Protein
View in Explore- UniProt accession
- E3SIZ1 [UniProt]
- Protein name
- Baseplate wedge initiator
- RBP type
-
TF
- Protein sequence
-
MAEKRVQFNNVVQNQLPSYVREEFPLISEFLKQYYLAQEFQGAPVDLIQNIDRYIKLDETTNLSDSVTLLSDIDFIDTTVKVDLGVNPTGTKGFPDTYGLIQIDDEIITYTSKTNSQFDGCIRGFVGITSYRAAANPENLVFGTSTANEHKSGSTIKNLSNLFLKEFLTKTKRQFLPLLDERPLSGELNQNLFIKQSKDFYLSRGTDRSFEILFQALYNEKVTVVKPREFLFTPSNSDYRITNDLVVEGVIGDPLDLDQATLNQEPYLPGNIGRAYAPITSVEKLQVGTAKSFYKLSLDGGYDRDVEVQGAIRGSFSVHPKTKLIGQVSSGATILNVDSTVGFGTTGELAVVYNDTTTGFVSYTSKTLTEFFGCSNVTGTISDGEDVGINTFAYGRSFRDQDEIITVRINSVLSNLEFPSNTTNFRNGDTARIRTLGRDKTETIYRNWFYNYASSHSVKSIKLVDASDNSYDLQLNQRQFFRPNDNIDIIDDTGATRTGVVYSILSDTAIAIKGSGSLNSNRSYTVNRKILKGNAQNFPSAELYQANVQGVYDNEENFLVASSSIPSYFTSAINTSDRTVTFSGTFLGDELEITPLGKHNFYSGDAVYYAAELKEETFVNDSGNTEKRTVRGTSLGANFPDGLYYIKRISDTKLKLAKSRSDVYNNKFVSVESSTTVTNNTLQPFTFRDKTLESQKLIREIPKNAQHTGKLTPTEPGFTGILVNGVEILNYKSPDVVYYGQIDEVEVLAQGSDYDVINPPLLFVSDTVGTGATGDVAVSGSLESIRVLDPGFDYTSKPTITIMGGNGSGASAIPNMKLIDHSVSFFSEAASNRVALGSTQSTIGFSTYHKLRNGEQIIYRTNGQQAIGGLTTDAKYHVSVQDNQTVKLHNNLSDVLAGINTVEFTSFGNGSHQLQTVNKKSVVESISVINSGSGYENKKRSSGISGISTSQDTININNHDFKSGEKVKYTAGTSAIGGLTDGTEYYVIRVDNDNFRLAEVGLTTSTRTLFYDTNQFIQLTSTGAGTHSFNYPAISVSISGPIGISSIGSETFQAEIQPIFRGEITSVNLSNNGVGYGSSEVLNLDRPPQVTVVSGQDAQLSPVINNGRLQEVLVLNAGKKYNSPPNLTVTGDGIGAVITPVMSNGTITSVKVLESGIGYDQSTTSIGVVFPGRGVTLRAKLQNWRVNLFQKNLFNFQDDDGIVVSGTNEDFGLQYAHVYAPRKFRQLNYSVDADGNVQYGDADLKIDANTKEESLSKQHSPIIGWAYDGHPIYGPYGYTTRSGGSVALMETGYVEDATKAQRPPLTSWPSGFFIEDFVYKNKTGVGVLDENNGRHCVTPDFPNGTYAYFATIATNEADTQSPFTGFRRPKFPYLIGHNYHANPNKFNFQKVANQDEFDFNNSNYIQNTAPFNYIDGKSTRYKYISLPGDLNQEVEVSNALRGPIDSVGIITGGNNYKVNDPVVFNESNTGGGGVSARVSRILGRPVESVSVATSSIENVEFYPSGEKGKFIAFTENPNDFRNSDIISVSGVSTSGSKLEGIYLAGIGTDVYKVAGVGTTSSGIGTVEATGIITYINVVGNLNYPNIRENDILQIGTETVKVLNVDPRLSRLRVRRSVNGVVGVSHTVGTGVTSLQRKLTITSGFKTDFAYRTNKQVYFNPAETVGLGSTAGVGIGSTIFFTNPGTGATSTIIPTKTLFFKDHEFKTGDLVTYSSGIGSGIVVQDETNVGVGTTLASGTQLFIAKVSENLIGLSTVRVGLGTTGTFVGIGTTASTTLAFLGIGTGVEHSLKTNHAVITGTISRNRVTVSTGQTHELRANHDIFLDVNPGVASAFTIKYNDFNRKIIVNPKSYSSTGINTSTGVITIVNHEFINGQKVIYTSGDVAEGLTDNDIYYVAVTGKDTFKLANSYEDSVRNIPATVGIASTGGGGTINPINPPLNLYKDSTVTFNLTDSSLSHIVQNTSYSSFEFNLYHDANFTNKYVGKLSDNRNFDVTRTGRPGIDGTAKVSLVVNDDTPDRLYYRLDPVYESDDVPVEKTGISIDADVLENNTAKVLKSLYNGKHKVSTAATDSFTFTIGVTPEKSSYISSTSAANITYETTCTHARGPVTQIEIVNGGKSYFALPGITTITSVDGRGVILEAKGNKIGKINKTRIKNIGFDFPSDKSLRPSITLPNVISIKSLKSFDAIGISSAGRGYSTAPKLLVFDGKTNERITDVDLRYKLGDNQVTILKNTKGMSNTTPVILPTANTNGVGISTIGFNTTTNQVTVTLAVGFSTADSFPCEVGDKVLIENISVGIGSTGKGFNSSAYDYKLFPIIAVDKNLGGIGATVAYSLEGLVDTDRGEFVGKFDSFNSGGRLIPEKHFPLFDVSLKDNEFLQDEIVSSPSTSGIVESWDRKTGTLRVSTNKDFAVGEIITGQASNTQGIASSVTTYNVILDTDASSRVIKGSQTDSGFLNASLQRVQDSFYYQNFSYSLRSRVDFDTWNDAVSVTNHTAGFRKFSDYQLETPASFSEVTGNSMAVGLSTELSYFSVVNDLYGVADLNCVYNFDLVAENSLDAAGAMYSDEVIFASRILTDFFESFGNRAVNFDNISGLFNSNPRATRFSLIDSFNINNSRAMKYFIYTKDERYVGHRQFDIVTMVQDGTFAYMNQYGRNDTVGELGSYDMTISGVNGSLQFFPNDFAFNDYQIVNIAYHLDDNVVGLGTTVNLGGGTAEIHTCSVDCSGGTTTVVSAAVTTRSLKMYSVLSDLTNNEYQYDEMNLIHDGSEVYVTEFGRLSTNQGSFVGTGFGTFYPHIDGETLKVDFIPEPGIAVTCNTLRVGLGSENIVGFGTEEMKHAFIDAQTTTIASSGTPGITTVASYLPEYDAAYFMVQISDVANEHYEMREIMVLDDDTQEDGTGTTYIQEFGMVETEGTMPYITGLGTFGARTSSGGVSLTFTPTAGIGVSVKTYMNALRLEDDSKDEIDFGNGLIVSHYARYEGTENAVKKSFNLEHRTAPVFEKYFLGNDSDIVSIDADTIRIPNHFYVTGEAIRYDRNGGITSAIGIATTSFAGVGNTEYLPTGEDIFVIKISDDKIKLASSAENALKRIAVPIELESVGIGTSHRFIATNQNARCLIALDNLIQSPIVSTAQTQTLAKNVTSVDNDVFLSGITSFFGSDLIQLGDEIMKITGVGVGSTNRFLVRRGWLGTRVGTGDTGDTITKVVGNYNIRDNVLHFVEAPYGGQPIGSITNRPDERDWIGITTGSSFQGRTFMRSGIPDTTQDTYHTNYLFDSLSDKFDGNTPTYTLTSAGSSDISGISTGNAIILINDILQGPGNSRDFTMGENLGVTTITFTGTASSTTTDANTSNLPLGGVLLSLGSTEGSGYQPLVSAGGTAVVSGLGTISLVSIANSGSGYRVPTKYEFLANIASPVGVGSTEIYLENTGSVLDLVATLNSGSNCTIGIGTDLTPVTIVSTASTFVRIGTSNTISTVMREGTQTKLIITDPQVGFVNVSVGESATGVGTMTHVGFATIMTGTGNISTSVTITNPGSGYTTLINPFVEVDAPLSYTNIPLNYVGTANSGLNATVDIVVGNGSSVTDFSINNKGVGYKPGEILTVPTGGLTGIPTSGTFDQFELTVQTVFSDEFTGWSLGVLQALDDPSDLFDGSTKAFNLTLAGNQISIRAPRGSKVDVEQVLIITINDILQEPGQGYQFPGGSVLTFAEAPKVGDTCKILFFKGTGDDTDVILREVIETVKKGDELTLGYDPARGQDKFLQEEERTVTNVNSTDVVQTFPYFGPGNTGDEELFRPVVWCRQTEDKIIDEKRVAKDRELYEPLIYPFAYITKSVGIGSTMIYVDRVRPLFNGLNENDTSLTFQEKVKFVTQATKVGASATAVVSAAGTVSSLVISDGGVGYSTATVSIGGTAQQDPTLGFTTATARVTISAGGTISALTLTNVGTGYTTDKPPVVLISPPTDEEEENLITDYLGDSGVIVGFGTTTVSGVTTQFIFDLHIPYESKLRETTIVGTAVTLSSLGVNDYFIVSNSNVGSATTSITSIDFQDSSTAGVGKSFIDNVYVVQSVQNVERNIIGIGTSVFRRVFVNVDDTFAFGTAGTISTTTLAGYGEYSWGKMVMASRAANNSYSAYTSGGIIGINTSMRVERSQQLKSKNYIVSNT
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 4156 AA molecular weight: 447600,54090 Da isoelectric point: 4,92325 aromaticity: 0,09264 hydropathy: -0,17067
Domains
Domains [InterPro]
DC_1555
ATT
4–291
ATT
4–291
IPR025924
STR
1253–1355
STR
1253–1355
1
4156
Architecture
ATT 4-291 | ATT 525-921 | STR 1082-1419 | ATT 3107-3218 | STR 3645-4155 |
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Synechococcus phage S-SM2 [NCBI] |
444860 | Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Nilusvirus > Nilusvirus ssm2 |
| Host |
Synechococcus sp. WH 8017 [NCBI] |
166321 | Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus > |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
ADO97439.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
GU071095
[NCBI]
CDS location
range 63546 -> 76016
strand +
strand +
CDS
ATGGCAGAAAAGAGAGTTCAGTTTAACAACGTAGTACAGAATCAGCTCCCCTCTTACGTTAGAGAGGAGTTTCCTCTTATTTCTGAATTTTTAAAACAATATTACCTGGCACAAGAATTTCAGGGTGCCCCTGTTGATTTAATTCAGAATATTGATCGTTATATTAAACTTGATGAGACAACTAATCTTTCAGATTCTGTTACATTGTTGTCAGATATAGATTTTATTGACACAACCGTAAAAGTTGATCTTGGAGTTAATCCTACTGGAACTAAAGGATTTCCAGACACATATGGTTTGATTCAGATCGATGATGAAATTATCACATATACATCAAAAACAAATTCTCAGTTCGACGGATGTATCAGAGGATTTGTTGGAATCACTTCCTATAGAGCAGCTGCAAATCCAGAGAATTTAGTTTTTGGAACCTCTACTGCTAATGAGCATAAGAGTGGTTCTACGATTAAAAACTTAAGCAATCTCTTCCTAAAAGAATTTTTAACAAAAACAAAACGTCAATTTCTTCCTCTTCTGGATGAAAGACCTCTTTCAGGTGAGTTAAATCAAAACCTTTTCATTAAGCAATCAAAAGATTTCTATCTGAGTAGAGGAACCGATAGATCTTTTGAAATTTTATTCCAAGCATTATATAATGAAAAAGTAACAGTTGTAAAACCAAGAGAGTTTCTCTTTACGCCATCTAACTCTGATTATAGAATTACCAATGATTTAGTTGTTGAGGGAGTAATTGGAGATCCTTTAGATCTTGATCAAGCAACTCTTAACCAAGAACCATACCTTCCTGGAAATATTGGAAGAGCATATGCACCAATTACTTCTGTAGAAAAACTTCAAGTTGGAACGGCTAAAAGTTTCTATAAATTAAGTCTTGATGGTGGATATGATAGAGATGTTGAAGTTCAGGGTGCTATTCGTGGATCTTTCTCCGTTCATCCCAAAACGAAACTAATCGGACAGGTTAGTTCTGGTGCAACTATTCTCAACGTAGACTCTACTGTTGGATTTGGAACTACTGGTGAACTGGCGGTTGTGTATAATGACACAACAACTGGTTTTGTTTCATATACATCCAAAACTTTAACAGAGTTCTTTGGTTGTTCTAACGTAACGGGAACAATTTCTGACGGTGAAGATGTTGGTATCAATACGTTTGCATATGGTAGATCTTTTAGAGATCAAGATGAAATTATTACCGTAAGAATCAACTCCGTTCTCAGTAATTTAGAATTTCCATCTAATACAACTAATTTCCGTAACGGAGATACTGCAAGAATCAGAACATTAGGTAGAGATAAGACTGAAACTATCTACAGAAATTGGTTTTATAACTATGCATCTTCTCACTCAGTAAAATCAATCAAGTTAGTTGATGCTTCTGATAACAGTTATGATCTTCAATTAAATCAGAGACAGTTTTTCCGTCCTAATGATAATATTGATATCATTGATGATACTGGAGCTACCAGAACTGGAGTTGTTTATTCAATCCTTTCTGACACTGCAATCGCTATAAAAGGATCTGGATCTCTTAATTCAAATAGATCATATACAGTAAATAGAAAAATCCTGAAAGGAAATGCTCAGAACTTCCCTTCAGCAGAATTATATCAAGCAAACGTGCAGGGTGTTTATGATAACGAAGAAAACTTCCTTGTAGCATCTTCTTCTATTCCATCATACTTTACGTCTGCGATTAATACCAGCGATAGAACTGTTACTTTTTCTGGCACTTTCCTTGGAGATGAACTTGAAATAACTCCTCTTGGAAAACATAACTTCTATTCAGGTGATGCAGTATACTATGCTGCAGAATTAAAGGAAGAGACATTCGTTAATGATAGTGGAAATACTGAAAAAAGAACCGTAAGAGGAACTTCTCTTGGTGCAAACTTCCCTGATGGATTATACTATATCAAGAGAATAAGCGATACTAAGTTAAAACTCGCTAAGAGTAGAAGTGATGTTTACAATAACAAATTTGTTTCGGTTGAGAGTTCAACTACGGTAACTAATAATACCTTACAACCATTTACTTTCAGAGATAAGACTCTTGAATCTCAGAAGTTAATCAGAGAGATTCCTAAAAATGCACAACACACTGGGAAATTAACTCCTACTGAACCAGGGTTTACTGGAATATTAGTTAATGGTGTTGAGATTCTTAATTACAAGTCTCCTGATGTTGTTTACTATGGTCAGATAGATGAAGTAGAAGTTCTTGCTCAAGGTTCTGATTATGATGTCATCAATCCTCCACTTCTTTTTGTCAGCGACACTGTTGGAACTGGTGCAACTGGAGATGTTGCTGTATCTGGTTCATTAGAATCTATCAGAGTTCTTGACCCTGGATTTGATTATACCTCAAAACCAACCATAACAATTATGGGTGGTAATGGTAGTGGAGCATCTGCTATCCCCAATATGAAACTGATTGACCATTCAGTTTCATTCTTCTCAGAAGCTGCATCTAATAGAGTTGCCCTTGGTTCTACTCAGTCAACTATTGGATTCTCTACTTATCATAAACTGAGAAATGGTGAGCAGATAATCTATAGAACGAATGGTCAGCAAGCAATCGGTGGTCTCACAACAGACGCCAAGTATCATGTTTCTGTTCAAGATAATCAAACTGTAAAACTCCACAACAATTTAAGTGATGTTCTTGCGGGAATTAATACAGTAGAATTCACTTCTTTCGGAAATGGATCTCATCAACTTCAAACTGTAAACAAAAAATCTGTAGTCGAGTCTATTTCTGTCATCAACAGCGGATCTGGATATGAAAATAAGAAGAGATCTTCAGGAATTTCTGGAATAAGCACTTCACAAGATACTATCAATATAAACAATCACGACTTTAAGTCTGGAGAGAAAGTAAAATACACTGCTGGAACCTCTGCAATCGGTGGATTGACTGATGGAACAGAATATTATGTGATCAGAGTTGACAATGACAACTTTAGGTTAGCAGAAGTAGGACTTACTACATCAACAAGAACTCTCTTCTATGATACGAATCAGTTTATTCAACTGACATCCACTGGTGCTGGAACTCACTCATTCAACTATCCTGCGATTTCAGTTTCTATTTCTGGACCAATTGGAATATCTTCCATTGGATCTGAAACATTTCAGGCAGAAATTCAACCAATCTTTAGAGGAGAGATAACCTCAGTCAATCTCTCTAACAATGGTGTTGGATATGGATCATCTGAAGTTCTTAATCTTGATAGACCTCCTCAAGTAACTGTTGTTTCTGGACAAGATGCACAGTTGTCACCAGTAATTAATAATGGCCGTCTACAAGAAGTATTAGTATTAAATGCTGGTAAAAAGTACAATTCTCCACCAAATTTGACAGTCACTGGAGATGGTATTGGTGCTGTTATAACACCAGTCATGTCTAATGGAACTATAACCTCAGTTAAAGTTCTTGAATCTGGAATTGGATATGATCAGAGCACAACTTCTATCGGTGTTGTGTTCCCTGGAAGAGGTGTTACCTTAAGAGCGAAACTTCAGAATTGGAGAGTCAACTTATTCCAGAAGAATCTGTTTAATTTCCAAGACGACGATGGTATTGTTGTATCTGGAACTAATGAGGACTTTGGATTACAATATGCTCACGTTTATGCTCCAAGAAAGTTTCGTCAGTTAAACTATTCCGTTGATGCTGACGGTAATGTACAATACGGTGATGCAGATCTTAAGATTGATGCAAATACAAAAGAAGAATCTCTATCAAAACAACACTCACCAATTATAGGTTGGGCGTATGATGGTCATCCAATCTATGGTCCATATGGATATACAACCCGCTCTGGTGGGTCCGTTGCTCTCATGGAGACTGGATATGTAGAGGATGCTACTAAAGCACAAAGACCTCCACTTACATCTTGGCCATCAGGATTCTTCATTGAAGACTTTGTATATAAAAATAAAACTGGAGTAGGAGTTCTTGATGAGAACAATGGAAGACATTGTGTAACTCCAGATTTCCCAAATGGGACTTATGCATACTTTGCGACTATCGCAACCAATGAAGCAGATACTCAATCACCTTTCACTGGATTTAGAAGACCCAAATTCCCATATCTGATTGGACATAATTATCATGCTAACCCAAATAAATTCAATTTCCAAAAGGTAGCAAACCAAGATGAGTTTGATTTTAATAATTCAAACTATATCCAGAATACTGCTCCATTTAACTATATTGATGGTAAGTCAACAAGATATAAGTATATTTCTCTTCCGGGTGATTTAAACCAAGAAGTTGAAGTTAGTAATGCTCTCAGAGGACCTATTGATTCTGTTGGAATTATCACTGGAGGAAACAATTATAAGGTTAATGACCCAGTTGTATTTAATGAATCAAATACAGGTGGTGGAGGCGTTTCTGCAAGGGTCTCACGCATCTTAGGAAGACCTGTTGAGAGTGTAAGTGTTGCCACAAGTTCTATAGAAAATGTAGAATTTTATCCATCTGGAGAGAAAGGTAAATTTATTGCCTTTACCGAAAACCCTAATGATTTTAGAAATTCTGATATCATCTCTGTAAGTGGAGTTTCAACTTCTGGATCTAAACTCGAAGGGATTTATCTCGCAGGTATTGGAACAGACGTTTATAAGGTAGCCGGAGTAGGAACCACATCTTCTGGGATTGGAACTGTCGAAGCAACTGGTATTATCACTTACATCAATGTGGTTGGTAATTTAAATTATCCAAATATCAGAGAGAATGATATTCTTCAAATTGGAACAGAAACTGTTAAGGTTCTGAACGTTGATCCACGTCTTTCAAGATTGAGAGTTCGTAGATCTGTAAATGGTGTTGTTGGTGTATCTCATACTGTCGGAACTGGTGTAACTTCCTTACAGAGAAAATTAACTATTACCTCTGGATTCAAGACAGATTTTGCATACAGAACTAATAAGCAAGTTTACTTTAATCCAGCAGAAACTGTAGGACTTGG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Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
No tertiary structures available.