Protein
View in Explore- Genbank accession
- WMM95705.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TFTFTF
- Protein sequence
-
MANSFVRYTGNGSTTAYAISYTYRDAADLIVSINGVATTSYTLNSAGTTLTFDSAPANASAIEIRRKTSQTTRLTDYAAGSVLTENDLDTDSNQAFFMGQEAIDDANDVIKISSTDFQYDATNKQIRNVANPTSAQDVATKHYLENTWLSTANKTALTTVNANIANINAVNSNSSNINSAVSNATNINTVATNIGSVNTVATDITKVIAVANDLAEAVSEVETVANDLNEATSEIDTVAGSITNVDNVGGSIANVNTVSGSIANVNTVATNISNVNTVQNVSSDVTTVAGIASDVTAVANDATDIGNVSSDIANVNTVAGSISNVNTVATNVANVNTVANDLNEATSEIDTVATNIANVNTVGNAISNVNAVASNASNINAVAGNETNINAVNSNSTNINTVAGNNSNITTVAGISSDVTAVANISSDIQAVENKLTEVQAVADDLAEQTSEIDTVAGSITNVNNVGGSIANVNTVATNISNVNSVANDATDIGTVASNIANVNTVAGNNSNINTVAGNNANITTVAGISADVTSVAGISTAVSNVNSNSTNINAVNANSANINAVAGDATDIGIVATDIANVNTVAGISSNVTTVANDGTDIGTVATNIANVNLVGGSITNVNTVASNISGVNSFADRYRVASSDPSTNLDAGDPAFNTSGSVFKYYDGSAWQVITAGGITDVIQDSTPQLGGNLDLNGNDITGTGNVNITGNVSLTGTVDGRVIASDGTKLDGIESGATGDQSNAEIKTAYEANSNTNAFTDTLLSKLNGIEASATADQSNAEIKTAYEANSNTNAFTDAEKTKLSGVATNANNYVLPTNLAGDDINIDTGALTGATVISDLDLNVTTDTSGRVTDANATVATRNLTLANLGYTGATNANYITNNNQLTNGAGYTTNTGDITGVTAGTNLTGGGSSGSVTLNMATGGVGSGTYGSTSNGTKIDTITVDAYGRVTGVATGATGDGDITGVTAGTGLTGGGTSGTPTLNVDVGTSANKIVQLDGSSRLPAVDGSQLTNIPGISGWSSSSGNLLPASATAGIYLGVSSATASNLLSDYEEGTWSPKHATSGGTPNQTYNYNNGYYVKVGNVVTITADVHISNGEGGFFDQRVSNFPFTTKNSTNTIAVGVFGFVQNTGQSSTKPMVWNAEENRTFGDVKKNDLSNCPAGTFTSNTTFKYTATYLTE
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1185 AA molecular weight: 119647,43040 Da isoelectric point: 4,05003 aromaticity: 0,04304 hydropathy: -0,10962
Domains
Domains [InterPro]
IPR005604
ATT
3–120
ATT
3–120
DC_0265
STR
28–155
STR
28–155
DC_0265
STR
226–302
STR
226–302
1
1185
Architecture
ATT 3-120 | STR 121-302 | STR 344-424 | STR 426-516 | STR 540-599 | RBD 635-864 |
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Pelagibacter phage HTVC309P [NCBI] |
3072840 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host |
Candidatus Pelagibacter [NCBI] |
198251 | cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Alphaproteobacteria > Candidatus Pelagibacterales |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WMM95705.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
OR420751.1
[NCBI]
CDS location
range 33422 -> 36979
strand +
strand +
CDS
ATGGCTAATTCATTTGTAAGATATACAGGTAATGGCTCTACAACTGCTTACGCTATATCATATACATATAGAGACGCAGCAGATTTAATTGTGAGCATCAATGGTGTCGCTACTACATCTTATACTTTAAACTCTGCGGGAACTACTTTAACTTTTGATTCCGCTCCCGCTAACGCAAGTGCTATAGAAATACGTAGAAAAACTTCTCAAACAACAAGATTAACAGATTATGCGGCAGGTTCGGTTTTAACTGAAAACGATTTAGATACAGACTCAAACCAAGCTTTCTTTATGGGACAAGAAGCTATTGATGATGCAAATGATGTAATCAAAATTTCAAGCACAGATTTTCAATATGACGCAACTAACAAACAAATAAGAAATGTTGCAAATCCTACGTCAGCACAAGATGTTGCTACTAAACATTATTTAGAAAACACTTGGTTATCTACAGCTAACAAAACAGCTTTAACTACAGTAAATGCTAACATAGCAAACATTAATGCAGTAAATTCAAACTCATCAAATATCAACTCAGCAGTATCTAACGCTACAAATATCAATACAGTAGCTACCAACATTGGTTCAGTAAATACTGTAGCAACAGATATTACAAAAGTAATTGCAGTCGCTAATGATTTAGCAGAAGCAGTAAGTGAAGTAGAAACAGTAGCAAATGATTTAAACGAAGCAACTTCAGAAATAGATACAGTAGCAGGTTCTATTACAAACGTAGACAATGTTGGTGGAAGTATAGCTAATGTAAACACAGTAAGTGGCTCTATAGCTAACGTAAATACAGTAGCAACAAACATTAGTAATGTTAATACAGTACAAAATGTTTCTAGCGATGTAACTACAGTTGCAGGAATTGCTTCAGATGTAACAGCAGTAGCAAATGATGCTACAGACATTGGAAACGTTTCTTCAGATATAGCAAATGTAAATACAGTTGCAGGCTCTATATCTAACGTAAATACAGTTGCAACTAATGTGGCAAACGTAAATACAGTAGCTAATGATTTAAATGAAGCTACGTCAGAGATTGATACAGTAGCTACAAATATTGCAAATGTTAATACTGTTGGAAATGCAATTTCGAATGTAAACGCAGTAGCTAGTAATGCTAGTAATATTAACGCTGTAGCAGGTAATGAAACAAATATTAATGCTGTAAATTCAAACAGCACAAACATTAATACAGTAGCAGGTAATAATTCTAATATAACTACAGTAGCAGGGATTAGTTCAGACGTAACTGCTGTTGCAAATATTAGTTCAGATATTCAAGCAGTAGAAAATAAACTAACAGAAGTTCAAGCTGTTGCAGATGACTTAGCTGAACAAACTTCAGAAATAGATACAGTTGCAGGTTCAATTACTAATGTTAATAATGTTGGTGGTTCGATTGCTAATGTTAATACAGTTGCAACAAATATTTCAAATGTAAATTCAGTTGCAAATGATGCTACAGATATTGGAACTGTCGCTAGTAATATTGCTAACGTTAATACTGTTGCAGGAAATAATTCAAATATAAATACTGTAGCAGGAAACAACGCTAACATTACTACTGTTGCAGGTATTAGTGCAGATGTAACTTCAGTAGCAGGTATTTCAACTGCTGTATCAAATGTAAATTCAAATAGTACAAATATTAATGCTGTTAATGCAAATTCAGCTAACATAAATGCAGTAGCAGGTGATGCAACAGATATAGGAATAGTAGCTACAGATATTGCTAATGTTAATACTGTTGCAGGTATTTCTAGCAATGTAACTACAGTTGCTAATGATGGAACAGATATAGGAACAGTTGCAACTAATATTGCTAATGTAAATCTAGTAGGTGGCTCAATTACAAATGTAAATACAGTCGCTTCAAATATTAGTGGTGTAAATTCTTTTGCTGATAGATATAGAGTAGCTTCAAGTGACCCTTCAACAAATTTAGATGCAGGTGACCCCGCTTTTAATACTTCGGGGTCTGTATTTAAATATTATGATGGTTCAGCTTGGCAAGTTATAACAGCAGGTGGTATAACTGATGTTATTCAAGATAGTACACCACAACTTGGTGGTAACTTAGACCTAAATGGAAATGATATTACTGGAACTGGTAATGTTAATATTACAGGAAACGTATCTTTAACTGGTACAGTAGATGGTAGAGTTATTGCTTCTGATGGTACTAAACTTGATGGTATTGAAAGTGGTGCAACAGGAGACCAATCAAATGCTGAAATCAAAACTGCTTACGAAGCTAATTCAAATACAAACGCATTTACAGATACATTATTAAGTAAATTAAATGGCATAGAAGCAAGTGCAACAGCAGACCAATCTAATGCTGAGATTAAAACTGCTTATGAAGCTAATTCAAATACAAACGCATTTACTGATGCTGAGAAAACAAAATTAAGTGGTGTTGCTACAAATGCAAACAATTATGTATTACCAACTAATTTAGCAGGTGATGATATTAATATTGATACTGGAGCATTAACAGGTGCAACAGTTATTTCTGATTTAGATTTAAATGTTACAACAGATACATCAGGTCGTGTTACAGATGCTAATGCAACTGTTGCTACTAGAAATTTAACACTAGCTAACTTAGGTTATACTGGAGCTACTAATGCTAATTATATTACAAATAATAATCAATTAACAAATGGTGCTGGTTATACTACTAATACTGGAGATATAACAGGTGTTACGGCAGGTACAAATTTAACAGGAGGTGGAAGTTCTGGCTCAGTAACATTAAACATGGCAACTGGTGGTGTTGGTTCTGGTACTTATGGAAGTACATCTAATGGAACTAAAATTGATACAATTACTGTTGATGCTTATGGTAGAGTTACTGGTGTTGCAACTGGAGCAACTGGAGACGGAGATATTACAGGCGTTACTGCTGGAACTGGATTAACTGGTGGTGGAACTTCTGGTACACCTACTTTAAATGTAGATGTTGGAACATCAGCAAATAAAATTGTTCAACTTGATGGTTCAAGCAGATTACCAGCAGTAGATGGTTCTCAATTAACTAACATACCAGGTATTTCTGGTTGGTCGTCATCATCTGGAAATTTATTACCAGCAAGCGCAACTGCTGGAATTTATTTAGGAGTTAGTTCAGCAACAGCGTCTAATCTTTTATCTGATTACGAAGAAGGAACTTGGTCGCCAAAACACGCAACAAGTGGTGGAACTCCAAATCAAACCTATAACTATAATAATGGTTATTATGTTAAAGTTGGAAATGTAGTTACAATAACAGCAGATGTTCACATAAGTAATGGTGAAGGTGGTTTCTTTGACCAAAGAGTAAGTAATTTTCCTTTTACTACTAAGAACTCAACTAATACTATTGCTGTTGGTGTCTTTGGTTTTGTACAAAACACTGGTCAATCTTCTACTAAACCTATGGTCTGGAACGCAGAAGAAAATAGAACTTTTGGTGATGTTAAAAAGAATGATTTAAGTAACTGTCCAGCTGGTACTTTTACATCTAATACAACGTTTAAATACACAGCAACTTATTTAACAGAATAA
Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
98a36e7327855593a4cadc677613bc97266d1b1e111de3f523e13a12448eaa8c
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50