Protein

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Genbank accession
YP_010674892.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MASDTYDLDWDDDPFGGDLDFDMDFDMDPYAKKGFVGGMASGFLSGIVDETVGSGEARMRTLRTILPKSFSTALDRVSWAGRRFDELKTEFKEENASSVKSLQSIAGHLSKKMGERMPSSITNELENFSQKDFSSWEKLGGYEAPGLAIEETSDYDVAAALDRSLEAQEGMFTALGETLNTMSAHVGGMITASISSGNRQLVNIESGMRDLVNYQRNVQLRMDQAKLSLLAKTYVSNVKYYKFMEKGIHTEIAELKKIQKASMMSDYQKTSNFTASKEFMRNKLFSTIGKRVGGLTGLIKDKFGKSARQEGYQGGNFALEQIADMLDMSDGMPMSKGMIGDLIGKQLGSMFVSNIPYFFERGKGKDWINKLAAKNPKEAKQFQEMFGKLTNFGNKASYASTSGVGLINYLAEDYEAMDEMEYLDYQDYLDQLPPGKKPIPKAIWVAKNAATNKAKASVNSFMSEITKSRGTQYTLNKRNVKDLNNPGIWKETNNITLNEVIPGLLSRILTSTEGIRTGEKNIEGVSYNYMRGQFQTDSEKRISVKADLMPYGDFSRYAQAALEMVDGLDTERSLSAGARKALAQQIAKDVDQEKGFNPFYYLGDIPNVSGAHQKEIHAVMKRHFGLNDQDVSEFKSAKGFDKLKRMTDMRSNEGNERLNVASATAANMKELFPNVAERIDMLRSTGNEQLLRDLGVIYTEAGVEKVNMDIFHERLGQFMENPNNPQLKGMFDTTSKKPVSDGKGGFIVPKSPTGSASTNNTFNELNSSISDLSAQLSRLVDNTSKVNTESSKGPQAYFDTHTGEVITNIDKIATSTSNMDALFTELLTIVKDGKLFNKQAKSETEERQADRYNFDVINRLKKILPTNILGKGFEMVMQNQPLILGSILGGVSSHFIQNPILAAAAGVGGVALGALVQHWGRVDNENAVGDEPSDEEDILDENGNPILKSSKLKAGDYYDAVKRRVINTWRDIKGPIFDAAEKVTITIKELGGKIFGADGRAVVLSGIVKLKDAVVGAYNFVDPLTRIKSVMEMGKNLIYQQDVYVKGEKTPRLRAVKFKEGEYSIEDTTGSIKPIWGWNEITGPVYDSEGNEVISQIEFDQGLITATGQKVRAVGSAASGLAETAAGLARSGLDTILGKFGYNRPQSDTEGSVGGKPGQSSNRGVERRLDRIYAILSQKFGIDIPDNFDGESDPIGSPITKGLRLNSLEDKIRQEKAEKQEKVQDSIIDIAEGMKEPKEGEKTEKQGIFGKLFSLMGGMGDFAMRLIKNPIGTLGGLIMGSLVNSGKRLASIGSMLFSGVLGVASPIFKLMKWGFTALTKATMAKTAAGGLGDALGSAGKGGVRGKIGGALGKLGGRGKMLAALLGTGAVVGGGMYAADAFGGEDEPTDGDVYEDGKDDNGPKLTTMEKVVDTASDFFLPTLALKTAKEFLLPKAASDFIDNKGVFWAPDGTFFTDRREAQAYIDGAGGVSAKEIPDSLQRRIRYAQYGIKSIDGNLAKRVSKLEQALIPHLAIANNRASFTQNAPVAQILQQFAKGGDSVPFDQVHTWFNARFKPVFLLYAVAVSVGRHGDINEFDRKESYEVTLLCERVRTSMGTLDPFPYEVQVQIDPREGILNRVMTENLVSSLLSELRKKYPTPEEEFKLETDVERRSRVLNEKTPDGLAGWFSNSFGDRANKLAQEEVDRKFQTPQAVREIDISDLHKDANTAIDPFTMVRLGVYGNIDNMPWRVDAVLRLERYCEDLINTLGTEAVFSGNPTRVFNLFKAQFRIETTNGESNWHLWFQNRFLPVLQQYVKEMKRLRNQLPKQGWRSLSDTNKAKLARFLSETRVIYQQEEVSVWDVKVSPFENSNSGSWPDRVEKYLKSLDAKATKARLKEPELEDERSLTYDEKVNGSKIDSNQVQVNTNALFDKVYGKNRNVSAGNVGIYGGGTGNSFTADGRNNNGIGFGTNYNLQGGNVNLGWSDTFNPEFQKLAGDDKGIKMDPAQGEQLLLNHLLKAGVTDKKMLALALAMAKKETGNYSATVENTNWSAPTLKRYFRNIPDMATAEKVAAMSPPERAMYVYGRAPKGPTLGNTKPEDGWLYRGRGLFQLTGKANYEKFKQETGIDVVSNPRIVSEDPNVMAESAVRFLLNSKAMRSIAQTGDFETAMRGINGGNPVPGSDERRQYYQEYLDRLNRGDISVPDTGEQGSVQISNEQAQLPSVPDSNVPPDHVDGNKAVNPDAKEDINSLMNAADTAKVSNKPVSPTSTPTASPASKPKVPAPPPSIAAPQQPSNTATNTPAVNQSNVMKTSTKEVPVELKLPDGPLAVNDEANTAAMARLITSVDTLNEGINRLAKQQSGVRMN
Physico‐chemical
properties
protein length:2347 AA
molecular weight: 257574,87260 Da
isoelectric point:6,14125
aromaticity:0,07755
hydropathy:-0,48040

Domains

Domains [InterPro]
DC_0124
STR
1–2253
DC_0124
Coil
Unmapped
1205–1225
Coil G3DSA:1.10.530.10
IPR023346
STR
2000–2178
IPR023346
YP_010674892.1
1 2347
Architecture
STR
STR 1-2253 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Aeromonas phage PS1
[NCBI] 		2591406 Uroviricota > Caudoviricetes > Chimalliviridae > Ferozepurvirus PS1 >
Host Aeromonas hydrophila subsp. hydrophila
[NCBI] 		196023 Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Aeromonadales > Aeromonadaceae > Aeromonas > Aeromonas hydrophila subsp. hydrophila

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_010674892.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_070998.1 [NCBI]
CDS location
range 212002 -> 219045
strand -
CDS
ATGGCAAGTGATACTTATGATCTAGACTGGGATGATGATCCCTTTGGTGGAGATCTCGACTTTGATATGGATTTTGATATGGATCCGTATGCAAAGAAAGGGTTTGTCGGAGGGATGGCCTCCGGATTCCTTTCTGGGATTGTCGATGAAACAGTTGGAAGTGGCGAAGCAAGAATGCGAACACTTCGTACTATTCTTCCTAAATCATTCTCCACAGCGTTAGATCGGGTCAGCTGGGCTGGTCGTAGATTTGACGAATTAAAAACAGAATTTAAAGAAGAAAATGCTTCTTCTGTTAAATCGTTACAAAGCATTGCGGGTCATCTGTCAAAGAAAATGGGCGAAAGAATGCCCAGTTCAATTACAAATGAGCTCGAGAATTTCTCCCAGAAAGACTTTTCTAGTTGGGAGAAATTAGGTGGTTATGAAGCTCCTGGTTTAGCTATAGAAGAAACTAGTGACTACGATGTTGCTGCTGCGCTTGATCGCTCTCTTGAAGCTCAAGAAGGAATGTTCACAGCTTTAGGTGAAACATTAAATACCATGTCTGCTCATGTTGGCGGGATGATCACCGCGAGTATCTCTTCTGGTAATAGACAACTCGTTAACATCGAATCTGGAATGCGTGATCTGGTTAACTACCAACGTAACGTCCAACTTCGAATGGATCAGGCTAAGCTTTCTTTATTAGCTAAAACTTACGTTTCTAACGTCAAGTACTATAAGTTTATGGAGAAAGGAATTCATACTGAAATTGCTGAATTGAAAAAGATTCAAAAAGCAAGTATGATGAGCGATTACCAAAAGACGTCCAACTTTACTGCTTCTAAAGAGTTTATGAGAAATAAGCTTTTTAGCACAATAGGTAAACGTGTAGGTGGACTCACTGGTTTAATTAAGGATAAGTTTGGTAAGTCGGCTAGACAAGAAGGTTATCAAGGTGGTAATTTTGCTTTAGAACAAATTGCTGATATGTTAGACATGTCAGATGGAATGCCGATGTCCAAAGGGATGATTGGTGATCTAATCGGCAAACAACTCGGTAGTATGTTCGTTTCCAATATTCCTTACTTCTTTGAACGTGGTAAAGGTAAAGATTGGATTAATAAGCTAGCAGCTAAAAATCCCAAAGAAGCTAAGCAGTTCCAAGAAATGTTTGGCAAATTGACTAACTTTGGTAATAAAGCTTCTTACGCTTCTACTTCTGGTGTTGGGTTAATTAACTACCTTGCTGAAGATTACGAAGCTATGGACGAGATGGAGTATCTTGATTATCAAGATTACTTAGATCAACTTCCTCCTGGTAAGAAACCTATTCCAAAGGCTATTTGGGTTGCTAAGAATGCAGCCACCAACAAAGCTAAAGCTTCCGTTAACAGCTTCATGTCAGAGATTACTAAATCTCGTGGCACTCAATATACCCTTAATAAACGTAATGTAAAAGATCTCAATAATCCAGGTATCTGGAAAGAGACTAACAATATCACACTCAATGAGGTTATCCCAGGGTTGCTTAGTAGGATCTTAACCAGCACCGAAGGGATTCGTACTGGCGAAAAGAATATCGAAGGTGTAAGCTATAACTATATGCGTGGTCAGTTCCAAACTGATTCTGAAAAGCGCATTTCTGTTAAAGCTGATTTAATGCCTTACGGAGACTTTAGTCGTTACGCTCAAGCAGCTTTGGAGATGGTTGACGGGCTGGATACAGAGCGTTCTCTTAGCGCTGGTGCTAGAAAAGCGCTAGCCCAACAGATCGCTAAAGATGTCGATCAAGAGAAAGGGTTTAACCCATTCTATTATCTTGGTGATATTCCTAACGTTTCTGGCGCTCACCAAAAAGAAATCCATGCTGTAATGAAACGTCACTTTGGACTTAATGACCAAGATGTTTCTGAGTTTAAATCTGCTAAGGGTTTTGATAAACTTAAGCGCATGACCGACATGCGTAGTAATGAAGGTAACGAGCGCCTTAACGTAGCTTCTGCCACTGCTGCTAACATGAAGGAACTTTTCCCCAATGTAGCAGAGCGCATCGACATGCTTCGTTCTACTGGTAATGAACAACTCCTTAGAGATCTTGGTGTCATTTACACTGAAGCTGGGGTAGAGAAAGTTAACATGGACATTTTCCACGAAAGGTTGGGACAGTTCATGGAGAACCCTAATAACCCTCAATTGAAGGGTATGTTCGATACCACTTCCAAGAAACCTGTTAGTGACGGTAAAGGTGGATTCATCGTTCCTAAATCACCAACTGGTTCAGCTTCTACTAACAATACGTTTAACGAACTCAATAGTTCCATAAGCGATTTGTCAGCTCAGCTTAGCAGATTGGTTGATAATACTTCCAAAGTTAATACAGAAAGTTCTAAGGGACCACAGGCTTACTTTGACACACATACCGGTGAAGTAATTACCAACATTGATAAGATCGCAACTTCAACTTCTAATATGGATGCGTTGTTTACAGAACTTTTGACTATTGTTAAAGATGGTAAATTGTTTAACAAGCAAGCCAAGTCAGAAACTGAGGAACGTCAAGCTGATCGTTATAACTTTGATGTTATTAATAGACTTAAGAAAATCCTCCCAACTAATATCTTGGGTAAAGGGTTTGAAATGGTTATGCAAAACCAGCCATTAATCTTAGGTTCTATTTTAGGTGGTGTTAGTTCTCATTTTATCCAAAATCCAATTCTAGCAGCAGCCGCTGGAGTAGGTGGTGTCGCTCTAGGTGCTTTAGTACAACATTGGGGTAGGGTTGACAATGAGAATGCGGTAGGTGACGAACCTTCTGATGAAGAAGATATTCTTGATGAGAACGGCAACCCGATTCTTAAGTCATCTAAGTTAAAAGCTGGTGATTATTACGATGCTGTAAAACGTCGTGTGATAAACACTTGGCGTGATATTAAAGGTCCAATCTTTGATGCAGCTGAAAAGGTTACCATAACTATTAAGGAGTTAGGTGGTAAAATCTTTGGTGCTGATGGTAGAGCGGTGGTTCTCTCTGGCATTGTTAAGCTCAAAGATGCCGTAGTTGGTGCTTATAACTTTGTTGATCCACTAACACGTATTAAGTCTGTGATGGAGATGGGTAAGAATCTCATTTACCAGCAAGATGTATATGTGAAAGGTGAGAAGACTCCTAGACTTAGAGCTGTGAAGTTCAAAGAAGGTGAATACTCAATTGAAGATACCACTGGTTCTATTAAACCTATTTGGGGATGGAACGAAATAACTGGACCTGTTTATGACAGTGAAGGGAATGAGGTTATCTCTCAAATTGAGTTTGATCAAGGTCTTATCACAGCAACTGGTCAGAAAGTAAGAGCTGTAGGTAGTGCTGCTTCAGGATTAGCAGAAACAGCCGCTGGACTGGCTAGATCAGGTCTTGATACCATCTTAGGTAAGTTCGGTTATAATCGTCCACAGAGTGATACAGAAGGTTCTGTAGGTGGTAAACCAGGCCAAAGTAGTAACCGTGGTGTTGAACGTCGTTTAGATCGTATCTATGCTATATTGTCTCAGAAGTTTGGTATTGATATTCCAGATAACTTTGATGGTGAAAGTGATCCAATAGGGTCGCCTATCACTAAAGGTTTGAGGTTAAACTCTCTGGAAGATAAGATCCGTCAAGAGAAAGCAGAGAAACAAGAAAAGGTTCAGGACTCCATCATCGATATTGCTGAAGGAATGAAAGAACCTAAAGAGGGAGAGAAAACCGAAAAGCAAGGCATCTTCGGTAAACTCTTTAGCTTGATGGGAGGGATGGGTGATTTTGCCATGCGTCTTATTAAGAATCCCATTGGAACCTTAGGTGGTTTGATTATGGGTTCTCTGGTTAACTCTGGAAAACGCTTAGCTTCTATCGGTAGTATGTTGTTCTCGGGAGTGTTGGGTGTAGCTTCTCCCATCTTCAAATTAATGAAGTGGGGTTTCACTGCTCTGACTAAAGCCACCATGGCTAAAACAGCAGCAGGTGGTTTAGGGGATGCATTAGGTAGTGCTGGTAAAGGAGGGGTAAGAGGTAAGATCGGTGGAGCGCTTGGCAAGTTGGGTGGTCGTGGTAAGATGTTGGCTGCTTTACTAGGTACTGGTGCTGTAGTAGGTGGCGGGATGTACGCAGCCGATGCCTTTGGTGGTGAAGATGAACCCACTGATGGAGATGTGTACGAAGATGGTAAAGACGATAATGGTCCAAAGTTAACTACTATGGAGAAAGTTGTCGATACTGCTTCTGATTTCTTCTTACCTACACTTGCTTTGAAAACAGCTAAGGAATTCTTGTTACCAAAAGCCGCTAGTGACTTTATCGATAACAAGGGTGTATTCTGGGCTCCTGACGGAACCTTCTTTACTGACCGTCGTGAAGCACAAGCTTACATTGATGGTGCTGGTGGAGTTAGCGCTAAAGAGATTCCTGATTCACTACAACGTCGCATTCGTTATGCTCAGTACGGTATCAAGAGTATTGACGGTAATTTGGCTAAACGTGTCTCTAAGTTGGAACAAGCATTAATTCCTCATTTGGCTATTGCTAATAACAGGGCAAGTTTTACCCAAAATGCTCCTGTTGCACAGATCCTCCAGCAGTTTGCTAAAGGTGGAGATAGTGTTCCATTTGATCAAGTTCACACTTGGTTTAATGCACGTTTCAAACCAGTGTTCTTGCTGTACGCTGTAGCAGTATCCGTAGGTAGACATGGTGACATCAACGAGTTTGACCGCAAAGAGAGCTATGAAGTTACACTACTCTGTGAACGTGTAAGAACATCTATGGGTACTTTGGATCCATTCCCTTATGAAGTCCAAGTTCAGATAGATCCAAGGGAAGGTATTCTTAATCGAGTGATGACTGAGAACTTGGTTAGTTCTTTACTGTCAGAACTTCGTAAGAAATACCCCACTCCTGAAGAAGAGTTCAAACTAGAAACAGATGTAGAGCGTCGTAGCAGAGTGCTCAACGAAAAGACTCCGGACGGTCTTGCAGGGTG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Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
18c8f8b0f31ae794b05ea95b1bb71b9644631b1cd1c088eb574de47c6fe2ad0e
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5187
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete genome sequence of Aeromonas hydrophila bacteriophage PS1 Rai,S., Tyagi,A., Kumar,N. and Singh,N. 2020-04-30 — GenBank