Protein

View in Explore
Genbank accession
QBX22251.1 [GenBank]
Protein name
tail fibers protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
Protein sequence
MQITFYDKNMIETATADNQLLNAIKIKKASLSSYFEEATHYVEFEFSKETGEWWGIKENGYLAFRFRGKFYRFNIVKFKEDVKTNSISILGDYFNLEMLNENCLAYEKQPSRTIVQHLVAMEILPYANFEIGVNELASSSRVVEYTGEEMKYKRLISLINNFDGECQFEIRQKRNGEFDKLILNIYKANDGEKIQGVGRNRRDLELNIDNTNNISRSVDSTTIRTAIEPTGKDGLRLGNSGKTWRNNDGRVEFEQKDGRIYAVIAAEETTRVLSNDKWLVWKQNFDTDSLDKLESESYKWIKNNCYAKETIEVAGSFDVEIGDTVILNHKGVGRYGLLGTLRVVKIVWDLLTEENEVSFANFKRLSSKISAQGLALQESIETPASYDITFNTTAGQVFKNNTGASIVSFNFKKNGLDAAVIGQRWYNGTQLLSNGLEVTIKPDMLTDGKLNLRLEVDVTDAITFSKELTFINVSDGEKGNGIESGKVTYGKTTSISTQPVNWSDSRPAVGQGEVLWSKTTLSYTDKNVPDTIDIKYTYQGKDGALDEEQYNAIVAKNVSQDELISQVKSTADAAKDTASVALSNIVSESKKLTDQMSALSKTEGEHYSATSQQLTQIDGTVKGLQTDYTALVNKDNEITQTLTNYKQTIDQNTAHIAENKQSVDGTISSLQTQVTQNKNDIATKASQLTVNNLSGRMSSAETTITQNANEISTRLSQTNIESLITSKATVITDNKVKETSDSFSREITRVEGLVDGIFSGNRNLLVNTKSMDNIPYTSANKTSETYMGGSVVSALGQSGSYKDAFRQKMSIVPDELEYIVSFYAKSTAVSHNVTCYFYAPNTTIKSVSSQGVVNDRPTGSDGSINISLTNEWKRYWIKWTLRAPKDDTEKIPKEVIVGRNWDSVNSVSIALPALYAGNLNTEWSQAPEDLKAVTDGLTIKYNTVKDTVDSHTQQIGQQGISLTTTIQRVDSIQSSVSSIDGRLSTVTQTADGLVTTVQNLSVGGNNLLLNADFELLENKTSFTVGGVTYSQGPKYWSTYNGGIPNPVTSFHSYSGSFAGRNNVVIFNESDGSRNWKAINQSIGKTIMSDFPDSTDDFILSFDAYADLSGAKLFGGFYYVNKLTGTANFHAGQFTVNLITSGSWNRYSVKVPFNKDNCDFSKTFSFLIYGYGFSSNAILALDNVKLETGTISSAFSKSKKELDDQISSIQTTVTQTSNSWAVKNLTSNGSILSQINLTDGTVKIDGKYVKITGQTLIDNGIITNAMIKDLTADKIIGGTIDANKISVINLNASNITSGQISGGLIKGGVLTALNGAMSIDLNNGTTEMYNDNPAIRRVTADLPNQFIKFSTGTQPNDNNYRIIGSGTKSNLTAAITSIGTNRLRTENNLDGGFTGINIYAGGSGTGDSVVDRIEISSDILKIAHSANSSDRGWVFENINGLNNQYVFRPNTTYQDTYKAMIGTSLNPVDEMYINEMYIKGQRLGYILKDIANRIGNVGSWAAVIS
Physico‐chemical
properties
protein length:1504 AA
molecular weight: 165512,59020 Da
isoelectric point:5,35295
aromaticity:0,08577
hydropathy:-0,38684

Domains

Domains [InterPro]
DC_0266
STR
1–636
DC_0266 DC_2006 IPR012892
DC_2025
RBD
930–1501
DC_2025
QBX22251.1
1 1504
Architecture
STR
STR
RBD
STR 1-636 | STR 661-982 | RBD 983-1501 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Streptococcus phage Javan645
[NCBI] 		2548298 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Streptococcus urinalis
[NCBI] 		149016 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Bacillota > Bacilli > Lactobacillales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QBX22251.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MK448826.1 [NCBI]
CDS location
range 28881 -> 33395
strand +
CDS
GTGCAGATTACTTTTTATGATAAGAATATGATTGAAACAGCAACTGCTGACAATCAATTGTTAAATGCTATCAAAATTAAAAAGGCATCATTATCATCATATTTTGAAGAGGCAACTCATTATGTTGAGTTTGAATTTTCAAAAGAAACAGGTGAATGGTGGGGGATCAAAGAAAATGGCTATCTTGCATTTAGATTTAGAGGCAAATTTTATAGATTTAATATCGTAAAATTCAAAGAAGATGTCAAAACCAATTCCATCAGCATTTTAGGTGATTATTTCAATCTAGAAATGCTAAATGAGAACTGTTTAGCATATGAAAAACAACCATCAAGGACTATTGTACAGCATTTAGTAGCAATGGAGATTTTGCCATATGCTAACTTTGAAATAGGTGTCAATGAACTAGCAAGCAGCAGCAGAGTTGTTGAATATACAGGTGAAGAGATGAAATACAAAAGACTCATCTCTCTAATCAATAACTTTGATGGTGAGTGTCAATTTGAAATTAGACAAAAAAGAAATGGTGAGTTTGACAAACTAATTCTAAATATCTATAAAGCAAATGATGGTGAAAAAATTCAAGGTGTTGGTAGAAATAGAAGAGATTTAGAACTCAATATTGATAACACTAACAACATTAGCAGATCGGTTGATTCAACAACTATAAGAACAGCTATTGAACCAACAGGAAAAGATGGGTTGAGGTTAGGCAATAGCGGAAAAACCTGGAGAAATAATGATGGTAGAGTTGAATTTGAACAAAAAGATGGCAGAATTTATGCTGTTATTGCTGCCGAAGAAACAACTCGTGTATTATCTAATGACAAATGGTTAGTTTGGAAACAAAATTTTGATACTGATTCATTAGATAAACTTGAGTCTGAGTCATACAAATGGATAAAAAACAATTGTTATGCAAAAGAAACCATTGAGGTTGCAGGGTCTTTTGATGTTGAAATTGGAGATACTGTAATTTTGAATCATAAAGGTGTTGGTAGATATGGGCTTTTGGGAACTTTGCGTGTTGTTAAAATTGTATGGGATTTACTAACTGAGGAAAATGAAGTCTCATTTGCTAATTTCAAACGATTATCATCCAAAATTTCTGCTCAAGGTCTTGCTTTACAAGAAAGTATTGAGACACCTGCAAGTTATGATATTACATTTAATACAACTGCCGGACAAGTTTTTAAAAACAACACTGGGGCATCAATAGTATCATTCAATTTTAAAAAGAATGGATTGGATGCTGCTGTCATTGGTCAAAGATGGTACAATGGCACTCAACTATTATCAAATGGCTTAGAAGTGACAATAAAGCCTGACATGCTGACAGATGGCAAGTTAAATTTGAGGCTTGAGGTTGATGTCACTGATGCAATTACATTTAGCAAAGAGTTAACATTTATCAATGTTAGTGACGGCGAAAAAGGGAATGGCATTGAGTCAGGAAAAGTCACATATGGCAAGACAACATCAATATCAACCCAACCTGTAAATTGGTCAGATAGCAGGCCAGCTGTCGGTCAGGGAGAGGTGCTTTGGTCAAAAACAACACTATCATATACTGATAAAAATGTTCCTGATACTATCGATATAAAGTATACATATCAAGGTAAAGACGGGGCGCTAGACGAAGAACAATATAATGCAATTGTTGCAAAAAATGTCAGTCAAGATGAGCTAATAAGTCAAGTTAAATCAACAGCTGATGCTGCTAAGGATACCGCGAGTGTTGCCTTGTCTAACATAGTTAGTGAGTCTAAAAAATTAACTGATCAGATGTCCGCTTTGTCTAAAACAGAAGGCGAACATTACTCTGCAACATCTCAACAACTAACTCAAATTGATGGAACTGTAAAAGGTCTACAAACTGATTACACTGCATTAGTTAACAAAGATAATGAGATTACTCAGACATTAACTAACTACAAGCAGACTATCGATCAGAATACAGCCCACATTGCAGAAAATAAACAATCTGTCGATGGAACGATCAGCAGTCTACAAACACAAGTTACTCAAAATAAAAATGATATTGCCACAAAAGCAAGTCAGTTAACAGTAAATAACTTATCAGGTCGAATGTCTAGCGCTGAGACGACTATCACGCAGAATGCTAACGAGATTAGTACACGATTATCTCAGACTAATATCGAGTCACTCATTACTAGCAAAGCAACTGTCATTACGGATAACAAAGTCAAAGAGACATCAGATAGTTTTAGTCGTGAGATAACGAGAGTTGAAGGATTAGTTGATGGGATTTTTTCAGGCAATCGTAACCTATTGGTTAATACAAAATCAATGGACAATATACCTTATACATCAGCAAATAAGACTTCAGAGACATACATGGGTGGTTCTGTTGTTTCAGCGTTGGGTCAATCTGGTAGCTACAAAGATGCTTTTAGACAAAAAATGAGCATTGTTCCTGACGAATTAGAGTATATTGTTTCTTTTTACGCAAAATCAACGGCTGTCAGTCATAATGTGACTTGTTATTTTTACGCACCTAACACGACAATAAAATCGGTTTCGTCCCAAGGGGTTGTAAATGATAGACCTACCGGTTCTGATGGGTCCATAAATATCTCATTAACGAATGAGTGGAAACGATATTGGATAAAATGGACTCTCAGAGCTCCAAAAGACGATACGGAAAAAATTCCAAAGGAAGTAATTGTCGGAAGGAATTGGGATAGTGTTAACAGCGTGTCTATCGCTTTACCTGCTTTATACGCTGGCAATCTTAACACAGAGTGGTCTCAAGCTCCCGAAGACCTCAAAGCTGTCACAGATGGATTAACTATCAAATACAACACAGTAAAAGATACAGTAGATAGTCACACTCAACAAATTGGTCAGCAGGGAATATCTTTAACGACTACAATTCAAAGAGTAGACTCTATCCAATCGTCAGTAAGCAGTATTGACGGTAGGTTATCGACAGTCACACAGACTGCTGATGGACTTGTAACAACAGTTCAAAATCTATCTGTTGGTGGAAATAATCTGTTGTTAAATGCTGATTTTGAATTATTAGAAAATAAAACATCTTTTACTGTTGGTGGAGTTACTTATTCACAAGGTCCTAAATATTGGTCGACTTATAATGGTGGAATTCCGAATCCAGTAACATCTTTTCATTCATATAGTGGTTCGTTTGCCGGTCGAAATAATGTTGTAATTTTCAATGAATCTGACGGATCAAGGAATTGGAAAGCAATAAATCAATCAATAGGAAAAACAATAATGTCAGATTTTCCTGATTCAACAGATGATTTTATTCTTTCGTTTGATGCATATGCTGATCTATCCGGTGCTAAATTATTTGGTGGTTTTTATTATGTTAACAAATTGACTGGTACAGCGAATTTCCACGCCGGGCAATTTACAGTCAACTTAATAACTTCTGGATCTTGGAACAGATACTCTGTTAAAGTTCCGTTTAACAAGGATAACTGTGATTTTAGTAAGACATTTTCATTTTTAATCTACGGTTATGGTTTTTCATCAAATGCAATATTAGCGCTTGATAATGTTAAGTTAGAAACAGGAACAATATCATCAGCATTTAGCAAATCTAAAAAAGAACTTGACGATCAAATATCATCAATTCAAACGACAGTTACCCAAACATCCAATAGCTGGGCGGTTAAAAACTTAACATCAAATGGTTCAATCCTTAGTCAAATCAATCTAACCGATGGCACAGTAAAAATTGATGGTAAGTATGTTAAAATCACCGGTCAGACATTAATTGACAACGGTATTATTACTAATGCAATGATTAAGGATTTGACAGCTGATAAAATTATAGGTGGTACCATTGATGCAAATAAAATATCAGTAATTAATTTAAATGCGAGTAACATTACTTCAGGTCAGATTTCTGGAGGTCTTATTAAAGGTGGCGTTTTAACCGCATTAAATGGTGCGATGTCGATTGATTTGAATAATGGTACAACAGAAATGTACAATGATAACCCAGCAATCAGAAGAGTAACTGCTGATTTACCAAATCAATTTATTAAATTCAGTACTGGTACTCAACCCAATGACAACAATTATAGAATTATTGGTTCCGGCACAAAATCAAATTTGACAGCTGCTATTACATCAATTGGCACTAATCGATTGCGAACGGAAAATAATTTAGATGGTGGTTTTACTGGCATCAATATCTACGCTGGTGGAAGTGGAACTGGTGACAGCGTTGTAGACAGAATTGAAATTTCATCAGATATTTTAAAAATTGCGCATTCAGCGAATTCTAGTGATAGAGGCTGGGTATTTGAAAATATTAATGGTTTGAATAACCAGTATGTTTTTAGACCAAATACGACATATCAGGATACGTATAAAGCAATGATTGGAACATCTCTGAATCCTGTTGATGAAATGTACATTAATGAAATGTATATTAAAGGCCAACGTTTGGGTTATATACTAAAAGACATAGCTAATCGAATCGGTAATGTAGGCTCATGGGCAGCAGTTATCTCATAG

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
b820f4014f3f3fc7974cdd9e41b4e27cd82d62b60de840a27c3d241b5006bf59
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7538
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50