAGCGGTGGATATATTGAGTTTAATTATCGTACTACTGGAAGTGGGGCTTGGTCCGGTCAACACACTGCAAAAGCTCCAATTTTTGTAGATTTAAGCTCAGCTACTTCCACATCTGAATATAATCCTATAATTAAACAGCGCTTTAAAGATGGAACTTTTTCATTAGGTACTTTAGTTTCTGAAGGTTCGTTGAAGATTCATTATATTGATGAAACTGGTCAATCTAAATATTGGACATTTGCGCGCTCAGGTAATTTTCAAGTTGATTCTGGTAATTTATTAGTATCTGGTGGGTATTTAGTCGCTCAGAGTAATATTGAAACAAGAACAGGTTCTTTGATTGGTCCATCTGTTGTAACTAAAAATATTTCATTTGATACGAAAGCGTTTGGACAATACGATTCGCAGTCATTAGTTCAATATGTTTATCCTGGAACTGGTGAAACAAACGGAATTAATTACCTTCGTAAATTCCGTGCAAAATCTGGTGGTACGATTTATCATGAATTAGCTTCTGCACAAACCGGAAAAAGTGATGAACTGTCTTGGTGGACCGGTAATACAGCCGTTAATAAACAAATGGGCCTTCGCAATGATGGGTCTTTAGTGTTGCGACGCTCACTCGCAATTGGTACAATTACAACAGATGAAAACATTAATAATTACGGCTCCACTGGAGCAATGGGTGAATGCTATATAGTCATTGGAGATGCCGCAACTGGTGTATCATATAAAAGATCTGGTGTATATGATTTAGTTGCTAATGGTCTTTCTATCGCGTCTATTACTCCTGATAGTTTCCGTAGTACTCGTAAAGCGTTATTTGGACGTTCAGAAGACCAAGGCGGAACCTGGACAATGCCTGGAACGAATGCTGCATTTTTATCAGTTCAAACACAGGCTGATGAAAACAGTGCTGGAGACGGTCAGACACATATTGGCTATAATTCAGGCGGAAAAATGAACCACTATTTCCGCGGCAAAGGCAAAACTAATATTAATACTCAAGAAGGCATGGAAGTTAACCCGGGTATTCTTAAAATAGTAACCGGTGCAAATAATGTAATGTTTTATGCTGATGGCGGTATTACATCCACTAAGCAGCTTTCAATATATAATGGTGTATATTTAGCAGCTAATAATTCTACTGCTGGGCTAACATTCGCTCCAACTACTACAATTGATGGCACTAAGCAAATTTTGTGGGAAGGTGGTAAGCGCGCTGGACAGAATAAAAGCTATGTAACTGTTAAAGCGTGGGGTAATTCATTTAACGCATCTGGCGATCGTAATCGTGAAACAGTTTTTGAAGTAGCTGACGGACAAGGTTATTATTTTTATTCCCAGCGTGTAGCCCCAAGCGGCTCAGAAACTACTGGTCCTGTTGTAACTCAGTTTGCTGGAGCTGTTAATGCTAGAGGAAGTATTATTACTGACGGAAGTTTTAAAGTTAATGGATTGAGCACTTTAGTCGGTAATGTTACCATGTCTAATGGTTTGTTTGTCCAAGGTGGTTCTTCTGTTACTGGACAAGTTAAAATCGGCGGAACTGCTGATGCATTAAGAATTTGGAATGCCGAATATGGTGCTATTTTCCGTCGCTCAGAAAGTAATCTTTATATTATCCCGACTCCTAAAGATGCTGGAGAATCTGGTGGTATAAGTAATCTTAGACCATTGATAATAGAACTGAACACTGGCACAGTTAAAATGTCGCATGATGTTCATTTAGGAGATTCTGGATCTGGTACAGGATTATTACAAGTAAGTAATAGTCTTAAAACTATTAAAATGATATGTCCAGTAACTATTAATGAACGCAATGCAGCGCTTACTCTAGATTCTCCTTCATCTTCTTCTGCTAATTATTTGCAGGGTTCTAAAGCTGGAACTAGATCGTGGTATGTTGGTCTTGGTGGTGCTGGAAATGATTTATCACTTTATAGCCAATCTTATGGGCATGGTCTTGTTATAAGTGATAATTTCGTGTCAATCACTAAACCCTTTAAAGTCGGAAATGCCCAACTAGGAACTGACGGTAATATTACCAACGGTTCAGGAAACTTTGCTAACTTAAATACCACGTTAAATCGTAAAGTTAATTCTGGATTTATTACTTATGGAGCAACTGCTGGATGGTATAAGTTTGCAACAGTAACAATGCCACAATCCACTTCGACAGTCTTCTTTAAAATAGCCGGTGGTTCTGGATTTAATAGCGGATTATTCACACAATGTAATATTGCTGAAATTGTTTTACGTACTAGCAATGAAAGACCTGCTGACTTAAATGCTGTATTATACACAAGAACAATTGGATCTGCATTTAAAGATATTGCAGTTAATAACGTCTCTGGAGATACATATGACATTTATGTTTCTGCCGGAACATATTGCAATCAATTAACTTGTGAATGGACATGTACTGAAAACGCTACGGTTAGTGTTATTGGTATTAACTCATCTACACAATCGCCTGTAGATGCTCTTCCAGACACAGCAGTTAACGGTCAAGTTGCTAATGTTCTTAATAACTTGGTTGATCGCGGTAAAGTTAAACGTTACGAAGCTGATTCTGAAATAGCTATTAATAACCAAACCGGCATTCGTATTAGAAGCAACGGCGATAAAACTGGTTCTATTGCTACAATGCTACGAAATGATGGCGGTAGTTTTTATATTCTGTTTACAGATAAAAATGCCACCGATGGCGCAGCAACTGTTAACGGCGATTGGAATAGTAAGCGTCCTTTCGCAATTAACTTAACAACCGGTGAAGTGCTAATGAATAACGGTATAGCTGTTCGCAGCGCTGCTTTATTCTATAATAGCATAAACGTCAAAGATAATGGTTCTATTAACTTTGATAAATCAGGCGCTAACCCTAGAAATATGAGAATATTTCATGCTGGCGATGCTTCTCGCGGTAACCGTATTGAAATTGCCGATGAAACTAACTATATTGCTTACTTTGAAAAAGCTCCAGGTGGAGCTAACCGCTTTGTAGTAAATAATGCTACTGTGGCTGGTGTTAATCAAATGAATTCATTTGGTATTAACATCAATAACGCACTTGGTGGAAACAGTATAGCATTTGGTGATAATGACACGGGTATTAAGCAAAACGGCGATGGATTATTAGACATTTATGCGAATGGTGTGCAAACGTTCCGTTTCCAAAACGGTGATTTGTACTCATATAAAAATATAAATGCCCCAAACGTTTATATTCGTTCTGATATTCGCTTAAAATCTAATTTCAAACCTATCGAAAATGCACTTGATAAAGTTGAAAAACTCAATGGTGTCATTTATGATAAAGCTGAATACATCGGTGGAGAGGCAATTGAAACTGAAGCGGGTATTGTGGCTCAAACGTTACAAGACGTTTTACCAGAAGCTGTCCGTGAAACAGAAGACAGCAAGGGTAATAAAATACTCACTGTTTCTTCTCAAGCCCAGATTGCTCTTCTGGTTGAAGCTGTGAAAACACTTTCTTCTCGTGTAAAAGAACTTGAATCTAAACTTATGTAA
Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
7b12ad4b0faafe905fd00d62ea7149480c2b6d676fbcc87cc852890eaf68bca9
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50