Protein

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Genbank accession
ADO99005.1 [GenBank]
Protein name
YadA domain-containing structural protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
Protein sequence
MANRIQLRRGNGQEWQNSNPILAQGELGIELNTGRFKIGDGVTPWNTLRYERPIESTSNTANTLVQRDNDGNFSAATVTATIIGNASTASRLASSRQIQLIGDVGGSQIFDGSENISLSATLDLLSTLPHHDNTETSSGTYTKVTVDAKGRVTNASNPTTLADYNLNGTVEGSSAQAYDLDLVALAGLTTTGFISRTASNTMATRTITGTAGKINVNNGGGLAGNPTLDLATTTVVDGDYNTESLTSVSGVGSNSEPFGTETVNAVKFSVDDRGRLTSATNVPIATATQGTTAAAYNAATVYVRGDQITNASKLYQAIAGIAAGAGAPTHSDTSDAGSWRHLGAAASPQKGLASFDQEDFDVTAGGHVTMALGSIDNDQLQNSRISFADGNTKEDFSLDQELTATTGYRGFNYLNYLKVNDTSGNLLFGANNTGDGGAGEVDINARLYFSDADITLDGAVAQTLDKTGDGNLTFQTTQDSSSARTLSILATNAGTGASGVVVTAENTVTITASDAAGKVQVEDMYFQGDYIASSAATMILDPGDDRAVSGKVQIMGDLQVDGTTTTINSTITTLDDPIITLGGDTAPGSDDNKDRGVEFRYYDTQARVGFFGYDDSAADLGGHTGAFSFIYDATNTSEVFSGTDAGIIAGNLKLTTGTASTTNTTGDLVVAGGAGITGDVNIGGSVDIDTNLGVTGTSLFTDEVVIKGASKNFILKDGSNNAKITAVTTSGNLTMAGILAVTGNVDINSNKFNITAASGNTAIAGTLTVSDETIVKADNKTFKVQTAAGVDKFVVDTDNGDTNSEGKLNVADLVHFESTDEPDILSGAPHSIQNSDYGALRVDGGGYFDKNVLFNGDIFLNGDFNQQEDATENYGLRNYLSVRYKMRAGSVGAYTPSYSNHNTSNLRVFGGAGVNTTLHVGGTGSGEGLFVGKKNSGDTVKFSVLGATGNTDIQGTLDVAGNSEFNGTVDVDGNFAVRSGTTDKFTIASATGNAVNEGELNVKGAVDFDTTLNVDGTATIQDDLIVKSDNKMFKVQTAAAADKFTVDTDNGNTVISGTLQVDGQINVNDSLVIDEANEVFSVQNGSAVAKFEVDTDNGNTNIIGTLTVGDATQINDTFGTSGVNTFTNNTEQTLSGSYAADGSARFSGGIGLAKNLAVGGGARVYGNTELTGTLDLNNSADISGALVTHDNVTITADNKEFAIQNGSAADKFTVDTDNGNTDIRGTLDVGGDVTAESNLTITGNLTVNGTTTTVNSTVTTLDDPIITVGGDTAPASNDGKDRGVEFRYYDGSAKIGFFGYDRSSSQFAFVTDSTNTSEVHAGTDGALRAGSLNLTAAGTALDVDNDANIDGALTVDGQIVSNKSSGAPFSIASTTKVNNLNVDLLDGMTTASANTGSTVVNRDSNGDFAANQITAASSAGAGAGFLGNASTADAWKTARTFTIDGVVSGSVSVDGSAAPTITTTYVDADITALAAMSGTGYVVRTAANTYAQRTLAVTASSGITLTNPDGVSGNTTINVASASTNAANNLVLRDGSGDFAANEITSDLVGNLTGATSTAKDLNPAADSTYDLGTSSVRWQGIFADAANITAITGTLTGTVSSIANHNTADLAEGTNLYYTDERVDDRVNALIVAGTGITKVYDDAAGTYTLTVTQADVNTDTITEGSTNLFTTAARTRTHFTYGTGITHSSGTLSVTQSDINTDNVTEGSTNLFTTAARTRTHFTYGTGITHSSGTLSVTQADIDTDNVTEGSTNLFTTAARTRTHFTYGVGIKLATADLALDFTEFDTDNITEGSTNLYYTQARADARVAAATGANLDLSSKSTTNLSEGTNQYYTEARVQTKLDNAFEQLSAMLNNLATSTTLTLALSGDPTPGAVVTTGVSVGGGGGFTAGTGVATTGGTGSSLTVNTTVVDGAITAAVVNAGGSGYLISDTVTVTNPNAGKVLTLNLATLSGGTGYSSATGVAVTGGSGSSMTADITASAGAITNVTVNNGGTGFAAGETITIANANASGIKTTGNVSAADASRTAGTYTIGASDYGTGGSGNSATFSIVVDGSGAATITVTDDGTGFVVDETITVADAQLGGGGGAALTFDATAIHGNGATVNIATVATNATLTLTDITTMEVGATVTGATSGTTGVVTALGTNQITVDNVDGFFKKGEVVSANDVTTLTISSFS
Physico‐chemical
properties
protein length:2180 AA
molecular weight: 221580,58340 Da
isoelectric point:4,22492
aromaticity:0,05917
hydropathy:-0,13349

Domains

Domains [InterPro]
DC_1619
ATT
1–450
DC_1619 DC_1617 DC_1607 DC_0029
SSF69349
STR
4–242
SSF69349 DC_1607 DC_0029
IPR041352
ATT
5–43
IPR041352
ADO99005.1
1 2180
Architecture
ATT
STR
STR
STR
RBD
ATT 1-450 | STR 451-966 | STR 980-1069 | STR 1115-1563 | RBD 1715-2040 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Prochlorococcus phage P-SSM7
[NCBI] 		445688 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Palaemonvirus > Palaemonvirus pssm7
Host Prochlorococcus marinus str. NATL1A
[NCBI] 		167555 Bacteria > Cyanobacteria > Prochlorales > Prochlorococcaceae > Prochlorococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
ADO99005.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
GU071103 [NCBI]
CDS location
range 90840 -> 97382
strand +
CDS
ATGGCAAATAGAATTCAATTAAGACGTGGTAATGGGCAAGAATGGCAAAACTCTAACCCTATCCTCGCTCAAGGCGAACTTGGTATCGAACTTAATACAGGTCGTTTTAAGATAGGTGATGGTGTCACCCCGTGGAATACCCTTAGATATGAACGCCCAATCGAGTCAACCTCAAACACGGCAAACACTCTAGTACAGAGAGATAATGACGGTAATTTTTCTGCTGCAACGGTTACTGCTACAATCATTGGTAATGCTTCAACAGCATCTAGATTAGCAAGTTCCAGACAGATACAGTTAATTGGTGATGTTGGTGGTTCTCAAATTTTTGATGGATCTGAAAATATTTCTCTTTCAGCAACTTTAGATCTATTATCTACTTTACCTCACCACGATAATACGGAAACTAGTAGCGGAACATATACAAAAGTTACTGTTGACGCTAAAGGTAGAGTTACAAATGCTTCAAACCCAACAACTCTTGCTGATTATAATTTAAATGGAACTGTAGAAGGTTCATCTGCACAAGCATATGATTTAGATTTAGTTGCTTTAGCAGGTCTTACTACTACAGGTTTTATTTCTAGAACTGCTTCAAACACAATGGCAACCCGTACTATTACGGGAACTGCAGGTAAAATTAATGTAAACAATGGTGGTGGTCTCGCTGGTAATCCCACTTTAGATCTTGCAACTACTACAGTAGTTGATGGTGATTATAACACTGAATCACTAACATCAGTATCTGGTGTTGGTAGTAATAGCGAACCTTTTGGAACTGAAACTGTAAACGCAGTTAAGTTCTCAGTTGATGATAGAGGTCGTTTAACATCTGCGACAAATGTACCTATAGCTACTGCTACACAAGGTACAACTGCAGCAGCATATAACGCAGCAACGGTTTATGTTCGTGGTGATCAAATCACTAACGCATCAAAACTTTATCAAGCAATAGCAGGAATTGCTGCTGGTGCTGGTGCTCCTACTCATTCAGATACCAGTGATGCTGGATCATGGAGACATCTTGGTGCTGCAGCATCACCACAAAAAGGACTTGCTTCATTCGATCAAGAAGATTTTGATGTAACTGCAGGTGGTCATGTTACAATGGCTCTTGGTTCTATTGATAATGATCAATTACAAAATAGTAGAATTTCCTTTGCAGACGGTAACACAAAAGAGGACTTCTCACTTGATCAAGAACTAACTGCTACTACAGGATACCGTGGATTCAACTATCTTAACTATCTCAAGGTTAATGATACAAGTGGTAATCTACTGTTTGGTGCGAATAATACTGGTGATGGTGGTGCTGGAGAAGTTGATATTAACGCAAGACTTTATTTTAGTGATGCAGACATTACCCTCGATGGGGCGGTTGCACAAACTTTAGACAAGACTGGAGATGGTAATCTAACATTCCAGACTACACAGGACTCATCTTCTGCTAGAACATTAAGTATTTTAGCAACTAATGCTGGTACTGGTGCTAGTGGTGTTGTAGTAACTGCAGAAAATACAGTTACAATTACTGCATCAGATGCTGCTGGTAAAGTACAAGTAGAAGACATGTACTTCCAAGGGGATTACATTGCTTCCTCTGCTGCTACCATGATCCTTGATCCTGGTGATGATAGAGCAGTATCTGGTAAAGTTCAGATAATGGGGGATTTACAAGTTGATGGAACGACTACAACAATTAATTCAACGATTACTACGTTGGATGATCCTATTATCACTCTTGGTGGTGATACTGCTCCAGGTTCAGATGACAATAAGGATAGAGGAGTTGAATTCAGATATTACGACACACAAGCAAGAGTTGGATTCTTTGGTTACGACGATTCGGCCGCTGATCTTGGAGGCCATACGGGAGCATTCTCATTCATCTACGATGCCACAAATACCTCCGAAGTATTCTCTGGAACAGATGCAGGGATCATCGCTGGTAACTTAAAACTGACAACTGGTACAGCATCTACAACTAATACTACTGGAGATTTGGTAGTTGCAGGTGGTGCTGGTATTACTGGTGATGTTAATATTGGTGGTTCAGTAGATATCGATACTAATTTAGGTGTCACAGGTACATCACTCTTTACTGACGAAGTAGTAATAAAAGGTGCTTCTAAGAATTTCATACTTAAGGATGGTAGTAACAACGCTAAGATTACTGCAGTAACTACATCTGGTAACCTAACAATGGCAGGAATTCTTGCTGTTACAGGTAACGTAGATATTAATAGTAATAAGTTTAATATAACAGCAGCATCTGGTAATACTGCTATTGCTGGTACTCTAACAGTATCTGATGAAACTATTGTTAAGGCAGACAATAAGACCTTCAAAGTTCAGACTGCTGCTGGAGTAGATAAGTTTGTTGTTGATACAGATAATGGTGATACTAACAGTGAAGGTAAATTAAACGTTGCTGACTTAGTTCACTTTGAGTCTACTGATGAACCTGATATTCTATCTGGTGCTCCTCACTCAATTCAGAATAGTGACTATGGTGCATTACGAGTAGATGGTGGAGGATACTTTGATAAGAACGTTCTCTTTAATGGTGATATCTTCCTGAATGGTGACTTTAACCAGCAAGAAGACGCAACTGAGAACTACGGTTTAAGAAACTATCTGTCTGTCAGATATAAGATGCGAGCAGGTTCTGTTGGTGCATATACTCCAAGTTACTCAAACCATAACACTTCTAACTTAAGAGTCTTTGGTGGTGCTGGTGTTAACACAACATTACACGTTGGTGGTACTGGATCTGGAGAAGGATTATTTGTAGGTAAAAAGAACTCTGGAGACACAGTTAAGTTTAGTGTTCTAGGTGCTACAGGTAATACAGATATTCAAGGTACACTTGATGTTGCTGGCAATTCAGAATTTAATGGAACTGTTGATGTAGATGGTAACTTTGCAGTTCGTTCTGGTACAACTGATAAGTTTACTATTGCTTCTGCTACTGGTAATGCAGTAAATGAGGGAGAACTAAATGTAAAAGGTGCAGTTGATTTTGATACTACACTTAATGTAGATGGTACAGCAACTATTCAAGATGATCTTATTGTCAAGTCTGACAACAAGATGTTTAAGGTTCAGACTGCTGCTGCAGCAGACAAGTTTACAGTAGATACTGATAATGGTAATACTGTAATTTCAGGAACCTTACAAGTTGATGGTCAGATCAATGTTAATGATTCTCTAGTAATCGATGAGGCAAACGAAGTCTTCTCTGTACAGAACGGTTCTGCAGTTGCGAAATTTGAGGTTGATACAGATAACGGTAATACAAATATAATTGGTACATTAACCGTTGGTGATGCTACACAGATCAACGATACATTCGGAACATCTGGTGTTAATACATTCACTAACAACACAGAGCAAACTTTATCAGGATCATATGCTGCTGATGGTTCTGCAAGATTCTCTGGTGGTATAGGTTTAGCTAAGAACTTAGCAGTTGGTGGCGGGGCACGAGTCTACGGTAATACAGAATTAACTGGTACATTAGATCTTAATAACAGTGCTGATATATCTGGTGCTTTAGTAACTCATGATAATGTTACTATCACTGCTGATAATAAAGAATTTGCTATTCAAAATGGATCTGCTGCTGATAAATTTACAGTTGATACCGACAATGGTAATACTGATATTCGTGGAACATTAGATGTTGGTGGTGATGTAACTGCCGAATCTAACCTCACAATTACGGGGAATCTTACTGTCAATGGAACAACAACTACTGTCAATTCTACGGTTACAACTCTCGATGACCCTATCATTACTGTGGGTGGTGACACAGCACCAGCGTCTAACGATGGTAAGGATCGTGGTGTTGAATTCCGTTATTACGACGGCTCTGCGAAAATTGGGTTCTTCGGATATGACAGATCATCCTCCCAATTCGCATTCGTAACAGATTCAACAAATACATCAGAAGTTCATGCTGGTACAGATGGTGCTCTTCGTGCTGGTAGTTTAAATCTTACTGCTGCTGGTACTGCACTTGATGTGGATAATGATGCTAACATCGATGGTGCTTTAACTGTTGATGGTCAAATTGTTTCTAATAAATCAAGTGGTGCTCCATTCTCTATTGCTTCAACTACTAAGGTTAATAACCTGAACGTTGACTTGCTAGATGGCATGACAACTGCAAGTGCTAATACAGGATCTACAGTTGTTAATAGAGATTCTAATGGAGACTTTGCTGCAAATCAAATTACTGCTGCTAGTTCTGCTGGTGCTGGTGCAGGTTTCTTAGGTAACGCTTCTACTGCTGATGCATGGAAGACTGCTAGAACATTCACTATTGACGGTGTTGTATCTGGTTCTGTATCTGTAGATGGTAGTGCTGCTCCAACAATCACAACAACATATGTTGATGCTGACATTACTGCTTTGGCAGCGATGAGTGGCACAGGATACGTTGTAAGGACTGCTGCAAATACATACGCACAAAGAACACTTGCTGTTACAGCATCCTCTGGTATTACTCTTACAAATCCTGATGGTGTTTCTGGTAACACAACAATTAACGTTGCTTCTGCAAGTACAAATGCTGCAAACAACTTAGTTTTACGTGACGGATCTGGTGACTTTGCTGCTAATGAAATTACTTCAGACTTAGTTGGTAACCTTACAGGTGCTACTTCTACTGCTAAGGATCTTAATCCTGCTGCAGATAGCACATATGATCTTGGTACATCTTCTGTTAGATGGCAAGGAATATTTGCAGATGCTGCAAACATAACTGCTATTACAGGAACCTTAACTGGTACAGTATCTAGTATTGCTAACCATAACACTGCTGACCTTGCTGAAGGTACTAATCTTTACTACACTGATGAGCGTGTAGATGATAGAGTTAACGCTCTTATAGTTGCTGGCACAGGTATCACTAAGGTATATGATGATGCTGCAGGAACTTACACACTTACAGTTACACAGGCAGATGTTAATACAGATACCATAACAGAAGGTTC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Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
a1edbe2bc628aa10c7f70f32011dc01703747fb178d6f8aa5abc3863229aa85d
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,4981
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
The Genome Sequence of Cyanophage NATL1A-15 Henn,M.R., Sullivan,M.S., Osburne,M.S., Levin,J., Malboeuf,C., Casali,M., Russ,C., Lennon,N., Erlich,R., Young,S.K., Koehrsen,M., Yandava,C., Zeng,Q., Alvarado,L., Anderson,S., Berlin,A., Borenstein,D., Chen,Z., Engels,R., Freedman,E., Gellesch,M., Goldberg,J., Green,L., Griggs,A., Gujja,S., Heiman,D., Hepburn,T., Howarth,C., Jen,D., Larson,L., Lewis,B., Mehta,T., Park,D., Pearson,M., Roberts,A., Ryan,E., Saif,S., Shea,T., Shenoy,N., Sisk,P., Stolte,C., Sykes,S., Walk,T., White,J., Yu,Q., Coleman,M.L., Huang,K.H., Weigele,P.R., DeFrancesco,A.S., Kern,S.E., Thompson,L.R., Fu,R., Hombeck,B., Chisholm,S.W., Haas,B., Nusbaum,C., Galagan,J. and Birren,B. 2011-09-23 — GenBank