Protein

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Genbank accession
WNO23966.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,71
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MATLKSIQFKRSKTPGAKPTAAQLDEGELAINLRDRTIFTKSDQGQIIDLGFAKGGTVDGDVTINGTLRINGPLNNFGNFSTSGSITAGTSISGQTFRALQGSFYARAPNDASNAHLWLENADGVERGVIYARPQTTTAGEIRLRVRQGTGSTINSEFYFRSINGGEFQANRILASDSLVTKRIAADTVIHGGKAFGVYDTDSLVNYVYPGTGETNGVNYLRKVRAKSGGTMWHELCTAQLGQADEMSWWTGNTPQSKQYGIRNDGRMAGRNSLALGTFTTDFPSSDYGNVGVMGDKYLVLGDTVTGLKYIKQYVYDLVGGGYSVASITPDSFRSTRKGLFGRSEDQGATWIMPGTNAAFLSAQTQADGNTAGDGQTHIGYNSGGKMSHYFRGRGQTNINTQEGMELNPGILKLVTGANNVMFYADGGITSTKQLSIYNGVYLAANNSTAGLTFSATTTIDGTKQILWEGGTRAGQNKSYVTVKAWGNSFNATGDKYRETVFEVSDGQGYHFYSQRGAPTGDETIGPVLMQVSGSLNARGTLNAGANLYVGGLSTHEGAVTMNNGLNLTGGASINGQVKMGGTADALRIWNAEYGMIFRRSESGSSSSFHLIPTLQNAGENGGISDLRPLSINLANGTVLMGNKSAGYGPLFTVDNVSKFVRTDCRLRVNMDSDAIVINASSQASSNFIQGRKADVTKWYLGIGDGGNVVRLHNYTYSHGIALNSDTVDITKALKIGSDVRIGPDGNITGSTALENFKNLNTTLDRKVNTGGWSGGATTGWYKFATVEMPQSTGTASFKISGGSGFNFKSYGQASIAEIVLRTGNNNPKGLNATLWNRTYEAISQIASVNTSEDIYDIYVYIGGYSNSLVVEYTCSSNSKVTVVGINSGVQPLVETLPEGHVVGKSVRMLNNLDGMFAAGESDIVTRGEYVANNKKGMRIKSSGNDIDSNAALIRNDGGSFYILFTDKNTAENPNATDGDWNGLRPFSINIADGRVGMNHGLNITGGGLNVAGGLNVTSGNTSLGNISSRVVAGWRGASGWGDNSDAMKSKITFMADHGDLSNSGSYYPIVGAYSNYGSAGYRQTFEFGWVGSGTTAGWRDGIIRIRGDNANGQQARWRFTMDGLLDCPGKVQMPQTSAFGVNTTNSLGGSSITFGDSDTGIKQNGDGLLDVYANSVQVFRFQNGDLYSYKNINAPNVYIRSDIRLKSNFKPIENALEKVEQLDGLIYDKADYIGGEVVHTEAGVIAQSLEKVLPEAIREVEDIKGNKVLTVSTQAQVALLLEAVKTLSAKVKELEAKLN
Physico‐chemical
properties
protein length:1300 AA
molecular weight: 138665,54450 Da
isoelectric point:7,60025
aromaticity:0,08692
hydropathy:-0,32115

Domains

Domains [InterPro]
DC_1954
STR
1–1300
DC_1954
IPR048390
ATT
493–632
IPR048390 G3DSA:6.20.80.10 IPR030392
IPR048388
ATT
675–753
IPR048388 IPR030392 Coil
WNO23966.1
1 1300
Architecture
STR
ATT
STR
ATT
STR
STR 1-492 | ATT 493-632 | STR 633-674 | ATT 675-753 | STR 754-1300
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
WNO23966.1
1 1300
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 149 149 0,1637
Central domain 150 359 211 0,7416
C-terminal 360 1300 940 0,6015
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-149
Central
150-359
C-terminal
360-1300

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage fDHCT2
[NCBI] 		3075956 Uroviricota > Caudoviricetes >
Host Escherichia coli
[NCBI] 		562 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WNO23966.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OR427838 [NCBI]
CDS location
range 47997 -> 51899
strand +
CDS
ATGGCTACTTTAAAATCGATACAATTTAAAAGAAGTAAAACACCAGGAGCCAAGCCTACTGCAGCTCAGTTAGATGAAGGCGAACTGGCTATTAACTTGCGTGACCGCACTATTTTTACCAAGTCAGACCAAGGACAGATTATTGATTTAGGTTTTGCTAAAGGTGGTACTGTCGACGGCGATGTGACTATTAATGGAACTTTACGCATTAACGGTCCATTAAACAATTTTGGAAACTTTTCTACAAGCGGGTCGATTACAGCGGGCACTAGTATTTCGGGCCAAACTTTTAGAGCGTTGCAAGGCTCGTTTTATGCAAGGGCACCAAACGACGCATCGAATGCCCATTTATGGCTTGAAAATGCCGATGGTGTTGAACGGGGTGTTATATATGCTCGGCCTCAAACTACAACCGCTGGTGAAATACGTCTTAGAGTTAGACAAGGAACCGGAAGCACTATTAATAGTGAATTCTATTTCCGTTCTATAAACGGCGGTGAATTTCAAGCCAACCGTATTTTAGCATCAGATTCGTTAGTAACTAAACGCATTGCAGCTGATACAGTTATCCACGGTGGCAAAGCCTTTGGTGTATATGATACGGATTCATTAGTTAATTATGTATATCCAGGCACCGGCGAAACAAATGGTGTAAACTATCTTCGTAAAGTTCGTGCTAAATCCGGCGGCACTATGTGGCATGAACTTTGCACTGCCCAACTAGGCCAAGCCGATGAAATGTCTTGGTGGACAGGTAATACCCCACAGTCAAAACAGTATGGTATTCGTAACGATGGCCGAATGGCTGGCCGTAATAGCCTTGCATTAGGTACATTCACTACAGATTTCCCGTCTAGCGATTATGGTAACGTCGGTGTAATGGGTGATAAGTATCTTGTTCTCGGTGACACTGTAACTGGTCTGAAATATATTAAACAATATGTTTATGATTTAGTTGGTGGGGGTTATTCAGTTGCTTCTATTACTCCTGATAGTTTCCGTAGTACTCGTAAAGGTTTATTTGGACGTTCAGAAGACCAAGGCGCTACATGGATTATGCCAGGCACGAATGCTGCATTTTTATCAGCCCAAACTCAGGCTGACGGGAATACAGCTGGTGATGGTCAGACACATATTGGTTATAACTCTGGTGGAAAAATGTCACACTATTTCCGCGGTAGAGGTCAAACCAATATTAACACCCAAGAAGGTATGGAACTTAACCCAGGTATTCTTAAACTAGTAACCGGTGCAAATAATGTAATGTTTTATGCTGATGGTGGTATTACATCCACTAAGCAGCTTTCAATTTATAATGGTGTTTATCTTGCAGCTAATAACTCAACCGCAGGTTTGACTTTTTCGGCAACTACCACTATTGATGGCACCAAACAAATTCTTTGGGAAGGTGGTACTCGAGCAGGCCAGAATAAGAGTTATGTAACTGTTAAAGCATGGGGTAATTCATTTAACGCCACTGGCGATAAATATCGTGAAACTGTATTTGAAGTTAGTGACGGACAAGGATACCATTTTTATTCTCAACGTGGTGCGCCTACAGGTGACGAAACTATCGGCCCTGTATTAATGCAAGTTTCAGGTTCTTTAAATGCAAGAGGAACATTAAACGCCGGTGCCAATCTTTATGTGGGAGGATTGAGTACACATGAAGGTGCTGTGACCATGAATAATGGGCTTAATTTAACTGGTGGGGCTTCAATTAACGGACAAGTTAAAATGGGTGGTACCGCTGATGCATTAAGAATTTGGAATGCCGAATATGGTATGATTTTCCGACGTTCGGAATCCGGTTCTTCTTCTTCATTCCATCTTATTCCTACCCTCCAGAATGCTGGCGAAAACGGTGGAATAAGTGACCTTCGCCCGCTTTCCATTAATTTGGCTAATGGCACGGTTCTAATGGGTAATAAAAGTGCTGGGTATGGTCCACTTTTCACAGTCGACAACGTAAGTAAATTTGTTCGGACCGACTGTAGACTGCGCGTTAATATGGATTCCGATGCCATTGTAATAAATGCTTCATCCCAGGCGTCATCTAACTTTATCCAGGGACGTAAAGCAGATGTTACAAAATGGTATCTCGGTATTGGCGACGGCGGCAACGTTGTTCGTTTACATAACTATACCTACTCCCACGGTATTGCATTAAACTCTGACACTGTTGATATAACCAAGGCACTTAAAATTGGTTCCGATGTTCGTATTGGTCCTGACGGTAATATTACAGGCAGCACTGCATTAGAAAACTTTAAAAACCTGAACACAACGTTAGACCGTAAAGTTAACACAGGCGGGTGGTCGGGTGGTGCTACTACAGGTTGGTATAAATTTGCTACTGTAGAAATGCCACAATCGACAGGTACAGCATCCTTTAAAATATCAGGTGGGTCTGGGTTTAATTTTAAAAGTTATGGTCAGGCTTCAATAGCCGAAATAGTCCTTAGAACCGGCAATAATAACCCTAAAGGCCTTAATGCTACGCTGTGGAATAGAACTTATGAAGCCATTTCCCAGATTGCTTCGGTTAATACAAGCGAAGATATCTATGATATTTACGTTTACATTGGTGGGTATTCTAATTCTTTGGTGGTAGAATATACCTGCAGCAGCAATAGTAAAGTAACCGTAGTGGGTATTAATAGCGGTGTCCAGCCTTTGGTAGAAACATTACCTGAAGGTCATGTTGTAGGTAAATCTGTAAGAATGCTGAACAACCTTGACGGAATGTTTGCTGCCGGCGAATCAGATATTGTTACACGTGGTGAATACGTCGCTAATAACAAAAAAGGTATGCGTATTAAATCTAGTGGTAATGATATAGATTCTAATGCCGCTTTAATTAGAAACGATGGCGGAAGTTTTTATATTTTATTTACGGATAAAAATACCGCAGAAAACCCAAATGCAACCGATGGTGATTGGAATGGCTTAAGACCTTTCTCTATCAACATAGCTGATGGCCGCGTTGGTATGAACCATGGGTTAAATATTACTGGCGGTGGTCTGAACGTGGCAGGTGGCCTTAATGTTACCAGTGGTAATACTAGTTTAGGTAATATCTCATCTCGTGTGGTTGCAGGTTGGCGCGGTGCCTCTGGTTGGGGTGATAACTCAGACGCAATGAAATCTAAAATCACCTTTATGGCAGACCACGGTGATTTATCTAATTCAGGTAGTTATTATCCTATTGTCGGTGCATACAGTAACTATGGTTCGGCGGGTTATCGTCAAACCTTTGAATTTGGTTGGGTCGGTTCCGGTACCACCGCTGGATGGCGTGACGGTATTATTCGTATACGTGGCGACAATGCCAACGGCCAACAGGCAAGATGGCGCTTTACAATGGACGGTCTTTTAGATTGCCCTGGTAAAGTACAGATGCCACAAACAAGTGCCTTTGGCGTCAACACAACTAACTCACTCGGTGGAAGTAGTATAACATTTGGCGATAGTGATACCGGTATTAAGCAAAACGGTGATGGTTTACTTGATGTTTATGCGAACAGTGTACAAGTATTCCGTTTCCAAAACGGCGATTTGTACTCGTATAAAAATATAAATGCTCCTAACGTTTATATTCGCTCTGATATTCGTTTGAAATCTAACTTCAAACCAATTGAAAACGCTCTCGAAAAGGTTGAACAGCTTGATGGTTTAATCTATGATAAAGCTGATTATATTGGTGGTGAGGTTGTTCACACTGAAGCAGGTGTTATTGCACAGAGCCTGGAAAAAGTATTACCTGAAGCTATTCGTGAAGTTGAAGATATCAAAGGTAATAAAGTTCTGACCGTTTCGACTCAGGCCCAAGTGGCGCTGTTACTTGAAGCGGTTAAAACCCTGTCGGCTAAAGTAAAAGAACTTGAAGCTAAATTAAATTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
98c9714ecde8e02e5bfca8011ccf0076afb9648e4c6e16922eea45febeaf8e20
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7170
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50