Protein

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UniProt accession
Q58MX6 [UniProt]
Protein name
Phage tail fiber-like protein
RBP type
TF
Evidence UniProt/TrEMBL
Probability 1,00
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,89
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,68
Protein sequence
MAAFDFPNSPSLNDTHTENGVIWKWNGYAWDRVPSSGPQGAPGPTGPAGPTGPSGPTGGDGPPGPGGPGGGTGPAGPPGPPGNDGADGSDGGTGTPGPAGPPGPPGNDGADGNDGGSGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPAGARNYTITNSGSGSYCVDSVCSNPTITLLRGLSYTFTVNASGHPFYIKTSQTTGTANQYNTGVTNNGTQSGTITWNVASDAPSTLYYICQYHSAMTGTISISDLGPAGPPGPTGPTGPTGPTGPTGPSGGTGPTGPAGADGSDGADGGTGPTGPAGPTGGDGPPGPTGPGGTGPTGPTGDDGPPGPPGPGGTGPAGPPGPPGADGDDGGSGPPGPPGSDGSDGGSGPPGPPGPTGGDGPPGPGGTGPTGPTGPTGPSGGSGPPGPPGTSGATVIPSGTVMVFMQSSAPTGWSRTSSYDGRAIRISSSGGGTGGSRSWDNTFDYITKWHSNVLTGRVTDGHTLTSSQGPVHNHSYDVPRGSWGGQYGFQDTANSGSSGTQAVAGNTPGGGSHSHDLNNISLNIGTYVDRRLVYATAIICSKN
Physico‐chemical
properties
protein length:559 AA
molecular weight: 52768,46990 Da
isoelectric point:4,43511
aromaticity:0,05367
hydropathy:-0,67084

Domains

Domains [InterPro]
DC_0856
STR
54–546
DC_0856
IPR008972
STR
160–241
IPR008972 IPR050149
IPR008972
STR
160–246
IPR008972
Q58MX6
1 559
Architecture
STR
STR 54-546 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Prochlorococcus phage P-SSM2
[NCBI] 		268746 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Salacisavirus > Salacisavirus pssm2
Host Prochlorococcus
[NCBI] 		1218 Bacteria > Cyanobacteria > Prochlorales > Prochlorococcaceae >
Host Prochlorococcus marinus str. NATL1A
[NCBI] 		167555 Bacteria > Cyanobacteria > Prochlorales > Prochlorococcaceae > Prochlorococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AAX44406.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
AY939844 [NCBI]
CDS location
range 25115 -> 26794
strand +
CDS
ATGGCAGCATTCGATTTTCCAAACAGTCCGTCCCTTAATGATACCCATACAGAAAATGGGGTAATTTGGAAGTGGAATGGATACGCTTGGGATAGAGTTCCAAGTAGTGGTCCGCAAGGTGCTCCTGGTCCTACAGGTCCAGCAGGTCCTACAGGTCCATCAGGTCCTACAGGTGGAGATGGTCCTCCAGGTCCAGGTGGTCCAGGTGGTGGCACAGGTCCAGCAGGTCCTCCAGGTCCTCCTGGAAATGATGGTGCTGATGGTTCTGATGGTGGAACTGGTACTCCAGGTCCAGCAGGTCCTCCAGGTCCTCCTGGAAATGATGGTGCTGATGGAAATGATGGTGGATCAGGTCCTACTGGTCCGACAGGTCCCACAGGACCAACTGGTCCCACAGGTCCAACTGGTCCTGCTGGAGCAAGAAATTATACTATAACAAATAGTGGATCTGGTTCTTACTGTGTTGATAGTGTATGCAGTAATCCAACAATAACTTTATTAAGAGGTTTAAGTTATACTTTTACTGTAAATGCAAGTGGACATCCATTCTATATTAAGACCTCTCAAACTACTGGAACGGCTAATCAATATAATACGGGAGTAACAAATAACGGTACTCAATCAGGAACTATAACTTGGAATGTTGCATCTGACGCACCAAGTACTCTTTATTATATTTGTCAATATCATAGTGCTATGACAGGCACTATTTCTATATCAGATTTAGGTCCTGCTGGTCCTCCAGGTCCAACTGGTCCTACAGGACCTACAGGTCCAACTGGTCCAACTGGTCCTTCAGGTGGAACTGGTCCAACTGGTCCTGCTGGTGCTGACGGAAGTGATGGTGCTGATGGTGGAACTGGTCCGACTGGTCCTGCTGGTCCTACTGGTGGAGATGGTCCTCCAGGTCCAACTGGTCCAGGCGGAACTGGTCCAACTGGTCCTACTGGTGATGATGGTCCTCCAGGTCCTCCAGGTCCAGGCGGAACTGGTCCTGCTGGTCCTCCAGGACCTCCTGGTGCTGACGGTGATGATGGGGGAAGTGGTCCTCCAGGTCCTCCAGGTTCTGATGGTTCTGATGGAGGAAGTGGTCCTCCAGGACCTCCAGGTCCTACTGGTGGAGATGGTCCTCCTGGTCCAGGTGGAACTGGTCCGACTGGTCCAACTGGTCCAACAGGTCCTTCAGGTGGAAGTGGTCCTCCAGGTCCACCAGGAACTTCAGGTGCTACAGTAATTCCTTCAGGCACTGTTATGGTATTCATGCAAAGTTCTGCTCCTACTGGATGGTCTAGAACTTCATCTTATGATGGTAGGGCGATAAGAATTTCAAGTTCTGGTGGTGGTACTGGTGGTAGTAGATCTTGGGATAATACTTTTGATTATATAACTAAGTGGCATAGTAATGTACTTACTGGTAGAGTTACTGATGGACATACATTAACATCATCTCAAGGTCCAGTTCACAACCACTCTTATGATGTTCCTCGTGGATCTTGGGGTGGACAGTATGGTTTCCAAGATACAGCAAACTCTGGTTCTTCTGGAACTCAAGCAGTTGCTGGTAATACACCAGGAGGTGGAAGTCACAGTCACGATCTTAATAACATATCTCTTAATATTGGAACATATGTAGATAGACGACTTGTGTATGCTACTGCTATAATATGCAGTAAGAACTAG
Genbank protein accession
ACY75904.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
GU071092 [NCBI]
CDS location
range 27123 -> 28802
strand +
CDS
ATGGCAGCATTCGATTTTCCAAACAGTCCGTCCCTTAATGATACCCATACAGAAAATGGGGTAATTTGGAAGTGGAATGGATACGCTTGGGATAGAGTTCCAAGTAGTGGTCCGCAAGGTGCTCCTGGTCCTACAGGTCCAGCAGGTCCTACAGGTCCATCAGGTCCTACAGGTGGAGATGGTCCTCCAGGTCCAGGTGGTCCAGGTGGTGGCACAGGTCCAGCAGGTCCTCCAGGTCCTCCTGGAAATGATGGTGCTGATGGTTCTGATGGTGGAACTGGTACTCCAGGTCCAGCAGGTCCTCCAGGTCCTCCTGGAAATGATGGTGCTGATGGAAATGATGGTGGATCAGGTCCTACTGGTCCGACAGGTCCCACAGGACCAACTGGTCCCACAGGTCCAACTGGTCCTGCTGGAGCAAGAAATTATACTATAACAAATAGTGGATCTGGTTCTTACTGTGTTGATAGTGTATGCAGTAATCCAACAATAACTTTATTAAGAGGTTTAAGTTATACTTTTACTGTAAATGCAAGTGGACATCCATTCTATATTAAGACCTCTCAAACTACTGGAACGGCTAATCAATATAATACGGGAGTAACAAATAACGGTACTCAATCAGGAACTATAACTTGGAATGTTGCATCTGACGCACCAAGTACTCTTTATTATATTTGTCAATATCATAGTGCTATGACAGGCACTATTTCTATATCAGATTTAGGTCCTGCTGGTCCTCCAGGTCCAACTGGTCCTACAGGACCTACAGGTCCAACTGGTCCAACTGGTCCTTCAGGTGGAACTGGTCCAACTGGTCCTGCTGGTGCTGACGGAAGTGATGGTGCTGATGGTGGAACTGGTCCGACTGGTCCTGCTGGTCCTACTGGTGGAGATGGTCCTCCAGGTCCAACTGGTCCAGGCGGAACTGGTCCAACTGGTCCTACTGGTGATGATGGTCCTCCAGGTCCTCCAGGTCCAGGCGGAACTGGTCCTGCTGGTCCTCCAGGACCTCCTGGTGCTGACGGTGATGATGGGGGAAGTGGTCCTCCAGGTCCTCCAGGTTCTGATGGTTCTGATGGAGGAAGTGGTCCTCCAGGACCTCCAGGTCCTACTGGTGGAGATGGTCCTCCTGGTCCAGGTGGAACTGGTCCGACTGGTCCAACTGGTCCAACAGGTCCTTCAGGTGGAAGTGGTCCTCCAGGTCCACCAGGAACTTCAGGTGCTACAGTAATTCCTTCAGGCACTGTTATGGTATTCATGCAAAGTTCTGCTCCTACTGGATGGTCTAGAACTTCATCTTATGATGGTAGGGCGATAAGAATTTCAAGTTCTGGTGGTGGTACTGGTGGTAGTAGATCTTGGGATAATACTTTTGATTATATAACTAAGTGGCATAGTAATGTACTTACTGGTAGAGTTACTGATGGACATACATTAACATCATCTCAAGGTCCAGTTCACAACCACTCTTATGATGTTCCTCGTGGATCTTGGGGTGGACAGTATGGTTTCCAAGATACAGCAAACTCTGGTTCTTCTGGAACTCAAGCAGTTGCTGGTAATACACCAGGAGGTGGAAGTCACAGTCACGATCTTAATAACATATCTCTTAATATTGGAACATATGTAGATAGACGACTTGTGTATGCTACTGCTATAATATGCAGTAAGAACTAG

Genome Context

Genome Context

Gene Ontology

Description Category Evidence (source)
GO:0031012 extracellular matrix Cellular Component IEA:TreeGrafter (UniProt)
GO:0005615 extracellular space Cellular Component IEA:TreeGrafter (UniProt)
GO:0030020 extracellular matrix structural constituent conferring tensile strength Molecular Function IEA:TreeGrafter (UniProt)
GO:0030198 extracellular matrix organization Biological Process IEA:TreeGrafter (UniProt)

Tertiary structure

PDB ID
a2ad821557ada183dc71b720db90b7b3ed22316ab90aedf01f21814e8afd5e2c
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6268
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50