Protein

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Genbank accession
AVH85289.1 [GenBank]
Protein name
tail spike protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MTNNLSDYNNSFLDLSEKLPERFRTKTMTSLMNNLFNRFLTKDESSHVIGWVGDKIGSSYYIEHADNDRTLNALQPVFYLEYGNTQVVTTFAEILRKLQMIGVDIYDYARWGKTASYNFVPPIDLDKFCNFTKYRWYGHLVTQSGVMPWNPNKKPEYYVMKPGFQVNDWTATNYWVHEDDVSTLGYSINSTIQATRPIIEYAADLELNARFDANGIPVILNGTGVTTYSQTKTEFNQKPMFNIYRMDGTYSGKVSPIIYYSEDSSAPVDADLQFRAVINTFSDYMFKIGISDDENRLYMYKTLGDNSLHTIWKTGSDTGPITYFVPEFFNSDSQGNLVNAAPTGTDADSTGTWKTPDPIFYNTEHEVRKQISYGDLYAHFITIIKAQPHLTGNPYGSNNFRTLTPYYGMGGTIKDFKGNLGIFIGLMSQEDITPVTLMKFAEYQYEQLINAVNEFVTQNIADYIVDTGIEFSGVLSNTLDPAYDTLQLKFREAVAQRNDYNVFIDTTSGIIGWPSSLPRFGMMMPTVPSIEFDMKLGYNVIKHHDGHVTKVPNDRPDLMANIAAEKRLRSDGTKTQGTIGQDLPIRPYKNQFWYDPVARILKSFDVISDQSVAPSGAKPGDFWYSRSTDTLYQYDGAAWNSRPEEMAWKKISISNIFASLLLSLEQRLYRQVGFFTTFGTSLLKWNAAQYQALMPTQFNTLLENQFAQFASKYNQDAYGTDFLPSDAFTWNYHNATIPGVAQGTARWYDIYEQYYGTPRPNLEPWKLQGYTTQPSWWNDLYSGVSKPSPGLNYSTGLYIQEVPSVVWDITHNYGYEPIVRVFDEDGYQIWPDGVDHVSEDRVKITFTSARTGVAKLLLTLEASQKQGTGRMWTDQMWYDIRHNTTPGHPAPTGAWTKPFSVNTQTDELLPPYVSPTSSLSSEALLNSIPSGASDRYTFGENGPIELIWRKSIEFNYDNVIVSFLLDPINFVEKTWGHNPTVMSTNGYDVDRTYHRKDSHVNMVLHGELIKRDPFFSGDQHVQVIENMFDSSAFFELQLLYVYPTATSFSGVFALRKNNTIVAYMMGNSGIYVEGSNAISFRFYDGAYDMLVGTKISVVGTATNMTVPTTKPMLGLCQWYVNLNRYNSVDTTISKNNSLLRNWTAKLGYRVGGLLDTEALTMRSDTFDLIRADHTFVIKNNKYVADSWLDAIRVQVGRTGAMKMQNGLSAPDHQGQDWIFKIQTFNPKHPSIKYYELDTSGPYTTFKAFDGVNVTDEYKKFTNTLDVKEIPTPFVVRGIQNLVNFIFGYVAKLEEDGWQFSSFEDSRIDPATGRYVDWQFYIEKFLNALYTGAKPGDALLMNPFAQKVWFNTPSGVVSGFTHKSFIDGSASQYVYDILGRSIRPERMRILREDKQTKFISDVPMAGMHLLLDKYEHVVIFDDYSGDITASHLLYDGFLGLRIPRLYMDITRQSEFTGRLSFGGYYIQGNEVKKNIEQSVKGLQNFYDFDNMYYGSESQNAATGLLGFSRKSYMDDLDIPLKSQFGYWKGLVSNKGSNFSLTAFLNSARFIDAKLDEFWAYKVADYGDARILEFPEIKISVDDANEKAMKLQFLDDGDTLNPGFIGITKTDDDRWFSLDDIKDSRYYFEAEVLGYVEFDNIVPGILYDLRDEDGNEIFTDHLEIYLKSDLNKNLLITGTDYDYVNASTVRFRDSMAGQNVIARCWGPARPEFNPAKLIDYQDKVIVSDIQLWDPARGAHTFSAAGNIDVTGATDPARYNYSTKIVSNKSYDPLRSWDSDQVGKVWWKTDNLGYIPYFDRKIYPNIDARIATWGSIADWASIDVYQWTESTVSPADYEAQTGVTGRASLKDVYFRERSWTSTPIAWKYADFPESAPRSFTASGEARIKLTNHDLGEAVAILSENRWSTFGLTTGSQFAGMNSYDQPFGTAQITGSEGYIIGSSSDYFSPDMMSGTFLSNLHVVGSTTANSLGNTIGPIVFTSETVGSDLYIRATSMLTSLSQSVKVVDTPNLQGAQVAMNFYELGVMIVGNTMYDWTQTGYTTSAQRIAAVAADFGNANHDVIIRTQVPVTIIDPFVLNGAAVDELNAIGDGLSTYWAAWKQPTAADIAADLLAPKNKWEPVYGVGTVVNAGPFIVNLIKSEISNPLITSDGTQIKKYSYKWGDWSVLKDDVREVKFDKSSGFYATHFTYTADQLKQRINVYVNGSIVNVSDWKIINNAVTITKNVNLGDKVRVIVRKYVPTSDDLAFNPDLLPDFDDPSKTIQYKEDYQYTVREIRDENGRVTKTLYYFWVSDKTVAEGNKTLSIKNVAQQLRNNTNPFAIFASFTAQGPLPHRYKAFVTIGLNRFVTRDNFYKLRFTNNFILRDNPNEMDLKNKHAEWSLMRRAQLTKIPKKLWDKLTDTIVGSDAFGNSVPSLERRTYDLKHSTNSRFGFEDDQALLDKDQAIETIKYTIMNTQLVVENTGHTDYIEFLDLTNIDSYFVDAATTRETMTRIYNEAKGRQINEIMFNVLEDMLTSNYEMTDIFKTSFIAAYSIRTLNSSIA
Physico‐chemical
properties
protein length:2540 AA
molecular weight: 288025,62120 Da
isoelectric point:5,18266
aromaticity:0,13228
hydropathy:-0,36728

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Ralstonia phage RsoM2USA
[NCBI] 		2070027 No lineage information
Host Ralstonia solanacearum
[NCBI] 		305 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Betaproteobacteria > Burkholderiales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AVH85289.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MG752970.1 [NCBI]
CDS location
range 229048 -> 236670
strand -
CDS
ATGACAAACAATCTGAGTGATTACAACAATTCGTTCCTAGACCTTAGTGAGAAGCTACCAGAGAGATTCCGCACTAAGACTATGACATCTCTGATGAACAACCTATTCAATAGATTCCTCACCAAGGATGAGTCGAGTCACGTAATTGGATGGGTAGGCGATAAGATCGGAAGCAGCTACTATATTGAGCATGCTGACAATGATCGCACGCTGAATGCTCTTCAACCTGTCTTCTATTTGGAATATGGTAATACTCAGGTTGTGACCACGTTTGCTGAGATACTCAGAAAGCTGCAAATGATCGGTGTAGATATCTACGATTACGCAAGATGGGGAAAGACGGCATCGTATAATTTTGTTCCACCTATCGACCTGGATAAGTTTTGCAACTTCACAAAATACCGTTGGTACGGACATCTTGTAACCCAATCAGGCGTTATGCCATGGAATCCAAATAAGAAACCAGAATATTACGTAATGAAACCTGGATTCCAAGTAAATGATTGGACGGCTACCAATTATTGGGTCCACGAAGATGATGTCTCTACATTGGGATACAGCATTAACTCTACCATTCAGGCTACTCGTCCTATTATTGAGTATGCTGCCGATTTGGAATTGAATGCGCGTTTTGACGCCAATGGAATTCCTGTTATTTTGAATGGAACCGGGGTTACTACATACTCTCAAACAAAAACCGAGTTTAACCAGAAACCAATGTTCAACATCTATCGCATGGATGGAACATATTCTGGAAAAGTGTCACCTATCATTTATTACAGCGAAGACTCATCTGCTCCGGTTGATGCTGATTTGCAATTCAGAGCGGTAATTAACACGTTCAGCGATTACATGTTCAAAATCGGTATCTCAGACGATGAGAATCGTCTGTACATGTACAAGACGCTCGGTGATAATTCACTACACACCATTTGGAAAACAGGATCAGACACCGGTCCAATAACGTATTTCGTTCCGGAGTTCTTTAACTCAGATTCGCAGGGAAATCTTGTTAATGCGGCTCCAACTGGTACTGATGCAGATTCAACAGGAACGTGGAAGACCCCAGATCCAATCTTTTATAACACTGAACATGAGGTGCGTAAGCAAATTTCGTATGGAGATTTATACGCTCACTTCATAACGATTATTAAGGCTCAGCCACATTTAACAGGCAATCCATACGGATCTAACAATTTTAGAACACTCACTCCATATTACGGAATGGGTGGAACAATCAAAGATTTCAAAGGCAACTTGGGTATCTTTATTGGTCTTATGAGCCAAGAAGACATTACTCCTGTTACTCTCATGAAGTTTGCAGAATATCAGTATGAGCAGTTAATTAATGCCGTCAATGAATTCGTAACCCAAAATATTGCCGACTATATAGTAGATACAGGAATAGAATTCTCTGGTGTGCTGTCAAATACGCTTGATCCTGCATACGATACACTGCAACTGAAATTCAGAGAAGCGGTTGCACAGAGAAATGATTACAATGTTTTCATTGACACAACATCTGGAATAATTGGATGGCCATCATCGCTTCCTAGATTTGGTATGATGATGCCTACGGTGCCGTCAATTGAATTTGATATGAAGCTTGGTTATAACGTAATCAAGCATCATGACGGACACGTTACTAAAGTTCCAAATGATAGACCGGATTTGATGGCAAACATCGCGGCTGAGAAGCGTTTAAGAAGCGATGGAACAAAAACACAAGGAACTATTGGTCAAGATCTTCCAATTCGTCCATACAAAAATCAATTCTGGTATGATCCTGTAGCTAGAATATTAAAGAGCTTTGATGTCATAAGCGACCAATCTGTTGCTCCATCTGGTGCTAAACCTGGAGATTTCTGGTATTCTAGATCTACTGATACGCTCTATCAATATGATGGCGCTGCATGGAACTCACGCCCAGAAGAAATGGCATGGAAGAAAATTAGTATTAGTAATATTTTCGCTTCTTTACTTCTAAGTCTAGAACAAAGACTGTATCGTCAAGTTGGATTTTTCACGACATTTGGTACGAGCCTTCTTAAGTGGAATGCTGCACAATATCAGGCATTGATGCCAACGCAGTTTAACACATTGTTGGAAAATCAGTTCGCACAATTTGCGAGCAAGTATAATCAAGACGCGTATGGTACGGATTTTCTGCCATCTGATGCATTTACGTGGAATTATCACAACGCTACCATTCCGGGTGTAGCCCAGGGAACTGCCCGCTGGTATGACATTTATGAGCAATATTACGGAACTCCTAGACCTAACCTTGAGCCATGGAAACTTCAAGGTTACACAACTCAGCCTTCATGGTGGAATGATCTATATTCGGGCGTATCGAAGCCATCGCCAGGCTTGAATTACTCAACTGGATTATACATTCAGGAAGTTCCATCGGTTGTATGGGATATAACTCACAACTACGGATATGAGCCTATAGTTCGGGTATTTGATGAAGATGGATATCAAATATGGCCAGATGGAGTTGATCACGTATCTGAAGATAGAGTCAAGATCACGTTTACATCTGCTCGAACTGGTGTTGCTAAACTCTTGCTCACTTTGGAAGCATCTCAAAAGCAAGGGACCGGTCGCATGTGGACTGATCAGATGTGGTATGACATTCGTCACAACACTACACCTGGCCATCCAGCTCCAACTGGTGCCTGGACAAAACCATTCTCAGTGAATACTCAAACTGATGAATTGTTGCCACCATATGTATCACCTACTTCATCGCTATCGAGTGAGGCATTGCTTAATAGCATTCCATCTGGTGCGTCTGACAGATACACATTCGGTGAAAATGGTCCTATTGAGTTAATTTGGAGAAAATCAATAGAATTCAATTACGATAACGTAATTGTATCATTCCTTCTAGATCCAATAAACTTTGTTGAAAAGACATGGGGTCATAACCCAACCGTAATGTCTACTAACGGATATGACGTTGATAGAACATATCACAGAAAGGATTCGCATGTAAACATGGTTCTCCATGGTGAATTGATCAAGCGTGATCCATTCTTCTCGGGAGATCAACATGTTCAAGTGATAGAGAACATGTTTGATTCATCAGCATTCTTTGAACTGCAACTATTGTACGTTTACCCAACTGCAACATCATTCTCTGGTGTATTTGCGTTGAGAAAGAATAACACCATTGTCGCTTACATGATGGGCAACTCTGGAATTTACGTTGAAGGTTCAAACGCAATATCATTTAGATTTTATGATGGCGCGTACGATATGTTGGTTGGAACTAAAATCAGCGTAGTTGGTACTGCAACCAACATGACTGTTCCAACTACAAAACCAATGCTTGGTCTATGTCAGTGGTATGTCAACCTTAATCGCTATAACTCAGTAGATACTACAATTAGTAAGAACAATTCTTTATTGAGAAATTGGACTGCAAAATTGGGATATAGAGTTGGTGGATTGCTGGATACTGAAGCACTCACCATGCGTAGTGACACGTTTGATTTGATCCGCGCAGATCATACATTTGTAATCAAGAATAACAAGTACGTTGCTGATTCATGGTTGGATGCTATTCGCGTACAGGTTGGTCGCACTGGCGCAATGAAAATGCAAAATGGTTTATCGGCACCAGATCATCAAGGTCAAGATTGGATTTTTAAGATTCAGACATTTAATCCTAAACATCCATCTATTAAGTACTACGAGCTTGACACATCAGGTCCATACACCACATTCAAGGCCTTCGATGGAGTCAACGTAACAGATGAGTACAAAAAATTCACCAATACTCTGGACGTTAAGGAAATTCCTACGCCATTCGTTGTTCGTGGAATCCAGAATTTGGTGAACTTCATCTTTGGTTATGTTGCAAAACTTGAAGAAGATGGATGGCAATTCTCTTCATTTGAAGATTCACGTATTGACCCAGCAACGGGACGTTATGTTGACTGGCAATTCTACATTGAAAAATTCCTGAATGCTCTATACACTGGAGCAAAGCCAGGTGACGCCTTGCTAATGAATCCATTTGCACAGAAGGTTTGGTTTAATACTCCATCTGGTGTCGTTAGTGGATTCACACACAAATCATTTATTGATGGAAGCGCGTCGCAGTATGTGTATGATATTCTAGGACGTTCTATTCGTCCAGAGCGTATGCGTATTCTTCGTGAAGATAAACAAACGAAGTTTATCTCTGATGTTCCTATGGCAGGCATGCACTTGTTGCTTGACAAGTATGAGCACGTTGTCATCTTTGATGATTACTCTGGCGATATAACCGCATCGCATCTACTGTATGATGGATTCTTGGGACTGCGTATTCCACGCCTTTACATGGACATCACTCGTCAGTCTGAATTTACGGGAAGATTGTCATTTGGTGGTTACTATATCCAGGGCAATGAGGTTAAGAAGAACATCGAGCAATCTGTTAAGGGTCTACAAAACTTTTATGATTTTGATAACATGTACTATGGATCAGAATCACAAAATGCTGCCACGGGATTGCTAGGATTTTCTAGAAAATCCTACATGGATGATTTAGATATTCCATTAAAATCACAATTTGGATACTGGAAGGGTTTGGTTTCAAATAAGGGATCTAACTTCTCACTTACAGCGTTTTTGAACTCTGCTAGATTCATTGACGCTAAACTAGATGAATTCTGGGCTTACAAGGTTGCGGATTACGGTGATGCCAGAATTTTGGAATTCCCAGAAATTAAAATCAGTGTGGATGACGCCAATGAGAAGGCAATGAAGTTGCAATTCTTGGATGATGGCGATACGCTAAATCCAGGATTTATTGGAATCACCAAGACGGATGATGACAGATGGTTCTCACTTGATGATATCAAGGATTCTCGTTACTATTTCGAAGCAGAAGTTCTAGGATACGTTGAGTTTGACAATATCGTTCCTGGTATTCTTTACGATCTGCGTGATGAAGATGGAAACGAAATTTTCACTGATCATTTAGAAATATATCTAAAATCGGA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Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
a15b4b3d92cde6d656df380e374ab8e7132243fd668359204b1af9cb3d48c7d4
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,6613
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete genome of RsoM2USA, the largest bacteriophage infecting plant pathogenic bacterium Ralstonia solanacearum Ahmad,A.A., Addy,H.S. and Huang,Q. 2021-09-27 — GenBank