Protein

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Genbank accession
AIX37425.1 [GenBank]
Protein name
structural protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,91
Protein sequence
MANRIQLRRGGAQEWANENPTLAQGEIGIELDTNRFKIGDGVRGWNTLPYERPIESVANTANTLVKRDADGNFTAGAITATLIGNSATSSRLANPRQIQLSQDLSGSGTFDGSSNLSLAAQLQTLTSLPHYDGTTSSSGQYTKVTVDAKGRITNASQPSSYVDLGLTDVQPIDSDLSAISNLTTTGIIARASAGNMQTRSVQGSSGRISVVNGNAVAGNPTLDLIDTTVALEAEFIAAAGLYNIPTLISVGGDDLPEAANRTVNSTRYTVDQYGRFTSALTIPIATAREGSKYAAYGAGVTYARYDIIEESSGVYQAIASIAAGQGAPTHTDASDAGAWRYLGAALTEQKGLASFAQEDFDVDSNGHVTIAAVGVDNTQLQNNRIGFADGNTLENFELDQELTATSGYRGFNYLNYVKVNDTSGNLLVGANNTGDSGAGELDVNVRSYFSDPDITLDGALNQTLDKTGDGDLTFQLTQDTASNRNFNILTTNAGSGSSNIIITAEDTIQINASEATGKVHVEDYRFQTNYLGTTDATMHLDPGDDRAITGTVRVWGNLQIDGVTTTINSTTLTVDDVTILLGGDTVPTTDDNLDRGIEFNYYDTEARLGFYGWDTSYTDLNSHGGGYRFLHAATNSSEVFTGTDSGIVAGNLKLTTNNNSTSNTTGDFVVAGGAGIGQDVNIGGLVDIDSTLRVHSTSRFDDNMVIQGASKTLQLNNGSGTTRVELQSTTGNASFYGVVDITNNLNINTDKFNVTAASGNTYTAGTLEVTQGSTLNGAVDLNNTLNVSSTVHFEATDEPTFAQNAGTGLWEIQSNDYGSFRFDGGGYIAGDFMFDSDVVINGTILQKESSTEVFNEQNFLRVRRKLESGSVQALNPSYANHTNSNLRIFGGAGIVQDLHIGDDLYIGKVNNGDTVEFTVLGESGNTQIGRSGAGTASVGTLTVYGDTLLDRDLTVNGSQITLGNANTDILTVNSDATFTDNLTVNQSVEFDSTLNVDDNVTFGAQLTVTGTTEFNNTVDVDANFAVRSGSTDKMTVASSSGNIATDGTLVVQGQTTINDSLYIQSSNEFFKIQNGSSVDKFTVDTDNGNTAIIGTLTVSNATQLNNTLGCQGIASFTNTTDQDVVSGSYTADGGVRITSGLGVERNLAVGGDTRFYGTVGFESALDVDNAVDISGNLNISNGNDVSNFTDTTVALKVSGGARISKKMMVGGDFTVYDSSGALNNFFVEKTTGNAELRNNLVVGGDLTVNGTTTTVNSTTLTVDDPIITLGGDSVPTTDDNLDRGVEFRYYDTQARLGFFGYDNNLNRYRFLVEATNSSETFSGTDASLQAGSLQLTSSGTGLDVDANANIDGTLTVDGQIISQVSSGPALVIPTTAKINNLNADLLDSMTTDSANTATTVVARDNSGDFAANQITVNNGIGAVAGIQGNATSADALRTARVITVDGVVNGNVSFDGSAAVTITTTYDDDDITALAAQTGTGIMARTAANTYAHRTIAVTGSGIGITNADGISGDPLITITSASTNSANNIVIRDVNGDFAAGTITATLVGDVTGDLTGNADNALQVSTGSGGAGGTMYFAMTNQYGAGSSRTLFANTSTITLDTSGGVGNNTLIVDKVTADLTGNVIGNVTGEVSSLANHDTADLAEGTNLYYTNARAEASFDTKIAAATTTDLTEGTNLYYTDERVDDRVGDLVVGGTGINALYDDGNGALTLTVTQGDIDTDNVTEGSTNIFYTEGRFDASLATKSTDQLTEGANLYYTNTRADDRVNLQTGTNLDLSSKSTSDLIEGSNLYYTETRVQDKLDNAFAQLQAMLTNLATTTTLTLNLSGDPTPGAAVTTSITNNGSGGFTAGTNVATTGGTGASLTVDTTVDAQGRITAATVNTPGSDYVVNEVVFILNANAGKVLSLNLASLAGGSNYVTGTALATTGGSGSASLTVNITASSGAITNVTINDGGTGYVIGETITIVQPTGADGLNPAAGGTVDVATIATNAGLQLTDVTTMELGAVVTGSESGTTGIITNIDTQAITVDTVDGFFKVGEVVSANDVTTLTLSSFA
Physico‐chemical
properties
protein length:2058 AA
molecular weight: 213241,14940 Da
isoelectric point:4,10130
aromaticity:0,06220
hydropathy:-0,16113

Domains

Domains [InterPro]
SSF69349
STR
4–229
SSF69349 DC_1607 DC_1607 DC_0029 DC_0029
IPR041352
ATT
5–42
IPR041352 DC_0029
AIX37425.1
1 2058
Architecture
ATT
STR
STR
STR
RBD
RBD
ATT 4-42 | STR 43-229 | STR 329-944 | STR 1116-1546 | RBD 1579-1721 | RBD 1730-2058
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage ACG-2014d
[NCBI] 		1493509 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Lowelvirus > Lowelvirus tuscon4d
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AIX37425.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KJ019125 [NCBI]
CDS location
range 81761 -> 87937
strand +
CDS
ATGGCAAATAGAATTCAACTTAGACGTGGTGGTGCTCAGGAATGGGCTAACGAAAACCCGACCCTAGCCCAAGGCGAGATTGGCATTGAACTTGACACTAACCGTTTTAAAATCGGTGATGGTGTTAGGGGATGGAATACTTTGCCCTATGAAAGACCGATTGAGTCCGTAGCAAATACGGCAAACACGCTTGTAAAACGAGATGCTGATGGTAATTTTACCGCTGGTGCAATTACAGCAACTCTAATTGGTAATTCTGCAACTTCTTCACGTCTTGCTAACCCAAGACAGATTCAGTTGTCGCAGGATCTTTCGGGTTCTGGTACTTTTGACGGTTCATCTAACCTATCTCTTGCTGCCCAACTTCAAACTTTAACCTCACTTCCACACTACGACGGAACAACTAGTTCTAGTGGACAGTATACTAAAGTAACTGTTGATGCTAAAGGTAGGATTACTAATGCATCTCAACCTTCGTCTTATGTTGACCTAGGATTGACTGATGTTCAACCTATTGACTCTGACCTGTCTGCTATCTCTAACCTGACAACTACAGGTATTATTGCTAGAGCATCTGCAGGAAACATGCAGACCAGATCTGTACAGGGTTCTTCAGGTAGGATTTCAGTTGTAAATGGTAACGCCGTTGCAGGTAACCCAACGCTTGACCTGATTGATACTACTGTAGCGTTAGAAGCAGAATTTATTGCTGCTGCTGGTCTTTATAATATTCCCACACTTATTTCAGTTGGTGGAGATGATCTGCCCGAAGCAGCAAACAGAACTGTAAACTCAACCAGATATACTGTTGATCAGTATGGTCGTTTCACTTCTGCCCTGACTATTCCTATTGCTACCGCTAGAGAAGGTAGTAAGTATGCTGCATATGGAGCAGGTGTAACGTATGCAAGATATGATATTATTGAAGAAAGTAGTGGAGTATATCAAGCAATCGCTAGTATTGCTGCAGGACAAGGTGCTCCAACTCATACTGATGCTTCAGATGCTGGTGCTTGGAGATATCTCGGTGCTGCACTGACAGAACAGAAAGGACTTGCTTCTTTCGCACAAGAAGATTTTGATGTTGACAGCAATGGACATGTAACTATTGCTGCTGTTGGTGTTGATAATACACAACTACAAAACAATCGTATTGGTTTCGCTGACGGTAATACCCTAGAAAATTTTGAACTGGATCAAGAACTTACTGCAACCTCTGGATACAGAGGATTCAATTATCTTAACTATGTTAAAGTTAATGATACGAGCGGTAATCTACTCGTTGGCGCTAATAATACGGGGGACAGCGGAGCTGGCGAACTTGATGTTAACGTACGGTCGTACTTCTCTGACCCTGATATTACTCTTGATGGCGCTCTTAATCAGACACTGGATAAGACTGGGGATGGCGACCTAACATTCCAGTTAACTCAGGACACTGCCTCAAATAGAAACTTTAATATTCTGACAACCAATGCTGGTTCTGGATCCAGCAACATTATTATTACTGCTGAAGATACTATACAGATTAATGCGTCAGAAGCAACTGGTAAGGTTCATGTAGAAGATTATAGATTCCAGACAAATTATCTTGGTACTACTGATGCAACTATGCATCTTGATCCAGGTGATGATCGTGCAATCACTGGCACCGTCCGTGTCTGGGGTAACCTTCAGATTGATGGGGTAACAACTACAATCAATTCAACTACACTGACTGTAGATGATGTCACTATTCTACTCGGTGGGGATACTGTACCTACAACTGATGACAATTTAGATCGTGGTATTGAATTCAACTATTATGATACTGAAGCCCGTTTAGGTTTCTATGGTTGGGATACTAGCTATACTGATTTGAATTCTCATGGTGGTGGATATCGTTTCCTCCATGCTGCTACAAATAGTTCTGAAGTCTTTACTGGTACTGACTCTGGTATTGTTGCTGGTAATCTTAAACTAACTACAAATAATAATTCTACTTCCAATACAACTGGTGACTTTGTAGTTGCTGGTGGTGCTGGTATTGGTCAAGATGTCAACATCGGCGGTCTGGTTGACATTGATAGCACTCTCAGAGTTCATAGTACCTCCCGCTTTGATGACAACATGGTCATCCAAGGTGCTTCTAAGACTCTGCAACTTAATAATGGTAGTGGCACTACTCGTGTTGAACTGCAATCTACCACTGGTAATGCATCATTCTACGGTGTTGTTGATATTACCAACAACCTGAATATTAATACTGATAAGTTTAATGTTACTGCAGCAAGTGGTAACACTTACACTGCTGGAACTCTTGAAGTTACTCAAGGTAGCACACTCAATGGTGCTGTGGACCTCAATAACACACTGAATGTTTCTAGTACTGTTCATTTTGAAGCAACAGATGAACCTACATTCGCACAGAACGCTGGCACTGGTCTTTGGGAAATTCAATCCAATGACTATGGTTCATTCCGATTTGATGGTGGTGGATATATTGCTGGCGACTTTATGTTTGACAGCGACGTTGTTATCAACGGTACTATTCTACAAAAAGAATCCTCTACTGAGGTCTTCAACGAGCAGAACTTCCTGAGAGTTCGTCGTAAGTTAGAATCTGGTTCTGTTCAAGCTCTCAATCCATCTTACGCAAATCATACAAACTCCAACCTTAGAATATTTGGTGGTGCTGGTATTGTACAAGACCTTCACATTGGAGATGACTTATATATTGGTAAGGTTAATAATGGCGACACCGTAGAATTCACAGTTCTGGGTGAGAGTGGTAATACTCAAATTGGTCGTTCTGGTGCTGGTACTGCATCGGTTGGTACTTTAACTGTCTATGGTGATACTCTGCTTGATAGAGATCTGACCGTCAATGGTTCTCAGATTACTCTTGGTAATGCAAATACAGATATACTTACAGTAAATTCAGATGCAACCTTTACTGATAACCTAACAGTTAATCAATCAGTTGAGTTTGATAGTACTCTTAATGTTGATGACAATGTTACATTCGGTGCTCAACTAACTGTTACTGGTACAACTGAGTTTAATAATACTGTTGATGTTGATGCCAACTTCGCTGTAAGAAGTGGTAGCACGGACAAGATGACCGTTGCCTCTTCTTCAGGTAACATTGCAACTGACGGCACACTGGTTGTTCAGGGTCAGACAACTATCAATGACTCTCTGTATATACAATCATCTAATGAATTCTTTAAAATTCAGAATGGTAGTTCTGTAGATAAGTTTACTGTTGATACTGATAATGGCAATACTGCTATTATTGGCACTCTAACGGTCTCCAATGCCACTCAACTGAATAATACACTTGGTTGCCAAGGAATCGCTTCCTTTACCAATACAACCGATCAGGACGTTGTTTCAGGGAGTTATACTGCAGACGGTGGTGTTAGGATTACTTCTGGTCTTGGAGTAGAGAGAAACTTAGCAGTTGGTGGAGATACTAGATTCTACGGAACAGTTGGATTTGAGTCTGCTCTTGATGTTGACAATGCTGTTGACATTTCAGGTAACCTGAACATCAGCAATGGTAACGATGTTAGTAATTTTACTGACACTACTGTTGCACTGAAGGTTAGTGGTGGTGCAAGAATCAGTAAGAAAATGATGGTCGGTGGAGATTTCACCGTATATGATTCTTCTGGAGCATTAAATAATTTCTTTGTTGAGAAGACTACAGGTAATGCAGAGTTAAGAAACAACCTGGTAGTTGGTGGAGATCTCACAGTAAATGGTACAACCACAACTGTAAATTCAACCACATTAACAGTGGACGATCCTATCATCACTTTGGGTGGAGATAGCGTTCCTACAACTGATGATAACTTGGATCGTGGTGTTGAATTTAGATACTATGACACTCAAGCGAGATTAGGTTTCTTTGGTTATGACAATAACCTCAATAGATATAGATTCTTAGTTGAAGCTACAAACTCATCAGAAACATTCAGTGGTACTGATGCGTCACTTCAGGCGGGTTCACTGCAACTAACCTCAAGTGGAACTGGACTTGATGTTGATGCTAACGCTAACATTGATGGTACTCTGACTGTAGATGGACAGATCATCTCTCAGGTTTCTTCTGGTCCTGCCCTGGTCATTCCTACCACTGCCAAGATCAACAATCTGAATGCTGATCTTCTGGACAGCATGACTACCGATTCGGCAAATACAGCGACTACTGTTGTTGCTCGTGACAATAGTGGAGATTTTGCTGCGAATCAAATTACAGTTAATAACGGTATTGGTGCTGTTGCAGGTATTCAAGGTAATGCTACATCAGCAGATGCACTGAGAACAGCAAGAGTCATCACAGTTGATGGTGTTGTTAATGGTAACGTATCGTTTGATGGATCGGCAGCAGTAACAATCACCACGACTTATGATGATGACGATATAACTGCTCTTGCTGCTCAGACAGGCACGGGTATTATGGCAAGAACTGCCGCCAATACTTATGCTCATCGTACTATCGCTGTTACTGGTTCTGGTATTGGTATCACTAATGCAGATGGAATCAGTGGTGACCCATTAATTACAATCACTTCTGCAAGCACAAACTCGGCAAATAACATAGTTATTCGTGACGTTAATGGTGACTTTGCTGCTGGAACAATCACAGCAACCTTGGTTGGTGATGTAACTGGTGATCTAACTGGTAATGCAGACAATGCTCTACAAGTTAGCACTGGATCTGGTGGTGCTGGTGGTACTATGTACTTTGCCATGACGAATCAATATGGTGCTGGTTCAAGTAGAACTCTGTTTGCTAATACCAGTACTATTACACTTGATACTTCTGGCGGTGTTGGAAACAATACTCTGATCGTAGATAAGGTTACTGCTGACTTGACTGGTAATGTAATTGGTAACGTAACTGGTGAAGTTTCTTCCCTTGCAAATCATGACACTGCTGATCTAGCAGAGGGAACTAACCTTTACTATACAAATGCTCGCGCTGAGGCATCCTTTGACACCAAGATTGC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Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
5734733b8652ddb14909d4be5880a8034aef23c9b4eda95ed0e21841e9a49e9c
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5042
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Ecological redundancy of diverse viral populations within a natural community Gregory,A.C., LaButti,K., Copeland,A., Woyke,T. and Sullivan,M.B. 2015-03-20 — GenBank